Wszystkie procedury związane z pobieraniem próbek zostały przeprowadzone zgodnie z wytycznymi instytutu IRB.
1. Przygotowanie bioreaktora
- Wykonaj formy do bioreaktorów
- Pobierz plik CAD (projektowanie wspomagane komputerowo) bioreaktora z dodatkowego pliku CAD lub utwórz niestandardowy projekt.
- Wygeneruj ścieżkę narzędzia CNC (Computer Numerical Control) z modelu 3D za pomocą oprogramowania CAM (Computer-aided manufacturing).
- Obróbka form acetalowych za pomocą frezarki CNC.
- Produkcja bioreaktorów
- Wymieszaj mieszaninę bazy 10:1 z utwardzaczem polidimetylosiloksanu (PDMS, 77 g mieszaniny na 4 platformy/formy).
- Umieść mieszaninę w komorze próżniowej, zamknij wszystkie zawory, włącz podciśnienie i odgazowuj mieszaninę przez co najmniej 30 minut, aż nie pozostaną pęcherzyki powietrza. Wlej mieszaninę do foremek i odgazuj formy w komorze próżniowej przez 1 godzinę.
- Zamknij foremki, tak aby górna połowa formy była we właściwej orientacji. Umieść stalowy sześciokątny pręt na środku i clamp po obu stronach.
- Napełnij górę PDMS.
- Utwardzać foremki w piekarniku o temperaturze 65 °C przez co najmniej 4 godziny.
- Wyjmij platformy z form po schłodzeniu do temperatury pokojowej.
- Wyczyść urządzenia w kąpieli ultradźwiękowej za pomocą 1-godzinnych cykli płynu do naczyń, 400 ml 100% izopropanolu i wody destylowanej.
- Suszyć przez noc w temperaturze 65 °C.
- Namocz szklane szkiełka nakrywkowe w 1% niejonowym poliolu powierzchniowo czynnym przez 30 minut, upewniając się, że nie układają się w stosy, aby wszystkie były odpowiednio pokryte.
- Dobrze spłukać wodą destylowaną i wysuszyć przez noc w temperaturze 65 °C.
- Szklane szkiełka nakrywkowe i platformę PDMS należy traktować środkiem do czyszczenia plazmowego na wysokich obrotach z 6 l/min tlenu przez 1-2 minuty. Po zabiegu połącz je ze sobą, dociskając PDMS do szkiełka nakrywkowego przez co najmniej 30 sekund.
- Autoklawuj połączone urządzenia przed dodaniem komórek.
2. Budowanie zestawu do stymulacji optycznej
- Używając systemu sześcianów klatkowych 30 mm, przymocuj pośrodku zwierciadło dichroiczne 573 nm. Połącz czerwoną diodę LED (Light Emitting Diode) o długości fali 627 nm z długoprzepustowym filtrem wzbudzenia o długości fali 594 nm i przymocuj ją do górnej części kostki, tak aby dioda LED była skierowana w stronę lustra. Następnie przymocuj niebieską diodę LED 488 nm z filtrem wzbudzenia krótkoprzepustowym 546 nm po sąsiedniej stronie kostki, tak aby dioda LED była skierowana w stronę lustra, jak pokazano na schemacie na rysunku 1A.
- Przymocuj przysłonę tęczówki uruchamianą pierścieniowo do dolnej części kostki klatki, aby kontrolować rozmiar oświetlanego obszaru.
- Zasilaj każdą diodę LED za pomocą sterownika LED T-Cube i steruj nią za pomocą płytki Arduino Uno Rev3. Podłącz boczne wejście sterownika LED do wtyczki źródła zasilania, podłącz środkowe wyjście do Arduino i podłącz boczne wyjście bezpośrednio do diod LED.
- Podłącz Arduino Uno do komputera za pomocą USB.
- Pobierz pliki z linku GitHub (https://github.com/ofvila/NMJ-function-analysis).
- Otwórz plik "Optical_Stimulation_Ramp_Arduino.ino" z folderu GitHub.
- Ustaw parametry początkowe: Steps = 30; startFrequency = 0,5; endFrequency = 3; pulseLength = 100.
- Upewnij się, że wyjście pin 4 jest przypisane do sterownika niebieskiej diody LED, a wyjście pinu 2 jest przypisane do sterownika czerwonej diody LED. Sprawdź, czy środkowe przewody sterownika LED są podłączone do masy i do odpowiedniego wyjścia pinowego.
- Skompiluj i załaduj program "Optical_Stimulation_Ramp_Arduino.ino" do Arduino.
- Podłącz każdy sterownik LED do odpowiedniego kanału.
3. Konfiguracja hodowli komórkowej (dzień -21-0)
- Pierwotne komórki mięśni szkieletowych
- Rozmrażaj i rozszerzaj pierwotne mioblasty szkieletowe (uzyskane z miozytu Cooka) przez maksymalnie sześć pasaży przy użyciu miotonicznej pożywki wzrostowej (+ suplement). Utrzymuj komórki w inkubatorze w inkubatorze ustawionym na 37 °C i 5% CO2 .
- Zmieniaj nośnik co 2 dni.
