8.5
Podczas replikacji DNA komplementarne parowanie zasad dyktuje sekwencję nukleotydów dodanych do nowej nici - par adeniny z tyminą i par guaniny z cytozyną.
Jednak nukleotydy mogą być czasami nieprawidłowo sparowane, na przykład adenina z cytozyną. Takim błędom zapobiega się lub naprawia je korekta właściwości polimeraz DNA przeprowadzana podczas syntezy DNA.
Po pierwsze, polimeraza DNA ma wysokie powinowactwo do komplementarnych nukleotydów, co poprawia dokładność wyboru właściwego przychodzącego nukleotydu do sparowania z nicią matrycową.
Po drugie, gdy nukleotydy zaczynają się parować, polimeraza DNA ulega zmianie konformacyjnej, która sprawia, że nieprawidłowo sparowane nukleotydy są bardziej podatne na dysocjację, ale zachowują prawidłowo sparowane nukleotydy.
Po trzecie, jeśli nieprawidłowy nukleotyd zostanie w jakiś sposób dodany do rosnącego końca 3', odchylenie strukturalne spowodowane tym nieprawidłowym parowaniem powoduje zatrzymanie polimerazy DNA.
W procesie zwanym korektą egzonukleolityczną koniec 3' jest następnie przenoszony do miejsca egzonukleazy polimerazy DNA. Polimeraza następnie usuwa nieprawidłowy nukleotyd w kierunku od 3 'do 5', zastępuje go właściwym nukleotydem i wznawia syntezę DNA.
Syntezę nowych cząsteczek DNA przeprowadza enzym polimeraza DNA, która dodaje nukleotydy na nici potomnej komplementarne do matrycowej nici DNA. Polimeraza DNA ma większe powinowactwo do dodawania właściwej zasady i zapewnia wierność podczas replikacji DNA. Ponadto wykazuje działanie korygujące podczas replikacji, wykorzystując domenę egzonukleazy, która odcina nieprawidłowe nukleotydy z powstającej nici DNA.
Błędy podczas replikacji są korygowane przez enzym polimerazę DNA
Genomowy DNA jest syntetyzowany w kierunku od 5’ do 3’. Każda komórka zawiera pewną liczbę polimeraz DNA, które odgrywają różną rolę w syntezie i korygowaniu błędów w DNA. Na przykład polimeraza DNA delta i epsilon mają zdolność korekty podczas replikacji jądrowego DNA. Te polimerazy „odczytują” każdą zasadę po jej dodaniu do nowej nici. Jeśli nowo dodana zasada jest nieprawidłowa, polimeraza zmienia kierunek (przechodząc z 3’ na 5’) i wykorzystuje domenę egzonukleolityczną do odcięcia nieprawidłowej zasady. Następnie wyciętą podstawę zastępuje się właściwą podstawą.
Mutacje w domenie egzonukleazy polimerazy DNA są powiązane z nowotworami
Korekta jest istotna, aby zapobiec występowaniu mutacji w nowo zsyntetyzowanym DNA, ale co się stanie, gdy mechanizm korekty zawiedzie? Kiedy mutacja zmienia domenę egzonukleazy polimerazy DNA, traci ona zdolność do usuwania nieprawidłowych nukleotydów. W rezultacie mutacje mogą szybko kumulować się w całym genomie. Ten typ mutacji powiązano z różnymi typami nowotworów.
Polimeraza DNA o niskiej wierności może generować zmutowane sekwencje DNA
Zmodyfikowane polimerazy DNA są wykorzystywane w nauce laboratoryjnej w reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), technice in vitro polegającej na wykonywaniu wielu kopii określonych fragmentów DNA. Chociaż polimerazy o wysokiej wierności stosuje się, gdy ważne jest, aby produkt końcowy był doskonały, niektóre techniki, takie jak podatna na błędy PCR, mają na celu celowe generowanie mutacji w odcinku DNA. Techniki te wykorzystują polimerazy, które mają obniżoną zdolność korekty.
Podczas replikacji DNA komplementarne parowanie zasad dyktuje sekwencję nukleotydów dodanych do nowej nici - par adeniny z tyminą i par guaniny z cytozyną.
Jednak nukleotydy mogą być czasami nieprawidłowo sparowane, na przykład adenina z cytozyną. Takim błędom zapobiega się lub naprawia je korekta właściwości polimeraz DNA przeprowadzana podczas syntezy DNA.
Po pierwsze, polimeraza DNA ma wysokie powinowactwo do komplementarnych nukleotydów, co poprawia dokładność wyboru właściwego przychodzącego nukleotydu do sparowania z nicią matrycową.
Po drugie, gdy nukleotydy zaczynają się parować, polimeraza DNA ulega zmianie konformacyjnej, która sprawia, że nieprawidłowo sparowane nukleotydy są bardziej podatne na dysocjację, ale zachowują prawidłowo sparowane nukleotydy.
Po trzecie, jeśli nieprawidłowy nukleotyd zostanie w jakiś sposób dodany do rosnącego końca 3', odchylenie strukturalne spowodowane tym nieprawidłowym parowaniem powoduje zatrzymanie polimerazy DNA.
W procesie zwanym korektą egzonukleolityczną koniec 3' jest następnie przenoszony do miejsca egzonukleazy polimerazy DNA. Polimeraza następnie usuwa nieprawidłowy nukleotyd w kierunku od 3 'do 5', zastępuje go właściwym nukleotydem i wznawia syntezę DNA.
From Chapter 8:
Now Playing
Replikacja i naprawa DNA
8.6K Views
Replikacja i naprawa DNA
67.3K Views
Replikacja i naprawa DNA
24.5K Views
Replikacja i naprawa DNA
16.8K Views
Replikacja i naprawa DNA
11.6K Views
Replikacja i naprawa DNA
22.1K Views
Replikacja i naprawa DNA
16.8K Views
Replikacja i naprawa DNA
7.4K Views
Replikacja i naprawa DNA
8.0K Views
Replikacja i naprawa DNA
4.6K Views
Replikacja i naprawa DNA
5.1K Views
Replikacja i naprawa DNA
5.9K Views
Replikacja i naprawa DNA
3.7K Views
Replikacja i naprawa DNA
2.6K Views
Replikacja i naprawa DNA
7.5K Views
See More