Evolution of Microbial Genome

Genomy mikroorganizmów zmieniają się z czasem poprzez przyrost i utrata genów.

W obrębie gatunku wiele szczepów konsekwentnie dziedziczy wspólny zestaw genów znany jako genom rdzeniowy.

Na przykład szacuje się, że gatunek bakteryjny X posiada około 5 podstawowych rodzin genów wspólnych dla analizowanych szczepów.

Ponadto niektóre szczepy mogą zyskiwać dodatkowe geny, często poprzez poziomy transfer genów.

Pangenom gatunku X składa się z pełnego zestawu podstawowych rodzin genów obecnych w badanych szczepach oraz dodatkowych genów występujących w wielu szczepach.

U niektórych gatunków pangenom ciągle się rozszerza, gdy pojawiają się nowe zestawy genów.

Te nabyte geny mogą być neutralne, a nawet szkodliwe, prowadząc do delecji genów powszechnych w genomach mikrobiologicznych, podczas gdy dobór naturalny zachowuje korzystne geny.

Wszystkie geny podstawowe do przetrwania są częścią rdzenia genomu gatunku.