RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
pl_PL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Opisujemy protokół produkcji i pomiaru urządzeń dla biosensorów wysokiej częstotliwości opartych na nanorurkach węglowych. Technika wykrywania wysokiej częstotliwości łagodzi podstawowy efekt ekranowania jonowego (Debye) i umożliwia pracę biosensora z nanorurkami w roztworach o wysokiej sile jonowej, w których zawodzą konwencjonalne bioczujniki elektroniczne. Nasza technologia stanowi unikalną platformę dla elektronicznych bioczujników przyłóżkowych (POC) działających w warunkach fizjologicznie istotnych.
Unikalne właściwości elektroniczne i wysoki stosunek powierzchni do objętości jednościennych nanorurek węglowych (SWNT) i nanodrutów półprzewodnikowych (NW) 1-4 sprawiają, że są one dobrymi kandydatami na biosensory o wysokiej czułości. Kiedy naładowana cząsteczka wiąże się z taką powierzchnią czujnika, zmienia gęstość nośnika5 w czujniku, powodując zmiany w jego przewodności prądu stałego. Jednak w roztworze jonowym naładowana powierzchnia przyciąga również przeciwjony z roztworu, tworząc podwójną warstwę elektryczną (EDL). Ten EDL skutecznie odsiewa ładunek, a w fizjologicznie istotnych warunkach ~100 milimolowych (mM), charakterystyczna długość ekranu ładunku (długość Debye'a) jest mniejsza niż nanometr (nm). Tak więc w roztworach o wysokiej sile jonowej wykrywanie oparte na ładunku (DC) jest zasadniczo utrudnione6-8.
Przezwyciężamy efekty ekranowania ładunków, wykrywając dipole molekularne, a nie ładunki o wysokiej częstotliwości, używając tranzystorów z efektem pola nanorurek węglowych jako mikserów wysokiej częstotliwości9-11. Przy wysokich częstotliwościach siła napędowa prądu przemiennego nie jest już w stanie pokonać oporu roztworu, a jony w roztworze nie mają wystarczająco dużo czasu, aby utworzyć EDL. Co więcej, technika mieszania częstotliwości pozwala nam działać na częstotliwościach wystarczająco wysokich, aby przezwyciężyć ekranowanie jonowe, a jednocześnie wykrywać sygnały detekcji na niższych częstotliwościach11-12. Ponadto wysoka transkonduktancja tranzystorów SWNT zapewnia wewnętrzne wzmocnienie sygnału detekcji, co eliminuje potrzebę stosowania zewnętrznego wzmacniacza sygnału.
Tutaj opisujemy protokół (a) produkcji tranzystorów SWNT, (b) funkcjonalizacji biomolekuł do nanorurki13, (c) zaprojektowania i naniesienia na urządzenie komory mikroprzepływowej z poli-dimetylosiloksanu (PDMS)14, oraz (d) przeprowadzenia wykrywania wysokiej częstotliwości w różnych roztworach siły jonowej11.
