1. Generowanie ex vivo limfocytów T ukierunkowanych na jelita oraz kontrolnych limfocytów T (patrz Rysunek 1)
- Wyizolować splenocyty poprzez rozcieranie jednej śledziony pobranej od myszy typu dzikiego. Zawiesinę komórkową resuspender w PBS i wirować przez 5' przy 400 x g. Usunąć nadsącz i poddać erytrocyty lizie, resuspender pellet komórkowy w 4 ml buforu lizującego ACK na 2-3 minuty. Następnie dodać 5 ml PBS. Wirować przez 5' przy 400 x g i usunąć nadsącz.
- Resuspender całkowitą liczbę splenocytów w stężeniu 1 x 106/mL w pożywce IMDM + 10% FBS + 50 mM 2-merkaptoetanolu + penicyliny/streptomycyny (pełna pożywka IMDM). Podzielić komórki na dwie grupy, z czego jedna zostanie uzupełniona o RA (lub syntetyczne agoniści RAR, takie jak Am80 lub Am580) do stężenia końcowego 100-200 nM 3. Limfocyty T aktywowane w obecności RA lub agonistów RAR będą wykazywać nadekspresję a4b7 oraz CCR9 i przekształcą się w limfocyty T o tropizmie jelitowym, natomiast limfocyty T aktywowane bez RA będą stanowić grupę kontrolną.
- Do każdego dołka płytki 24-dołkowej, uprzednio pokrytej przeciwciałami anty-CD3 (10 mg/ml) i anty-CD28 (10 mg/ml), dodać 1,5-2,0 mL zawiesiny komórkowej i inkubować w temperaturze 37°C w 5% CO2 (w celu pokrycia płytki dodać 500 ml/dołek anty-CD3 oraz anty-CD28 w PBS i inkubować przez 2 godziny w 37˚C, a następnie przemyć dwukrotnie 2 ml PBS).
- Aby uniknąć nadmiernej stymulacji limfocytów T, po 2-3 dniach przenieść zawiesiny komórkowe do nowej, niepokrytej płytki 24-dołkowej. Inkubować przez kolejne 2-3 dni. W zależności od gęstości komórek i proliferacji pożywka może zakwasić się (zmienić kolor na żółty), w takim przypadku może być konieczne zastąpienie połowy pożywki świeżą pełną pożywką IMDM. Zebrać komórki po 4-5 dniach (licząc od dnia 0).
- Typowa końcowa wydajność wynosi 1-2 x 106 efektorowych limfocytów T na dołek. W związku z tym, aby uzyskać 10-20 x 106 limfocytów T na każdą warunek, należy wysiać minimum 9-12 dołków limfocytów T o tropizmie jelitowym oraz 9-12 dołków limfocytów T kontrolnych.
2. Analiza receptorów homingu jelitowego na aktywowanych limfocytach T
Po 4-5 dniach hodowli powinniśmy zaobserwować wysoką ekspresję receptorów homingu jelitowego a4b7 oraz CCR9 na limfocytach T aktywowanych w obecności RA lub agonistów RAR, podczas gdy limfocyty T z grupy kontrolnej powinny wykazywać bardzo niski poziom tych receptorów 4.
Analiza cytometrii przepływowej (FACS).
- Należy zebrać od 0,2 do 0,5 x106 komórek i wirować przez 5 min przy 300 g w temperaturze 4°C.
- Inkubować z przeciwciałami anti-CD4-FITC, anti-a4b7-PE (BD Biosciences), anti-CCR9-APC (eBiosciences) oraz anti-CD8-PercP przez 15 min w temperaturze 4°C w ciemności.
- Po inkubacji wirować przez 5 min przy 300 g w temperaturze 4°C. Komórki należy przemyć, resuspender w buforze do barwienia i analizować za pomocą FACS.
3. Znakowanie limfocytów T markerami komórkowymi CFSE i CMTMR
- Przed rozpoczęciem należy utrzymać wszystkie roztwory w temperaturze 37°C. Komórki T tropiczne do jelit (a4b7HighCCR9High) oraz kontrolne komórki T (a4b7Low/Neg CCR9Low/Neg) należy przemyć dwukrotnie PBS w celu usunięcia surowicy. Stężenie komórek T należy dostosować do poziomu 10-15 x 106/mL w PBS.
