-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

PL

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

pl_PL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Neuroscience
VisioTracker, innowacyjne, zautomatyzowane podejście do analizy okulomotorycznej

Research Article

VisioTracker, innowacyjne, zautomatyzowane podejście do analizy okulomotorycznej

DOI: 10.3791/3556

October 12, 2011

Kaspar P. Mueller1, Oliver D. R. Schnaedelbach2, Holger D. Russig2, Stephan C. F. Neuhauss1

1Institute of Molecular Life Sciences,University of Zurich, 2TSE Systems GmbH

Cite Watch Download PDF Download Material list
AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

In This Article

Summary Abstract Introduction Protocol Representative Results Discussion Disclosures Acknowledgements Materials References Reprints and Permissions

Erratum Notice

Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice

Retraction Notice

The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice

Summary

VisioTracker to zautomatyzowany system do ilościowej analizy wizualnej larw i małych dorosłych ryb na podstawie rejestracji ruchów gałek ocznych. Oferuje pełną kontrolę nad właściwościami bodźców wzrokowych i analizę w czasie rzeczywistym, umożliwiając wysokoprzepustowe badania w takich dziedzinach, jak rozwój i funkcjonowanie układu wzrokowego, farmakologia, badania obwodów nerwowych i integracja sensomotoryczna.

Abstract

Badania nad rozwojem i funkcjonowaniem systemu wzrokowego wymagają wymiernych modeli behawioralnych wydajności wizualnej, które są łatwe do wywołania, solidne i łatwe do manipulowania. Odpowiedni model znaleziono w odpowiedzi optokinetycznej (OKR), odruchowym zachowaniu obecnym u wszystkich kręgowców ze względu na wysoką wartość selekcyjną. OKR polega na powolnych ruchach gałek ocznych podążających za bodźcem na przemian z szybko resetującymi się sakkadami. Pomiar tego zachowania jest łatwy do przeprowadzenia u larw danio pręgowanego, ze względu na jego wczesny i stabilny początek (w pełni rozwinięty po 96 godzinach od zapłodnienia (hpf)) oraz korzystanie z dogłębnej wiedzy na temat genetyki danio pręgowanego, od dziesięcioleci jednego z ulubionych organizmów modelowych w tej dziedzinie. Tymczasem analiza podobnych mechanizmów u dorosłych ryb zyskała na znaczeniu, szczególnie w zastosowaniach farmakologicznych i toksykologicznych.

Tutaj opisujemy VisioTracker, w pełni zautomatyzowany, wysokowydajny system do ilościowej analizy wydajności wizualnej. System oparty jest na badaniach przeprowadzonych w grupie prof. Stephana Neuhaussa i został przeprojektowany przez TSE Systems. Składa się z urządzenia unieruchamiającego małe rybki monitorowanego przez wysokiej jakości kamerę wideo wyposażoną w obiektyw zmiennoogniskowy o wysokiej rozdzielczości. Pojemnik na ryby jest otoczony ekranem bębna, na który można rzutować generowane komputerowo wzorce bodźców. Ruchy gałek ocznych są rejestrowane i automatycznie analizowane przez pakiet oprogramowania VisioTracker w czasie rzeczywistym.

Analiza danych umożliwia natychmiastowe rozpoznanie takich parametrów jak czas trwania fazy wolnej i szybkiej, częstotliwość cyklu ruchu, wzmocnienie fazy wolnej, ostrość widzenia i wrażliwość na kontrast.

Typowe wyniki pozwalają na przykład na szybką identyfikację mutantów układu wzrokowego, które nie wykazują widocznych zmian w morfologii typu dzikiego, lub określenie ilościowego wpływu czynników farmakologicznych lub toksycznych i mutagennych na wydajność systemu wzrokowego.

Protocol

1. Hodowla ryb

Zarodki były trzymane i hodowane w standardowych warunkach (Brand 2002) i klasyfikowane zgodnie z rozwojem w ciągu kilku dni po zapłodnieniu (dpf). Do pomiarów wykorzystano dorosłe osobniki i larwy w temperaturze 5 dpf.

2. Procedura eksperymentalna

  1. Przygotowanie instrumentu

Larwy: Larwy ryb zostały zanurzone w 3% wstępnie podgrzanej (28°C) metylocelulozie, aby zapobiec ruchom ciała. Zarodki umieszczono grzbietową stroną do góry w VisioTrackerze, przodem do ekranu. Dorosłe ryby: Ryby zostały krótko znieczulone w 300 mg/l MS-222, umieszczone w urządzeniu unieruchamiającym i umieszczone w VisioTrackerze. Przed rozpoczęciem pomiarów pozostawiono je do odzyskania na 1-2 minuty.