Gdy naładowana cząsteczka wiąże się z elektronicznym czujnikiem SWNT lub NW, może albo oddawać/przyjmować elektrony, albo działać jako lokalna bramka elektrostatyczna. W obu przypadkach związana cząsteczka może zmienić gęstość ładunku w kanale SWNT lub NW, prowadząc do zmiany zmierzonej przewodności prądu stałego czujnika. Duża różnorodność cząsteczek15-20 została z powodzeniem wykryta poprzez badanie charakterystyki prądu stałego nanoczujników podczas takich zdarzeń wiązania. Mimo że mechanizm wykrywania oparty na wykrywaniu ładunku ma wiele zalet, w tym wykrywanie bez etykiet21, czułość femtomolową22 i możliwość elektronicznego odczytu15; Jest skuteczny tylko w roztworach o niskiej sile jonowej. W roztworach o wysokiej sile jonowej wykrywanie prądu stałego jest utrudnione przez ekranowanie jonowe6-8. Naładowana powierzchnia przyciąga przeciwjony z roztworu, który tworzy podwójną warstwę elektryczną (EDL) w pobliżu powierzchni. EDL skutecznie odsiewa te opłaty. Wraz ze wzrostem siły jonowej roztworu EDL staje się węższy, a przesiewanie wzrasta. Ten efekt przesiewania charakteryzuje się długością przesiewania Debye'a λD,

, gdzie ε jest przenikalnością dielektryczną ośrodka, kB jest stałą Boltzmanna, T jest temperaturą, q jest ładunkiem elektronu, a c jest siłą jonową roztworu elektrolitu. Dla typowego roztworu buforowego 100 mM λ D wynosi około 1 nm, a potencjał powierzchniowy zostanie całkowicie przesienięty w odległości kilku nm. W rezultacie, większość czujników nanoelektronicznych opartych na SWNT lub NW działa albo w stanie suchym20, albo w roztworach o niskiej sile jonowej5,15,17,21-22 (c ~ 1 nM - 10 mM); W przeciwnym razie próbkę należy poddać etapom odsalania15,23. Urządzenia diagnostyczne w miejscu opieki nad pacjentem muszą działać z fizjologicznie istotną siłą jonową w miejscu pacjenta przy ograniczonych możliwościach przetwarzania próbek. W związku z tym łagodzenie efektu przesiewowego jonów ma kluczowe znaczenie dla rozwoju i wdrożenia nanoelektronicznych bioczujników POC.
Łagodzimy efekt ekranowania jonowego, używając nanoelektronicznego czujnika opartego na SWNT w zakresie częstotliwości megaherców. Przedstawiony tutaj protokół szczegółowo opisuje wytwarzanie nanoelektronicznej platformy detekcyjnej opartej na tranzystorze SWNT i pomiar mieszania wysokiej częstotliwości do detekcji biomolekularnej. Jednościenne nanorurki węglowe są hodowane przez chemiczne osadzanie z fazy gazowej na podłożach wzorowanych za pomocą katalizatorów Fe24. W naszych tranzystorach SWNT stosujemy zawieszoną górną bramkę25 umieszczoną 500 nm nad nanorurką, co pomaga poprawić reakcję czujnika wysokiej częstotliwości, a także pozwala na kompaktową komorę mikroprzepływową do uszczelnienia urządzenia. Tranzystory SWNT są eksploatowane jako miksery wysokiej częstotliwości9-11 w celu przezwyciężenia efektów ekranowania jonów tła. Przy wysokich częstotliwościach ruchome jony w roztworze nie mają wystarczająco dużo czasu, aby utworzyć EDL, a fluktuujące dipole biomolekularne mogą nadal bramkować SWNT, aby wygenerować prąd mieszający, który jest naszym sygnałem czujnikowym. Mieszanie częstotliwości wynika z nieliniowej charakterystyki I-V tranzystora FET z nanorurek. Nasza technika detekcji różni się od konwencjonalnych technik detekcji opartej na ładunku i spektroskopii impedancyjnej26-27. Po pierwsze, wykrywamy dipole biomolekularne o wysokiej częstotliwości, a nie związane z nimi ładunki. Po drugie, wysoka transkonduktancja tranzystora SWNT zapewnia wewnętrzne wzmocnienie sygnału detekcji. Eliminuje to potrzebę zewnętrznego wzmacniania, jak w przypadku pomiarów impedancji wysokiej częstotliwości. Ostatnio inne grupy również zajęły się detekcją biomolekularną w wysokich stężeniach tła23,28. Jednak metody te są bardziej skomplikowane, wymagają skomplikowanego wytwarzania lub starannej inżynierii chemicznej cząsteczek receptorów. Nasz czujnik SWNT wysokiej częstotliwości ma prostszą konstrukcję i wykorzystuje naturalną właściwość mieszania częstotliwości tranzystora nanorurkowego. Jesteśmy w stanie złagodzić efekty przesiewowych badań jonowych, obiecując w ten sposób nową platformę biosensoryczną do wykrywania w miejscu opieki nad pacjentem w czasie rzeczywistym, gdzie pożądane są bioczujniki działające bezpośrednio w fizjologicznie istotnych warunkach.