- Gdy komórki zlewają się w około 60%, przepuść je za pomocą 0,05% trypsyny-EDTA (1x, przez 5 minut w temperaturze 37 °C). Zbierz zdysocjowane komórki i dodaj świeże podłoże, aby zneutralizować trypsynę.
- Odwirować komórki przy 300 x g i zassać supernatant powyżej osadu komórkowego.
- Ponownie zawiesić komórki za pomocą MGM i wysiewać nasiona w stosunku 1:3 z 60 ml na kolbę trójwarstwową.
- ChR2-hiPSC
nuta: Wszystkie linie komórkowe do tej pracy zostały stworzone i wykorzystane zgodnie z wytycznymi instytucjonalnymi Columbia University, NY, USA. W tym protokole hiPSC z ekspresją ChR2 zostały wygenerowane poprzez edycję genomu CRISPR-Cas9 przy użyciu wcześniej opisanych metod18, ale w ten sam sposób można wykorzystać dowolne stabilne optogenetyczne linie komórkowe (lentiwirusowe, piggyBac itp.). Wybrano konstytutywne promotory ulegające ekspresji zarówno w iPSC, jak i w neuronach ruchowych (CAG). Stwierdzono, że komórki mają zdrowe kariotypy, jak zauważono w poprzednich publikacjach.
- Pokryć płytki 6-dołkowe 1 ml/basenik rozpuszczonej matrycy błony podstawnej rozcieńczonej w DMEM/F12 (1:80) i inkubować płytki w temperaturze pokojowej przez 1 godzinę.
- Wysiewaj iPSC na powlekanych płytkach 6-dołkowych z 2 ml pożywki do hodowli komórkowych bez podajnika (pożywki iPSC), wymieniając 2 ml pożywki co drugi dzień i pasażując co 5-7 dni. Utrzymuj komórki w inkubatorze ustawionym na 37°C i 5% CO2 .
- Przejście
- Dysocjację komórek macierzystych należy przeprowadzić poprzez inkubację z 1 ml bezenzymatycznego odczynnika uwalniającego komórki macierzyste przez 4 minuty i mechaniczne ścinanie ich pipetą P1000 z szeroką końcówką.
- Komórki nasienne w stosunku 1:24 lub 1:48 w pożywce iPSC z 2 μM dichlorowodorku Y-27632 w 2 ml / basenie na powlekane płytki 6-dołkowe.
4. Wysiewanie tkanki mięśni szkieletowych (dzień -3)
- Wyizoluj i policz 30 x 106 mioblastów za pomocą automatycznego licznika komórek.
- Ponownie zawiesić mioblasty w mieszaninie 4:1 3 mg/ml kolagenu I i rozpuszczonej macierzy błony podstawnej (800 μl mieszaniny kolagenu + 200 μl matrycy błony podstawnej, aby osiągnąć końcową objętość 1 ml). W przypadku składnika kolagenowego dodać dołączony środek neutralizujący (mieszanina kolagenu z neutralizacją w stosunku 9:1) i rozcieńczyć mieszaninę 1x PBS, aby uzyskać objętość 800 μL.
- Dodać 15 μl zawiesiny kolagenu komórkowego do każdej komory mięśniowej bioreaktora, upewniając się, że zawiesina została rozprowadzona na obu filarach za pomocą końcówki pipety (ryc. 2).
- Pozostawić mieszaninę komórkowo-żelową do polimeryzacji w temperaturze 37 °C przez 30 minut, a następnie napełnić każdy bioreaktor 450 μl miotonicznej pożywki wzrostowej.
- Po 3 dniach (po zagęszczeniu żelu) rozpocznij różnicowanie rurki mięśniowej.
5. Różnicowanie Myotube (dni 0-14)
- Infuzję rurki mięśniowej należy rozpocząć od przestawienia tkanek na 450 μl pożywki indukującej fuzję (FS, Tabela 1) przez 7 dni, zmieniając pożywkę co drugi dzień.
nuta: Spróbuj rozpocząć różnicowanie miotubki w tym samym dniu, w którym różnicowanie motoneuronów od hiPSC, aby zasiać motoneurony na końcu schematów różnicowania obu typów komórek.
- W 7 dniu zmienić pożywkę na 450 μl pożywki dojrzewającej Ia (MMIa, Tabela 1).
- W dniu 9 należy zmienić na 450 μl pożywki dojrzewającej Ib (MMIb, Tabela 1).
- W 11 dniu zmień pożywkę na 450 μl NbActiv4. Zmieniaj pożywkę co 2 dni, aż neurony ruchowe zostaną wysiane (krok 7).
6. Różnicowanie motoneuronów (dni 0-14)
- W dniu 0 przenieś 4 x 106 ChR2- hiPSC na szalkę Petriego o bardzo niskim przyczepie z 15 ml pożywki do hodowli zawiesiny neuronów ruchowych (MSCM, Tabela 1). Uzupełnij MSCM 3 μM CHIR99021, 0,2 μM LDN193189, 40 μM SB431542 hydratu i 5 μM dichlorowodorku Y-27632.
