$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Opisany powyżej protokół pozwala na łatanie rekordu zaciskowego z komórek M i ich homologów. Technika jest trudna i należy zachować ostrożność w kilku kluczowych obszarach podczas całej procedury. Omówimy teraz niektóre z tych obszarów i udzielimy pomocnych wskazówek, które zapewnią sukces.
Konstrukcja komory prosektoryjnej/rejestracyjnej jest kluczowym aspektem eksperymentu. Komórki M są trudne do zobaczenia, chyba że stosuje się kontrast interferencyjny. Nomarski DIC działa najlepiej z czystymi szklanymi szkiełkami nakrywkowymi, ale stwierdziliśmy, że bardzo cienka warstwa Sylgard (~1-2 mm) nie zniekształci DIC do tego stopnia, że zakłóci identyfikację komórek M. Dlatego używamy komory nagraniowej, która ma cienkie szklane szkiełko nakrywkowe na dnie, na którym umieszcza się małą plastikową podkładkę (średnica ~5 mm). Mieszamy Sylgard 184 na szalce Petriego i ostrożnie dodajemy płynny Sylgard do wnętrza myjki za pomocą pipety Pasteura. Sylgard można utwardzać w temperaturze pokojowej przez kilka dni lub można go podgrzać w celu szybkiego utwardzenia. Myjkę można wyjąć po utwardzeniu Sylgardu, chociaż nie jest to konieczne. Po wykonaniu komory preparcyjnej/rejestracyjnej można jej używać przez kilka tygodni, zanim potrzebne będzie świeże szkiełko wyłożone Sylgardem.
Kolejnym krokiem w procedurze jest sporządzenie wszystkich odpowiednich roztworów w dniu doświadczenia (Tabela 3). Roztwory wewnątrzkomórkowe zawierające wszystko oprócz ATP i GTP są przygotowywane z wyprzedzeniem i przechowywane w podwielokrotnościach o pojemności 5 ml w temperaturze -20 °C. W dniu rejestracji podwielokrotność rozmraża się do temperatury pokojowej i dodaje świeże ATP i GTP. Roztwór dostosowuje się do 280 mOsm i pH 7,4. W naszych rękach widzimy, że codzienne dodawanie świeżego ATP i GTP skutkuje dobrymi nagraniami. Wszystkie roztwory muszą być utrzymywane w sterylności, aby mieć największe szanse na sukces.
Roztwory wewnątrzkomórkowe muszą być filtrowane przez filtr 0,22 μm (Sigma) w celu usunięcia małych cząstek i zanieczyszczeń, które mogą mieć wpływ na zapis. Aby to zrobić, najpierw pobieramy roztwór wewnątrzkomórkowy do strzykawki o pojemności 1 ml, przymocowujemy filtr do końca strzykawki i dodajemy plastikową końcówkę pipety, która została podgrzana i pociągnięta do drobnej końcówki, do końca filtra. Dzięki temu możemy nanieść przefiltrowany roztwór wewnątrzkomórkowy bezpośrednio do wnętrza pipet ze szklanymi plastrami.
Po przygotowaniu roztworów zarodek można znieczulić i wypreparować. Przed przystąpieniem do sekcji należy zadbać o odpowiednią ocenę wieku organizmu. Każdy zarodek w lęgu starzeje się w nieco innym tempie. Dlatego przy ocenie wieku organizmu ważne jest, aby robić to zgodnie z ustalonymi procedurami 10,13, wykorzystując wskazówki fenotypowe, takie jak liczba somitów, ogólny kształt ciała i czas zapłodnienia jaj. Wszystkie sekcje są wykonywane za pomocą cienkiej pary kleszczy Dumont #5. Muszą być ostre i w dobrym stanie technicznym, w przeciwnym razie bardzo trudno będzie usunąć skórę pokrywającą tyłomózgowie i tkankę łączną na brzusznej powierzchni tyłomózgowia. Często musimy naostrzyć kleszcze po kilku tygodniach użytkowania i zrobić to sami za pomocą kamienia do ostrzenia.
