1. Ustanowienie stabilnych linii komórkowych
- Sklonuj interesujący Cię GPCR i wstaw go do wektora ekspresji zawierającego 5' sekwencję konsensusu Kozaka (GCCA/GCCATGG) wokół kodonu start w celu optymalnego wiązania rybosomalnego w systemie ssaków (Kozak, 1986). Tutaj używamy plazmidu pcDNA3.1 / Bm-KR dla receptora kininy kleszcza i plazmidu pcDNA3.1 / Aedae-KR dla receptora kininy komara (Holmes i wsp., 2003; Pietrantonio i wsp., 2005). Wektor pcDNA3.1(-) koduje oporność na ampicylinę do selekcji u bakterii i oporność na neomycynę (G418) na selekcję w komórkach ssaków.
- Hoduj puste komórki CHO-K1 (bez plazmidów) (ATCC, Manassas, VA, USA) lub inną pożądaną linię komórkową w kolbie T-25 (BD Falcon) w temperaturze 37°C w inkubatorze z wilgotnością 5% CO2 (Holmes i wsp., 2003). Wszystkie dalsze inkubacje powinny być przeprowadzane w tych warunkach, chyba że określono inaczej. Utrzymuj puste komórki w pożywce wzrostowej (pożywka F12K z 10% płodową surowicą bydlęcą) za pomocą 1X Antybiotyk-Antybiotyk Przeciwgrzybiczy (Invitrogen, CA).
- Aby podzielić komórki, podgrzej wszystkie roztwory do temperatury 37 °C. Usunąć starą pożywkę z kolby T-25 i przepłukać 5 ml PBS, a następnie usunąć PBS. Aby trypsynizować komórki, dodaj 2 ml PBS-Trypsin-EDTA (34 ml PBS, 2 ml 7,5% wodorowęglanu sodu, 4 ml 10X trypsyna-EDTA) przez 2 min. Dodaj 3 ml pożywki i odsysaj pożywkę w górę iw dół, aby wymieszać komórki. Przenieść pożywkę z komórkami do stożkowej probówki i wirować przez 2 minuty przy 200-300 g (1 000 obr./min). Odrzucić supernatant i ponownie zawiesić komórki w pożywce o pojemności 5 ml. Rozcieńczyć zawieszone komórki do stężenia 1:5 lub 1:10 świeżą pożywką i przenieść 5 ml do nowej kolby T-25.
- Po zdrowym wzroście komórek (około 2-3 dni), wysiewaj komórki CHO-K1 do kolb kultur tkankowych T-25 i hoduj je przez noc w pożywce wzrostowej bez antybiotyków, aż osiągną około 30% zlewu (około 18 godzin). Stopień konfluencji można określić, obserwując komórki pod odwróconą mikroskopią fluorescencyjną.
- Dla każdej próbki należy przygotować następujące mieszaniny:
- Połącz 1-2 μg DNA (przykład: użyj 4 μl 265 μg / μl pcDNA3.1 / Aedae-KR) ze 100 μl zredukowanego podłoża surowicy Opti-MEM I (Invitrogen).
- Wymieszaj 6 μl odczynnika Lipofektyny (InvitrogenTM) ze 100 μl F12K wolnej pożywki surowicy, uzyskując stosunek lipofektyny do DNA 1:1. Inkubować w temperaturze pokojowej przez 30-45 minut.
Delikatnie wymieszać roztwory z 1.5.1 z 1.5.2 kroplami (całkowita objętość = 200 μl). Odstawić w temperaturze pokojowej na 10-15 minut.
- Usuń starą pożywkę wzrostową z komórek i przemyj komórki 5 ml pożywki wolnej od surowicy F12K, a następnie usuń pożywkę wolną od surowicy F12K. W probówce o pojemności 15 ml delikatnie wymieszaj mieszaninę transfekcji z 1,8 ml świeżej pożywki F12K w sposób kroplowy. Następnie umyj komórki z kroku 1.5 PBS i dodaj ten nowy roztwór do transfekcji do komórek. Inkubować przez 18 godzin.
- Zmień pożywkę na pożywkę F12K plus 10% płodowej surowicy bydlęcej bez antybiotyków i inkubuj przez noc. Podzielić komórki na dwie kolby T-25 z podłożem F12K plus 10% płodowej surowicy bydlęcej bez antybiotyków przez kolejne 18 godzin (w celu podziału komórek patrz krok 1.3).