  1. Generowanie wzorców bodźców

Wzorce bodźców składające się z pionowych czarno-białych siatek sinusoidalnych obracających się wokół ryby zostały stworzone przy użyciu zastrzeżonego pakietu oprogramowania. Można je modulować za pomocą pakietu oprogramowania w zależności od kształtu fali, kontrastu, intensywności, prędkości kątowej i częstotliwości przestrzennej. Wzory były wyświetlane na ekranie za pomocą cyfrowego projektora świetlnego zawartego w VisioTrackerze. Przybliżona odległość między rybim okiem a ekranem wynosiła 4,5 cm, a rozmiar projekcji na ekranie wynosił 360 stopni w poziomie i 55 stopni w pionie. W przypadku larw ryb kierunek stymulacji zmieniono z częstotliwością 0,33 Hz w celu zmniejszenia częstotliwości sakkad. Dorosłe ryby były stymulowane jednokierunkowo i brano pod uwagę tylko oko stymulowane w kierunku skroniowo-nosowym, ponieważ prędkość oka z nosa do skroniowego jest ogólnie znacznie niższa i mniej stała (patrz Mueller i Neuhauss, 2010).

  1. Rejestrowanie ruchów gałek ocznych

Obraz głowy ryby w jasnym polu został przesłany do kamery wideo na podczerwień. Oświetlenie ryb w podczerwieni odbywało się od dołu. Kamera rejestrowała obrazy z szybkością odpowiednio 5 klatek/sekundę (larwy) lub 12,5 klatki/sekundę (dorosłe). Obrazy są automatycznie przetwarzane, korygowane i wygładzane w celu uzyskania kształtu oczu. Orientacja oka w stosunku do osi poziomej była następnie określana automatycznie, a prędkość oka była obliczana przez autorski pakiet oprogramowania. Niewielkie ruchy ryb były automatycznie korygowane przez oprogramowanie. Wszystkie zapisy i analizy odbywały się w czasie rzeczywistym.

3. Posteksperymentalne przetwarzanie danych

  1. Surowe pomiary prędkości oczu przefiltrowano pod kątem sakkad w celu wyodrębnienia prędkości wolnofazowej.
  2. Krzywe prędkości oka z filtrem sakkadowym zostały wygładzone przez średnią bieżącą z przesuwanym oknem 7 klatek.
  3. Prędkość oka uśredniono dla ramek o identycznych warunkach bodźca.
  4. W przypadku larw ryb prędkość gałek ocznych była uśredniona dla obu oczu.

4. Reprezentatywne wyniki:

Aby ocenić możliwości VisioTrackera dla larw i dorosłych ryb, przeprowadzono eksperymenty na larwach danio pręgowanego przy 5 dpf i dorosłych danio pręgowanych.

Dla larw Danio pręgowanego wybrano mutanta zderzaka. W tym mutancie komórki nabłonka soczewki ulegają hiperproliferacji, co prowadzi do zmniejszenia rozmiaru soczewki i ektopowej lokalizacji soczewki. Te zmiany morfologiczne znajdują odzwierciedlenie w znacznym zmniejszeniu wrażliwości na kontrast i ostrości wzroku (Schonthaler i wsp., 2010). Rysunek 1 pokazuje różnicę we wrażliwości na kontrast mutantów zderzaków w porównaniu z rodzeństwem typu dzikiego. Mutanty zderzakowe coraz częściej nie dostosowują prędkości gałki ocznej wraz ze spadkiem kontrastu bodźca. Analogicznie, gdy zwiększa się częstotliwość przestrzenna bodźca, tj. zmniejsza się szerokość paska bodźca, mutanty zderzakowe również wykazują obniżoną ostrość widzenia (ryc. 2)

Zależność wizualnych dorosłych ryb danio pręgowanego od warunków środowiskowych została zbadana poprzez poddanie ryb działaniu różnych stężeń alkoholu w wodzie w zbiorniku przez 30 minut, a następnie zmierzenie reakcji optokinetycznej w różnych warunkach bodźca. Dorosłe danio pręgowane wykazują wyraźne zmniejszenie wrażliwości na kontrast, gdy są utrzymywane w rosnącym stężeniu alkoholu (ryc. 3). Podobne, zależne od dawki zmniejszenie ogólnej prędkości gałki ocznej w szerokim zakresie częstotliwości przestrzennych można było zaobserwować, gdy ryby były traktowane zwiększonym stężeniem alkoholu (ryc. 4). Leczenie alkoholizmem w zależności od dawki ponadto zmniejsza sprawność okoruchową przy bardziej wymagających zadaniach, czego przykładem jest zwiększona szybkość bodźca (ryc. 5).

