Artykuł metodologiczny

Proste urządzenia mikrofluidyczne do in vivo Obrazowanie C. elegans, Muszka owocówka oraz danio pręgowany

DOI:

10.3791/3780

30 września 2012

W tym artykule

Podsumowanie

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Opracowano proste urządzenie mikrofluidyczne do obrazowania in vivo bez użycia środków znieczulających dla C. elegans, nienaruszonych larw Drosophila oraz larw rybek danio. Urządzenie wykorzystuje odkształcalną membranę z PDMS do unieruchomienia tych organizmów modelowych w celu wykonania obrazowania poklatkowego licznych procesów, takich jak bicie serca, podział komórkowy i podkomórkowy transport neuronalny. Prezentujemy zastosowanie tego urządzenia i pokazujemy przykłady różnych typów danych zebranych z różnych systemów modelowych.

Streszczenie

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Mikrofabrykowane urządzenia fluidyczne zapewniają dostępny mikrośrodowisko do badań in vivo na małych organizmach. Proste procesy fabrykacji urządzeń mikrofluidycznych są dostępne dzięki technikom soft litografii 1-3. Urządzenia mikrofluidyczne były wykorzystywane do obrazowania subkomórkowego 4,5, laserowej mikrochirurgii in vivo 2,6 oraz obrazowania komórkowego 4,7. Obrazowanie in vivo wymaga unieruchomienia organizmów. Osiągano to za pomocą ssania 5,8, kanałów zwężających się 6,7,9, odkształcalnych membran 2-4,10, ssania z dodatkowym chłodzeniem 5, gazów anestetycznych 11, żeli wrażliwych na temperaturę 12, kleju cyjanoakrylowego 13 oraz środków anestetycznych, takich jak lewamisol 14,15. Powszechnie stosowane środki anestetyczne wpływają na przekaźnictwo synaptyczne 16,17 i wiadomo, że mają szkodliwy wpływ na subkomórkowy transport neuronalny 4. W niniejszym badaniu prezentujemy urządzenie oparte na membranie z poli(dimetylosiloksanu) (PDMS), które pozwala na unieruchomienie bez użycia środków anestetycznych nienaruszonych genetycznych organizmów modelowych, takich jak Caenorhabditis elegans (C. elegans), larwy Drosophila oraz larwy danio pręgowanego. Organizmy modelowe te nadają się do badań in vivo w urządzeniach mikrofluidycznych ze względu na ich niewielkie średnice oraz optycznie przezroczyste lub półprzezroczyste ciała. Średnice ciała wynoszą od ~10 μm do ~800 μm dla wczesnych stadiów larwalnych C. elegans oraz larw danio pręgowanego i wymagają urządzeń mikrofluidycznych o różnych rozmiarach w celu osiągnięcia pełnego unieruchomienia dla obrazowania time-lapse o wysokiej rozdzielczości. Organizmy te są unieruchamiane za pomocą ciśnienia przyłożonego przez sprężony azot przez kolumnę cieczy i obrazowane przy użyciu mikroskopu odwróconego. Zwierzęta uwolnione z pułapki powracają do normalnej lokomocji w ciągu 10 min.

Prezentujemy cztery zastosowania obrazowania poklatkowego u C. elegans, mianowicie: obrazowanie transportu mitochondriów w neuronach, transportu pęcherzyków presynaptycznych u mutanta z defektem transportu, transportu receptorów glutaminianu oraz podziału komórek neuroblastów Q. Dane uzyskane z takich filmów wykazują, że immobilizacja mikrofluidyczna jest użyteczną i dokładną metodą pozyskiwania danych in vivo dotyczących zdarzeń komórkowych i subkomórkowych w porównaniu do zwierząt poddanych anestezji (Rycina 1J i 3C-F 4).

Wymiary urządzenia zostały zmienione, aby umożliwić obrazowanie typu time-lapse różnych stadiów rozwoju C. elegans, larw Drosophila pierwszego stopnia oraz larw zebrafish. Transport pęcherzyków znakowanych synaptotagminą z GFP (syt.eGFP) w neuronach sensorycznych wykazuje ukierunkowany ruch markerów pęcherzyków synaptycznych ekspresowanych w cholinergicznych neuronach sensorycznych w nienaruszonych larwach Drosophila pierwszego stopnia. Podobne urządzenie zostało wykorzystane do przeprowadzenia obrazowania time-lapse pracy serca w larwach zebrafish około 30 h po zapłodnieniu (hpf). Dane te pokazują, że opracowane przez nas proste urządzenia mogą być zastosowane w różnych systemach modelowych do badania wielu zjawisk biologii komórki i rozwoju in vivo.