Aby przypiąć rybę do cienkiej warstwy sylgardu, używamy szpilek wykonanych z cienkiego drutu wolframowego o średnicy 0,001 cala. Szpilki są wycinane starymi nożyczkami do mikropreparacji pod mikroskopem preparacyjnym i są na tyle małe, że mieszczą się w strunie grzbietowej. Przypinanie zarodków w jakimkolwiek innym miejscu nie unieruchamia ich i sprawia, że sekcje są prawie niemożliwe do wykonania. Kiedy po raz pierwszy uczysz się wykonywać nagrania, może być trudno zidentyfikować komórkę M na podstawie jej homologów (szczególnie MiD2 cm, która znajduje się w sąsiednim rombomerze - rombomerze 5). W niektórych zarodkach te dwie pary komórek wydają się mieć podobną wielkość. Otolity stanowią wygodny punkt orientacyjny, który pomaga w identyfikacji komórek M. Przy 48 hpf komórki M znajdują się tuż obok otolitów i mimo że otolity są usuwane podczas sekcji, pozostawiają lekko uszkodzony boczny obszar tyłomózgowia, który służy jako marker ich pierwotnej pozycji. Transgeniczne ryby, które wykazują ekspresję GFP lub innego markera fluorescencyjnego w komórce M, stanowią doskonałe przygotowanie dla nowych eksperymentatorów. W naszych rękach komórki M mają pojemność błony około 18-24 pF przy 48 hpf, podczas gdy mniejsze homologi są bliższe 12-14 pF. Ogniwa o większej powierzchni mają większe wartości pojemności błony (mierzone w pico Faradach (pF)) w porównaniu z mniejszymi ogniwami. W ten sposób pojemność membrany może być używana jako przybliżony wskaźnik wielkości komórki, przy czym większe ogniwa mają większe wartości pojemności. Ta cecha elektrofizjologiczna służy jako kolejna właściwość, dzięki której komórkę M można zidentyfikować na podstawie jej homologów. Wreszcie, często używamy żółtego Lucyfera w naszych rozwiązaniach do nagrywania (wewnątrzkomórkowego), co pozwala nam na przeprowadzenie pewnej identyfikacji badanego typu komórki za pomocą obrazowania fluorescencyjnego po zakończeniu nagrań.
Rezystancje końcówek pipet w zakresie 3,5-4,5 MΩ są najlepszym kompromisem pomiędzy rozmiarem końcówki a niską rezystancją dostępu, która zwykle wynosi od 8 do 15 MΩ. Jest to szczególnie ważne w przypadku zdarzeń z szybką kinetyką; ~0,1 ms (20-80%) czasy narastania i ~0,5 ms wykładnicze rozpady 12,14,15 (rys. 3A i 3B). Dane są pozyskiwane z szybkością digitalizacji 50-100 kHz i filtrowane z częstotliwością dolnoprzepustową 5-10 kHz. Jeśli chodzi o pipety z plastrami, stwierdziliśmy, że nie muszą one być polerowane ogniowo, aby uzyskać nagranie, ale anegdotycznie wydaje się, że oferują nieco większą szansę na uzyskanie dobrych uszczelnień w porównaniu z pipetami niepolerowanymi. Ponieważ końcówki pipet są stosunkowo duże, nie dodajemy zbyt dużego nadciśnienia do pipety przed wprowadzeniem do roztworu. Wymaga to praktyki w decydowaniu o odpowiedniej ilości nadciśnienia, które należy zastosować, ponieważ nadmierne ciśnienie zbyt mocno przesunie komórkę i zapobiegnie tworzeniu się uszczelnienia. Może również uszkodzić kontakty synaptyczne, ponieważ komórka jest delikatnie przemieszczana z pierwotnej pozycji. Z drugiej strony, zbyt mały nacisk powoduje zabrudzenie końcówek i nie czyści powierzchni ogniwa na tyle dobrze, aby utworzyć dobre uszczelnienia. Złoty środek można osiągnąć tylko dzięki znacznej praktyce i doświadczeniu. Tworzenie uszczelnień można usprawnić poprzez zastosowanie ujemnych napięć w pipecie. Zazwyczaj mamy uszczelki o mocy 1,2-2 GΩ, które doskonale nadają się do przełamywania w trybie całego ogniwa.
