Metody enkapsulacji mikrofluidycznej były wcześniej wykorzystywane do przechwytywania komórek w wodnych, monodyspersyjnych kroplach o skali pikolitra, zapewniając izolację od środowiska cieczy objętościowej, z zastosowaniami w wysokoprzepustowym przesiewaniu, cytometrii i spektrometrii mas. Opisujemy metodę, która pozwala nie tylko na enkapsulację pojedynczych komórek, ale także na powtarzalne przechwytywanie określonej liczby komórek (w niniejszej pracy demonstrujemy enkapsulację jednej i dwóch komórek), aby badać zarówno izolację, jak i interakcje między komórkami w grupach o kontrolowanych rozmiarach. Poprzez połączenie technik generowania kropli z uporządkowaniem komórek i cząstek, demonstrujemy kontrolowaną enkapsulację cząstek o rozmiarach komórek w celu uzyskania wydajnej, ciągłej enkapsulacji. Wykorzystując wodną zawiesinę cząstek i niemieszalny olej fluorowęglowy, generujemy krople wodne w oleju za pomocą dyszy skupiającej przepływ. Natężenie przepływu fazy wodnej jest wystarczająco wysokie, aby stworzyć uporządkowanie cząstek, które docierają do dyszy z częstotliwościami będącymi wielokrotnościami całkowitymi częstotliwości generowania kropli, co pozwala na enkapsulację kontrolowanej liczby komórek w każdej kropli. W celu uzyskania reprezentatywnych wyników, jako zamienniki komórek wykorzystano cząstki polistyrenu o rozmiarze 9,9 μm. Badanie to wykazuje wydajność enkapsulacji pojedynczych cząstek Pk=1 na poziomie 83,7% oraz wydajność enkapsulacji podwójnych cząstek Pk=2 na poziomie 79,5%, w porównaniu do ich odpowiednich wydajności Poissona wynoszących odpowiednio 39,3% i 33,3%. Wykazano, że efekt stałego stężenia komórek i cząstek ma kluczowe znaczenie dla wydajnej enkapsulacji; omówiono również przejścia z trybu kroplowania do trybu strumieniowania.
Wstęp
Ciągłe zawiesiny komórek w środowisku wodnym dzielą wspólne środowisko płynne, co umożliwia równoległe oddziaływanie komórek oraz homogenizuje wpływ poszczególnych komórek na pomiary z medium. Wysokoprzepustowa enkapsulacja komórek w kroplach o skali pikolitrowej ogranicza próbki, chroniąc krople przed kontaminacją krzyżową, umożliwiając pomiar różnorodności komórkowej w obrębie próbek, zapobiegając rozcieńczaniu reagentów i ekspresjonowanych biomarkerów oraz wzmacniając sygnały z produktów bioreaktora. Krople zapewniają również możliwość ponownego łączenia kropel w większe próbki wodne lub z innymi kroplami w celu badania sygnalizacji międzykomórkowej.1,2 Zmniejszenie rozcieńczenia oznacza silniejsze sygnały detekcji dla pomiarów o wyższej dokładności, a także możliwość ograniczenia potencjalnie kosztownych objętości próbek i reagentów.3 Enkapsulację komórek w kroplach wykorzystywano w celu poprawy detekcji ekspresji białek,4 przeciwciał,5,6 enzymów,7 oraz aktywności metabolicznej8 w badaniach wysokoprzepustowych; może ona również służyć do usprawnienia wysokoprzepustowej cytometrii.9 Dodatkowe badania przedstawiają zastosowania w bio-elektrosprayingu kropel zawierających komórki dla spektrometrii mas10 oraz w ukierunkowanych powłokach komórkowych powierzchni.11 Niektóre zastosowania były jednak ograniczone przez brak możliwości kontrolowania liczby komórek enkapsulowanych w kroplach. Przedstawiamy tutaj metodę uporządkowanej enkapsulacji12, która zwiększa wykazaną wydajność enkapsulacji dla jednej i dwóch komórek i może zostać ekstrapolowana na enkapsulację większej liczby komórek.