Protokół

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Wytwarzanie matrycy SU8

  1. Zaprojektuj struktury mikrofluidyczne w oprogramowaniu Clewin i wydrukuj je za pomocą plotera laserowego o rozdzielczości 65 024 DPI i minimalnym rozmiarze elementu 8 μm na folii do obwodów drukowanych.
  2. Oczyść płytki krzemowe o wymiarach 2 cm x 2 cm z natywną warstwą tlenku w 20% KOH przez 1 min, a następnie wypłucz w wodzie dejonizowanej; przygotuj jedną płytkę dla warstwy przepływowej i jedną dla odpowiadającej jej warstwy kontrolnej.
  3. Osusz elementy strumieniem azotu, a następnie odwodnij na płycie grzejnej w temperaturze 120 °C przez 4 h. Pozostaw elementy do ostygnięcia do temperatury pokojowej przed przejściem do następnego kroku.
  4. Umieszczaj elementy krzemowe pojedynczo na uchwycie wirówki i włącz próżnię. Pokryj powierzchnie krzemu ~20 μl heksametylodysilazanu (HMDS) i nanieś powłokę za pomocą wirówki SPIN150 przy 500 rpm przez 5 s, a następnie przy 3 000 rpm przez 30 s.
  5. Pokryj całkowicie płytki krzemowe ~1,5 ml SU8-2025 (http://www.microchem.com/Prod-SU82000.htm) i nanieś powłokę za pomocą wirówki SPIN150 przy 500 rpm przez 5 s, a następnie przy 2 000 rpm przez 30 s. Taki protokół wirowania pozwala uzyskać grubość fotorezistu ~40 μm, co jest odpowiednie dla warstw kontrolnych i przepływowych dla wczesnych stadiów larwalnych C. elegans.
  6. Nanieś ~1,5 ml SU8-2050 za pomocą wirówki SPIN150 przy 500 rpm przez 5 s, a następnie przy 2 000 rpm przez 30 s, aby uzyskać grubość fotorezistu ~80 μm, odpowiednią do wytworzenia warstwy przepływowej dla późnych stadiów larwalnych C. elegans, podstawowej warstwy przepływowej dla larw Drosophila/zebrafish oraz ich odpowiednich warstw kontrolnych.
  7. Umieść elementy krzemowe na płycie grzejnej warstwą SU8 skierowaną do góry. Przeprowadź wstępne wypalanie (soft bake) pokrytych elementów krzemowych w temperaturze 65 °C przez 1 min, a następnie w 95 °C przez 10 min. Pozostaw elementy do ostygnięcia do temperatury pokojowej przed przejściem do następnego kroku.
  8. Umieść wstępnie wypalone elementy krzemowe na stole naświetlania powierzchnią pokrytą SU8-2025 skierowaną do góry w stronę lampy UV. Użyj maski fotograficznej z projektem I (L1, Ryc. 1B) oraz projektem II (L2, Ryc. 1B) odpowiednio dla wzoru warstwy przepływowej i kontrolnej dla wczesnych stadiów larwalnych C. elegans. Umieść maskę fotograficzną na warstwie SU8 i upewnij się, że maska ściśle przylega do powłoki. Otwórz migawkę lampy UV i naświetlaj wstępnie wypalone płytki SU8 lampą UV o mocy 200 W przez maskę fotograficzną przez 15 s.
  9. Użyj maski fotograficznej z projektem I (L1, Ryc. 1B) oraz projektem II (L2, Ryc. 1B) na elementach pokrytych SU8-2050 (przygotowanych w kroku 1.6), aby wytworzyć warstwę przepływową i kontrolną dla późnych stadiów larwalnych C. elegans. Użyj maski fotograficznej z projektem I (L1, Ryc. 1C) oraz projektem II (L2, Ryc. 1C) odpowiednio dla podstawowej warstwy przepływowej i warstwy kontrolnej dla larw Drosophila/zebrafish na płytkach pokrytych SU8-2050 (przygotowanych w kroku 1.6). Naświetl powierzchnie SU8 przez maskę fotograficzną lampą UV o mocy 200 W przez 15 s.
  10. Umieść naświetlone elementy krzemowe na płycie grzejnej warstwą powłoki skierowaną do góry. Przeprowadź wypalanie końcowe (post bake) płytek w temperaturze 65 °C przez 1 min, a następnie w 95 °C przez 10 min. Pozostaw elementy do ostygnięcia przed przejściem do następnego kroku.
  11. Wywołaj elementy, używając roztworu wywoływacza SU8 przez 20 min. Wypłucz elementy w alkoholu izopropylowym (IPA) i osusz strumieniem azotu.
  12. Umieść elementy krzemowe w desykatore z wzorem SU8 skierowanym do góry. Powlekaj elementy oparami 50 μl trichloroo(1H,1H,2H,2H-perfluorooktylo)silanu w desykatorze przez 2 h.

