1. Przegląd zintegrowanego systemu mikroskopowego
System mikroskopowy wykorzystany w tych badaniach został opisany szczegółowo 1. W skrócie, odwrócony mikroskop Olympus IX-81 z przystawką TIRF (Olympus, Center Valley, PA) został połączony z głowicą skanującą CSU-22 Yokogawa (Yokogawa Electric Inc, Japan). Mikroskop sił atomowych Bioscope SZ (Veeco Instruments Inc, Santa Barbara, CA) jest zamontowany na górze optycznego mikroskopu odwróconego, a cały układ został umieszczony na stole optycznym klasy badawczej (Newport, irvine, CA).
Układ konfokalny składający się ze skanera z dyskiem obrotowym, zewnętrznego koła filtrów i kamery EMCCD (Roper Scientific-Photometrics, Tucson, AZ) jest sztywno połączony z aluminiową płytą podstawową umieszczoną na silikonowej podkładce niezbędnej do tłumienia drgań. Skaner konfokalny łączy się z mikroskopem za pomocą kołnierza z gwintowaną obręczą, która może zostać odłączona od mikroskopu podczas pomiarów AFM, tak aby drgania pochodzące ze skanera z dyskiem obrotowym nie wpływały na pomiary AFM. Laser argonowo-kryptonowy (Spectra Physics, Mountain View, CA) służy jako źródło wzbudzenia zarówno dla trybu obrazowania TIRF, jak i konfokalnego, i może być alternatywnie sprzężony z dwoma światłowodami, które dostarczają wiązkę lasera odpowiednio do przystawki TIRF lub głowicy skanującej. Systemem sterują dwa komputery: oprogramowanie Slidebook kontroluje obrazowanie optyczne, a oprogramowanie Nanoscope steruje AFM.
2. Hodowla komórkowa
Żywe komórki wykazujące ekspresję konstruktów GFP nakierowanych na specyficzne białka należy umieścić w szalku hodowlanym z szklanym dnem na 24 godziny przed eksperymentem zycie stymulacji mechanicznej. W dniu eksperymentu należy wymienić pożywkę hodowlaną na pożywkę bez czerwieni fenolowej. Szalkę hodowlaną montuje się na stoliku AFM za pomocą magnetycznego pierścienia mocującego.
3. Przygotowanie sondy AFM i konfiguracja mikroskopu
Końcówkę AFM zmodyfikowaną 2 micron biotynilowaną kuleczką szklaną należy przemyć pięciokrotnie DPBS, a następnie inkubować przez 5 min z awidyną (1 mg/ml), ponownie przemyć pięciokrotnie DPBS i inkubować przez 5 min z 1 mg/mL biotynilowaną fibronektyną. Na koniec końcówkę należy przemyć jeszcze pięć razy 2, zamontować na skanerze AFM, a następnie wokół uchwytu umieścić ochronną silikonową osłonę. Należy ustawić mikroskop w trybie podglądu wideo, aby wycentrować końcówkę AFM w polu widzenia. Należy skalibrować dźwignię optyczną, kierując wiązkę lasera na sam koniec wspornika, a następnie zmienić obiektyw na obiektyw o dużym powiększeniu odpowiedni do obrazowania pojedynczych komórek. Przed rozpoczęciem eksperymentu należy wyznaczyć stałą sprężystości końcówki. Parametr ten zostanie zmierzony metodą szumu termicznego (thermal tune) dostępną w oprogramowaniu Nanoscope. Należy przełączyć kamerę z trybu wideo na kamerę EMCCD, aby umożliwić obrazowanie fluorescencyjne. Następnie należy wybrać komórkę i doprowadzić końcówkę AFM do kontaktu z tą konkretną komórką. Po 20 min oczekiwania, niezbędnym do uformowania się silnej adhezji ogniskowej w punkcie kontaktu końcówki AFM z powierzchnią komórki, rozpocznie się procedura stymulacji mechanicznej.
