1. Dysocjacja komórek BTSC
BTSCs pochodzą z istniejących kultur hodowanych w bezserwatkowym medium dla komórek macierzystych w formie neurosfer, których hodowla została opisana wcześniej10, 1.
- Przygotować zawiesinę komórkową z neurosfer pochodzących z BTSC. Neurosfery pochodzące z BTSC zebrać do probówki stożkowej o pojemności 15 ml i odwirować z prędkością 90 rpm przez 5 minut. Szybsze wirowanie może doprowadzić do ścinania i/lub uszkodzenia neurosfer. Nadpłyn odessać, a kulturę neurosfer zawiesić ponownie w 0,5 ml uprzednio ogrzanej Accutase. Roztwór inkubować przez 5-10 minut w temperaturze 37°C, aby umożliwić rozluźnienie neurosfer. Komórki rozbić mechanicznie, wykonując 10-20 delikatnych ruchów pipetą P10, a następnie dodać do komórek 1,5 ml pożywki dla komórek macierzystych w celu neutralizacji Accutase.
- Następnie BTSC odwirować z prędkością 1300 rpm przez 5 minut i zawiesić ponownie w 1 ml pożywki dla komórek macierzystych.
- Z zawiesiny pobrać alikwot o objętości 50 μl i przenieść go do probówki do mikrocentryfugi w celu policzenia komórek. Do probówki Eppendorf dodać 50 μl błękitu trypanowego, a zawiesinę nanieść na komorę liczniczą (hemocytometr) w celu policzenia komórek.
- Jeśli po policzeniu komórek okaże się to konieczne, do zawiesiny BTSC dodać dodatkową ilość pożywki dla komórek macierzystych, aby uzyskać gęstość komórkową na poziomie 20 0 żywych komórek/μl pożywki.
2. Wykonanie dwuwarstwowej matrycy SU-8 i odlewanie stempla PDMS (patrz rycina 1)
Wykorzystujemy litografię optyczną oraz litografię miękką do wytworzenia matrycy z SU-8 i stempla z PDMS, które są niezbędne do montażu urządzeń mikroprzepływowych. W odróżnieniu od standardowej procedury12, nasza matryca z SU-8 składa się z dwóch warstw. Mikrokanały o wysokości 3 μm są odlewane w pierwszej/dolnej warstwie we wcześniejszym etapie procesu, natomiast komory zasiewcze i odbiorcze o wysokości 250 μm znajdują się w drugiej/górnej warstwie. Aby zapewnić prawidłowe połączenie między dwiema komorami hodowlanymi (mikrokanałami a komorami), obie warstwy muszą zostać precyzyjnie wyrównane pod względem położenia. Jednak grubość i nieprzezroczystość drugiej warstwy są na tyle duże, że blokują dostęp markerów referencyjnych/optycznego wyrównywacza do elementów dolnej warstwy. W związku z tym zaprojektowaliśmy maski z markerami referencyjnymi umieszczonymi w zdalnej pozycji. Dzięki temu markery w pierwszej warstwie mogą zostać selektywnie osłonięte podczas wirowania drugiej warstwy. W rezultacie oba poziomy struktur są wytwarzane w jednej matrycy i gotowe do odciśnięcia w formie basreliefu stempla z PDMS.
- Zaprojektować i przygotować dwie fotomaski. Pierwsza maska składa się z dwóch znaczników fiducjalnych i matrycy mikrokanałów (o długości 40 μm i szerokości 10-50 μm) dla pierwszej warstwy. Druga maska składa się z komór wysiewczych i odbiorczych (o długości 2 mm i szerokości 60 μm) dla drugiej warstwy. Obie maski są projektowane w programie Illustrator (Adobe, California), drukowane laserowo na foliach przezroczystych (Thin Metal Parts, Colorado), oczyszczane izopropanolem i suszone powietrzem.
- Wykonać pierwszą warstwę z fotorezystu SU-8 (MicroChem, Massachusetts) zgodnie z instrukcją produktu od dostawcy. Najpierw nałożyć metodą spin-coatingu na wafer nośny (WRS Materials, California) fotorezyst SU-8 (5) o grubości 3 μm, a następnie przeprowadzić wstępne wygrzewanie (soft-baking). Fotorezyst jest następnie naświetlany promieniami ultrafioletowymi i utwardzany z zastosowaniem odpowiedniej maski w kontakcie ścisłym, po czym następuje wygrzewanie końcowe (post-baking) i wywoływanie.