Gdy konieczne jest zastosowanie środków farmakologicznych do cytoplazmy komórki, włączamy je do roztworu wewnątrzkomórkowego przed napełnieniem pipety. Należy zachować ostrożność podczas przygotowywania roztworów pipet, aby uniknąć utraty środków w wyniku związania ich z filtrem 0,22 μm. Dlatego najpierw filtrujemy pożywkę wewnątrzkomórkową, a następnie ostrożnie dodajemy środek farmakologiczny do przefiltrowanego roztworu. Zastosowanie związków do kompartmentu wewnątrzkomórkowego wiąże się z unikalnym zestawem wyzwań. Na przykład dodanie leków do pożywki wewnątrzkomórkowej zwykle zmniejsza szanse na utworzenie uszczelki GΩ, ale nie do tego stopnia, aby stanowiło główną przeszkodę w eksperymencie.
Należy zdawać sobie sprawę, że zastosowanie środków farmakologicznych w ten sposób nie pozwala eksperymentatorowi na zarejestrowanie najwłaściwszej kontroli, ponieważ czynnik ma natychmiastowy dostęp do komórki od początku całej konfiguracji komórki. Dlatego, chociaż rejestrujemy dane w tego typu eksperymencie, należy mieć świadomość, że następną najlepszą kontrolą jest wewnątrzkomórkowe zastosowanie nieaktywnej formy środka. W wielu przypadkach przybiera to postać związku inaktywowanego termicznie, zaszyfrowanego peptydu lub nieaktywnego izomeru otrzymanego od dostawcy.
Pozyskujemy dane w postaci prądów synaptycznych (mPSC), prądów bramkowanych napięciem oraz potencjałów czynnościowych. Prądy miniaturowe mogą być analizowane przez kilka doskonałych programów (pClamp, Axograph itp.), chociaż my wolimy używać Axograph X (John Clements). Axograph X działa zarówno na platformach Windows, jak i Macintosh i może być używany zarówno do pozyskiwania, jak i analizy danych elektrofizjologicznych. mEPC są pozyskiwane za pomocą wybranego przez eksperymentatora szablonu, uzyskanego z samego zapisu. Poszczególne zdarzenia mogą być analizowane pod kątem takich właściwości, jak czas narastania, amplituda, połowa szerokości i czas zaniku itp. Eksportujemy arkusz kalkulacyjny z danymi do Kaleidagraph (Synergy Software), gdzie możemy wyprodukować liczby, w tym kopie śladów zdarzeń z Axograph X.
Jednym z trudniejszych aspektów eksperymentu jest ustalenie, czy zapis został wykonany na tyle dobrze, aby dostarczyć czystych, wiarygodnych danych. Na przykład mogą wystąpić problemy z zaciśnięciem przestrzeni podczas rejestrowania mPSC z komórek M, które mają duże aksony i rozległe procesy dendrytyczne. Podczas zaciskania napięcia można na ogół dość dobrze kontrolować napięcie na końcówce pipety (zwłaszcza jeśli rezystancja dostępu(Ra) jest niska), ale może nie być właściwej kontroli potencjału membrany w procesach dendrytycznych lub aksonach znajdujących się daleko od końcówki pipety. Jedną z metod określenia, czy komórka była prawidłowo zaciśnięta przestrzennie, jest utworzenie wykresu punktowego czasu narastania w funkcji amplitudy zarejestrowanych mPSC. Korelacja między danymi sugeruje niewystarczające ograniczenie przestrzeni. Innymi słowy, jeśli zacisk przestrzenny jest słaby, wówczas mPSC, które występują w pobliżu pipety, będą miały krótsze czasy narastania i większe amplitudy niż zdarzenia zachodzące w pewnej odległości od pipety. Jeśli korelacja istnieje, dane są problematyczne i nie można ich wykorzystać.
