W celu pozyskania larw do mikrogavage stosujemy opublikowane protokoły standardowej hodowli i utrzymania rybek zebrafish27. Do rozmnażania ryb wykorzystujemy głównie rozród naturalny, a ryby są utrzymywane w cyklu 14 h światła / 10 h ciemności. Niniejszy protokół został zoptymalizowany dla mikrogavage larw zebrafish w 6-7 dniach po zapłodnieniu (dpf). Przewidujemy, że metody te będą ogólnie stosowalne do młodszych i starszych stadiów rozwojowych po wprowadzeniu niewielkich modyfikacji. Jeśli nie wskazano inaczej, wykorzystano szczep zebrafish typu dzikiego TL w 6 dpf, a ryb nie karmiono. Wszystkie eksperymenty przeprowadzono w wodzie systemowej pozyskanej z naszej konwencjonalnej zaprawy akwakultury zebrafish; można jednak zastosować dowolne odpowiednie medium dla zebrafish (np. medium dla embrionów lub gnotobiotyczne medium dla zebrafish (GZM)28). W niniejszym protokole termin „medium dla zebrafish” odnosi się do medium wybranego przez użytkownika.
1. Przygotowanie metylocelulozy, formy do gavage oraz wykonanie igły do mikrogavage
Dzień przed eksperymentem lub wcześnie w dniu jego przeprowadzenia należy przygotować metylocelulozę, formę agarozową do stabilizacji larw oraz igły do mikrogavage.
- Rozpuść 3 g metylocelulozy w 100 ml sterylnej wody dejonizowanej lub pożywki dla danio pręgowanych (w zależności od zastosowania), aby przygotować 3% roztwór. Do butelki włóż mieszadło magnetyczne, podgrzej wodę prawie do wrzenia i ustaw na płytce grzewczo-mieszającej w wysokiej temperaturze. Podczas mieszania powoli wsypuj metylocelulozę, aby zapobiec powstawaniu grudek. W ciągu dnia stopniowo zmniejszaj prędkość mieszania oraz temperaturę płytki, aż roztwór osiągnie temperaturę pokojową.
- Kontynuuj powolne mieszanie przez noc, aż metyloceluloza całkowicie się rozpuści. Roztwór można przechowywać w temperaturze pokojowej przez kilka miesięcy w szczelnym pojemniku.
- Przygotuj formę z 3% żelu agarozowego w szalce Petriego o średnicy 10 cm, używając plastikowego odlewu (Adaptive Science Tools, TU-1) zgodnie z instrukcjami producenta. Uszczelnij parafildem i przechowuj w temperaturze 4 °C do momentu użycia, aby zapobiec wysychaniu. Przed eksperymentem ogrzej formę do temperatury pokojowej lub 28 °C. Formy agarozowe można zazwyczaj wykorzystać wielokrotnie.
- Wytwórz kilka igieł do gavage’u, wykorzystując kapilary z borokrzemianowego szkła oraz wyciągarkę do mikropipet Flaming Brown (FT330B) wyposażoną w szeroki włókno grzejne. Programy stosowane do produkcji igieł są następujące:
| Typ igły | Ciśnienie | Ciepło | Pociągnij | Prędkość | Czas |
| embrion | 500 | 315 | 100 | 50 | 200 |
| zgłębniki (podawanie przez zgłębnik) | 500 | 315 | 125 | 75 | 200 |
Ponieważ włókna mogą różnić się w zależności od instrumentu, należy zapisać czas narastania (aktywny czas nagrzewania). W przypadku tego programu nasz czas narastania mieści się w przedziale 8,57-8,79 ms. Program ten pozwala na stworzenie krótszych i szerszych igieł niż tradycyjne igły do mikrowstrzykiwania (Rysunek 1). Ustawienia te mogą wymagać optymalizacji w przypadku korzystania z różnych wyciągaczy mikropipet.
2. Przycinanie, napełnianie i kalibracja igieł do mikrogavage
Uwaga*: Przycinanie igły jest krytycznym krokiem w tym protokole. Ponadto metody ładowania i kalibrowania igieł będą się różnić w zależności od rodzaju używanego urządzenia do mikroiniekcji. Zoptymalizowaliśmy ten protokół przy użyciu mikroiniektorów Drummond II, jednak przewidujemy, że będzie on możliwy do zastosowania również w innych instrumentach do mikroiniekcji po wprowadzeniu niewielkich modyfikacji. Ponieważ zestawy do iniekcji oraz wyciągarki do igieł różnią się pomiędzy laboratoriami, istotne będzie zmierzenie i skalibrowanie objętości iniekcji (patrz sekcja 2.8).