- Zastąp pożywkę pożywką selektywną (pożywka F12K plus 10% płodowej surowicy bydlęcej 800 μg/ml GENETYCYNY, Invitrogen). Hoduj komórki za pomocą selektywnej pożywki przez 3-4 tygodnie. Z biegiem czasu będzie to selekcjonować komórki, które stabilnie włączyły plazmid do swojego genomowego DNA. Kontynuuj utrzymywanie komórek za pomocą pożywki podtrzymującej (pożywka F12K plus 10% płodowej surowicy bydlęcej z 400 μg/ml genetycyny). Okresowo zamrażaj linie komórkowe za pomocą pożywki do zamrażania w stosunku 1:1 (pożywka selektywna z 20% DMSO), aby zapobiec stratom w przypadku nieoczekiwanego zanieczyszczenia.
- Wybór klonalnych linii komórkowych: w pierwszym kroku trypsynizuj i odwiruj komórki z kroku 1.8 z pożywką konserwacyjną, jak w kroku 1.3. Ponownie zawiesić komórki w 5 ml pożywki konserwacyjnej, pobrać 0,5 ml zawiesiny komórek i dodać 4,5 ml świeżej pożywki konserwacyjnej, aby uzyskać 10-krotne rozcieńczenie. Przenieś 10-krotne rozcieńczenie do 12 dołków na 96-dołkowej płytce, dodając 100 μl do każdej studzienki, aby wybrać pojedyncze komórki.
- Kontynuować wykonywanie 10-krotnych seryjnych rozcieńczeń tych komórek w celu uzyskania teoretycznej końcowej zawiesiny jednej komórki na 100 μl (zwykle końcowe rozcieńczenie będzie mieścić się w zakresie od 10-11 do 10-19; całkowita liczba 10-krotnych seryjnych rozcieńczeń wynosi ̃19). Bezpośrednio po każdym rozcieńczeniu przenieść 100 μl rozcieńczenia do 12 dołków płytki 96-dołkowej. Po 18 godzinach inkubacji obserwuj 96 płytek dołkowych pod mikroskopem odwróconego światła lub fluorescencji i zaznacz studzienki, które wydają się zawierać tylko jedną pojedynczą komórkę lub zawierają dwie komórki, które w oczywisty sposób oddzieliły się od jednej komórki. Obserwuj codziennie i zmieniaj podłoże co trzy dni.
- Gdy studzienki są w 80% zlewające się (około tygodnia), przepłucz oznaczone studzienki 200 μl PBS i trypsynizuj je 100 μl roztworu PBS-trypsyna-EDTA. Przenieść komórki z każdej oznaczonej studzienki do jednego dołka 6-dołkowej płytki z 1 ml pożywki konserwacyjnej. Hoduj te komórki przez 3 dni, a następnie przenieś je do pojedynczej kolby T25. Zbadać te komórki za pomocą testu bioluminescencji wapnia z peptydami agonistycznymi (patrz punkt 2).
- Wybierz 1 linię komórkową z kroku 1.11 z najwyższą odpowiedzią w teście bioluminescencji wapnia na płytce i przeprowadź po raz drugi selekcję pojedynczych komórek, wykonując kroki 1.9-1.11. Okresowo zamrażaj linie komórkowe.
- Z selekcji wtórnej opisanej w kroku 1.12 wybierz 2-3 linie komórkowe o najwyższej odpowiedzi w teście bioluminescencji wapnia na płytce i utrzymuj je w hodowli do dalszych testów na płytkach bioluminescencyjnych wapnia. Śledź numery przejazdów. Od czasu do czasu zamrażaj linie komórkowe z wczesnych pasaży, aby zawsze móc do nich wrócić, jeśli linie komórkowe z większą liczbą pasaży przestaną działać konsekwentnie.
2. Test płytki bioluminescencji wapnia
- Zwiąż interesujący nas gen reporterowy do wektora ekspresji. Tutaj użyliśmy plazmidu aequorin mtAEQ/pcDNA1 (prezent od dr C. J. P. Grimmelikhuijzen i Michaela Williamsona z Uniwersytetu w Kopenhadze, Dania). Przekształć plazmid w komórkach E. coli MC1061/PS (Invitrogen) i oczyść je za pomocą zestawu do miniprepu wirowego QIAprep (Qiagen Inc.). W ostatnim etapie wymyj plazmid za pomocą buforu Tris bez EDTA, a nie wody.