Środki ostrożności: Należy przestrzegać zasad bezpieczeństwa podczas obchodzenia się z odczynnikami chemicznymi w trakcie traktowania KOH, nakładania i wywoływania fotorezystu. Powlekanie oparami silanu powinno być przeprowadzane wewnątrz eksykatora w wentylowanym pomieszczeniu. Należy chronić rezyst SU8 przed nadmierną ekspozycją na światło. Przy korzystaniu ze źródła światła UV należy stosować okulary ochronne.

2. Wykonanie formy z PDMS

  1. Przygotuj PDMS w stosunku 10:1, łącząc 50 g bazy Sylgard 184 z 5 g czynnika sieciującego w plastikowym kubku. Mieszaj zawartość ręcznie przez ok. 3 min. Odgazuj mieszaninę w deskryptorze, aby usunąć wszystkie pęcherzyki powietrza powstałe podczas mieszania.
  2. Wlej ostrożnie, aby uniknąć powstawania pęcherzyków powietrza, warstwę mieszaniny PDMS o grubości 5 mm na wafle krzemowe z wzorem SU8 projektu II (warstwa kontrolna). W przypadku powstania pęcherzyków podczas wlewania, odgazuj PDMS na wzorze SU8 w niskiej próżni, aby usunąć wszystkie pęcherzyki.
  3. Umieść wafle krzemowe z wzorem SU8-2025 projektu I (warstwa przepływowa) na uchwycie wirówki i włącz próżnię, aby je ustabilizować. Przykryj wafle ok. 1 ml mieszaniny PDMS i pokryj je za pomocą wirówki SPIN150 przy 500 rpm przez 5 s, a następnie przy 1 500 rpm przez 30 s.
  4. Nanieś ok. 1 ml mieszaniny PDMS na wafle krzemowe z wzorem SU8-2050 o grubości 80 μm projektu I (L1, Rycina 1B), przeznaczone dla warstwy przepływowej dla późnych stadiów larwalnych C. elegans, używając wirówki SPIN150 przy 500 rpm przez 5 s, a następnie przy 1 000 rpm przez 30 s. Nanieś grubą warstwę mieszaniny PDMS na elementy krzemowe z wzorem SU8-2050 warstwy przepływowej projektu I (L1, Rycina 1C) dla larw Drosophila/zebrafish, używając wirówki SPIN150 przy 500 rpm przez 35 s.
  5. Wypal w piecu z konwekcyjnym obiegiem gorącego powietrza w temperaturze 50 °C przez 6 h pokryte PDMS elementy krzemowe projektu I oraz wafle z odpowiadającym im projektem II dla warstwy kontrolnej zawierającej PDMS dla C. elegans i/lub larw Drosophila/zebrafish.
  6. Wytnij element PDMS z podłoża krzemowego zawierającego wzór SU8 II dla C. elegans i/lub larw Drosophila/zebrafish, używając ostrego ostrza. Wywierć mały otwór o średnicy ok. 1 mm nad zbiornikiem łączącym główną pułapkę w formie PDMS za pomocą dziurkacza Harrisa.
  7. Umieść wydziurawiony blok PDMS (zawierający formę o grubości 40 μm dla warstwy kontrolnej L2) na plastikowej tacy, stroną formowaną warstwy kontrolnej do góry. Umieść pokryty PDMS wafel krzemowy zawierający projekt SU8 o grubości 40 μm projektu I na tej samej tacy, stroną pokrytą PDMS do góry. Wsuń tacę do komory urządzenia do plazmowania i włącz próżnię na 2 min. Następnie włącz zasilanie plazmy i obniż ciśnienie w komorze, aż nabierze ona jasno-różowego koloru. Poddaj obie powierzchnie działaniu plazmy powietrznej o mocy 18 W w niskiej próżni przez 2 min.
  8. Umieść wydziurawiony blok PDMS usunięty z matrycy SU8 o grubości 80 μm zawierającej wzór II dla późnych stadiów larwalnych C. elegans lub larw Drosophila/zebrafish na plastikowej tacy, stroną formowaną warstwy kontrolnej do góry. Umieść jednocześnie na tej samej tacy odpowiadającą wypaloną warstwę PDMS naniesioną metodą spin-coatingu na wafel krzemowy zawierający projekt o grubości 80 μm projektu I dla późniejszych stadiów C. elegans lub larw Drosophila/zebrafish, stroną płaską pokrytą PDMS do góry. Zastosuj ten sam protokół opisany powyżej, aby poddać je działaniu plazmy powietrznej.
  9. Złącz dwie powierzchnie potraktowane plazmą dla C. elegans i/lub larw Drosophila/zebrafish, wywierając lekki nacisk, i wypal w piecu z konwekcyjnym obiegiem gorącego powietrza w temperaturze 50 °C przez 2 h.
  10. Wytnij złączone urządzenia z podłoża krzemowego z projektem SU8 projektu I dla C. elegans i/lub larw Drosophila/zebrafish. Wywierć otwory dostępowe w zbiornikach wlotowym i wylotowym kanału przepływowego.
  11. Umieść złączoną formę PDMS dla C. elegans na plastikowej tacy, stroną formowaną projektu warstwy przepływowej do góry. Wyczyść szklaną laseczkę przykrywkową (22 X 22 mm, grubość nr 1) i umieść ją na tej samej plastikowej tacy. Wsuń tacę zawierającą formę PDMS i szklaną laseczkę do komory plazmy. Poddaj dolną powierzchnię PDMS urządzenia oraz szklaną laseczkę działaniu plazmy powietrznej o mocy 18 W przy niskim ciśnieniu przez 2 min. Złącz dwie powierzchnie potraktowane plazmą, wywierając lekki nacisk, i wypal w piecu z konwekcyjnym obiegiem gorącego powietrza w temperaturze 50 °C przez 2 h.
  12. Przechowuj urządzenie w czystym środowisku do przyszłego użycia.