- Igły są przycinane pod stereomikroskopem. Używamy stereomikroskopu Leica S6E ustawionego na powiększeniu 2,5x. Przy tym ustawieniu skala okularowa z 100 podziałkami ma długość 2 mm.
- Należy wyrównać końcówkę igły z końcem skala okularowej (znacznika podziałki 100) i przyciąć igłę za pomocą precyzyjnej pęsety zegarmistrzowskiej w odległości ok. 1 mm od końcówki (znacznik podziałki 48-50) (Ryc. 1A).
- Igła powinna mieć średnicę ok. 27-30 μm i być tępa. Należy zbadać końcówki igieł przy powiększeniu 100x. Igły ostre lub poszarpane zwiększają prawdopodobieństwo uszkodzeń podczas gavage i należy ich w miarę możliwości unikać.
- Alternatywnie, jeśli jest dostępny, można użyć mikrokuźni (microforge), aby lepiej kontrolować punkt cięcia igły oraz wypolerować termicznie końcówki igieł w celu usunięcia ostrych krawędzi (Ryc. 1B).
- Należy przygotować roztwór do gavage. W większości zastosowań przygotowujemy roztwór z dodatkiem 1:10 rozcieńczenia 0,5% roztworu czerwieni fenolowej w soli fizjologicznej z buforem fosforanowym Dulbecco (DPBS) (Sigma-Aldrich), aby zapewnić widoczność roztworu pod stereomikroskopem w celu monitorowania prawidłowego działania mikroinjektora oraz umiejscowienia roztworu do gavage w przedniej opuszce. Barwniki ładunkowe inne niż czerwień fenolowa nie zostały ocenione, ale mogą być stosowane.
- Należy przygotować igłę do gavage, wypełniając ją olejem mineralnym za pomocą strzykawki 1 ml z igłą 25G 5/8. Następnie należy ją zamontować w urządzeniu do mikroiniekcji Nanoject II.
- Plastikową szalkę Petriego o średnicy 10 cm należy owinąć parafilmem, aby uzyskać płaską, wodoodporną powierzchnię, a następnie nanieść ok. 2 μl roztworu do gavage na parafilm. Należy ręcznie wypełnić igłę do gavage, uważając, aby nie doprowadzić do powstania pęcherzyków powietrza w oleju mineralnym.
- Aby przetestować działanie mikroinjektora i skalibrować objętość wyrzutu, należy napełnić szalkę Petriego o średnicy 3 cm olejem mineralnym i wstrzykiwać do oleju, aż krople będą miały jednolity rozmiar. Średnicę kropli należy zmierzyć za pomocą skali okularowej lub funkcji pomiarowej w stereomikroskopie, jeśli jest dostępna. Następnie należy obliczyć objętość kropli (Wzór: V=4/3πr3). Spójność objętości między igłami została przedstawiona na wykresie (Ryc. 1C).
- Przed rozpoczęciem gavage należy przepłukać końcówkę igły poprzez wielokrotne zanurzanie w czystym medium dla danio pręgowanego, aby usunąć pozostałości oleju mineralnego. Olej mineralny jest bardzo gęsty i może spowodować uszkodzenie tkanek nabłonkowych, jeśli nie zostanie zmyty z końcówki igły.
3. Znieczulanie, mocowanie i gavage larw rybek danio
- Przed rozpoczęciem eksperymentu ogrzać formę agarozową w temperaturze pokojowej lub do 28 °C.
- Przygotować formę agarozową do gavage'u, pokrywając 3 rowki 3% metylocelulozą. Należy użyć takiej ilości metylocelulozy, która pokryje rowki i utrzyma ryby, ale nie będzie tak mała, aby szybko wyschła.
- W czystej płytce 6-dołkowej rozdzielić larwy danio-ostrobuzych dla każdej grupy eksperymentalnej do osobnych dołków, z których każdy zawiera 3,5-4,0 ml pożywki dla danio-ostrobuzych.