- Hoduj linie komórkowe od kroku 1.13 wyrażające pożądany receptor w pożywce podtrzymującej. Gdy komórki są w 90% zlewne, trypsynizować, odwirować, a następnie ponownie zawiesić komórki w 5 ml pożywki konserwującej, jak w kroku 1.3. Rozcieńczyć komórki (około 10x pożywką konserwacyjną) i policzyć liczbę komórek za pomocą licznika komórek (Bright-Line Hemacytometer) pod mikroskopem. Dostosuj liczbę komórek do około 2 x 105 komórek / ml (średnio 20 komórek w jednym z 9 kwadratów pokazanych w hemacytometrze). Umieścić 2 ml rozcieńczonych komórek w pożywce do każdego dołka na płytce sześciodołkowej. Inkubować przez 24 godziny (po inkubacji komórki powinny osiągnąć około 60% zbieżności).
- Zmień pożywkę w płytce 6-dołkowej na pożywkę OPTI-MEM. Dla każdej studzienki wymieszaj 96 μl OPTI-MEM z 4 μl odczynnika do transfekcji FuGENE 6 (Roche Biochemicals) w probówce do mikrofuge i pozostaw w temperaturze pokojowej na 5 minut. Dodać 1 μg plazmidowego DNA aequorin/pcDNA 1 do każdej probówki, a następnie delikatnie wstrząsać próbką przez 1 minutę, inkubować w temperaturze pokojowej przez 15-20 minut. Dodaj każdą mieszaninę do każdej studzienki kroplami, delikatnie potrząsając płytką dołka. Inkubować płytki przez 6 godzin i zmienić pożywkę na pożywkę F12K zawierającą 10% płodowej surowicy bydlęcej bez antybiotyku.
- Po inkubacji komórek na płytce sześciodołkowej przez 24 godziny, trypsynizować, odwirować i ponownie zawiesić komórki zgodnie z krokiem 1.3. Policz liczbę komórek do 400 000 komórek/ml w kroku 2.1 i przenieś 100 μl (łącznie 40 000 komórek/100 μl) do każdego dołka 96-dołkowej białej płytki do mikromiareczkowania z cienkim dnem (Costar 3610). Inkubuj przez kolejne 24 godziny, aż do około 80% zbiegu komórek. Jest to optymalne stężenie komórek do testu bioluminescencyjnego.
- Przygotować 90 μl/basenik bezwapniowej pożywki DMEM (Invitrogen) zawierającej 5 μM koelenterazyny (Invitrogen) w ciemności (koelenterazyna jest wrażliwa na światło). Weź płytkę z 2,4, usuń stare podłoże i dodaj te 90 μl do każdej studzienki. Inkubować płytki przez 3 godziny w ciemności w temperaturze 37°C i 5% CO2 , po czym komórki na płytce są gotowe do badania.
3. Obsługa urządzenia i analiza danych
- Każdy czytnik płytek bioluminescencyjnych jest inny. Nasz test wykonujemy za pomocą czytnika płytek NOVOstar (BMG Labtechnologies) w trybie bioluminescencji. Jeśli używasz innego instrumentu, musisz dostosować protokół.
- Przed użyciem należy oczyścić pompy czytnika płytek (lub POMPY ZALEWOWE). Wyłącz światło w pomieszczeniu przed umieszczeniem tabliczki na uchwycie talerzy. Po zamknięciu uchwytu na talerz włącz światła.
- Rozpuszczaj peptydy (w 1,5 ml probówce Eppendorfa) w bezwapniowym pożywce DMEM. Ustaw "Głębokość aspiracji" i "Określenie pozycji" roztworu peptydu przed użyciem. Rzuć wyzwanie komórkom za pomocą 10 μl (10x) o różnych stężeniach peptydów (FFFSWG-NH2, Aedes-K1-3 lub inny pożądany peptyd) i natychmiast rozpocznij rejestrowanie emisji światła. Ustawiliśmy instrument tak, aby rejestrował emisję światła (465 nm) dla każdej studni co 2 sekundy przez łączny czas 50 sekund.
