Część A: Immunohistochemia
Przygotowanie płytki 96-dołkowej i zapobieganie barwieniu tła Biopsje skóry z ponczu są pobierane od ludzi i inkubowane przez 12-24 godziny w roztworze utrwalającym (2% paraformaldehydu z 0,75 M roztworem L-lizyny (pH 7,4) i 0,05 mM periodianem sodu) w temperaturze 4 °C, jak opisano wcześniej 8. Próbki są następnie kriozabezpieczone w roztworze soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) z 20% glicerolem w temperaturze 4 °C przez okres do 1 tygodnia, zatopione w podłożu montażowym o optymalnej temperaturze cięcia (OCT), a następnie podzielone na sekcje o grubości 50 μm na kriostacie. Opisany poniżej protokół jest przeznaczony dla 8 odcinków skóry, co stanowi maksymalną liczbę skrawków skóry, które można poddać immunohistochemii swobodnej w jednej 96-dołkowej płytce.
DZIEŃ 1:
1. Zapobieganie nieswoistej immunoreaktywności w warstwie rogowej naskórka
- Oznaczyć płytkę 96-dołkową, jak pokazano na rysunku 1.
- Dodać 150 μl sygnału Image-IT FX (Image-IT), skutecznego do blokowania barwienia tła 11,12, do każdej studzienki w rzędzie 1 płytki 96-dołkowej.
- Dodać 150 μl 1X PBS do każdego dołka w rzędzie 2 i 3 płytki 96-dołkowej.
- Pobrać dwa skrawki 50 μm na pacjenta: jeden wycinek z biopsji pobranej w DL, jeden wycinek z biopsji pobranej w PT. Pętla zaszczepiająca (LeLoop) służy do przenoszenia skrawków z jednego płukania do drugiego, aby uniknąć uszkodzeń morfologicznych. Delikatnie przenieść każdy odcinek o wielkości 50 μm, za pomocą pętli zaszczepiającej, do indywidualnego dołka w rzędzie 1, zawierającego Image-IT. Inkubuj sekcje w Image-IT przez 30 minut w RT na płaskim rockerze.
- Przepłukać sekcje dwukrotnie 1X PBS (rzędy 2 i 3) przez 10 minut w temperaturze pokojowej. Umieść płytkę studzienkową na płaskim kołysku między płukaniami.
2. Przygotowanie 5% roztworu blokującego BSA i 1% roztworu płuczącego
- Podczas inkubacji skrawków biopsji w Image-IT należy przygotować 5% roztwór blokujący (5% BSA, 0,3% TX-100, 0,1 M PBS-Vortex roztwór aż do całkowitego rozpuszczenia BSA).
- Dodać 150 μl 5% roztworu blokującego BSA do każdego dołka w rzędzie 4.
- Za pomocą pętli zaszczepiającej przenieś skrawki do indywidualnych studzienek z 5% roztworem blokującym BSA. Inkubuj sekcje w 5% roztworze blokującym BSA przez 1-2 godziny przy temperaturze pokojowej na płaskim wahaczu.
3. Przygotowanie 1% roztworu płuczącego BSA i rozcieńczenie przeciwciał pierwszorzędowych
- Podczas inkubacji skrawków w 5% roztworze blokującym BSA, należy przygotować 1% roztwór do płukania (1% BSA, 0,3% TX-100, 0,1 M PBS-Vortex roztwór, aż BSA całkowicie się rozpuści).
- Podczas gdy sekcje inkubują się w 5% roztworze blokującym BSA, rozcieńczyć przeciwciała pierwszorzędowe w 1% roztworze do płukania.
- Na osiem sekcji (8 x 150 μl = 1 200 μl) potrzeba łącznie 1 200 μl. Przeciwciała pierwszorzędowe składają się z 1 500 μl (około 20% dodatkowej objętości).
- Rozcieńczenia przeciwciał pierwszorzędowych: PGP, 1:500; Trk A, 1:500 w 1% roztworze płuczącym BSA.
4. Inkubacja biopsji podzielonej na sekcje w pierwotnym przeciwciałie
- Dodać 150 μl rozcieńczonych przeciwciał pierwszorzędowych do wyznaczonych dołków płytki 96-dołkowej (rząd 5).
- Przenieść skrawki z 5% roztworu blokującego (wiersz 4) do wyznaczonych studzienek na przeciwciała pierwotne (wiersz 5).
- Uszczelnij 96-dołkową płytkę parafilmem i folią aluminiową, aby uniknąć wysuszenia i ekspozycji na światło.
- Inkubować 96-dołkową płytkę O/N w temperaturze 4 °C na płaskim kołysku.
DZIEŃ 2:
5. Płukanie biopsji w 1% roztworze do płukania BSA
- Dodać 150 μl 1% roztworu płuczącego BSA do każdej studzienki w rzędzie 6, 7 i 8.
- Przepłukać sekcje trzykrotnie 1% roztworem płuczącym BSA (rzędy 6, 7 i 8) przez 1 godzinę za każdym razem w temperaturze suchej masy. Przykryj płytkę studzienki folią aluminiową i umieść na płaskim wahaczu między płukaniami.
6. Rozcieńczenie przeciwciał drugorzędowych
- Podczas gdy skrawki inkubuje się w ostatnim płukaniu 1% roztworu płuczącego BSA (wiersz 8), rozcieńczyć przeciwciała drugorzędowe w 1% roztworze płuczącym BSA:
- Na osiem sekcji (8 x 150 μl = 1 200 μl) potrzeba łącznie 1 200 μl. Przeciwciała drugorzędowe składają się z 1 500 μl (około 20% dodatkowej objętości).