- Przygotować 3x roztwór trikainy (0,05% w/v) w odpowiedniej pożywce dla danio-ostrobuzych. Znieczulać ryby kolejno w każdym dołku, dodając do dołka z larwami taką samą objętość 3x trikainy, aby uzyskać końcowe stężenie 1,5x (0,025%), i delikatnie zamieszać ruchem wirowym.
- Gdy tylko danio-ostrobuzie przestaną się poruszać, przenieść je z dołka za pomocą szklanej pipety Pasteura o szerokim wylocie i pompy pipetującej, a następnie układać pojedynczo na metylocelulozie, z głowami skierowanymi pod kątem 45° rowka, a ogonami w stronę kąta 90° rowka. Delikatnie docisnąć je do metylocelulozy tępą sondą sekcyjną, aby ustabilizować ich pozycję.
- Wyregulować zestaw do mikroiniekcji Nanoject II tak, aby igła była nachylona pod niewielkim kątem, niemal równolegle do kąta 45° formy agarozowej. Należy upewnić się, że zakres wysuwu igły będzie wystarczający, aby przekroczyć dno dołka formy, co zminimalizuje konieczność wprowadzania korekt po umieszczeniu ryb.
- Ustawić urządzenie do mikroiniekcji tak, aby podawać 4,6 nl (maksymalnie) w trybie wolnej iniekcji (23 nl/sec). Przy tych ustawieniach podawana objętość powinna wypełniać jedynie przednią część jelita, nie wyciekając przez przełyk ani kloakę. W zależności od celu eksperymentu można zastosować mniejsze objętości.
- Jedną ręką wprowadzać niewielkie korekty położenia płytki z unieruchomionymi larwami, jednocześnie sterując drugą ręką manipulatorem urządzenia do mikroiniekcji.
- Delikatnie wprowadzić igłę do gavage'u do pyska znieczulonej ryby, przez przełyk, lekko docisnąć zwieracz przełyku, aby wprowadzić końcówkę igły tuż za przednią część jelita (Rysunek 2, krok 1-2, a&b).
- Po wprowadzeniu do przedniej części jelita, delikatnie nacisnąć pedał nożny lub przycisk iniekcji, aby podać substancję. Szybko i płynnie wycofać igłę, starając się nie uwolnić znacznej ilości materiału do przełyku (Rysunek 2, krok 3-4).
- Po gavage'u, używając szklanej pipety Pasteura o szerokim wylocie i pompy pipetującej, delikatnie przenieść larwy danio-ostrobuzych do świeżej pożywki. Napełnić pipetę wodą do około 1 cala powyżej zgięcia szyjki, stworzyć małą kieszonkę wodną w metylocelulozie przy głowie larwy, aby ją zwolnić, delikatnie unieść głowę do otworu pipety i wyciągnąć larwę z metylocelulozy. Delikatnie wypuścić rybę wraz z całą wodą z pipety do naczynia ze świeżą pożywką.
- Płukać larwy w świeżej pożywce, delikatnie pipetując w górę i w dół lub kilka razy oblewając pożywką, aby usunąć metylocelulozę i wybudzić larwy z narkozy. Przenieść larwy do szalki Petriego lub płytki 6-dołkowej do czasu kolejnych obrazowań i analiz.
4. Analiza dekstranu w celu oceny bezpieczeństwa gavage i szczelności bariery jelitowej
Mikrogaważ można wykorzystać do podawania różnych substancji do jelit. Jako przykład przedstawiamy poniżej protokół gavage’u dekstranu 10 kD sprzężonego z Texas Red w celu analizy integralności bariery nabłonka jelitowego. Istnieją co najmniej dwie potencjalne drogi przepuszczalności parakomórkowej, różniące się selektywnością w zależności od ładunku i wielkości substancji rozpuszczonych, nazywane szlakami „porów” (pore) lub „przecieków” (leak)29. Ponieważ ten dekstran jest zbyt duży, aby zostać wchłoniętym przez nabłonek jelitowy drogą parakomórkową przez pory (ograniczenie wielkości ~4Å, dekstran 10kD = ~23Å)9,30-32, powinien on pozostać w świetle jelita, o ile integralność bariery jelitowej nie jest naruszona. Chociaż dekstran 10 kD mógłby być transportowany drogą parakomórkową przez szlak przecieków, ścieżka ta ma niższą pojemność i wolniejszą kinetykę29,33, w związku z czym mało prawdopodobne jest, aby wystąpiła ona w czasie trwania tego testu. Jako „kontrolę pozytywną” w celu naruszenia integralności bariery stosuje się EDTA, który rozbija połączenia ścisłe nabłonka34,35. Ten test gavage’u dekstranu może służyć jako kontrola jakości w celu wykazania, że procedura gavage jest wykonywana bezpiecznie, bez niezamierzonego uszkodzenia tkanek. Dodatkowo test ten może być wykorzystany do badania integralności bariery jelitowej w zależności od genotypu lub zastosowanego leczenia.