3. Dodatkowe kroki dla urządzenia do Drosophila/zebry

  1. Naraź czystą szklaną powierzchnię o wymiarach 2 cm X 2 cm na 50 μl par trichlorosilanu (1H,1H,2H,2H-perfluorooctylu) w eksykanie przez 2 hr.
  2. Nanieś metodą wirowania ~1 ml mieszaniny PDMS w stosunku 10:1 przygotowanej w kroku 2.1 na sylanizowaną powierzchnię szkła, używając wirówki SPIN150 przy 500 rpm przez 35 sec. Wypal podłoża szklane pokryte PDMS w piecu z wymuszonym obiegiem powietrza w temperaturze 50 °C przez 6 hr, powierzchnią pokrytą skierowaną do góry. Pozostaw warstwę PDMS do ostygnięcia do temperatury pokojowej przed przejściem do następnego kroku.
  3. Wykrawaj w pokrytej warstwie otwór za pomocą specjalnie wykonanego, ostrego metalowego wycinaka w środku PDMS, aby utworzyć warstwę dystansową z PDMS. Kształt metalowego wycinaka jest zaprojektowany analogicznie do projektu przepływu dla Drosophila/danio pręgowanego (L1, Ryc. 1C).
  4. Naraź warstwę dystansową z PDMS oraz blok z pojedynczym wiązaniem (warstwę przepływową i warstwę kontrolną, wykonane w kroku 2.9 dla larw Drosophila/danio pręgowanego) na plazmę powietrzną o mocy 18 Watt przy użyciu oczyszczacza plazmowego w niskiej próżni. Złącz dwie powierzchnie traktowane plazmą i wypal je w piecu z wymuszonym obiegiem powietrza w temperaturze 50 °C przez 2 hr.
  5. Odetnij złączone urządzenie od szkła, wykonaj otwory dostępowe w zbiornikach wlotowym i wylotowym, a następnie przyłącz je do szklanego szkiełka podstawowego (22 X 22 mm, grubość nr 1) przy użyciu oczyszczacza plazmowego, jak opisano w kroku 2.11. W ten sposób powstanie urządzenie do unieruchamiania larw Drosophila pierwszego stadium z wysokością kanału ~500 μm. W przypadku larw danio pręgowanego powtórz proces wytwarzania warstwy dystansowej z PDMS z dodatkowym krokiem łączenia. Podwójna warstwa PDMS-S zapewnia wysokość kanału 900 μm dla 30 hfp larw danio pręgowanego.