1. Wzorce katalizatora dla wzrostu SWNT
Porada: Zaprojektuj doły o różnych rozmiarach, np. 5 mikronów x 5 mikronów, 10 mikronów x 5 mikronów itd., aby uwzględnić zmienność procesu wzrostu chemicznego osadzania z fazy gazowej (CVD) SWNT.
2. Wzrost CVD nanorurek węglowych
Porada: Określ idealne miejsce dla wzrostu nanorurek. Wzrost jest równomierny na obszarze 2 cale x 2 cale za naszym piecem (rysunek 2c).
3. Produkcja tranzystorów SWNT FET
Porada: Rozsuń elektrody daleko od siebie na matrycy, aby pozostały dostępne nawet po umieszczeniu mikro-przepływowego stempla na obszarze aktywnej nanorurki.
Porada: Użyj grubej warstwy chromu, aby zwiększyć wytrzymałość zawieszonej górnej bramy. Wymiary bramy mają również kluczowe znaczenie dla skutecznego zawieszenia.
Wskazówka: Zalecana jest kalibracja czasu wytrawiania.
4. Chemiczna funkcjonalizacja ścian bocznych z nanorurek węglowych
Uwaga: Płuczemy matrycę, dozując wodę DI (~50 ml) na matrycę za pomocą butelki do wyciskania. Następnie przenosimy kostkę na inną szalkę Petriego zawierającą wodę demineralizowaną i przesuwamy kostkę przez 1 minutę. Powtarzamy te dwa kroki w sumie 8-10 razy.
5. Przygotowanie formy z polidimetylosiloksanu (PDMS) do komory płynów
Porada: Jeśli mieszanina zacznie się pienić, przewietrz komorę i pozwól jej się uspokoić na kilka sekund przed ponownym odgazowaniem.
Tip: Strona PDMS bezpośrednio stykająca się z płytką krzemową jest czysta i wyjątkowo płaska. Ta strona będzie w kontakcie z matrycą SWNT FET. Uważaj, aby go nie zanieczyścić.
Porada: Można to zrobić gołym okiem lub za pomocą mikroskopu optycznego z wystarczającą ilością miejsca do pracy. Jeśli PDMS nie przylega dobrze (zwykle jeśli matryca i/lub stempel PDMS nie są czyste), wykonaj plazmę tlenową (20 watów, 15 sekund) na PDMS, aby wspomóc wiązanie. Użycie mocy plazmy wyższej niż ta prowadzi do silniejszego wiązania, jednak w takim przypadku zaobserwowaliśmy rozerwanie elektrod podczas usuwania PDMS.
6. Przygotowanie kanału przepływu mikroprzepływowego
Porada: Aby uniknąć zawalenia się konstrukcji, wystarczy stosunek szerokości kanału do wysokości 10:1 (w tym przypadku 300 μm: 30 μm).
7. Konfiguracja pomiaru elektrycznego prądu stałego
Porada: Dla pomiarów w roztworze, utrzymuj parametr przemiatania napięcia bramki w granicach |0,7 wolta|, aby uniknąć wycieku i reakcji między metalową elektrodą bramki a roztworem.
8. Konfiguracja pomiaru elektrycznego prądu przemiennego
9. Pomiary elektryczne w roztworze (brak przepływu)
Porada: Użyj pipety, aby pobrać poprzedni roztwór, a następnie kilkakrotnie przepłukać komorę nowym roztworem. Zawsze zmieniaj roztwory o niskim i wysokim stężeniu.
10. Pomiar elektryczny w roztworze (przepływ w czasie rzeczywistym)
Obraz tranzystora SWNT z zawieszoną górną bramką ze skaningowego mikroskopu elektronowego jest pokazany na rysunku 7a. Wymiary bramy mają kluczowe znaczenie dla zawieszenia25. Obecne wymiary konstrukcyjne to (długość x szerokość x grubość = 25 μm x 1 μm x 100 nm). Elektroda bramkowa składa się z 50 nm Cr/50 nm Au; Gruba warstwa chromu zwiększa wytrzymałość zawieszonej konstrukcji. O podwieszeniu konstrukcji świadczy brak prądu upływowego między górną bramą a odpływem (rysunek 7b).
