W niniejszym artykule omówiono trzy kluczowe elementy uznawane za krytyczne dla pomyślnego przeprowadzenia badań w dziedzinie neuronauki behawioralnej: (1) reprezentatywny i walidacyjny model zwierzęcy; (2) dokładny i czuły protokół immunocytochemiczny oraz (3) właściwą analizę (obserwacyjną i statystyczną) danych behawioralnych oraz mózgowych. Błędy w choćby jednej z tych kategorii z pewnością wpłyną negatywnie na wyniki całego badania. Dlatego po starannym wyborze odpowiedniego modelu zwierzęcego należy poświęcić znaczną uwagę testom pilotażowym procedur behawioralnych i histologicznych, aby zapewnić rzetelną obserwację zachowań w badaniu, a następnie prawidłowe przetworzenie mózgów.
Jak wspomniano wcześniej, wykorzystanie gatunków porównawczych do identyfikacji mechanizmów neurobiologicznych konkretnej reakcji jest cennym podejściem metodologicznym, ponieważ technika ta nie wymaga inżynierii genetycznej ani bolesnych manipulacji chirurgicznych. W związku z tym podejście to pozwala na wykorzystanie zwierząt nienaruszonych i mniej zagrożonych. Wykorzystanie naturalnych wariacji zwierząt jest jednak wzmacniane przez wprowadzenie środowisk przypominających naturalne, nawet jeśli zwierzęta są przetrzymywane w laboratorium. Ponadto zaleca się wykonanie kolejnego kroku, jakim jest rozszerzenie badań laboratoryjnych na warunki terenowe w celu dalszej walidacji autentyczności różnic międzygatunkowych w badanym zachowaniu. Chociaż podejście porównawcze oferuje wiele zalet, ograniczeniem jest korelacyjny charakter danych; w konsekwencji należy zastosować dodatkowe techniki, takie jak manipulacje farmakologiczne, aby dalej potwierdzić rolę ukierunkowanych systemów neurobiologicznych w analizowanym zachowaniu.
Po upewnieniu się badaczy co do poprawności procedur behawioralnych, histologicznych i statystycznych, należy zadbać o to, aby warunki bytowe zwierząt pozostały stałe dla wszystkich grup, z wyjątkiem oczywiście manipulacji eksperymentalnej. Zmiany zmiennych takich jak harmonogramy oświetlenia, poziom hałasu, opiekunowie, poziom wilgotności i zapachy w laboratorium mogłyby mieć istotny wpływ na odpowiedzi neurobiologiczne zwierząt.
W niniejszym artykule przeciwciało pierwszorzędowe zostało wykorzystane do wykrywania wazopresyny, jednak można zastosować inne przeciwciała pierwszorzędowe dla wielu różnych interesujących neurochemikaliów. Jeśli badacz pracuje z nowym przeciwciałem, ważne jest przeprowadzenie badań miareczkowania w celu ustalenia optymalnego rozcieńczenia nowego przeciwciała. Bardzo często stosuje się zbyt dużą ilość przeciwciała (zgodnie z sugestią producenta), co skutkuje zbyt ciemnym zabarwieniem tkanki, uniemożliwiającym odróżnienie sygnału; ponadto nadmierne zużycie przeciwciał wiąże się z wysokimi kosztami.
Wreszcie, jeśli do przedstawienia alternatywnych ujęć i interpretacji danych można zastosować więcej niż jedną analizę statystyczną, należy z nich skorzystać. W niniejszym badaniu wykorzystano ogólne modele liniowe, analizy korelacyjne oraz wielowymiarowe skalowanie, aby uzyskać najbardziej informacyjne ujęcia danych.