- Nałożyć metodą spin-coatingu drugą warstwę z SU-8 (210) o grubości 250 μm. Aby zapobiec zablokowaniu znaczników fiducjalnych z pierwszej warstwy przez grubą warstwę fotorezystu, obszary te zaklejamy taśmą klejącą przed nałożeniem drugiej warstwy. Następnie taśmę odkleja się, aby odsłonić znaczniki w celu wyrównania.
- Naświetlić drugą warstwę promieniami UV za pomocą drugiej maski. Po odsłonięciu znaczników wyrównania można je łatwo dopasować do znaczników na drugiej masce za pomocą optycznego wyrównywacza masek. Druga warstwa fotorezystu jest następnie naświetlana promieniami ultrafioletowymi i utwardzana w kontakcie ścisłym, po czym następuje wygrzewanie końcowe (post-baking) i wywoływanie.
- Nałożyć powłokę antyadhezyjną na otrzymaną matrycę. Aby ułatwić usuwanie utwardzonego PDMS, matrycę SU-8 można silanizować metodą osadzania z fazy gazowej, aby uzyskać powierzchnię o właściwościach nieprzywierających. Wystarczy umieścić ją w eksykatorze na co najmniej jedną godzinę w próżni z kilkoma kroplami roztworu trichloro(1H,1H,2H,2H-perfluorooctyl)silanu.
- Odlać PDMS z matrycy. Dokładnie zmieszać bazę prepolimeru i utwardzacz PDMS Sylgard 184 (Dow Corning, Michigan) w stosunku 10:1. Umieścić mieszaninę w eksykatorze w celu odgazowania próżniowego, aż do całkowitego usunięcia pęcherzyków powietrza. Wylać mieszaninę na maskę i ponownie odgazować, jeśli pojawiły się nowe pęcherzyki powietrza. Utwardzać formę na poziomej płycie grzejnej przez 2 godziny w temperaturze 90 °C. Po ochłodzeniu do temperatury pokojowej ostrożnie odkleić stempel z PDMS. W ten sposób w PDMS zostają wytrawione kanały hodowlane, gotowe do montażu urządzenia. Matryca nadaje się do wielokrotnego użytku w procesie odlewania, dopóki nie ulegnie pęknięciu lub zużyciu. Powłokę antyadhezyjną należy nałożyć ponownie, gdy powierzchnia odzyska właściwości przylegania.
3. Montaż urządzeń mikroprzepływowych i hodowla komórek (rycina 2)
W celu hodowli komórek stempel z PDMS z wytrawionymi strukturami zostaje przymocowany do szkiełka nakrywkowego, aby utworzyć zamknięte kanały. Tworzone są wloty i wyloty służące do wprowadzania pożywki/mediów. Jednocześnie konieczne jest przeprowadzenie oczyszczania oraz innych procedur w odniesieniu do podłoża szklanego i stempla z PDMS, aby zapewnić biokompatybilność z komórkami.
- Za pomocą wycinaka do biopsji wykonaj otwory tworzące zbiorniki w stemplu z PDMS. Wybieramy średnicę 6 mm. Zbiorniki te służą dwóm celom: przechowywaniu dodatkowych składników odżywczych dla wzrostu komórek oraz umożliwieniu dostępu dla pipety podczas ładowania i aspiracji próżniowej.
- Namocz stempel z PDMS w 70% etanolu przez 30 min, a następnie płucz go wodą dejonizowaną przez kolejne 10 min. Celem jest usunięcie potencjalnych pozostałości organicznych wprowadzonych podczas procesu produkcji oraz zanieczyszczeń z nieusieciowanego PDMS. W innych pracach stosowano bardziej intensywne i gruntowne procesy czyszczenia, takie jak ekstrakcja organiczna13 i ekstrakcja Soxhleta14, jednak w przypadku hodowli BTSC uznaliśmy je za zbędne.
- Sterylizuj stempel z PDMS w autoklawie (121°C, 35 min). Ten etap dodatkowo dopełnia reakcję sieciowania PDMS. Od tego momentu aż do kroku 3.6 wszystkie procedury należy przeprowadzać w warunkach sterylnych.