Używamy systemu ligand-receptor biotyna-streptawidyna do oceny naszego czujnika SWNT. Aby scharakteryzować powodzenie funkcjonalizacji ścian bocznych, monitorujemy krzywe przenoszenia prądu stałego FET w powietrzu po każdym etapie funkcjonalizacji. Rysunek 7c ilustruje, że krzywa przenoszenia przesuwa się w prawo po biotynylacji (kolor czerwony) i związaniu streptawidyny (kolor niebieski). Można to przypisać bramkowaniu elektrostatycznemu przez elektroujemne grupy aminowe obecne na biotynie, PEO-aminie i streptawidynie.
Dla pomiarów o wysokiej częstotliwości, postępujemy zgodnie ze schematem pokazanym na rysunku 5b. Nieliniowa charakterystyka I-V tranzystora SWNT miesza wejścia wysokiej częstotliwości w źródle i bramce, aby uzyskać wyjście prądu mieszającego,mieszam, który jest naszym sygnałem czujnikowym. Rysunek 7d przedstawiamieszankę I mierzoną w funkcji napięcia bramki dla typowego urządzenia w 100 mM NaCl. Prąd mieszania dla wejścia modulowanego AM przy częstotliwości modulacji, ωm, jest określony przez10-11

, gdzie m oznacza głębokość modulacji, vac oznacza amplitudę wejściową AM, a ∂G/∂Vg oznacza transkonduktancję urządzenia (nachylenie krzywej Idc-V g na rysunku 7d). Wyniki prądu mieszania (m = 0,78 i vac = 20 mV) dobrze zgadzają się z modelem, jak pokazano na rysunku. W przypadku statycznych pomiarów fluidycznych porównujemy szczyt takich przemiatania prądu mieszania dla funkcjonalizowanych nanorurek. W przypadku pomiarów przepływu ustalamy częstotliwość nośną sygnału modulowanego AM i ustalamy napięcie bramki (Vg = 0) oraz monitorujemymieszankę I pod kątem wiązania biomolekularnego w funkcji czasu, utrzymując stały przepływ płynu. Rysunek 7e-7f przedstawia reprezentatywne wyniki zarówno dla pomiarów statycznych, jak i przepływowych.
Do detekcji biomolekularnej konieczne jest, aby CNT był wystawiony bezpośrednio na działanie roztworu, tzn. SiO2 jest całkowicie wytrawiany podczas etapu wytrawiania BHF. Jeśli ten warunek nie jest spełniony, chemiczna modyfikacja CNT nie jest możliwa, ponieważ cząsteczka łącznika nie może układać się wzdłuż ściany bocznej nanorurki. Jest to wyraźnie zilustrowane na rysunku 7g, gdzie nie widzimy żadnych zmian przed i po związaniu, nawet w wodzie DI dla urządzenia pasywowanego SiO2. Dowodzi to również, że wyniki naszych pomiarów wskazują na udaną modyfikację chemiczną, a także detekcję biomolekularną w wysokich stężeniach jonów tła. We wszystkich pomiarach zaobserwowaliśmy, że odpowiedź czujnika spada powyżej 30 MHz, co jest spowodowane rezonansem z konfiguracji.

Rysunek 1. Przebieg procesu produkcji tranzystorów nanorurkowych. (a) Proces produkcyjny - (1) Warstwa fotomaski-1 (PL-1) do osadzania katalizatora, (2) unoszenie metalu, (3) wzrost CNT, (4) PL-2 do kontaktu źródło-dren, (5) metalowe liftoff, (6) osadzanie koca SiO2, (7) PL-3 do styku bramy, (8) metalowe liftoff, (9) cienkie osadzanie SiO2, (10) PL-4 do mokrego kanału trawienia BHF i (11) urządzenie końcowe po usunięciu fotorezystu. Kolorystyka jest zilustrowana. (b) Schemat budowy urządzenia.

