Małe interferujące RNA (siRNA)

Małe interferujące RNA lub siRNA to niekodujące RNA o długości około 22 nukleotydów, które regulują syntezę i stabilność mRNA.

siRNA może pochodzić z wnętrza komórki poprzez transkrypcję DNA, może być przetwarzane z wirusowego RNA lub może być dodawane przez naukowców w celach eksperymentalnych.

siRNA są przetwarzane z długich dwuniciowych RNA. Ten RNA jest rozszczepiany na wiele krótkich siRNA za pomocą endonukleazy Dicer.

Każde siRNA następnie wiąże się z Argonaute wraz z innymi białkami, co prowadzi do powstania kompleksu wyciszającego indukowanego RNA lub RISC.

W RISC nić prowadząca RNA jest oddzielana od nici komplementarnej i pozostaje w kompleksie, dzięki czemu może następnie sparować się z docelowym mRNA. Następnie docelowe mRNA jest rozszczepiane za pomocą Argonaute, a następnie degradowane w cytoplazmie.

Podczas swojego cyklu życiowego wirusy oparte na RNA dostają się do komórki gospodarza i wytwarzają dwuniciowe RNA. Ten RNA jest rozpoznawany przez Dicera i przetwarzany na siRNA. Te siRNA pomagają zwalczać infekcje wirusowe, promując degradację wirusowego mRNA.

W jądrze powtórzenia DNA związane z centromerem kodują transkrypty, które są przetwarzane przez Dicera w celu wytworzenia określonych typów siRNA. W przeciwieństwie do cytoplazmatycznego siRNA, hamują one syntezę mRNA i promują tworzenie heterochromatyny, która może regulować transkrypcję.

Te siRNA wiążą się z wieloma białkami, w tym Argonaute, tworząc kompleks wyciszania transkrypcji indukowany przez RNA lub RITS.

SiRNA kieruje RITS do aktywnego miejsca transkrypcji, gdzie wiąże się z powstającym mRNA. To wiązanie prowadzi następnie do rekrutacji dodatkowych białek, które modyfikują pobliskie białka histonowe i promują tworzenie heterochromatyny.

To sprawia, że określone geny są niedostępne, hamując inicjację transkrypcji w regionie docelowym i wyciszając transpozony.