- Do komórek T tropicznych do jelit i kontrolnych komórek T należy dodać fluorofory CFSE (estery sukcynimidylowe karboksyfluoresceiny) lub CMTMR (chlorometylo-benzoilo-amino-tetrametylorodaminę) do końcowych stężeń odpowiednio 5 mM i 10 mM, delikatnie wymieszać na wirówce typu vortex i inkubować przez 20 min w 37°C. Zaleca się zamianę etykietowania w tym samym lub osobnym eksperymencie, aby wykluczyć potencjalny wpływ wewnętrzny fluoroforów na migrację komórek T.
- Po inkubacji proces należy zatrzymać, dodając 1 objętość FBS, a następnie inkubować przez 1-5 min w temperaturze pokojowej. Roztwór należy rozcieńczyć 10-krotnie w ciepłym PBS i odwirować przez 5 min przy 300 g. Próbkę należy przemyć dwukrotnie PBS i resuspendować w pełnej pożywce IMDM.
- W idealnych warunkach 10-20 x 106 komórek z każdej populacji T należy zmieszać w stosunku 1:1, a następnie odwirować przy 300 x g przez 5 min. Na koniec komórki należy resuspendować w 200-250 mL ciepłego PBS i wstrzyknąć do żyły ogonowej.
- Aby obliczyć dokładny stosunek wprowadzonych komórek (idealnie bliski 1), należy odłożyć 5-10 mL wstrzykiwanej zawiesiny komórek, rozcieńczyć ją 300 mL PBS i przeanalizować metodą FACS.
4. Analiza homingu limfocytów T
Chociaż myszy można analizować w różnych punktach czasowych (od 1 h do kilku dni po iniekcji limfocytów T), homing limfocytów T tropicznych do jelit jest najlepiej udokumentowany między 12 a 24 h po iniekcji. Dłuższe odstępy czasu zwiększają potencjalny wpływ innych zmiennych oddziałujących na końcową liczbę lub stosunki komórek, takich jak apoptoza limfocytów T oraz ich opuszczanie tkanki. Po eutanazji myszy zawiesiny komórkowe z kilku tkanek należy wyizolować bezzwłocznie, aby ograniczyć śmierć komórek, co mogłoby wpłynąć na końcową wydajność i wyniki. Tkaniami podlegającymi analizie są jelito cienkie, jelito grube, śledziona, węzły chłonne, kępki Peyera, wątroba, płuca oraz krew. Jeśli wstrzyknięte limfocyty T są rzeczywistymi limfocytami T tropicznymi do jelit, powinny one migrować do błony śluzowej jelita cienkiego średnio 5-10 razy efektywniej (lub bardziej) w porównaniu z kontrolnymi limfocytami T. Jednak w innych tkankach, takich jak krew i śledziona, nie powinna występować preferencyjna migracja limfocytów T. Izolacja limfocytów z blaszki właściwej jelit oraz z przedziału wewnątrznabłonkowego została opisana wcześniej 5.
- Barwienie FACS: Próbki są resuspenderowane w zależności od liczby zebranych komórek, do gęstości nieprzekraczającej 3.0 x 106 komórek/ml. Jeśli w charakterze biorców zastosowano myszy kongeniczne CD45.1+ lub Thy1.1+, komórki barwi się odpowiednim markerem kongenicznym (np. CD45.2 lub Thy1.2) w połączeniu z markerem linii (np. TCRbchain, CD4, CD8, CD45.1+/CD45.2+).
- Podczas analizy FACS komórki są bramkowane na marker kongeniczny (np. CD45.1), a następnie na specyficzne markery linii (np. CD4/CD8) i analizowane pod kątem stosunku komórek pozytywnych dla CMTMR i CFSE.
- Dane są zazwyczaj wyrażane jako indeks homingu (Homing Index, HI), który oblicza się jako stosunek CFSE/CMTMR (lub CMTMR/CFSE) w każdej tkance podzielony przez odpowiadający mu stosunek wejściowy (patrz poniżej). Jeśli stosunek wejściowy jest bardzo bliski 1, to stosunki tkankowe będą równoważne HI.