Aby uzyskać monodyspersyjną generację kropli, mikrofluidyczne „ogniskowanie przepływu” (flow focusing) umożliwia tworzenie kropli o kontrolowanej wielkości jednego płynu (wodnej mieszaniny komórek) wewnątrz innego (ciągłej fazy olejowej) przy użyciu dyszy, w której strumienie zbiegają się.13 Dla danej geometrii dyszy częstotliwość generowania kropli f oraz ich rozmiar można zmieniać poprzez regulację przepływów fazy olejowej i wodnej Qoil oraz Qaq. Wraz ze wzrostem szybkości przepływu może nastąpić przejście z generowania kropli do niestabilnego strumieniowania cieczy wodnej z dyszy.14
Gdy roztwór wodny zawiera zawieszone cząsteczki, zostają one zamknięte w kropelkach i odizolowane od siebie na dyszy. W przypadku generowania kropelek z losowo rozłożonej wodnej zawiesiny komórek, średnia frakcja kropelek Dk zawierających k komórek jest określana przez statystykę Poissona, gdzie Dk = λk exp(-λ)/(k!) oraz λ jest średnią liczbą komórek na kropelkę. Frakcja komórek, które trafią do „poprawnie” zamkniętych kropelek, jest obliczana za pomocą wzoru Pk = (k x Dk)/Σ(k' x Dk'). Subtelna różnica między tymi dwoma miernikami polega na tym, że Dk odnosi się do wykorzystania cieczy wodnej i ilości sortowania kropelek, które musi zostać przeprowadzone po enkapsulacji, natomiast Pk odnosi się do wykorzystania próbki komórek. Przykładowo, można użyć rozcieńczonej zawiesiny komórek (niskie λ), aby tworzyć kropelki, w których większość kropelek zawierających komórki posiadałaby tylko jedną komórkę. Choć wskaźnik wydajności Pk byłby wysoki, większość kropelek byłaby pusta (niskie Dk), co wymagałoby zastosowania mechanizmu sortującego w celu usunięcia pustych kropelek, co z kolei obniżałoby przepustowość.15
Połączenie generowania kropel z uporządkowaniem bezwładnościowym umożliwia enkapsulację kropel z bardziej przewidywalną liczbą komórek na kroplę oraz wyższą przepustowością niż w przypadku enkapsulacji losowej. Fokuzowanie bezwładnościowe zostało po raz pierwszy odkryte przez Segre i Silberberga16 i odnosi się do tendencji cząstek o skończonej wielkości do migrowania do bocznych pozycji równowagi w przepływie w kanale. Uporządkowanie bezwładnościowe odnosi się do tendencji cząstek i komórek do pasywnej organizacji w równomiernie rozstawione, przesunięte, pociągi o stałej prędkości. Zarówno fokuzowanie, jak i uporządkowanie wymagają wystarczająco wysokich szybkości przepływu (wysoka liczba Reynoldsa) oraz rozmiarów cząstek (wysoka liczba Reynoldsa dla cząstek).17,18 Tutaj liczba Reynoldsa Re =uDh/ν oraz liczba Reynoldsa dla cząstek Rep =Re(a/Dh)2, gdzie u jest charakterystyczną prędkością przepływu, Dh [=2wh/(w+h)] jest średnicą hydrauliczną, ν jest lepkością kinematyczną, a to średnica cząstki, w to szerokość kanału, a h to wysokość kanału. Empirycznie długość wymagana do uzyskania w pełni uporządkowanych pociągów maleje wraz ze wzrostem Re i Rep. Należy zauważyć, że wysokie wymagania dotyczące Re i Rep (w niniejszym badaniu odpowiednio rzędu 5 i 0,5) mogą kolidować z potrzebą utrzymania niskich szybkości przepływu fazy wodnej, aby uniknąć przejścia w tryb strumieniowy przy dyszy generującej krople. Ponadto wysokie szybkości przepływu prowadzą do wyższych naprężeń ścinających działających na komórki, czego nie omówiono w niniejszym protokole. Poprzednie badanie nad uporządkowaną enkapsulacją wykazało, że ponad 90% pojedynczo enkapsulowanych komórek HL60 w warunkach przepływu podobnych do tych w niniejszym badaniu zachowało integralność błony komórkowej.12 Jednak wpływ wartości i skal czasowych naprężeń ścinających będzie musiał zostać starannie rozważony przy ekstrapolacji na inne typy komórek i parametry przepływu. Nakładanie się ograniczeń szybkości przepływu fazy wodnej dla uporządkowania komórek, generowania kropel i żywotności komórek zapewnia idealny reżim operacyjny dla kontrolowanej enkapsulacji pojedynczych i wielu komórek.
Ponieważ bardzo niewiele badań dotyczy odstępów między rzędami cząstek,19,20 określenie tych odstępów najłatwiej przeprowadzić empirycznie, a wynik będzie zależał od geometrii kanału, szybkości przepływu, wielkości cząstek i ich stężenia. Niemniej jednak równomierne odstępy boczne między rzędami oznaczają, że komórki docierają w przewidywalnych, stałych odstępach czasu. Gdy generowanie kropel odbywa się z taką samą częstotliwością, z jaką uporządkowane komórki docierają do dyszy, komórki zostają zamknięte w kropli w sposób kontrolowany. Technika ta została wykorzystana do enkapsulacji pojedynczych komórek z wydajnością rzędu 15 kHz,12 co stanowi znaczną poprawę w stosunku do wcześniejszych badań, w których zgłaszano szybkości enkapsulacji rzędu 60-160 Hz.4,15 W badaniach nad kontrolowaną enkapsulacją ponad 80% kropel zawierało dokładnie jedną komórkę, co stanowi znaczną poprawę wydajności w porównaniu ze statystyką Poissona (losową), która przewiduje średnią wydajność poniżej 40%.12
W poprzednich badaniach nad kontrolowaną enkapsulacją,12 średnia liczba cząstek na kroplę λ była dostrajana w celu zapewnienia enkapsulacji pojedynczych komórek. Hipotezyzujemy, że poprzez regulację szybkości przepływu możemy efektywnie enkapsulować dowolną liczbę komórek na kroplę, gdy λ jest równa lub bliska pożądanej liczbie komórek na kroplę. Podczas gdy enkapsulacja pojedynczych komórek jest cenna przy określaniu indywidualnych reakcji komórkowych na bodźce, enkapsulacja wielu komórek dostarcza informacji dotyczących interakcji kontrolowanej liczby i rodzajów komórek. Przedstawiamy tutaj protokół, reprezentatywne wyniki z wykorzystaniem mikrosfer polistyrenowych oraz dyskusję dotyczącą kontrolowanej enkapsulacji wielu komórek przy użyciu pasywnego kanału uporządkowania inercyjnego i dyszy do generowania kropli.