- Upewnij się, że uwzględniłeś kontrolę pozytywną, taką jak aktywny analog (zastosowano analogowy FFFSWGa, Taneja-Bageshwar i wsp., 2009) oraz kontrolę negatywną, taką jak transfekowane komórki tylko wektorowe. Kontrola ujemna będzie konieczna podczas analizy danych w celu ustalenia progu wyjściowego (zob. reprezentatywne wyniki). Niepowiązany, nieaktywny peptyd może być również dodany jako kontrola ujemna.
- Po zakończeniu pracy umyj pompę instrumentalną (lub POMPY PRIME), a następnie umieść następną próbkę peptydu. Zapisz swoje dane i ponownie umyj pompy.
- Obsługa danych: Przenieś dane dotyczące emisji światła z każdej studni do arkusza danych programu Microsoft Excel.
- Wklej dane z Excela do oprogramowania Prism 4.0 z GraphPad Software Inc. (San Diego, CA, USA). Różne stężenia peptydów to oś X, a jednostki bioluminescencji to oś Y. Aby znormalizować dane, należy wykreślić krzywą logarytm-odpowiedź. Wybierz analizę dopasowania krzywej regresji nieliniowej (sigmoidalne równanie dawka-odpowiedź ze zmiennym nachyleniem), aby uzyskać krzywe stężenie-odpowiedź dla każdego peptydu. Program wykreśla wartości na końcu i podaje EC50.
- Każdy eksperyment należy powtórzyć trzy razy w celu analizy danych.
4. Reprezentatywne wyniki:
Gdy wyrażony w komórkach CHO-K1, receptor kininowy komara Aedes aegypti zachowywał się jak receptor wieloligandowy i funkcjonalnie reagował na stężenia tak niskie jak 1 nM trzech endogenorów Aedes kinin, Aedae kinins 1-3, testowane pojedynczo za pomocą testu płytki bioluminescencji wapnia. Rysunek 1 pokazuje, że uzyskana kolejność rang mocy była następująca: Aedae-K-3 > Aedae-K-2 > Aedae-K-1, w oparciu o odpowiednie wartości EC50 Aedae-K-3, 16,04 nM; Aedae-K-2, 26,6 nM i Aedae-K-1, 48,85 nM, które różniły się statystycznie istotnie (P < 0,05) (Pietrantonio i wsp., 2005).
Użyliśmy również tego testu, aby określić, które reszty kininy są kluczowe dla interakcji peptyd kinina z receptorem. Peptydy kininowe owadów mają wspólny C-końcowy pentapeptyd, który reprezentuje minimalną sekwencję wymaganą do aktywności biologicznej, znaną również jako rdzeń. W Tabeli 1 analogi rdzenia peptydu kininowego zsyntetyzowano jako serię zastępczą alaniny rdzeniowego pentapeptydu kininowego FFSWGa i przetestowano za pomocą testu bioluminescencji wapnia na płytkach (Taneja-Bageshwar i wsp., 2006). Odkryliśmy, że aminokwasy Phe1 i Trp4 były niezbędne do aktywności kinin owadów dla obu receptorów.
Test może być również używany do testowania peptydów zaprojektowanych w celu zwiększenia biostabilności. Tabela 2 przedstawia zaprojektowane analogi kininy zawierające kwas aminoizomasłowy (Aib) testowane na rekombinowanym receptorze kininowym kleszcza, a rysunek 2 przedstawia porównanie aktywności sześciu analogów kwasu alfa-aminoizomasłowego na linii komórkowej receptora kininy kleszcza eksprymującego CHO-K1 za pomocą testu bioluminescencji płytki wapniowej (Taneja-Bageshwar i wsp., 2009). Analog heksapeptydu FFFSWGa dodaje się w celu pozytywnej kontroli aktywności receptora. Analogowy FF[Aib]WGa okazał się bardziej aktywny niż ten analog kontroli heksapeptydu. Analog z dwoma zamiennikami kwasu aminoizomasłowego, [Aib]FF[Aib]WGa, był najsilniejszym z testowanych analogów podwójnej wymiany (Tabela 2 i Rysunek 2).
Więcej przykładów zastosowania tego testu można znaleźć w Nachman i Pietantonio (2010), Nachman et al. (2009), Taneja-Bageshwar i wsp. (2008a) oraz Taneja-Bageshwar i wsp. (2008b).