- Stempel z PDMS umieść na szklanej lamelce, która została wcześniej pokryta poli-L-lizyną.15-17 Następnie pokryj urządzenie lamininą, wypełniając kanał roztworem lamininy przez noc w temperaturze 37°C. Odaspiruj lamininę z urządzenia i przemyj je pożywką dla komórek macierzystych.
- Wprowadź zawiesinę komórkową z kroku 1 do zbiorników i kanałów. Do jednego zbiornika zasiewowego wprowadź 11 μl zdysocjowanych komórek. W razie potrzeby użyj aspiracji próżniowej, aby wprowadzić komórki do komory zasiewowej. Do sąsiedniego zbiornika zasiewowego wprowadź dodatkowe 7 μl komórek. Uwaga: Średnia gęstość komórek wynosi 20,0 komórek/μl pożywki. Po pięciu minutach wypełnij zbiorniki zasiewowe i odbiorcze pożywką.
- Na wierzchu umieść wstępnie autoklawowaną arkusz z PDMS o grubości 0,5-1 mm. Naturalna adhezja powierzchniowa między dwoma kawałkami PDMS zapewni szczelność hodowli komórkowej, przygotowując ją do transportu, inkubacji i obrazowania mikroskopowego.
4. Długoterminowe obrazowanie poklatkowe migracji BTSC z wykorzystaniem systemu BioStation IM (Nikon Instruments Inc, Melville, USA).
Łącząc w jednej obudowie kamerę, oprogramowanie i inkubator, ten system mikroskopowy umożliwia obrazowanie hodowli komórkowych przez wiele dni bez ich zakłócania. Ponadto unikalna konstrukcja silnika przesuwa obiektyw, utrzymując stoлик z próbką w bezruchu podczas korzystania z funkcji odwiedzania punktów. Dzięki temu system ten jest praktyczny do obrazowania eksperymentów równoległych oraz śledzenia lokomocji komórek w badaniach wysokoprzepustowych.
- Poddać Biostation IM wstępnemu wyrównaniu przez 45 minut w celu stabilizacji temperatury, wilgotności i dopływu powietrza. W celu utrzymania odpowiedniej wilgotności w komorze próbki należy umieścić kilka naczyń z wodą.
- Umieścić urządzenie z komórkami w komorze próbki mikroskopu i wycentrować je za pomocą mikropincety.
- Ustawić ostrość, punkty położenia oraz punkty czasowe w oprogramowaniu Biostation i rozpocząć obrazowanie poklatkowe (time-lapse).
5. Reprezentatywne wyniki:
Przykłady wizualnej inspekcji i charakterystyki migracji komórek rakowych z wykorzystaniem kompartymentowego urządzenia mikroprzepływowego przedstawiono na rysunku 3 oraz rysunku 4. Wykorzystano linię komórkową BTSC. Przy obecnej konfiguracji aparatury obrazy fazowe hodowli komórkowej mogą być rejestrowane w sposób ciągły przez okres do 5 dni (rysunek 3) z częstotliwością co 2 sekundy (rysunek 4). Po upływie 5 dni konieczna jest wymiana pożywki w celu uzupełnienia składników odżywczych i usunięcia produktów przemiany materii. Nasz długoterminowy obraz time-lapse pozwala zidentyfikować cykliczną sekwencję sześciu etapów stanu komórek podczas migracji, w oparciu o zmiany morfologiczne. Jak pokazano na rysunku 3, opisano je jako: (i) przedmigracyjny, (ii) inicjacji, (iii) eksploracji ścieżki, (iv) przemieszczania się, (v) eksploracji celu i (vi) pomigracyjny. W komorze odbiorczej komórki o wrzecionowatym kształcie pozostają w stadium (i), podobnie jak w guzach litej masy, gdzie są zdolne do wzrostu, podziału i stopniowej migracji. W miarę zbliżania się do wejścia do mikrokanału, niektóre komórki przechodzą do stadium (ii), w którym powiększają się i tworzą wypustki adhezyjne. Tylko jedna z nich jest w stanie zająć wejście i przejść do stadium (iii), w którym następuje eksploracja kierunku migracji. Po ustaleniu kierunku migracji, komórka przechodzi do stadium (iv), aby przemieszczać się przez mikrokanał ze stałą i wysoką prędkością, co utrzymuje się przez cały odcinek mikrokanału. Na końcu mikrokanału komórka przechodzi do stadium (v), aby eksplorować wolną przestrzeń komory odbiorczej, a następnie do stadium (vi). W mikrokanale siła napędowa migracji jest generowana głównie przez aktywność pęcherzykową (blebbing), jak zilustrowano na rysunku 4, co przypomina ruch komórek ameboidalnych. Proces blebbingu komórkowego i deformacji błony został tutaj w pełni zarejestrowany.