- Rozcieńczenia przeciwciał drugorzędowych: dla PGP (Alexa Fluor 488 osła anty-królik, 1:250), dla Trk A (Alexa Fluor 647 ośla anty-koza, 1:250) w 1% roztworze płuczącym BSA.
7. Inkubacja biopsji wycinkowych w przeciwciałach wtórnych
- Dodać 150 μl rozcieńczonych przeciwciał drugorzędowych do wyznaczonych dołków na 96-dołkowej płytce (wiersz 9).
- Przenieść skrawki z 1% roztworu blokującego BSA (wiersz 8) do dołka przeciwciał drugorzędowych (wiersz 9).
- Uszczelnij 96-dołkową płytkę parafilmem i folią aluminiową, aby uniknąć wysuszenia i ekspozycji na światło.
- Inkubować skrawki w wyznaczonych przeciwciałach drugorzędowych O/N w temperaturze 4 °C na płaskim wahaczu.
8. Płukanie biopsji w 1% roztworze do płukania BSA
- Dodać 150 μl 1% roztworu płuczącego BSA do każdej studzienki w rzędzie 10, 11 i 12.
- Przepłukać sekcje trzykrotnie 1% roztworem płuczącym BSA (rzędy 10, 11 i 12) za każdym razem przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej. Przykryj płytkę studzienki folią aluminiową i umieść na płaskim wahaczu między płukaniami.
9. Przygotowanie preparatów mikroskopowych i montaż biopsji sekcyjnych
- Podczas inkubacji skrawków biopsji w ostatnim płukaniu 1% roztworu płuczącego BSA (rząd 12), należy przygotować szkiełka mikroskopowe.
- Umieszczać 50 μl 1% roztworu płuczącego BSA na jednym szkiełku na raz.
- Usunąć skrawki z 1% roztworu płuczącego BSA (rząd 12) i umieścić je w kropli 50 μl 1% roztworu płuczącego BSA na wyznaczonym szkiełku mikroskopowym. Po zoptymalizowaniu położenia sekcji, usunąć nadmiar 1% roztworu płuczącego BSA za pomocą szklanej pipety z bańką, zachowując środki ostrożności, aby uniknąć dotykania próbki.
UWAGA: Upewnij się, że sekcja nie jest zagięta; próbka powinna przylegać płasko do powierzchni szkiełka mikroskopowego.
- Umieść 1 kroplę odczynnika do mocowania zapobiegającego blaknięciu Prolong Gold z DAPI w pobliżu biopsji na szkiełku mikroskopowym. Weź szkiełko nakrywkowe mikroskopu o wymiarach 22x22 mm i delikatnie umieść je na biopsji i kropli odczynnika przeciwblaknięcia Prolong Gold z kroplą DAPI. Powtórz te czynności dla każdej sekcji.
- Pozwól szkiełkom mikroskopowym wyschnąć O/N przy RT w ciemności.
UWAGA: Usuń wszelkie pęcherzyki powietrza za pomocą końcówki pipety. Zetrzyj nadmiar odczynnika zapobiegającego blaknięciu Prolong Gold.
Część B: Obrazowanie konfokalne
10. Obrazowanie konfokalne
- Obrazuj sygnały fluorescencji za pomocą laserowego skaningowego mikroskopu konfokalnego Olympus FluoView 500 z 40-krotnym obiektywem olejowym (1,3 NA) i dwukrotnym zoomem za pomocą oprogramowania FluoView w wersji 5.0.
- Użyj Alexa Fluor 488 i Alexa Fluor 647, aby wzbudzić odpowiednio zielony laser HeNe 543 nm i czerwony laser HeNe 633 nm. Sygnał Alexa Fluor 488 jest reprezentowany przez zieloną tabelę przeglądową (LUT), a Alexa Fluor 647 przez czerwoną tablicę LUT.
- Ustaw apertury konfokalne dla każdego detektora na 400 μm, aby wzmocnić sygnały. Skany sekwencyjne powinny być wykonywane w rozdzielczości 1,024 x 1,024, aby zmaksymalizować separację sygnału.
- Rejestruj trójwymiarowe obrazy z serii Z przy użyciu interwałów kroku Z 1,2 μm (w oparciu o optymalną jednostkę skanującą obliczoną przez oprogramowanie FluoView) z uśrednianiem Kalmana (dwie klatki).
Część C: Trójwymiarowa wizualizacja i animacja
11. Trójwymiarowa (3D) wizualizacja i animacja
- Otwórz pliki Fluoview w oprogramowaniu Imaris x64 (wersja 7.3, Bitplane AG), aby zobrazować zestawy obrazów 3D.
- Dostosuj wyświetlacz zgodnie z potrzebami, aby zwiększyć kontrast sygnału specyficznego dla nerwu.
- Utwórz powierzchnię, aby uwidocznić granicę skórno-naskórkową. Użyj narzędzia Kontur w trybie rysowania, aby narysować obwiednię.
- Przypisz półprzezroczystą powierzchnię do granicy, aby zobaczyć leżące pod nią sygnały fluorescencyjne.
- Uchwyć nieruchome obrazy sygnałów fluorescencyjnych 3D, aby utworzyć obrazy migawkowe filmu 3D.
- Użyj funkcji Animacja, aby utworzyć film 3D. Obrazy można kilkakrotnie obrócić o 360 stopni, aby pokazać każdy sygnał osobno i połączyć (rysunki 2, 3 i 4). Ustaw animację, aby tworzyć filmy składające się z 200 klatek animowanych z prędkością 15 klatek na sekundę. Zapisz każdy film jako nieprzetworzony plik AVI.
- Skompresuj końcowy film AVI za pomocą oprogramowania VirtualDub (wersja 1.9.4).