Rysunek 1
Rysunek 1. Prędkość gałki rachunkowej larw danio pręgowanego zależy od kontrastu bodźca. 10 mutantów zderzaków i 10 rodzeństwa typu dzikiego analizowano przy 5 dpf w różnych warunkach kontrastu pasków bodźca. Wykres przedstawia średnią prędkość gałki ocznej ± 1 SEM.

Rysunek 2
Rysunek 2. Prędkość oczu larw danio pręgowanego zależy od częstotliwości przestrzennej. 10 mutantów zderzaków i 10 rodzeństwa typu dzikiego poddano różnym szerokościom pasków bodźcowych przy 5 dpf i przeanalizowano zgodnie z opisem. Wykres przedstawia średnią prędkość gałki ocznej ± 1 SEM.

Rysunek 3
Rysunek 3. Dorosłe danio pręgowane wykazują zależne od stężenia alkoholu zmniejszenie wrażliwości na kontrast. Dorosłe rybki danio pręgowanego utrzymywano w różnych stężeniach alkoholu, jak wskazano, przez 30 minut i analizowano w różnych warunkach kontrastu paska bodźca. Wykres przedstawia średnią prędkość skroniowo-nosową oka ± 1 SEM dla 9 ryb na grupę (z wyjątkiem grupy kontrolnej: n=11).

Rysunek 4
Rysunek 4. Dorosłe danio pręgowane wykazują zależne od stężenia alkoholu zmniejszenie ogólnego ruchu gałek ocznych w szerokim zakresie szerokości pasków bodźców. Dorosłe rybki danio pręgowanego utrzymywano w różnych stężeniach alkoholu, jak wskazano, przez 30 minut i analizowano w różnych warunkach szerokości pasa bodźca. Wykres przedstawia średnią prędkość skroniowo-nosową oka ± 1 SEM dla 9 ryb na grupę (z wyjątkiem grupy kontrolnej: n=11).

Rysunek 5
Rysunek 5. Dorosłe danio pręgowane wykazują zależne od stężenia alkoholu zmniejszenie ogólnego ruchu gałek ocznych w szerokim zakresie prędkości bodźca. Dorosłe danio pręgowane utrzymywano w różnych stężeniach alkoholu, jak wskazano, przez 30 minut i analizowano w różnych warunkach prędkości bodźca. Wykres przedstawia średnią prędkość skroniowo-nosową oka ± 1 SEM dla 9 ryb na grupę (z wyjątkiem grupy kontrolnej: n=11).

Discussion

Oliver D.R. Schnaedelbach i Holger D. Russig są pracownikami firmy TSE Systems GmbH, która produkuje wizualny system śledzenia wydajności wykorzystany w tym artykule. Produkcja tego artykułu była sponsorowana przez TSE Systems GmbH. Stephan C.F. Neuhuass jest pracownikiem Uniwersytetu w Zurychu, który otrzymuje wynagrodzenie od TSE Systems za każdy sprzedany system.

Disclosures

VisioTracker to zautomatyzowany system do ilościowej analizy wizualnej larw i małych dorosłych ryb na podstawie rejestracji ruchów gałek ocznych. Oferuje pełną kontrolę nad właściwościami bodźców wzrokowych i analizę w czasie rzeczywistym, umożliwiając wysokoprzepustowe badania w takich dziedzinach, jak rozwój i funkcjonowanie układu wzrokowego, farmakologia, badania obwodów nerwowych i integracja sensomotoryczna.

Acknowledgements

KPM był wspierany przez EU FP7 (RETICIRC).

