1. Przygotowanie komórek bakteryjnych
- Wysiać bakterie fluorescencyjne z zapasu w glicerolu (np. S. Typhimurium ekspresujące GFP) na płytkę z agarem LB zawierającym 100 μg/ml ampicyliny.
- Hodować pojedynczą koloni z agaru LB przez noc w 2 ml świeżej pożywki LB.
- Dodać 0,5 ml hodowli bakteryjnej do 4,5 ml świeżej pożywki LB i inkubować do osiągnięcia gęstości optycznej 1,0 przy 600 nm.
- Zebrać komórki bakteryjne poprzez wirowanie (3,000 x g, 5 min, 4°C).
- Odlać nadsącz i dwukrotnie przemyć osad 5,0 ml sterylnego roztworu soli fizjologicznej z fosforanem (PBS).
- Resuspendować osad bakteryjny w 5 ml PBS i wykorzystać 50 μl zawiesiny zawierającej około 107 jednostek tworzących kolonie (CFU) jako inokulum.
- W przypadku użycia bakterii znakowanych fluorescencyjnie, komórki bakteryjne znakowano odczynnikiem do znakowania fluorescencyjnego zgodnie ze standardowym protokołem.
2. Znieczulenie
- Napełnić niewielkie plastikowe pudełko (10 x 10 x 5 cm) 5% (v/v) odparowanego izofluranu zmieszanego z powietrzem (przepływ: 200 ml/min).
- Zanestetyzować myszy samce lub samice w wieku od ośmiu do szesnastu tygodni w pudełku.
- Po znieczuleniu przenieść myszy na stół sekcyjny.
- Podtrzymać znieczulenie myszy, stosując 2% (v/v) odparowany izofluran zmieszany z powietrzem (przepływ: 200 ml/min) (Rysunek 1). Jest to procedura terminalna.
3. Analiza pętli z podwiązanymi kępkami Peyera
- Naciąć skórę brzucha na 1 cm, a następnie rozciąć otrzewnę brzuszna u znieczyszonej myszy i wyciągnąć jelito cienkie zawierające kępki Peyera.
- Podwiązać jelito nicią chirurgiczną, uważając, aby nie uszkodzić naczyń krwionośnych. Uwaga: należy podwiązać tylko jedną stronę jelita, pozostawiając drugą stronę wolną.
- Za pomocą strzykawki wstrzyknąć 50 μl zawiesiny bakteryjnej lub PBS (kontrola) do podwiązanej pętli kępki Peyera od strony wolnej jelita (Rycina 2).
- Podwiązać stronę wolną i zamknąć brzuch myszy za pomocą klipsa.
- Po 1 h usunąć podwiązaną pętlę kępki Peyera, a następnie uśmiercić mysz poprzez zwichnięcie szyi.
- Wyciąć kępkę Peyera z podwiązanej pętli.
- Przepłukać stronę apikalną kępki Peyera 1 ml PBS za pomocą strzykawki z igłą, aby usunąć nadmiar płynu śluzówkowego i bakterii. Przepłukać kępkę Peyera dodatkowo dwa razy.
4. Barwienie całego preparatu i analiza mikroskopowa kłaczków Peyer'a za pomocą mikroskopu konfokalnego
- Utkwić kępki Peyerów w roztworze BD Cytofix/Cytoperm na lodzie przez 1 hr.
- Przemyć kępki Peyerów trzy razy 1 ml buforu BD Perm/Wash przez 5 min, a następnie zablokować 1 ml buforu blokującego zawierającego 0,1% (w/v) saponiny i 0,2% (w/v) BSA w PBS przez 30 min na lodzie.
- Do preparatu dodać 200-krotnie rozcieńczone przeciwciało monoklonalne anty-mysie GP2 (5 μg/ml) w celu detekcji komórek M.
- Inkubować przez 2 hrs w temperaturze pokojowej lub przez noc w 4°C.
- Przemyć trzy razy 1 ml zimnego PBS, a następnie do preparatu dodać 200-krotnie rozcieńczone przeciwciało anty-szczurze IgG sprzężone z DyLight549 (20 μg/ml).
- Inkubować próbkę na lodzie przez 2 hrs.
- Przemyć trzy razy 1 ml zimnego PBS, a następnie do preparatu dodać 50-krotnie rozcieńczoną faloidynę sprzężoną z Alexa 633 w celu detekcji F-aktyny.
- Inkubować na lodzie przez 2 hrs.
- Przemyć delikatnie 1 ml zimnego PBS. Następnie umieścić trzy do czterech okrągłych szkiełek nakrywkowych na preparacie i zatopić preparaty w 30% roztworze glicerolu w PBS na szkiełku (Rycina 3).
- Obserwować preparaty przy użyciu konfokalnego mikroskopu laserowego DM-IRE2 lub mikroskopu dekonwolucyjnego DeltaVision Restoration.
5. Reprezentatywne wyniki:
Przykładowy preparat z analizy pętli kępki Peyera myszy z podwiązaniem z zastosowaniem GFP-S. Typhimurium był obserwowany przy użyciu mikroskopu dekonwolucyjnego DeltaVision Restoration (Rysunek 4). GFP-S. Typhimurium jest transportowane przez transcytozę przez komórki M GP2+. Analiza pętli jelitowej kępki Peyera myszy pozwala zidentyfikować rodzaje bakterii komensalnych lub patogennych, które mogą być transportowane przez transcytozę przez komórki M.

Rysunek 1. Anestezja myszy z wykorzystaniem odparowanego izofluranu. Odparowany izofluran był dostarczany za pomocą dedykowanego aparatu do anestezji (lewa strona).

Rysunek 2. Podsumowanie testu pętli jelitowej z podwiązanym kęcikiem Peyera. Zawiesinę fluorescencyjnych bakterii wstrzyknięto za pomocą strzykawki do podwiązanej pętli z kęcikiem Peyera po luźnej stronie jelita.

Rycina 3. Montaż preparatów. Preparaty zatopiono w 30% roztworze glicerolu w PBS na specjalnym szkiełku, w którym perforowana plastikowa płytka (o grubości 1 mm) została przymocowana do szkiełka przedmiotowego za pomocą substancji klejącej.

Rysunek 4. Przykład testu pętli z podwiązaną kępką Peyera u myszy z użyciem GFP-S. Typhimurium. Marker GP2, uznawany za specyficzny marker komórek M5, został zabarwiony przeciwciałami anty-mysim GP2 (kolor czerwony). Preparat obserwowano za pomocą mikroskopu dekonwolucyjnego DeltaVision Restoration. GFP-wyrażające S. Typhimurium współlokalizowały z GP2 na apikalnej błonie plazmatycznej komórki M oraz w podapikalnych pęcherzykach cytoplazmatycznych (groty strzałek). Góra: widok apikalny. Dół i bok: widoki boczne. Pasek skali: 10 μm.