RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
pl_PL
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Badacze neuroobrazowania zazwyczaj uważają reakcję mózgu za średnią aktywność w powtarzających się próbach eksperymentalnych i ignorują zmienność sygnału w czasie jako "szum". Staje się jednak jasne, że w tym szumie jest sygnał. W artykule opisano nowatorską metodę entropii wieloskalowej do ilościowego określania zmienności sygnałów mózgowych w dziedzinie czasu.
Biorąc pod uwagę dane z ludzkiego neuroobrazowania, docenienie zmienności sygnału stanowi fundamentalną innowację w sposobie, w jaki myślimy o sygnałach mózgowych. Zazwyczaj naukowcy reprezentują reakcję mózgu jako średnią w powtarzających się próbach eksperymentalnych i ignorują wahania sygnału w czasie jako "szum". Staje się jednak jasne, że zmienność sygnałów mózgowych przekazuje istotne informacje funkcjonalne na temat dynamiki sieci neuronowych. W artykule opisano nowatorską metodę entropii wieloskalowej (MSE) do ilościowego określania zmienności sygnałów mózgowych. MSE może być szczególnie pouczające w zakresie dynamiki sieci neuronowych, ponieważ pokazuje zależność od skali czasu i wrażliwość na dynamikę liniową i nieliniową w danych.
Ostatnie postępy w neuroobrazowaniu znacznie poszerzyły nasze zrozumienie funkcji mózgu. Jednak wiele zastosowań danych neuroobrazowych ma tendencję do wzmacniania obrazu mózgu w stanach statycznych, zamiast kłaść nacisk na operacje poznawcze w miarę ich rozwoju w czasie rzeczywistym. W związku z tym niewiele wiadomo na temat struktury czasoprzestrzennej sieci mózgowych i tego, w jaki sposób sekwencja zmian we wzorcach czasoprzestrzennych w wielu skalach czasowych przyczynia się do określonej operacji poznawczej. Niniejszy artykuł opisuje entropię wieloskalową (MSE) 5, nowe narzędzie analityczne do danych neuroobrazowych, które bada złożoność wzorca czasoprzestrzennego leżącego u podstaw określonych operacji poznawczych, dostarczając informacji o tym, jak różne generatory neuronowe w funkcjonalnej sieci mózgowej komunikują się w wielu skalach czasowych.
Wywodzący się z teorii informacji, stosowanej gałęzi matematyki 7,16, MSE został pierwotnie zaprojektowany do badania złożoności elektrokardiogramów 4. Teoretycznie MSE może być używany do analizy złożoności dowolnego szeregu czasowego; Podstawowym wymogiem jest, aby szereg czasowy sygnału zawierał co najmniej 50 punktów danych w czasie ciągłym. Jednak zależność od skali czasowej i wrażliwość na dynamikę liniową i nieliniową w danych może sprawić, że MSE będzie szczególnie pouczające w zakresie dynamiki sieci neuronowych.
Tutaj skupiamy się na zastosowaniu MSE do danych neuroobrazowania elektroencefalogramu (EEG) 9,12. EEG to nieinwazyjna technika neuroobrazowania, w której elektrody umieszczone na skórze głowy rejestrują odpowiedzi postsynaptyczne populacji neuronów w korze nowej 1. Dzięki wysokiej rozdzielczości czasowej, EEG z łatwością spełnia długość szeregów czasowych wymaganą przez MSE bez zmiany typowego protokołu akwizycji. Aby podkreślić użyteczność zastosowania MSE do danych EEG, porównujemy tę nowatorską metodę z bardziej tradycyjnymi podejściami, w tym potencjałem związanym ze zdarzeniami i mocą spektralną. Stosowane razem, te uzupełniające się metody analizy zapewniają pełniejszy opis danych, który może prowadzić do dalszego wglądu w operacje sieci neuronowych, które dają początek poznaniu.
1. Akwizycja EEG
2. Analiza EEG
Rysunki 1A i 2A reprezentują sygnał EEG w odpowiedzi na prezentację obrazu twarzy. Uśrednianie w poprzek podobnych prób tworzy przebieg ERP, który składa się z serii dodatnich i ujemnych odchyleń zwanych składnikami ERP. Rysunek 1B ilustruje uśredniony przebieg dla pojedynczego obiektu, a rysunek 6A ilustruje uśredniony przebieg dla grupy badanych. Istnieje bogata literatura, która wiąże każdy komponent ERP z określoną operacją percepcyjną, motoryczną lub poznawczą. Na przykład N170 jest ujemnym odchyleniem, które osiąga szczyt po około 170 ms po rozpoczęciu bodźca i jest związane z przetwarzaniem twarzy 8,15.