Materials

MetylocelulozaSigma-AldrichM0387
Metanosulfonian 3-aminobenzoesanu etylu (MS-222)Sigma-AldrichE10521
Naczynie do hodowli komórkowych 35 mmCorning430165
Pipeta do surowicyGreiner Bio-One612 361
VisioTrackerTSE Systems302060

References

  1. Bahadori, R., Rinner, O., Schonthaler, H. B., Biehlmaier, O., Makhankov, Y. V., Paris, R., Jagadeeswaran, P., Neuhauss, S. C. F. The fade out mutant is a novel genetic model for Hermansky-Pudlak syndrome. Investigative Optical and Visual Sciences. 47, 4523-4531 (2006).
  2. Beck, J. C., Gilland, E., Baker, R., Tank, D. W. Instrumentation for measuring oculomotor performance and plasticity in larval organisms. Methods in Cell Biol. 76, 383-411 (2004).
  3. Brand, M. G. M., Nüsslein-Vollhard, C., Nüsslein-Vollhard, C., Dahm, R. Keeping and raising Zebrafish. Zebrafish, Practical Approach Series. , 7-37 (2002).
  4. Easter, S. S., Nicola, G. N. The development of vision in the zebrafish (Danio rerio). Dev. Biol. 180, 646-663 (1996).
  5. Easter, S. S., Nicola, G. N. The development of eye movements in the zebrafish (Danio rerio). Dev. Psychobiol. 31, 267-276 (1997).
  6. Haug, M. F., Biehlmaier, O., Mueller, K. P., Neuhauss, S. C. F. Visual acuity in zebrafish: behavior and histology. Frontiers in Zoology. 7, 8-8 (2010).
  7. Huang, Y., Neuhauss, S. C. F. The optokinetic response in zebrafish and its applications. Frontiers in Bioscience. 13, 1899-1916 (2008).
  8. Major, G., Baker, R., Aksaya, E., Mensh, B., Seung, H. S., Tank, D. W. Plasticity and tuning by visual feedback of the stability of a neural integrator. Proc Natl Acad Sci U.S.A. 101, 7739-7744 (2004).
  9. Mueller, K. P., Neuhauss, S. C. F. Quantitative Measurements of the optokinetic response in adult fish. J. Neurosci. Meth. 186, 29-34 (2010).
  10. Neuhauss, S. C. F., Biehlmaier, O., Seeliger, M. W., Das, T., Kohler, K., Harris, W. A., Baier, H. Genetic disorders of vision revealed by a behavioral screen of 400 essential loci in zebrafish. J. Neurosci. 19, 8603-8615 (1999).
  11. Qian, H., Zhu, Y., Ramsey, D. J., Chappell, R. L., Dowling, J. E., Ripps, H. Directional asymmetries in the optokinetic response of larval zebrafish. Zebrafish. 2, 189-196 (2005).
  12. Renninger, S. L., Gesemann, M., Neuhauss, S. C. F. Cone arrestin confers cone vision of high temporal resolution in zebrafish larvae. Eur. J. Neurosci. 33, 658-667 (2011).
  13. Rick, J. M., Horschke, I., Neuhauss, S. C. F. Optokinetic behavior is reversed in achiasmatic mutant zebrafish larvae. Curr. Biol. 10, 595-598 (2000).
  14. Rinner, O., Rick, J. M., Neuhauss, S. C. F. Contrast sensitivity, spatial and temporal tuning of the larval zebrafish optokinetic response. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 46, 137-142 .
  15. Rinner, O., Makhankov, Y. V., Biehlmaier, O. S., Neuhauss, C. F. Knockdown of cone specific kinase GRK7 in larval zebrafish leads to impaired cone-response recovery and delayed dark adaptation. Neuron. 47, 231-242 (2005).
  16. Roeser, T., Baier, H. Visuomotor behaviors in larval zebrafish after GFP-guided laser ablation of the optic tectum. J. Neurosci. 23, 3726-3734 (2003).
  17. Schonthaler, H., Fleisch, V. C., Biehlmaier, O., Makhankov, Y. M., Rinner, O., Bahadori, R., Schwarz, H., Neuhauss, S. C. F., Dahm, R. The zebrafish mutant leberkn del/vam6 resembles human multi-systemic disorders caused by aberrant trafficking of endosomal vesicles. Development. 135, 387-399 (2008).
  18. Schonthaler, H. B., Franz-Odendaal, T. A., Hodel, C., Gehring, I., Schwarz, H., Neuhauss, S. C. F., Dahm, R. The zebrafish mutant bumper shows a hyperproliferation of lens epithelial cells and fibre cell degeneration leading to functional blindness. Mech. Dev. 127, 203-219 (2010).
  19. Schonthaler, H. B., Lampert, J. M., Lintig, J. v. o. n., Schwarz, H., Geisler, R., Neuhauss, S. C. F. A mutation in the pmel17 gene leads to defects in melanosome biogenesis and alterations the visual system in the zebrafish mutant fading vision. Developmental Biology. 284, 231-242 (2005).

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission

Play Video

VisioTracker, innowacyjne, zautomatyzowane podejście do analizy okulomotorycznej
JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code