HI = CFSEtissue / CMTMRtissue : CFSEinput / CMTMRinput
Krew powinna zostać również poddana analizie w celu ustalenia, czy obie populacje limfocytów T są reprezentowane w krążeniu w równym stopniu, czy też jedna z populacji limfocytów T jest zmniejszona w stosunku do drugiej (np. wskutek preferencyjnego zatrzymania w płucach/wątrobie lub obniżonej żywotności). Może to wystąpić przy porównywaniu naiwnych lub spoczynkowych komórek pamięci T z niedawno aktywowanymi efektorowymi limfocytami T, ponieważ te ostatnie mogą być w większym stopniu zatrzymywane w płucach. Jeśli HI we krwi różni się znacząco od 1, można znormalizować HI w tkankach względem HI we krwi. Krew można pobrać poprzez punkcję serca u myszy znieczulonych (awertynem lub izofluranem przed eutanazją); przed użyciem do barwienia FACS krew powinna zostać dwukrotnie poddana lizie w buforze ACK.
Normalizacja krwi = HItkanka/ HIkrew
5. Reprezentatywne wyniki
Myszy biorców (Thy1.1+) uśmiercono 18h po iniekcji komórek. Przygotowano zawiesiny komórkowe ze śledziony, obwodowych węzłów chłonnych (PLN), krezkowych węzłów chłonnych (MLN) oraz blaszki właściwej (LP) jelita cienkiego. Następnie komórki barwiono pod kątem Thy1.2 i CD8, a następnie analizowano metodą FACS, wyznaczając bramkę dla żywych komórek Thy1.2+CD8+; ostatecznie przeanalizowano stosunek komórek CMTMR+ (limfocyty T tropistyczne do jelit) do komórek CFSE+ (kontrolne limfocyty T), podzielony przez stosunek wejściowy. Wyniki można przedstawić tak, jak pokazano na Ryc. 2, gdzie widać, że limfocyty T tropistyczne do jelit oraz kontrolne limfocyty T migrowały w równym stopniu do śledziony (HI bliskie 1, zaznaczone czerwoną linią). Z kolei limfocyty T tropistyczne do jelit migrowały do LP około 10 razy efektywniej w porównaniu z kontrolnymi limfocytami T.

Rycina 1: Schemat przedstawiający generowanie i znakowanie limfocytów T tropistycznych do jelit oraz nietropistycznych do jelit. Limfocyty T są izolowane od myszy typu dzikiego i aktywowane przeciwciałami anty-CD3/anty-CD28 w obecności lub w nieobecności 100-200 nM all-Proszę podać tekst źródłowy do tłumaczenia. kwas retinowy (RA). Po 4–5 dniach limfocyty T traktowane RA wykazują ekspresję receptorów homingu do jelit CCR9 oraz $\alpha$4$\beta$7. Następnie limfocyty T tropiczne do jelit oraz kontrolne są różnicowo znakowane CFSE lub CMTMR, przemywane, mieszane w stosunku 1:1 i wstrzykiwane biorczej myszy do żyły ogonowej. Część znakowanych komórek wykorzystuje się do określenia początkowego stosunku CFSE/CMTMR (powinien być on bliski 1).

Rysunek 2: Przykład analizy homingu. Myszy analizowano 12-18 h po wstrzyknięciu limfocytów T, a następnie uzyskano zawiesiny pojedynczych komórek z wybranych organów. Komórki barwiono przeciwciałami anty-Thy1.2 (marker kongeniczny) oraz anty-CD8, a następnie za pomocą FACS analizowano stosunek komórek CMTMR+ do CFSE+ wśród limfocytów T Thy1.2+CD8+ w każdej tkance. Stosunki CMTMR/CFSE w tkankach znormalizowano następnie względem stosunku CMTMR/CFSE w materiale wyjściowym (Input), aby uzyskać indeksy homingu (HI). W tym przykładzie komórki CMTMR+ są komórkami tropnymi do jelit, a komórki CFSE+ stanowią kontrolne efektorowe limfocyty T.