Środki ostrożności: Należy unikać zanieczyszczeń pyłem podczas wytwarzania urządzeń. Dwie powierzchnie oczyszczone plazmą muszą być całkowicie wolne od pyłu, aby zapewnić prawidłowe wiązanie. W sytuacjach, gdy nie ma dostępu do specjalistycznego pomieszczenia czystego, urządzenia należy przechowywać w eksykatorze, aby zminimalizować gromadzenie się cząsteczek pyłu w urządzeniach.

4. Wykorzystanie membrany PDMS

  1. Podłącz jeden koniec rurki micro-flex (średnica wewnętrzna ~1,6 mm, średnica zewnętrzna ~4,8 mm) do regulatora zasilania sprężonym azotem, a drugi koniec do zbiornika głównej pułapki za pomocą igły o rozmiarze 18 G (średnica zewnętrzna ~1,25 mm) przyklejonej do rurki. Trzydrożny kurek zamontowany w połowie połączenia rurki umożliwia przyłożenie lub zwolnienie nacisku na membranę.
  2. Wypełnij rurkę podłączoną do urządzenia PDMS słupkiem wody destylowanej o długości 10 cm przed podłączeniem jej do zbiornika głównej pułapki w urządzeniu dla C. elegans i/lub larw Drosophila/rybek danio.
  3. Ustaw zawór zasilania azotem na wartość 14 psi i monitoruj przy niskim powiększeniu mikroskopu odwróconego ugięcie membrany głównej pułapki w stronę kanału przepływowego. Długość słupka wody w rurce micro-flex ulega skróceniu za każdym razem, gdy trzydrożny kurek jest otwarty. Krawędzie ugiętej membrany są widoczne w świetle przechodzącym (Rysunek 1I i 1J). Ugięcie membrany powoduje przemieszczenie cząstek kurzu/pęcherzyków powietrza pod membraną PDMS i wypchnięcie ich do granic kanału.
  4. Odczekaj, aż czoło cieczy całkowicie wypełni mikrokanał, nie pozostawiając uwięzionego powietrza.
  5. Zwolnij ciśnienie za pomocą trzydrożnego kurka, aby membrana powróciła do pozycji spoczynkowej.

5. Wprowadzanie larw C. elegans, Drosophila i danio pręgowanego do urządzenia oraz ich unieruchomienie pod elastyczną membraną PDMS

  1. Wypełnij kanał przepływowy buforem M9 [3 g KH2PO4, 6 g Na2HPO4, 5 g NaCl, 1 ml 1 M MgSO4, H2O do 1 L, sterylizować w autoklawie] dla C. elegans 18 lub 1X PBS [8 g NaCl, 0,2 g KCl, 1,44 g Na2HPO4, 0,24 g KH2PO4, H2O do 1 L, sterylizować w autoklawie] dla larw Drosophila/zebrafish 19 przez 10 min przed eksperymentem.
  2. Zlokalizuj pojedynczego osobnika C. elegans o wymaganym stadium na płytce NGM 18 (lub larwy Drosophila pierwszego stadium z agarowej płytki z jajami lub ręcznie dechorionowane larwy zebrafish 30 hpf w medium płynnym 20) za pomocą stereomikroskopu o niskim powiększeniu. Pobierz pojedynczego osobnika, używając małej objętości roztworu buforowego w mikrokońcówce. W przypadku większych larw Drosophila lub zebrafish w buforze użyj mikrokońcówki z odciętym końcem.
  3. Wprowadź pojedynczy organizm przez wlot kanału przepływowego. Dostosuj ciśnienie pipetowania, aby umieścić osobnika pod główną pułapką.
  4. Powoli zwiększaj ciśnienie membrany PDMS, aby dosunąć zwierzę do krawędzi kanału i unieruchomić je pod ciśnieniem 14 psi dla C. elegans, 7 psi dla Drosophila i 3 psi dla larw zebrafish.
  5. Ustaw unieruchomionego osobnika w centrum pola widzenia mikroskopu. Użyj mikroskopu odwróconego z odpowiednimi ustawieniami dla obrazowania w jasnym polu o wysokiej rozdzielczości lub obrazowania fluorescencyjnego. Wykonaj pojedyncze zdjęcia fluorescencyjne lub serię czasową (time-lapse) z predefined frame rate.
  6. Zwolnij ciśnienie w pułapce i monitoruj lokomocję zwierzęcia przez 5-10 min przy niskim powiększeniu.
  7. Wypłucz zwierzę i wprowadź nowego osobnika, aby powtórzyć powyższe kroki.
  8. Wypłucz wszystkie zwierzęta z rezerwuaru odpadów, używając wody destylowanej podawanej strzykawką. Osusz kanał, przepychając powietrze za pomocą strzykawki w celu ponownego użycia w przyszłości.