- W dniu 2 wyizoluj neurosfery (NS) za pomocą odwracalnego sitka 37 μM i ponownie plateruj w 15 ml MSCM z 3 μM CHIR99021, 0,2 μM LDN193189, 40 μM SB431542 hydratem i 0,1 μM kwasu retinowego. Po 2 dniu NS powinien być widoczny na szalce Petriego bez użycia mikroskopu.
- W 4 dniu przenieś komórki i pożywkę do probówki o pojemności 50 ml i pozwól neurosferom osiąść na dnie (5 min). Odessać supernatant i ponownie zawiesić komórki w 15 ml MSCM uzupełnionym 0,5 μM SAG, 0,2 μM LDN193189, 40 μM SB431541 i 0,1 μM kwasu retinowego.
- W dniu 7 powtórz krok 6.3, ale ponownie zawieś komórki w 15 ml MSCM uzupełnionym 0,5 μM SAG i 0,1 μM kwasu retinowego.
- W dniu 9 powtórz krok 6.3, ale ponownie zawieś komórki w 15 ml MSCM uzupełnionym 10 μM DAPT.
- W dniu 11 powtórz krok 6.3, ale ponownie zawieś komórki w 15 ml MSCM uzupełnionym 20 ng/ml BDNF i 10 ng/ml GDNF.
- W dniu 14 umieść motoneurony na platformie.
7. Zasiewanie agregatów motoneuronów w bioreaktorze (dzień 14)
- Przygotuj żelową mieszaninę 4:1 2 mg/ml kolagenu I i Matrigelu (800 μl mieszanki kolagenu + 200 μL Matrigel, aby osiągnąć końcową objętość 1 ml). W przypadku składnika kolagenowego dodać towarzyszący środek neutralizujący (mieszanina kolagenu z neutralizatorem w proporcji 9:1) i rozcieńczyć mieszaninę 1x PBS, aby uzyskać końcową objętość 800 μL.
- Użyj sitka komórkowego o długości fali 400 nm, aby wybrać duże neurosfery i ponownie zawiesić je w mieszaninie żelu.
- Odessać pożywkę ze zbiornika i ostrożnie ze studni neurosfery (ryc. 2).
- Dodać 15 μl mieszaniny żelu do kanału neurosfery.
- Załaduj pipetę o pojemności 10 μl z 10 μl żelu, a następnie wybierz jedną neurosferę.
- Umieść NS w kanale neurosfery i upewnij się, że NS znajduje się w komorze. Powoli podnieś pipetę, jednocześnie uwalniając pozostały żel po nałożeniu NS. Jeśli nie masz pewności, czy NS został prawidłowo zdeponowany, sprawdź jego lokalizację za pomocą mikroskopu.
- Pozostawić żel do polimeryzacji przez 30 minut w temperaturze 37 °C.
- Do zbiorników dodać 450 μl NbActiv4 uzupełnionego 20 ng/ml BDNF i 10 ng/ml GDNF.
- Zmieniaj podłoże co drugi dzień, aby umożliwić wzrost aksonów od NS do tkanki mięśniowej.
8. Jednoczesna stymulacja optyczna i nagrywanie wideo z funkcją NMJ (dzień 24+)
- Do obrazowania należy użyć odwróconego mikroskopu fluorescencyjnego z naukową kamerą typu sCMOS (Complementary metal-oxide-semiconductor).
- Ustaw grupowanie oprogramowania aparatu na 2x2, ekspozycję na 20 ms, włączoną migawkę typu rolling shutter, częstotliwość odczytu na 540 MHz, zakres dynamiki: 12-bit i wzmocnienie 1 oraz tryb czujnika: nakładanie się.
- Użyj obiektywu 2x na mikroskopie, aby zobrazować mikrotkanki.
- Podłączyć komorę z żywymi komórkami (37 °C, 5% CO2 ) do stolika mikroskopu.
- Wybierz obszar zainteresowania (ROI), który zawiera unerwioną tkankę tkanek szkieletowych, aby zminimalizować rozmiar pliku i czas przetwarzania.
- Umieść długoprzepustowy filtr emisyjny 594 nm między próbką a obiektywem obrazowania, aby odfiltrować impulsy światła niebieskiego z kamery.
- Umieść prostokątną 4-dołkową płytkę zawierającą 4 bioreaktory (24 tkanki) w komorze na żywe komórki.
- Kliknij opcję Live View (Podgląd na żywo). Wyśrodkuj i ustaw ostrość obrazu z żądanym zwrotem akcji.
- Przekaż niestandardowy kod makra z folderu GitHub (https://github.com/ofvila/NMJ-function-analysis), aby sterować pozycją stołu montażowego, płytą Arduino i akwizycją wideo.
- Ustaw film wyjściowy jako day_tissue group_tissue name_experiment.nd2.
- Uruchom kod makra z żądanymi współrzędnymi X,Y ustawionymi na stole montażowym i uzyskaj szybki upływ czasu z 1700 klatkami przy 50 klatkach / s.
- Po obrazowaniu należy wymienić pożywkę i umieścić próbki z powrotem w inkubatorze. Odczekaj co najmniej 24 godziny między sesjami pozyskiwania obrazu, aby uniknąć zmęczenia tkanek.