Rysunek 2. Wzrost nanorurek węglowych. (a) Etap wyżarzania w celu usunięcia pozostałości fotorezystu, (b) etap wzrostu dla wzrostu CNT i (c) umieszczenie urządzenia w piecu wzrostowym.

Rysunek 3. Schemat blokowy chemicznej funkcjonalizacji CNT.

Rysunek 4. Pieczęć PDMS do pomiarów roztworu. lit. a)-b) Pomiary statyczne (brak przepływu). (a) Wykrawanie i montaż komory PMDS na urządzeniu, (b) Schemat ideowy komory przepływowej na urządzeniu. lit. c)-e) Pomiary przepływu. (c) Przebieg procesu dla kanału przepływowego PDMS przy użyciu formy SU-8. (1) Fotomaska do definiowania kanału przepływu, (2) usieciowana forma SU-8, (3) PDMS na SU-8 i (4) kanał przepływu PDMS wybity na urządzeniu. (d) Schemat ideowy kanału przepływowego na urządzeniu oraz (e) Wykrawanie otworów wlotowych/wylotowych w PDMS, tłoczenie kanału przepływowego na urządzeniu i podłączanie przewodów polietylenowych do portów wlotowych/wylotowych.

Rysunek 5. Konfiguracja pomiaru elektrycznego. (a) Schemat pomiaru prądu DC, (b) Schemat pomiaru prądu mieszania prądu przemiennego oraz (c) obraz zestawu doświadczalnego do pomiaru mieszania częstotliwości modulowanej AM. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą postać.

Rysunek 6. Konfiguracja pomiaru przepływu. a) Obraz całego układu pomiarowego; b) pompa strzykawkowa i stacja sondy; oraz (c) obraz urządzenia z kanałem przepływowym PDMS, rurkami przepływowymi wlotowymi/wylotowymi i sondami elektrycznymi.

Rysunek 7. Reprezentatywne wyniki dla biosensora SWNT. (a) obraz SEM typowego zawieszonego urządzenia z górną bramką, (b) nieszczelność drenu bramki w celu potwierdzenia zawieszonej struktury, (c) krzywa Idc-V g dla nieskazitelnie czystych nanorurek FET (), po biotynylacji (czerwona) i po związaniu streptawidyny (niebieska) mierzona w powietrzu, (d) prąd stały, Idc (, Vsd = 10 mV) i prąd mieszający, mieszam (czerwony, modulacja f = 200 kHz) w funkcji Vg dla urządzenia w 100 mM roztworze NaCl. Dla porównania pokazano równieżteoretyczną mieszaninę I otrzymaną za pomocą modelu z równania (1) (▲). e) Mieszam krzyweV g dla biotynylowanego (czarnego) i związanego ze streptawidyną i biotyną (czerwonego) SWNT w 100 mM NaCl przy f = 10 MHz, (f) pomiar przepływu w czasie rzeczywistym w celu wykrycia wiązania streptawidyny w 100 mM NaCl oraz (g) zmiana sygnału po związaniu w całkowicie pasywowanym urządzeniu kontrolnym w wodzie DI o różnych częstotliwościach. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą postać.
Autorzy oświadczają, że nie mają konkurencyjnych interesów finansowych.
Opisujemy protokół produkcji i pomiaru urządzeń dla biosensorów wysokiej częstotliwości opartych na nanorurkach węglowych. Technika wykrywania wysokiej częstotliwości łagodzi podstawowy efekt ekranowania jonowego (Debye) i umożliwia pracę biosensora z nanorurkami w roztworach o wysokiej sile jonowej, w których zawodzą konwencjonalne bioczujniki elektroniczne. Nasza technologia stanowi unikalną platformę dla elektronicznych bioczujników przyłóżkowych (POC) działających w warunkach fizjologicznie istotnych.