Środki ostrożności: Zwierzęta wymagające wyższego ciśnienia pipetowania w celu przemieszczenia się wewnątrz głównego kanału wykazują tendencję do słabej lokomocji/zdrowia po uwolnieniu z pułapki i powinny być pomijane podczas obrazowania. Należy oczyścić kanał przepływowy z wszelkich śladów buforu, aby zapobiec zatykaniu kanału przez kryształy. W przypadku użycia oleju do obrazowania o wysokiej rozdzielczości, należy oczyścić szklane szkiełko zakrywe, aby utrzymać korzystny stosunek sygnału do szumu w kolejnych eksperymentach.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Wyniki

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Urządzenie do unieruchamiania stanowi dwuwarstwowy blok PDMS, wykonany poprzez połączenie dwóch warstw: warstwy przepływowej (warstwa 1) i warstwy sterującej (warstwa 2), jak pokazano na Rysunku 1. Główna pułapka jest połączona z butlą z azotem poprzez regulator i trójdrożny kurek odcinający, aby przyłożyć niezbędne ciśnienie (3-14 psi) na membranę za pomocą kolumny cieczy (Rysunek 1A). Odgięta membrana unieruchamia C. elegans, Drosophila lub larwy ryb zebrafish w kanal...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Dyskusja

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Urządzenia mikrofluidyczne z PDMS są optycznie przezroczyste, co pozwala na ich wykorzystanie do obrazowania in vivo w wysokiej rozdzielczości dowolnego przezroczystego lub półprzezroczystego organizmu modelowego. Nasz projekt nadaje się do czasoprzestrzennego obrazowania zdarzeń komórkowych i podkomórkowych w wysokim powiększeniu u nienaruszonych żywych zwierząt. Mikrotworzywo z wykorzystaniem technik miękkiej litografii umożliwia łatwą manipulację wymiarami urządzenia dla różnych rozmiarów organizmów modelowyc...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Oświadczenia

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Nie zgłoszono żadnych konfliktów interesów.

Podziękowania

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Dziękujemy dr. Krishanu Rayowi za szczepy Drosophila, Tarjani Agarwal za opiekę nad klatką z Drosophila, Peterowi Juo za nuIs25 oraz CGC za szczepy C. elegans. SPK przygotował jsIs609 w laboratorium Michaela Noneta. Dziękujemy Arpanowi Agnihotri (BITS Pilani) za pomoc w obrazowaniu time-lapse transportu mitochondriów u zwierząt jsIs609 w urządzeniach mikrofluidycznych. Jesteśmy wdzięczni dr Vatsali Thirumalai i Surya Prakashowi za dostarczenie embrionów zebrafish. Dziękujemy dr Krishnie oraz CIFF w NCBS za możliwość korzystania z konfokalnego mikroskopu z dyskiem wirującym, wspieranego przez Department of Science and Technology- Centre for Nanotechnology (nr SR/55/NM-36-2005). Dziękujemy również Kaustubhowi Rau, V. Venkatramanowi i Chetanie Sachidanand za dyskusje. Praca ta była finansowana ze stypendium podoktorskiego DBT (S.M.), programu fast-track DST (S.M.) oraz grantu DBT dla (S.P.K.). S.A. otrzymał wsparcie z grantów DST i CSIR przyznanych dla SPK.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Materiały