- Przygotować następujące roztwory do zgłębnika: 1% dekstranu/1x PBS/0,05% czerwieni fenolowej oraz 1% dekstranu/20 mM EDTA/1x PBS/0,05% czerwieni fenolowej (kontrola dodatnia). Roztwór stokowy 5% dekstranu w ddH2O przechowuje się w aliquotach po 50 μl w temperaturze -20 °C, aby ograniczyć liczbę cykli zamrażania i rozmrażania. Należy również przygotować pozorny roztwór do zgłębnika składający się z 1x PBS/0,05% czerwieni fenolowej.
| | | | | kontrola + (EDTA) | bez EDTA |
| | stężenie zapasu | stężenie końcowe | czynnik rozcieńczenia | 10 μl | 10 μl |
| EDTA, pH 8 | 200 mM | 20 mM | 10 | 1 | 0 |
| Dekstran | 5% | 1% | 5 | 2 | 2 |
| PBS | 10x | 1x | 10 | 1 | 1 |
| Czerwień fenolowa | 0,50% | 0,05% | 10 | 1 | 1 |
| | | | suma częściowa: | 5 | 4 |
| | | | ddH2O: | 5 | 6 |
| | | | Suma: | 10 | 10 |
- Zastosuj protokół opisany w sekcji 3, aby przeprowadzić gavage w grupach 10-20 larw zebrafish dla każdego warunku eksperymentalnego. Jeśli to możliwe, powtórz tę procedurę na grupach dubletowych lub tripletowych.
- Po gavage doprowadź larwy do wybudzenia z anestezji i pozwól im swobodnie pływać w świeżym medium.
- W 18-20 min po gavage ponownie poddaj larwy anestezji zgodnie z krokiem 3.3. Umieść larwy w 3% metylocelulozie na bloku z 3% agarozy (redukuje to odblaski tła podczas obrazowania).
- Wykonaj obrazowanie larw za pomocą stereoskopu fluorescencyjnego (np. Leica M205C> i zestawu filtrów Texas Red przy powiększeniu umożliwiającym obrazowanie larw od pyska do obszaru bezpośrednio za końcem kloaki.
- Wszystkie obrazy należy pozyskać przy tych samych ustawieniach ekspozycji, aby można było je później skwantyfikować i porównać. Fluorescencja będzie intensywna w świetle jelita wszystkich larw wstrzykniętych dekstranem, jednak funkcję bariery ocenia się na podstawie poziomu dekstranu, który pojawia się w tkankach pozajelitowych (tzn. w tułowiu i naczyniach krwionośnych) (Rycina 5). Dostosuj ekspozycję do ustawień umożliwiających wizualizację fluorescencji tułowia, nawet jeśli spowoduje to prześwietlenie fluorescencji światła jelita.
- Zaplanuj czas gavage w odstępach, tak aby każda grupa spędziła w przybliżeniu taką samą ilość czasu na regenerację po zabiegu i była obrazowana w tym samym przybliżonym czasie po gavage. W tym eksperymencie jedna osoba potrzebuje około 1 hr na ukończenie procedury dla każdej grupy. Ryby są poddawane anestezji w 18-20 min po gavage, a obrazowanie trwa ~1-2 min na rybę.
- Użyj programu do analizy obrazu, takiego jak ImageJ, aby skwantyfikować względną średnią intensywność fluorescencji w obszarze tułowia bezpośrednio nad jelitem. Znormalizuj te wartości, odejmując pomiar tła wykonany w obszarze obrazu poza rybą.
