Method Article

Wizualizacja pojedynczych kompleksów molekularnych in vivo przy użyciu zaawansowanej mikroskopii fluorescencyjnej

DOI:

10.3791/1508

September 8th, 2009

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Tutaj demonstrujemy protokoły do wykonywania mikroskopii fluorescencyjnej pojedynczych cząsteczek na żywych komórkach bakteryjnych, aby umożliwić wykrywanie, śledzenie i ilościowe określanie funkcjonalnych kompleksów molekularnych.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
Pełny wgląd w mechanizmy działania żywych komórek można osiągnąć tylko poprzez zbadanie kluczowych procesów, które wywołują i kierują zdarzeniami na poziomie komórkowym. Do tej pory złożoność ścinania systemów biologicznych powodowała, że precyzyjne eksperymenty na pojedynczych cząsteczkach były zbyt wymagające, zamiast tego skupiano się na badaniach pojedynczych systemów przy użyciu stosunkowo prymitywnych pomiarów średnich masowych. Jednak wiele ważnych procesów zachodzi w żywej komórce na poziomie zaledwie jednej lub kilku cząsteczek; Pomiary zespołowe na ogół maskują stochastyczną i niejednorodną naturę tych zdarzeń. Tutaj, korzystając z zaawansowanej mikroskopii optycznej i narzędzi analitycznej analizy obrazu, pokazujemy, jak monitorować białka w pojedynczej żywej komórce bakteryjnej z dokładnością do pojedynczych cząsteczek i jak możemy obserwować dynamikę w kompleksach molekularnych w funkcjonujących maszynach biologicznych. Techniki te mają bezpośrednie znaczenie fizjologiczne. Są one minimalnie perturbacyjne i nieinwazyjne w stosunku do badanej próbki biologicznej i są w pełni dostosowane do badań w żywym materiale, cechach niedostępnych dla innych podejść biofizyki do pojedynczych cząsteczek. Ponadto, wszystkie badane próbki biologiczne wytwarzają znakowane fluorescencyjnie białko na poziomach, które są prawie identyczne z niezmodyfikowanymi szczepami komórkowymi ("kodowanie genomowe"), w przeciwieństwie do bardziej powszechnego, ale mniej idealnego podejścia do generowania znacznie większej ilości białka niż miałoby to miejsce naturalnie ("ekspresja plazmidu"). W związku z tym rzeczywiste próbki biologiczne, które będą badane, są znacznie bliższe organizmom naturalnym, a zatem obserwacje są bardziej istotne dla rzeczywistych procesów fizjologicznych.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Aby rozpocząć tę procedurę, 50 μl zamrożonych zapasów białka fluorescencyjnego eksprymującego komórki bakteryjne Escherichia coli jest najpierw rozmrażane i hodowane tlenowo przez wytrząsanie w 5 ml pożywki wzrostowej LB przez noc w temperaturze 37 stopni C. Rano 50 μl tej nasyconej kultury ekstrahuje się i podkulturuje na pożywkę do hodowli glukozy M63 o minimalnej ilości, inkubując w temperaturze 30 stopni C przez 4 do 6 godzin. Tutaj demonstrujemy na przykładzie dwóch różnych szczepów komórkowych, z których jeden wyraża cytochrom transportujący elektrony połączony z GFP, drugi wyraża białko zaangażowane w bakteryjny silnik wiciowy połączony z GFP.
  2. Komórki mogą b....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Należy uważać, aby nie "nadmiernie ścinać" komórki podczas patrzenia na bakterie na uwięzi, ponieważ może to pogorszyć funkcjonalność silników wiciowych. Ważne jest, aby raz na szkiełku mikroskopowym używać komórek przez znacznie dłużej niż godzinę, ponieważ mogą one ulec wyczerpaniu tlenu. Znalezienie najlepszych warunków obrazowania mikroskopowego dostosowanych do konkretnego badanego systemu biologicznego może wymagać znacznej optymalizacji. Rozsądne może być podjęcie próby obrazowania przy użyciu samego oczyszczonego.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Autorzy nie mają nic do ujawnienia.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Dziękujemy za darowizny szczepów bakteryjnych od grup prof. Judith Armitage (University of Oxford, Wielka Brytania) i prof. Conrada Mullineaux (Queen Mary University of London, Wielka Brytania). IMD jest finansowany wspólnie przez Wydział Biochemii (Uniwersytet Oksfordzki) i OCISB; AR jest finansowany przez stypendium DTC Rady ds. Badań Inżynieryjnych i Fizycznych (EPSRC); ND jest finansowany przez Radę ds. Badań Biotechnologii i Nauk Biologicznych (BBSRC); MCL jest finansowany przez Royal Society University Research Fellowship.

....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Leake, M. C., Chandler, J. H., Wadhams, G. H., Bai, F., Berry, R. M., Armitage, J. P. Stoichiometry and turnover in single, functioning membrane protein complexes. Nature. 443, 355-358 (2006).
  2. Leake, M. C., Greene, N. P., Godun, R. M., Granjon, T., Buchanan, G., Chen, S., Berry, R. M., Palmer, T., Berks, B. C.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Single Molecule FluorescenceAdvanced Fluorescence MicroscopyLiving Bacterial CellsFluorescent Protein TaggingTotal Internal Reflection FluorescenceElectron Multiplying CameraHigh Numerical Aperture ObjectiveFluorescent Spot DetectionPhoto Bleaching AnalysisMolecular Complex Visualization

Related Articles