Lista materiałów użytych w tym artykule
NazwaFirmaNumer katalogowyKomentarze
Wafle krzemoweUniversity wafer150 mm (100) Mech Grade SSP Si
Oprogramowanie ClewinOprogramowanie WieWebWersja 2.90
Ploter laserowyFine Line Imaging65 024 DPI
HMDSSigma-Aldrich440191-100ML
SU8MicrochemSU8-2025, SU8-2050
WywoływaczMicrochemSU8 Developer
SilanSigma-Aldrich448931-10G
PDMSDow corningSylgard 184
Lampa UVOriel66943Lampa rtęciowa Oriel 200W
Piec z nadmuchy powietrzemUltra InstrumentsWykonany na zamówienieUstawiony na 50 °C
Płyta grzewczaIKA Laboratory Equipment3810000http://www.ika.com
Oczyszczacz plazmowyHarrick PlasmaPDC-32G
Wirówka (spinner)Semiconductor Production SystemsSPIN150-NPPwww.SPS-Europe.com
Szklane szkiełko nakrywkoweGold Seal22 X 22 mm, grubość nr 1
C. elegansCaenorhabditis Genetics Center (CGC)e1265, ayIs4
DrosophilaBloomingtonP{chaGAL4}/cyo, UAS-syt.eGFP
Danio pręgowanyIndyjski typ dzikiTyp dziki
Rurka TygonSigmaZ279803
MikroiłaSigmaZ118044Pocięta na odcinki o długości 1 cm
Kurek trójdrożnySigmaS7521
Wykrawacz HarrisaSigmaZ708631
Sprężony azotLokalny dostawca gazówUżyć regulatora do kontroli ciśnienia
StereomikroskopNikonSMZ645
Mikroskop konfokalnyAndor OlympusKonfokalny mikroskop z dyskiem wirującym Yokogawa
ImageJNational Institutes of Healthwww.rsbweb.nih.gov/ijProgram do przetwarzania obrazów oparty na języku Java