- Przedstaw dane z analizy obrazu na wykresach i przeanalizuj je za pomocą GraphPad Prism lub podobnego oprogramowania statystycznego.
5. Test fluorescencyjnych mikrosfer do badania motywności jelit
Gavage (podanie dożylne/zgłębnikowe) zapewnia lepszą kontrolę nad czasem i ilością podawanego do jelit materiału, co czyni tę metodę idealną alternatywą w badaniach nad motylością jelit. Wcześniej opublikowane techniki pomiaru motylości jelit u larw danio-pręgowanego obejmowały bezpośrednią obserwację skurczów i fal jelitowych za pomocą mikroskopii1,21,36 lub karmienie larw pokarmem zmieszanym z żółto-zielonymi fluorescencyjnymi mikrosferami polistyrenowymi26. W niektórych badaniach ilościowa analiza wzorców motylości jelit była usprawniana poprzez zanurzanie larw w mediach zawierających barwnik spożywczy37 lub zastosowanie specjalistycznej techniki analizy wideo zwanej mapowaniem czasoprzestrzennym (spatiotemporal mapping)38,39. W niniejszej pracy przedstawiamy badanie typu proof-of-concept, aby wykazać, że możliwe jest podanie fluorescencyjnych mikrosfer drogą gavage do przedniej części żarawki jelita, a śledzenie ruchu mikrosfer może być wykorzystane do oceny motylości jelit (Rycina 6). Główną różnicą między tą metodą a podejściem Fielda i współpracowników26 jest to, że kuleczki są wprowadzane samodzielnie i nie mogą zostać włączone w pokarm ze względu na ograniczenia średnicy igły do gavage.
- Utrzymywać larwy danio pręgowanego w płytkach 10 cm z 35 ml pożywki aż do przeprowadzenia eksperymentu w 7 dpf. Rozpocząć karmienie larw codziennie rano od 5 dpf, podając ~0,6 mg pokarmu w proszku (dieta dla larw, zgodnie z wcześniejszym opisem40; podawana za pomocą sterylnej pętli szczepiącej 1 mm).
- Delikatnie wstrząsnąć butelką z polistyrenowymi mikrosferami Fluoresbrite YG 2.0 μm (~2,5% zawiesina wodna), aby wymieszać zawiesinę. Nanieść kroplę z butelki na parafilm, aby umożliwić odmierzenie określonej objętości za pomocą pipety.
- W probówce typu Eppendorf odwirować kuleczki z niską prędkością w wirówce laboratoryjnej, usunąć nadsącz i zastąpić go 1x PBS w pierwotnej objętości. Powtórzyć ten proces, aby przemyć mikrosfery 2 razy.
- Przygotować zawiesinę do zgłębnikowania zawierającą 0,25% mikrosfer (rozcieńczenie zawiesiny stokowej 1:10)/1x PBS/0,05% czerwieni fenolowej. W objętości 4,6 nl podawanej pojedynczej larwie znajduje się ~2,6x103 mikrosfer.
- Zastosować protokół opisany w sekcji 3, aby przeprowadzić zgłębnikowanie pożądanej liczby larw. Mikrosfery wykazują pewną wyporność; dlatego zgłębnikowanie powinno być wykonane tak szybko, jak to możliwe, aby zmaksymalizować jednorodność zawiesiny.
- W tym eksperymencie 15 larw poddano zgłębnikowaniu, a następnie utrzymywano w pojedynczych dołkach płytki 12-dołkowej po wybudzeniu z anestezji, aby śledzić transport w poszczególnych osobnikach. Można jednak poddać zgłębnikowaniu większe grupy i oceniać transport w całej populacji, a nie indywidualnie. Standardowe praktyki opisano w pracy Field et al.26.
- Ocenić motorykę jelit poprzez określenie najbardziej rostralnej (lub przedniej) lokalizacji fluorescencyjnych mikrosfer u żywych larw w różnych odstępach czasu przy użyciu fluorescencyjnego stereomikroskopu. Krótko znieczulić larwy w 1x (0,017%) tricaine, a następnie określić strefy lokalizacji mikrosfer lub wykonać zdjęcia do późniejszej oceny.
- Przedstawić na wykresie i porównać procent całkowitej liczby larw z mikrosferami w określonym regionie jelita w funkcji czasu.