1. Przygotowanie świeżych roztworów roboczych
- TBS: 0,05 M roztwór soli buforowanej Trisem, pH 7,8 (TBS). Przygotować 60 ml TBS na płytkę mikrotitracyjną.
- PPE: Elastaza trzustkowa świńska, typ 1 (PPE) dostarczana jest w formie zawiesiny. Wstrząsnąć dokładnie i rozcieńczyć PPE w TBS do stężenia około 0,01 U/ml. Przygotować 6 ml roztworu roboczego na płytkę mikrotitracyjną.
- SA3NA: Succinyl-L-Ala-L-Ala-L-Ala-p-nitroanilid (SA3NA). Przygotować 0,1 M roztwór zapasowy SA3NA w dimetylosulfotlenku (DMSO) i użyć natychmiast lub przechowywać w temperaturze -20 °C. Przygotować 6 ml roztworu roboczego na płytkę mikrotitracyjną poprzez rozcieńczenie roztworu zapasowego SA3NA 1/100 w TBS.
- COOMASSIE BLUE: Przygotować 10% roztwór zapasowy Coomassie Brilliant Blue R-250 (Coomassie Blue) w TBS i użyć natychmiast lub przechowywać w temperaturze -20 °C. Przygotować 6 ml roztworu roboczego poprzez rozcieńczenie roztworu zapasowego 1/1000 w TBS.
2. Przygotowanie śliny
- POBIERANIE ŚLINY: W pozycji stojącej pobudź wydzielanie surowicy do śliny, umieszczając w jamie ustnej sialogog, taki jak kwas cytrynowy lub guma do żucia. W przypadku pacjentów z HIV-1, którzy często są bezzębni i nie mogą żuć gumy, wygodnym rozwiązaniem jest bezcukrowy cukierek cytrynowy. Przez pierwsze 3 min połykaj ślinę w razie potrzeby, a przez kolejne 3 min zbieraj ślinę z całej jamy ustnej do zakręcanego kubka. Pozwoli to na uzyskanie około 2 ml śliny. Próbkę należy wykorzystać natychmiast lub przechowywać w temperaturze -80 °C.
- OBRÓBKA ŚLINY: Jeśli próbka była zamrożona, rozmrozić ją w temperaturze 37 °C i umieścić na lodzie. Świeżą lub rozmrożoną próbkę przechowywać w temperaturze 2-4 °C nie dłużej niż przez 3 dni. Nie mieszać śliny w vortexie i unikać pipetowania mucyn, które nie zawierają wysięku surowiczego. Podczas pracy ze śliną należy stosować standardowe środki ostrożności http://www.cdc.gov/hicpac/pdf/isolation/Isolation2007.pdf .
3. Przygotowanie mikropłytki
- BUFOR: Pomiary wykonuje się w trzech powtórzeniach. Do każdego dołka płytki mikrotitracyjnej dodaje się 130 μL TBS.
- PRÓBKI: Do każdego dołka testowego dodaje się 20 μL śliny, aby uzyskać objętość końcową 150 μl/dołek. Mieszamy poprzez pipetowanie, unikając tworzenia pęcherzyków powietrza.
- KONTROLE: Kontrola pozytywna zawiera PPE, ale nie zawiera śliny. Kontrola negatywna zawiera ślinę, ale nie zawiera PPE. Do dołka kontroli pozytywnej dodaje się 20 μL TBS. Do dołka kontroli negatywnej dodaje się 20 μL śliny.
- INKUBACJA PPE: Dobrze wstrząśnąć roztworem roboczym PPE. Do każdego dołka, z wyjątkiem dołków kontroli negatywnej, dodać 50 μL roztworu roboczego PPE. Do dołków kontroli negatywnej dodać 50 μL TBS. Inkubować przez 10 min w temperaturze 23 °C.
- INKUBACJA SUBSTRATU: Do każdego dołka dodać 50 μL roztworu roboczego SA3NA. Inkubować przez 45 min w temperaturze 23 °C.
- COOMASSIE BLUE: Dodać 50 μL roztworu roboczego Coomassie Blue.
- ODCZYT: Odczytać absorbancję w czytniku płytek mikroprzestrzennych przy A405 nm w celu wykrycia rozszczepienia SA3NA, co reprezentuje aktywną α1PI, oraz przy A595 nm w celu wykrycia Coomassie Blue, co reprezentuje zawartość białek.
4. Oblicz indeks α1PI
- NORMALIZACJA ŚREDNICH A405 nm ORAZ A595 nm: Dla każdego pomiaru wykonanego w trzech powtórzeniach obliczyć średnią. Od średniej dla próbki odjąć średnią dla kontroli negatywnej. Aby zminimalizować różnice między płytkami, znormalizować średnie, dzieląc każdą średnią dla próbki przez średnią dla kontroli pozytywnej w następujący sposób:

- OBLICZ WSKAŹNIK α1PI INEX: Podziel znormalizowaną wartość A405 nm przez znormalizowaną wartość A595 nm:

5. Reprezentatywne wyniki
Aby ustalić, czy test α może być odpowiedni do zastosowania jako szybki test przesiewowy w punkcie opieki (point-of-care) do monitorowania liczby limfocytów CD4 w regionach endemicznych o ograniczonych zasobach, pobrano stymulowaną ślinę od 20 kobiet i 11 mężczyzn zakażonych HIV-1, którzy zgłosili się do kliniki na rutynowe badania w Kamerunie. Zgodnie z wstępnymi obserwacjami poczynionymi podczas opracowywania testu α przy użyciu śliny pobranej w Nowym Jorku, indeks α1PI w ślinie pobranej w Kamerunie korelował z liczbą CD4 (r2=0,91, p<0,0001. n=31). Zależność tę określono za pomocą trzymającej się parametrów krzywej sigmoidalnej, co jest spójne z zależnością dawka-odpowiedź (Rysunek 2A). 95% przedziały ufności i predykcji przedstawiono odpowiednio liniami niebieskimi i czerwonymi (Rysunek 2B).
W poprzednim badaniu ustaliliśmy, że limfocyty T CD4+ wykazują cykl sinusoidalny o periodyczności 23±3,5 dnia u osób z HIV-1 oraz u osób z dziedziczną postacią niedoboru α1PI (PIZZ)3. Przedstawiono tutaj reprezentatywny przykład komputerowej analizy krzywej sinusoidalnej cykliczności CD4 u zdrowej kontroli bez HIV-1, wykazującej periodyczność 27 dni (Rycina 3A).
Analiza wygenerowanej komputerowo krzywej sinusoidalnej zmian liczby limfocytów T CD4+ u 6 badanych pozwoliła uzyskać wartości amplitudy szczyt-szczyt oraz osi oscylacji3. Zgodnie z oczekiwaniami, oś oscylacji była skorelowana z amplitudą (r2=0,96, p=0,009, n=6) (Rycina 3B). U pacjentów z niską liczbą limfocytów T CD4+ cykliczne zmiany ich liczby były niewielkie, natomiast u pacjentów z wysoką liczbą limfocytów T CD4+ zmiany cykliczne były duże.
Ponieważ linia regresji przedstawiona na Ryc. 2 szacuje oś oscylacji, a oś oscylacji jest skorelowana z amplitudą, można obliczyć amplitudę dla linii regresji, szacując tym samym, o ile powyżej i poniżej linii regresji spodziewane są wahania limfocytów T CD4+ wynikające z cykliczności (Ryc. 3C). Po nałożeniu amplitudy obliczonej na Ryc. 3C oraz przedziału ufności obliczonego na Ryc. 2B stwierdzono, że amplituda (linia zielona) mieści się w 95% przedziale ufności (linia niebieska) (Ryc. 3D).

Rysunek 1. Podsumowanie procedury: Umieszczenie kwasu cytrynowego w jamie ustnej i pobranie śliny. Dodanie rozcieńczonej śliny do studzienek mikropłytki w trzech powtórzeniach. Dodanie PPE do każdej studzienki i inkubacja przez 15 min w 23 °C. Dodanie substratu PPE do każdej studzienki i inkubacja przez 45 min w 23 °C. Dodanie Coomassie Blue i odczyt przy 405 nm w celu wykrycia aktywności PPE oraz przy 595 nm w celu wykrycia białek.

Rysunek 2. Porównanie testu α ze standardową metodą zliczania komórek CD4. A) Test α przeprowadzono poprzez ilościowe oznaczenie indeksu α1PI w stymulowanej całej ślinie jam ustnej. Liczbę komórek CD4 oznaczono w niezależnym laboratorium medycznym przy użyciu standardowej cytometrii przepływowej. Krew do cytometrii przepływowej oraz ślinę pobrano podczas tej samej wizyty w klinice. Zależność między indeksem α1PI a liczbą komórek CD4 określono za pomocą 3-parametrycznej krzywej sigmoidalnej (r2=0,91, p<0,0001, n=31). B) 95% przedziały ufności i predykcji przedstawiono odpowiednio liniami niebieskimi i czerwonymi.

Rysunek 3. Dokładność obliczania liczby komórek CD4 przy użyciu indeksu α1PI. A) Komórki CD4+ T wykazywały cykle sinusoidalne z 27-dniową periodycznością u zdrowej kontroli niezakażonej HIV-1. Przedstawiono oś oscylacji (czerwona przerywana linia). B) Komputerowa analiza fali sinusoidalnej cykliczności limfocytów T CD4 została wykorzystana do obliczenia amplitudy szczyt-szczyt oraz osi oscylacji u 4 pacjentów z HIV-1, 1 pacjenta z PIzz niezakażonego HIV-1 oraz u zdrowej kontroli niezakażonej HIV-1 przedstawionej w części A. Zależność między amplitudą limfocytów T CD4+ a osią oscylacji została określona przez 3-parametryczną krzywą sigmoidalną (r2=0,96, p=0,009, n=6). C) Zależność sigmoidalna między amplitudą a osią oscylacji wyprowadzona w części B) została wykorzystana do obliczenia oczekiwanej amplitudy (zielone linie) punktów wzdłuż linii regresji (czarna linia) z Rysunku 2. D) Przedział oczekiwanej amplitudy (zielone linie) różnił się znacząco od 95% przedziału ufności (niebieskie linie), co określono za pomocą testu suma rang Manna-Whitneya (na podstawie porównania mediany różnicy między 95% przedziałem ufności a linią regresji (63 komórki/μl) oraz mediany różnicy między linią amplitudy a linią regresji (37 komórek/μl); p=0,001).