Bibliografia

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Whitesides, G. M., Ostuni, E., Takayama, S., Jiang, X., Ingber, D. E. Soft lithography in biology and biochemistry. Annu. Rev. Biomed. Eng. 3, 335-373 (2001).
  2. Guo, S. X. Femtosecond laser nanoaxotomy lab-on-a-chip for in vivo nerve regeneration studies. Nat. Methods. 5, 531-533 (2008).
  3. Gilleland, C. L., Rohde, C. B., Zeng, F., Yanik, M. F. Microfluidic immobilization of physiologically active Caenorhabditis elegans. Nat. Protoc. 5, 1888-1902 (2010).
  4. Mondal, S., Ahlawat, S., Rau, K., Venkataraman, V., Koushika, S. P. Imaging in vivo neuronal transport in genetic model organisms using microfluidic devices. Traffic. 12, 372-385 (2011).
  5. Chung, K., Crane, M. M., Lu, H. Automated on-chip rapid microscopy, phenotyping and sorting of C. elegans. Nat. Methods. 5, 637-643 (2008).
  6. Allen, P. B. Single-synapse ablation and long-term imaging in live C. elegans. J. Neurosci. Methods. 173, 20-26 (2008).
  7. Chronis, N., Zimmer, M., Bargmann, C. I. Microfluidics for in vivo imaging of neuronal and behavioral activity in Caenorhabditis elegans. Nat. Methods. 4, 727-731 (2007).
  8. Rohde, C. B., Zeng, F., Gonzalez-Rubio, R., Angel, M., Yanik, M. F. Microfluidic system for on-chip high-throughput whole-animal sorting and screening at subcellular resolution. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104, 13891-13895 (2007).
  9. Hulme, S. E., Shevkoplyas, S. S., Apfeld, J., Fontana, W., Whitesides, G. M. A microfabricated array of clamps for immobilizing and imaging C. elegans. Lab Chip. 7, 1515-1523 (2007).
  10. Zeng, F., Rohde, C. B., Yanik, M. F. Sub-cellular precision on-chip small-animal immobilization, multi-photon imaging and femtosecond-laser manipulation. Lab Chip. 8, 653-656 (2008).
  11. Chokshi, T. V., Ben-Yakar, A., Chronis, N. CO2 and compressive immobilization of C. elegans on-chip. Lab Chip. 9, 151-157 (2009).
  12. Krajniak, J., Lu, H. Long-term high-resolution imaging and culture of C. elegans in chip-gel hybrid microfluidic device for developmental studies. Lab Chip. 10, 1862-1868 (2010).
  13. Goodman, M. B., Hall, D. H., Avery, L., Lockery, S. R. Active currents regulate sensitivity and dynamic range in C. elegans neurons. Neuron. 20, 763-772 (1998).
  14. Snow, J. J. Two anterograde intraflagellar transport motors cooperate to build sensory cilia on C. elegans neurons. Nat. Cell Biol. 6, 1109-1113 (2004).
  15. Lewis, J. A., Wu, C. H., Berg, H., Levine, J. H. The genetics of levamisole resistance in the nematode Caenorhabditis elegans. Genetics. 95, 905-928 (1980).
  16. Richmond, J. E., Jorgensen, E. M. One GABA and two acetylcholine receptors function at the C. elegans neuromuscular junction. Nat. Neurosci. 2, 791-797 (1999).
  17. Badre, N. H., Martin, M. E., Cooper, R. L. The physiological and behavioral effects of carbon dioxide on Drosophila melanogaster larvae. Comp. Biochem. Physiol. A. Mol. Integr. Physiol. 140, 363-376 (2005).
  18. Stiernagle, T. Maintenance of C. elegans. WormBook. , 1-11 (2006).
  19. Westerfield, M. The zebrafish book. A guide for the laboratory use of zebrafish (Danio rerio). , 4th edn, Univ. of Oregon Press. Eugene. (2000).
  20. Henn, K., Braunbeck, T. Dechorionation as a tool to improve the fish embryo toxicity test (FET) with the zebrafish (Danio rerio). Comp. Biochem. Physiol. C. Toxicol. Pharmacol. 153, 91-98 (2011).
  21. Fatouros, C. Inhibition of tau aggregation in a novel Caenorhabditis elegans model of tauopathy mitigates proteotoxicity. Hum. Mol. Genet. , (2012).
  22. Barkus, R. V., Klyachko, O., Horiuchi, D., Dickson, B. J., Saxton, W. M. Identification of an axonal kinesin-3 motor for fast anterograde vesicle transport that facilitates retrograde transport of neuropeptides. Mol. Biol. Cell. 19, 274-283 (2008).
  23. Craig, M. P., Gilday, S. D., Hove, J. R. Dose-dependent effects of chemical immobilization on the heart rate of embryonic zebrafish. Lab. Anim. (NY). 35, 41-47 (2006).
  24. Pardo-Martin, C. High-throughput in vivo vertebrate screening. Nat. Methods. 7, 634-636 (2010).
  25. Stainier, D. Y., Lee, R. K., Fishman, M. C. Cardiovascular development in the zebrafish. I. Myocardial fate map and heart tube formation. Development. 119, 31-40 (1993).
  26. Hall, D. H., Hedgecock, E. M. Kinesin-related gene unc-104 is required for axonal transport of synaptic vesicles in C. elegans. Cell. 65, 837-847 (1991).
  27. Kumar, J. The Caenorhabditis elegans Kinesin-3 motor UNC-104/KIF1A is degraded upon loss of specific binding to cargo. PLoS Genet. 6, e1001200(2010).
  28. Ou, G., Vale, R. D. Molecular signatures of cell migration in C. elegans Q neuroblasts. J. Cell. Biol. 185, 77-85 (2009).
  29. Levitan, E. S., Lanni, F., Shakiryanova, D. In vivo imaging of vesicle motion and release at the Drosophila neuromuscular junction. Nat. Protoc. 2, 1117-1125 (2007).
  30. Morris, R. L., Hollenbeck, P. J. The regulation of bidirectional mitochondrial transport is coordinated with axonal outgrowth. J. Cell. Sci. 104, 917-927 (1993).
  31. Louie, K., Russo, G. J., Salkoff, D. B., Wellington, A., Zinsmaier, K. E. Effects of imaging conditions on mitochondrial transport and length in larval motor axons of Drosophila. Comp. Biochem. Physiol. A. Mol. Integr. Physiol. 151, 159-172 (2008).
  32. Pilling, A. D., Horiuchi, D., Lively, C. M., Saxton, W. M. Kinesin-1 and Dynein are the primary motors for fast transport of mitochondria in Drosophila motor axons. Mol. Biol. Cell. 17, 2057-2068 (2006).

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Przedruki i uprawnienia

Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE

Poproś o pozwolenie

Tagi

mi kka litografiamembrana PDMSlarwy Drosophilalarwy zebrafishunieruchomienie bez u ycia rodk w znieczulaj cychci nienie gazu azotowegoobrazowanie time lapse

Powiązane artykuły