Dziękujemy prof. Paulowi McEuenowi z Cornell University za wczesną dyskusję. Prace są wspierane przez fundusz start-up zapewniony przez University of Michigan i National Science Foundation Scalable Nanomanufacturing Program (DMR-1120187). W pracy wykorzystano Lurie Nanofabrication Facility na Uniwersytecie Michigan, członka Narodowej Sieci Infrastruktury Nanotechnologicznej finansowanej przez National Science Foundation.
| AGENT | |||
| Odczynniki, które zostały dostarczone w Lurie Nanofabrication Facility (University of Michigan) są oznaczone jako LNF w kolumnie katalogu. Chemikalia, które wymagają wyposażenia ochronnego (rękawice, okulary ochronne, maska na twarz, fartuch) i/lub wyciąg spalinowy, są oznaczone środkami ochrony osobistej w sekcji komentarzy. | |||
| Płytki krzemowe (typ P, < 100>, 500-550 μ m gruby) | Silicon Valley Microelectronics | ||
| SPR 220 3.0 | Dow (Rohm and Haas) | Megaposit SPR | PPE |
| AZ 300MIF | AZ Electronic Material Corporation | PPE | |
| Aceton | J T Baker | 9005-05 | PPE |
| Izopropanol (IPA) | J T Baker | 9079-05 | |
| Buforowany kwas fluorowodorowy | Transen | PPE | |
| Kwas 1-pirenowo-butanowy, ester sukcynimidylu | Sondy molekularne | P130 | PPE |
| Biotyna PEO Amine | Thermo Scientific | EZ-Link PEG2 Biotyna, # 21346 | PPE |
| Streptawidyna | Invitrogen | S 888 | PPE |
| Dimetyloformamid | MP Biomedicals | 0219514791 | PPE |
| Polidimetylosiloksan Baza elastomerowa i utwardzacz | Dow Corning | Sylgard 184 Zestaw elastomerów | PPE |
| SU-8 2015 | Microchem | Y111064 | PPE |
| SU-8 Developer | Microchem | Y020100 | PPE |
| Środek silanizujący | Sigma | Aldrich 452807 | PPE |
| Czystość wodoru | Plus | LNF | |
| Czystość etylenu | Plus | LNF | |
| Argon | System soli fizjologicznej buforu fosforanowegoPurity Plus | LNF | |
| Sigma Aldrich | PBS1 | ||
| EQUIPMENT | |||
| Sprzęt dostarczony przez Lurie Nanofabrication Facility (University of Michigan) jest oznaczony jako LNF w kolumnie Katalog. | |||
| GCA 200 Autostepper | GCA | LNF | |
| Niskociśnieniowe narzędzie do chemicznego osadzania z fazy gazowej | Tempress | LNF | |
| Parownik e-beam | Enerjet | LNF | |
| Piec wzrostowy CNT | Pierwszy Nano | Easy Tube 3000 (LNF)Fotomaski | |
| Nanofilm LNF | |||
| szalka Petriego (150mm) | LNF | ||
| Eksykator | Bel-Art | F420100000 | |
| Dziurkacz do biopsji | Ted Pella | 15071/78 | |
| Skalpel | Ted Pella | 548 | |
| Rurka polietylenowa PE-50 | VWR | 20903-414 | |
| Pompa strzykawkowa | New Era Systemy pomp | NE-1000 | |
| Strzykawka | Fisher Scientific | BD Safety-Lok Strzykawki | |
| Igły strzykawkowe | Fisher Scientific | 14-821-13A | |
| Karta DAQ | National Instruments | 779111-01 | |
| Złącze GPIB | National Instruments | 778032-51 | |
| Wzmacniacz blokujący | Generator częstotliwości Stanford Research Systems | SR 830 | |
| HP Agilent | 8648B, 9kHz -2GHz | ||
| Bias Tee | Picosecond | 5575A-104 | |
| Przedwzmacniacz prądowy | DL Instruments, LLC | DL 1211 | |
| BNC | Allied Electronics | 665-xxxx | |
| SMA | Sentro Tech Corp | SCF65141 | |