Rysunek 1. Oszacowanie efektywnego stężenia kinin Aedes (EC50) na komórkach CHO-K1 E10 za pomocą testu na płytce wapienno-bioluminescencyjnej. Oś y w krzywych stężenie-odpowiedź uzyskano z jednostek bioluminescencji wyrażonych jako procent maksymalnej odpowiedzi obserwowanej dla każdego peptydu. Punkty danych reprezentują średnią z sześciu powtórzeń uzyskanych podczas trzech niezależnych eksperymentów. Słupki reprezentują błąd standardowy. a) Oszacowanie Aedae-K1 EC50 = 48 nM. b) Oszacowanie Aedae-K2 EC50 = 26 nM. c) Oszacowanie Aedae-K3 EC50 = 16 nM. EC50 Aedae-K3 < EC50 Aedae-K2 < EC50 Aedae-K1; P < 0,05. Analiza statystyczna i wykresy zostały wykonane za pomocą oprogramowania GraphPad Prism 4.0.

Rysunek 2. Porównanie aktywności sześciu analogów kwasu alfa-aminoizomasłowego na linii komórkowej receptora kininy kleszcza wykazującego ekspresję CHO-K1 za pomocą testu na płytce bioluminescencji wapnia. Oś y reprezentuje procent maksymalnych jednostek bioluminescencji dla każdego analogu wyrażony jako procent bioluminescencji obserwowanej przy stężeniu w porównaniu z maksymalną odpowiedzią obserwowaną wśród wszystkich stężeń badanych dla każdego analogu. Analizę statystyczną i wykresy wykonano za pomocą oprogramowania GraphPad Prism 4.0.
Linia komórkowa receptora kleszcza
Linia komórkowa receptora komara
peptydy
EC
50 (nM)
Maksymalna odpowiedź bioluminescencyjna przy 1 mM
EC
50 (nM)
Maksymalna odpowiedź bioluminescencyjna przy 1 mM
AFSWGa (Federacja AFSWGa)
ja
ja
ja
ja
FASWGa (Międzynarodowa Organizacja Pracy)
Okręg wyborczy 586 TGL
5 600 szt.
b.d.
400 szt.
FFAWGa powiedział:
Rozdział 64
12 800 osób
Okręg wyborczy 621 TGL
3 050 szt.
FFSAGa powiedział:
ja
ja
ja
ja
FFSWAa powiedział:
Z numerem 417
10 600 osób
2 800 szt.
1 830 szt.
FFSWGa powiedział:
590 szt.
10 800 TGL
b.d.
525 szt.
Międzynarodowa Grupa Robocza (FSWGa)
ja
ja
ja
ja
FFSWa powiedział:
ja
ja
ja
ja
FFSWG-OH
ja
ja
ja
ja
FFFSWGa powiedział:
259 szt.
13 000 osób
562 JEZDNE
10 000 szt.
FF[Aib]WGa
29
12 700 szt.
445 szt.
9 300 osób
Tabela 1. Szacowane potencje (EC50) i maksymalna odpowiedź bioluminescencyjna wszystkich peptydów badanych na liniach komórkowych transfekowanych receptorami kleszczy i komarów*.
*EC50 szacuje stężenie wymagane do wywołania odpowiedzi o połowie maksymalnej. I: Nieaktywny, jeśli odpowiedź bioluminescencyjna jest mniejsza niż 300 jednostek (poziom komórek transfekowanych tylko wektorem). A: Pozycja, w której odpowiednia reszta w peptydzie FFSWGa została zastąpiona alaniną. N.D.: Analog był testowany, ale albo nie był zbyt aktywny, albo nie był aktywny w dolnych zębach trzonowych, więc nie można było określić EC50.
K-AIB-1
[Aib]FF[Aib]WGa
K-AIB-2
[α MeF]FF[Aib]WGa
K-AIB-3
Ac-R[Aib]FF[Aib]WGa
K-AIB-4
Ac-R[β3F]FF[Aib]WGa
K-AIB-5
[Aib]RFF[Aib]WGa
K-AIB-6
[Aib-Aib-Aib-Aib]RFF[Aib]WGa
Tabela 2. Analogi kininy (K) zawierające kwas aminoizomasłowy (Aib) badane na rekombinowanym receptorze kininowym kleszcza. Ac: acetyl; α mnie: α metylo-fenyloalaniny; β3F: β3 -fenyloalanina; O: Amid.