Rysunek 2B ilustruje dekompozycję tego samego sygnału EEG na składowe pasma częstotliwości. Wyniki analizy mocy spektralnej ujawniają zawartość częstotliwościową sygnału (rysunek 2C), przy czym wzrost mocy przy określonej częstotliwości odzwierciedla wzrost obecności tego rytmu w sygnale EEG.
Podobnie jak moc spektralna, MSE jest wrażliwe na złożoność składowych oscylacyjnych składających się na sygnał. Jednak w przeciwieństwie do mocy spektralnej, MSE jest również wrażliwy na interakcje między składowymi częstotliwości (tj. dynamika nieliniowa 18). Złożoność sygnału EEG jest reprezentowana jako funkcja entropii próbki (rysunek 5) w wielu skalach czasowych (rysunek 4). Jak pokazano na rysunku 3, entropia próbki jest niska dla sygnałów regularnych i wzrasta wraz ze stopniem losowości sygnału. W przeciwieństwie do tradycyjnych miar entropii, które rosną wraz ze stopniem losowości, entropia wieloskalowa jest w stanie odróżnić złożone sygnały od białego szumu, biorąc pod uwagę entropię w wielu skalach czasowych. Na przykład Costa i in., 2005 porównali wieloskalowe wartości entropii dla nieskorelowanego (białego) szumu ze skorelowanym (różowym) szumem. Podczas gdy entropia próbki była większa dla białego szumu niż różowego w precyzyjnej skali czasowej, odwrotność zaobserwowano w grubszych skalach czasowych 5-20. Innymi słowy, gdy entropia była brana pod uwagę w wielu skalach czasowych, prawdziwa złożoność sygnałów była dokładniej odwzorowana, niż gdyby pod uwagę brano tylko jedną skalę czasową. W zależności od dynamiki czasowej określonego kontrastu, efekty warunków mogą być wyrażone: 1) w ten sam sposób we wszystkich skalach czasowych, 2) w niektórych skalach czasowych, ale nie w innych, lub 3) jako efekty krzyżowania, przy czym kontrast jest różny w cienkich i grubszych skalach czasowych.
Rysunek 6 przedstawia różnice w warunkach w ERP (Rysunek 6A), mocy spektralnej (Rysunek 6B), MSE (Rysunek 6C) kontrastując początkowe i powtarzalne prezentacje zdjęć twarzy 9. W tym przykładzie wszystkie miary zbiegły się, aby ujawnić ten sam efekt; Jednak obserwowany spadek entropii próbki, który towarzyszy powtarzaniu twarzy, jest ważny, ponieważ ogranicza interpretację wyników. Spadek złożoności sugeruje, że podstawowa sieć funkcjonalna jest prostsza i zdolna do przetwarzania mniejszej ilości informacji.
Rysunek 7 przedstawia wyniki statystyczne z wielowymiarowej analizy cząstkowo-najmniejszych kwadratów 11 zastosowanych do ERP, mocy spektralnej i MSE. W eksperymencie manipulowano znajomością związaną z różnymi twarzami (Heisz i in., 2012). Kontrast (wykres słupkowy) pokazuje, że amplituda ERP odróżniała nowe twarze od znajomych twarzy, ale nie wśród znajomych twarzy, które różniły się ilością wcześniejszej ekspozycji. Moc spektralna rozróżniała twarze zgodnie z nabytą znajomością, ale nie rozróżniała dokładnie twarzy o średniej i niskiej znajomości. MSE był najbardziej wrażliwy na różnice w warunkach polegające na tym, że wartości entropii próbki rosły wraz ze wzrostem znajomości twarzy. Wykresy obrazów ujmują czasoprzestrzenny rozkład efektu warunku we wszystkich elektrodach i czasie/częstotliwości/skali czasowej. Przykład ten pokazuje sytuację, w której analiza EEG przez MMP dostarczyła unikalnych informacji, które nie zostały uzyskane przy użyciu tradycyjnych metod ERP lub mocy spektralnej. Ta rozbieżność MSE sugeruje, że warunki różnią się w odniesieniu do nieliniowych aspektów dynamiki ich sieci, co może obejmować interakcje między różnymi składnikami częstotliwości.