Rycina 1. Schematy wykonania urządzenia mikroprzepływowego. Cały proces przeprowadzono na 3-calowym podłożu z wafla krzemowego przy użyciu zmodyfikowanej techniki miękkiej litografii. 3-μm– wysokie mikrokanały oraz markery wyrównawcze wykonuje się analogicznie jak w pierwszej warstwie. Następnie 250-μmNanosi się grubą warstwę SU-8 metodą spin-coatingu, podczas gdy markery wyrównujące zostają zakryte taśmą klejącą, aby były one później dostępne dla urządzenia do wyrównywania masek bez blokowania widoczności przez gruby fotorezyst. Dzięki temu elementy komory mogą zostać wykonane jako druga warstwa i precyzyjnie wyrównane względem pierwszej warstwy. Następnie z otrzymanego matrycy odlewa się stempel z PDMS.

Rycina 2. Schematy montażu urządzenia i procesu zasiewu komórek. Przestrzeń do hodowli 3D, zamknięta przez PDMS i szklaną lamellkę, składa się z komór, zbiorników i mikrokanałów. Komora zasiewna jest wypełniona kulturą komórek, natomiast komora odbiorcza jest początkowo wypełniona pożywką pozbawioną komórek. Mikrokanały łączące obie komory stanowią ścieżkę migracji komórek ze strony zasiewnej do strony odbiorczej.

Rysunek 3. Migracja BTSC przez mikrokanał. Góra: migawki z filmu poklatkowego przedstawiają migrację pojedynczej komórki (wyróżnionej na zielono) przez 400 μm od strony zasiewu do strony odbiorczej. Cały proces trwa około 2 dni i obejmuje sekwencję zmian morfologicznych komórek. Pasek skali wynosi 40 μmNa dole: schematyczne przedstawienie sześciu etapów migracji. Przed migracją (i): w komorze zasiewczej wrzecionowate i zdolne do podziału komórki stopniowo migrują wzdłuż siebie. Komórki znajdujące się w pobliżu wlotu do mikrokanału konkurują ze sobą poprzez polaryzację ciała komórki i wysuwanie lamellipodiów. Inicjacja (ii): komórka migracyjna o najwyższej zdolności zajmuje wlot do kanału, podczas gdy pozostałe komórki wycofują się. Eksploracja ścieżki (iii): komórka migracyjna przechodzi w tryb ameboidalny o niewielkiej polaryzacji. Ten tryb migracji charakteryzuje się niezwykle wysoką ruchliwością i zdolnością do eksploracji ścieżki we wszystkich kierunkach poprzez tworzenie drobnych wypustek błonowych (blebbing). Przesuwanie się (iv): po wyznaczeniu ścieżki migracji komórka przechodzi w przystosowany tryb ameboidalny, utrzymując dodatkową dużą wypustkę skierowaną do przodu. W ten sposób komórka zachowuje wysoką ruchliwość oraz stały kierunek i prędkość. Eksploracja celu (v): na końcu ścieżki komórka zwalnia i rozwija filopodia, aby przeszukać komorę odbiorczą w poszukiwaniu celu inwazji. Po migracji (vi): po wejściu do komory odbiorczej komórka przybiera kształt gwiazby i zachowuje wysoką ruchliwość, lecz nie posiada określonego kierunku.

Rycina 4. Klatki z filmu time-lapse przedstawiają cykl aktywności blebowania i deformacji błony BTSC: (A-B) inicjacja; (B-D) ekspansja; (D-F) retrakcja. Strzałki i linie krzywe reprezentują odpowiednio kierunek oraz miejsce deformacji błony. Klatki były zbierane co 8 sekund.