4. Stymulacja mechaniczna żywej komórki
Obrazowanie TIRF 3-4 będzie preferowaną metodą wizualizacji i kwantyfikacji adhezji ogniskowych, natomiast obrazowanie konfokalne z dyskiem obrotowym (spinning-disk) 5 zostanie wykorzystane do wizualizacji cytoszkieletu aktynowego w całym ciele komórki. AFM 6 zostanie użyty w trybie obrazowania kontaktowego w cieczy.
Przed rozpoczęciem procedury stymulacji mechanicznej zostanie wykonany obraz komórki przy użyciu mikroskopii TIRF lub konfokalnej. Stymulację mechaniczną wywoła funkcjonalizowana sonda AFM, która będzie przemieszczać się w górę w dyskretnych krokach co 3-5 min przez określony czas (1-1,5 godziny). Reakcja komórki będzie rejestrowana w sposób ciągły w oprogramowaniu Nanoscope jako seria obrazów wysokości, gdzie każda linia na obrazie reprezentuje jednostkę czasu wynoszącą 1 sec. Podczas pozyskiwania danych AFM operator stale monitoruje pozycję z końcówki AFM, aby określić właściwy moment kolejnego pociągnięcia.
Po każdej stymulacji mechanicznej możliwe jest wykonanie obrazu TIRF lub konfokalnego komórki w oprogramowaniu Slidebook, przy jednoczesnym ciągłym pozyskiwaniu danych AFM. Obrazy optyczne mogą być przetwarzane w trybie off-line w celu stworzenia filmów pokazujących reorganizację cytoszkieletu aktynowego i adhezji ogniskowych. Ponadto każdy obraz może zostać poddany analizie ilościowej w celu określenia powierzchni komórki, powierzchni konkretnych białek oraz analizy ogólnej morfologii komórki.
Po zakończeniu eksperymentu końcówka AFM zostaje wycofana z komory, a następnie w oprogramowaniu Nanoscope dokonuje się pomiaru czułości końcówki AFM.
Eksperyment jest bardzo wrażliwy na zakłócenia! Należy unikać rozmów oraz dotykania mikroskopu w trakcie jego przeprowadzania. Aby zminimalizować poziom szumów w pomiarach AFM, konfokalny mikroskop z dyskiem obrotowym powinien zostać odseparowany od mikroskopu. Czas oczekiwania na utworzenie silnej adhezji ogniskowej między powierzchnią komórki a końcówką AFM może się różnić w zależności od zastosowanego typu komórek oraz macierzy naniesionej na końcówkę.
5. Reprezentatywne wyniki

Rycina 1. Ta sama komórka mięśni gładkich naczyń (VSMC) przetransfekowana actin-mRFP i vinculin-GFP została zobrazowana za pomocą: (A) AFM na apikalnej powierzchni komórki; (B) TIRF na bazalnej powierzchni komórki; oraz (C) konfokalnej mikroskopii z dyskiem obrotowym w całej objętości komórki. Obraz konfokalny przedstawiono jako projekcję maksymalną stosu 3-D. Dobre nakładanie się obrazów AFM i TIRF lub obrazów konfokalnych z dyskiem obrotowym pokazano odpowiednio w (D) i (E). Rozmiar obrazu wynosi 64 x 50 micron.

Rycina 2. Komórka VSMC przetransfekowana aktyną-mRFP została poddana stymulacji mechanicznej za pomocą AFM i obrazowaniu za pomocą konfokalnej mikroskopii z dyskiem obrotowym. Strzałki wskazują włókna aktynowe, które: (a) polimeryzują/pogrubiają się, (b) depolimeryzują/zanikają lub (c) łączą się w pęczki w wyniku przebudowy aktyny. Białe przerywane linie reprezentują końcówkę AFM nad komórką. Rozmiar obrazu 91 x 91 micron.