Rysunek 1. A) Odpowiedzi EEG pojedynczego pacjenta w funkcji odchylenia amplitudy od wartości wyjściowej dla każdego badania wykreślonego w funkcji czasu od początku badania. Każda próba polegała na przedstawieniu zdjęcia wizerunku twarzy. Odchylenia o dodatniej amplitudzie są pokazane na czerwono; Ugięcia o ujemnej amplitudzie są przedstawione na niebiesko. Wszystkie próby wykazują dodatnie odchylenie w zakresie około 100 ms i 250 ms, co wskazuje na aktywność fazową związaną ze zdarzeniem. B) Uśrednianie we wszystkich próbach przedstawionych na rysunku 1A daje uśredniony przebieg ERP z wyraźnymi dodatnimi i ujemnymi odchyleniami zwanymi komponentami związanymi ze zdarzeniem i nazwanymi zgodnie ze standardową nomenklaturą. Na przykład P1 jest pierwszym dodatnim komponentem idzie, a N170 jest ujemnym komponentem, który osiąga szczyt po około 170 ms po rozpoczęciu bodźca.

Rysunek 2. A) Odpowiedź EEG pojedynczego pacjenta dla pojedynczego badania, wykreślająca amplitudę według czasu (w punktach danych, częstotliwość próbkowania 512 Hz). B) Odpowiedź EEG rysunku 2A przefiltrowana w celu wyizolowania pasm częstotliwości delta (0-4 Hz), theta (5-8 Hz), alfa (9-12 Hz), beta (13-30 Hz) i gamma (> 30 Hz). C) Widmowa gęstość mocy odpowiedzi EEG przedstawiona na rysunku 2A przedstawiająca skład częstotliwościowy sygnału w funkcji mocy przez częstotliwość. Wzrost mocy widmowej przy określonej częstotliwości odzwierciedla wzrost liczby synchronicznie aktywnych neuronów porwanych w tym konkretnym paśmie częstotliwości. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą postać.

Rysunek 3. A) Dwa symulowane przebiegi: regularny lub przewidywalny przebieg przedstawiony na fioletowo i bardziej stochastyczny przebieg przedstawiony na czarno. B) Przykładowe wartości entropii dwóch symulowanych przebiegów dla pierwszych trzech skal czasowych. Entropia próbki jest niska w przypadku sygnałów wysoce przewidywalnych niż w przypadku sygnałów bardziej stochastycznych. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą postać.

Rysunek 4. Próbkowanie w dół oryginalnego szeregu czasowego generuje wiele szeregów czasowych o różnych skalach czasu. Skala czasu 1 jest oryginalnym szeregiem czasowym. Szeregi czasowe skali czasu 2 są tworzone przez podzielenie oryginalnego szeregu czasowego na nienakładające się okna o długości 2 i uśrednienie punktów danych w każdym oknie. Aby wygenerować szeregi czasowe kolejnych skal czasu, podziel oryginalny szereg czasowy na nienakładające się okna długości skali czasu i uśrednij punkty danych w każdym oknie.

Rysunek 5. Symulowany przebieg, w którym każdy prostokąt reprezentuje pojedynczy punkt danych w szeregu czasowym. Przykładowa entropia szacuje zmienność szeregów czasowych. W tym przykładzie m (długość wzorca) jest ustawiona na dwa, co oznacza, że wariancja wzorca amplitudy każdego szeregu czasowego będzie reprezentowana w przestrzeni dwuwymiarowej i trójwymiarowej przez uwzględnienie wzorca sekwencji odpowiednio dwóch i trzech kolejnych punktów danych; r (kryterium podobieństwa) odzwierciedla zakres amplitudy (oznaczony wysokością kolorowych pasków), w którym punkty danych są uważane za "pasujące". Aby obliczyć entropię próbki dla tego symulowanego szeregu czasowego, zacznij od pierwszego dwuskładnikowego wzorca sekwencji, koloru czerwono-pomarańczowego. Najpierw policz, ile razy wzorzec sekwencji czerwono-pomarańczowej występuje w szeregu czasowym; Istnieje 10 dopasowań dla tej dwuskładnikowej sekwencji. Po drugie, policz, ile razy pierwszy trzyskładnikowy wzorzec sekwencji, czerwono-pomarańczowo-żółty, występuje w szeregu czasowym; Istnieje 5 dopasowań dla tej trzyskładnikowej sekwencji. Kontynuuj w ten sposób dla następnej sekwencji dwuskładnikowej (pomarańczowo-żółta) i sekwencji trzyskładnikowej (pomarańczowo-żółto-zielona). Liczba dopasowań dwuskładnikowych (5) i trójskładnikowych (3) dla tych sekwencji jest dodawana do poprzednich wartości (łączna liczba dopasowań dwuskładnikowych = 15; łączna liczba dopasowań trzyskładnikowych = 8). Powtórz te czynności dla wszystkich innych dopasowań sekwencji w szeregach czasowych (do N - m), aby określić łączny stosunek dopasowań dwuskładnikowych do dopasowań trzyskładnikowych. Entropia próbki jest logarytmem naturalnym tego stosunku. Dla każdego podmiotu oblicz oszacowanie MMP specyficzne dla kanału jako średnią z pomiarów entropii pojedynczej próby dla każdej skali czasowej.

Rysunek 6. Różnice w warunkach ERP (A), mocy spektralnej (B), MSE (C) kontrastujące początkowe i wielokrotne prezentacje zdjęć twarzy. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą postać.

Rysunek 7. Porównanie odpowiedzi EEG na poznane twarze w różnych pomiarach ERP, mocy spektralnej i entropii wieloskalowej. Wykresy słupkowe przedstawiają kontrast między warunkami wyznaczonymi za pomocą częściowej analizy najmniejszych kwadratów 11. Wykres obrazu podkreśla rozkład przestrzenno-czasowy, przy którym ten kontrast był najbardziej stabilny, określony przez bootstrapping. Wartości reprezentują wyniki ~z, a wartości ujemne oznaczają istotność dla efektu warunku odwrotnego. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą postać.
Nie stwierdzono konfliktu interesów.
Badacze neuroobrazowania zazwyczaj uważają reakcję mózgu za średnią aktywność w powtarzających się próbach eksperymentalnych i ignorują zmienność sygnału w czasie jako "szum". Staje się jednak jasne, że w tym szumie jest sygnał. W artykule opisano nowatorską metodę entropii wieloskalowej do ilościowego określania zmienności sygnałów mózgowych w dziedzinie czasu.
| Badanie EEG | BioSemi |