Prawidłowe formowanie się komór mózgu podczas embrionalnego rozwoju mózgu jest niezbędne dla jego prawidłowego funkcjonowania. Komory mózgu to wysoce konserwatywne jamie w obrębie mózgu, wypełnione płynem mózgowo-rdzeniowym. U danio pręgowanego, po formowaniu się cewy nerwowej, neuroepithelium przechodzi szereg zwężeń i fałdowań w miarę wypełniania się płynem, co prowadzi do powstania komór mózgu. Aby zrozumieć proces formowania się komór oraz towarzyszące mu zmiany kształtu neuroepithelium, opracowaliśmy metodę wizualizacji przestrzeni komorowej w porównaniu z tkanką mózgową. Jednak ze względu na przezroczystość embrionów danio pręgowanego, rozróżnienie tkanki od przestrzeni komorowej jest utrudnione. Opracowaliśmy zatem technikę wstrzykiwania do komór mózgu, w której przestrzeń komorowa jest wypełniana barwnikiem fluorescencyjnym, a następnie obrazowana za pomocą mikroskopii jasnopolowej i fluorescencyjnej. Obrazy jasnopolowe i fluorescencyjne są następnie przetwarzane i nakładane na siebie w programie Photoshop. Technika ta umożliwia wizualizację przestrzeni komorowej za pomocą barwnika fluorescencyjnego w odniesieniu do kształtu neuroepithelium widocznego na obrazie jasnopolowym. Wstrzykiwanie do komór mózgu u danio pręgowanego można stosować od 18 godziny po zapłodnieniu aż do wczesnych etapów larwalnych. Metoda ta była przez nas szeroko wykorzystywana w badaniach nad formowaniem się i morfogenezą komór mózgu, a także w charakterystyce mutantów morfogenezy mózgu (1-3).