Innym aspektem zapisów elektrofizjologicznych, którym należy się zająć, są prądy upływowe. Jest to szczególnie ważne, gdy ogniwo jest zaciskane napięciem w celu rejestrowania prądów bramkowanych napięciem, takich jak prądy Na+ lub K+ . Gdy potencjał membranowy jest odchylony od spoczynku, prądy upływowe mogą być rejestrowane wraz z aktywnością bramkowaną napięciem. Prądy upływowe (IL), kombinacja prądu potasu (IK), sodu (INa) i chlorku (ICl) przepływające przez kanały bramkowane napięciem zaciemnią interesującą nas aktywność i muszą zostać odjęte od zapisu. Wzmacniacz jest w stanie wykonywać tę funkcję w trybie online podczas nagrywania, uruchamiając to, co zwykle nazywa się protokołem P/N. Podczas protokołu P/N wzmacniacz przeprowadzi kilka małych depolaryzacji (lub hiperpolaryzacji) ze spoczynku i zarejestruje wynikający z tego prąd upływu, który wystąpi. Ważne jest, aby używać wystarczająco małych impulsów, które nie aktywują kanałów bramkowanych napięciem. Prądy, które występują podczas tych impulsów, są rejestrowane i uśredniane, dzięki czemu te prądy upływowe można odjąć od aktywności kanału bramkowanego napięciem.
Na koniec należy wziąć pod uwagę potencjał połączeniowy, który występuje na końcu elektrody między roztworami wewnątrzkomórkowymi i zewnątrzkomórkowymi. Roztwory wewnątrzkomórkowe i zewnątrzkomórkowe zazwyczaj składają się z różnych jonów o różnej aktywności i ruchliwości. Większe jony o mniejszej ruchliwości będą oferować większą oporność na ruch jonów niż mniejsze, co może skutkować niewielką, ale znaczącą różnicą potencjałów na styku roztworów. Ten potencjał złączowy musi być brany pod uwagę przy określaniu odpowiednich napięć doświadczanych przez ogniwo.
Przedstawiona tu technika jest stosowana przez nasze laboratorium od wielu lat. Istnieją jednak alternatywne metody nagrywania z komórki M. Przede wszystkim Joseph Fetcho i współpracownicy opracowali doskonały preparat, w którym można rejestrować z komórek M starszych larw (w wieku 4-5 dni) w sposób mniej inwazyjny niż przedstawiony tutaj, gdzie do komórki M zbliża się od powierzchni grzbietowej16. Próbowaliśmy podobnej techniki, ale okazało się, że łatwiej jest zbliżyć się do komórki M od brzusznej strony tyłomózgowia, gdzie komórka jest bliżej powierzchni mózgu, szczególnie u młodych ryb (tj. 24 hpf do 72 hpf). Co więcej, podejście od powierzchni grzbietowej zwykle wymaga użycia linii transgenicznej, która wyraża znacznik fluorescencyjny w komórce M, co może wprowadzić dodatkowe zmienne do zapisu. Ten problem nie występuje w przypadku używania ryb typu dzikiego. Jednak w przypadku przedstawionej tutaj techniki jesteśmy ograniczeni do badania młodszych zwierząt (od 24 hpf do 72 hpf). Każde podejście ma więc swoje zalety i ograniczenia.
Test t Studenta może być używany do porównywania dwóch grup danych, podczas gdy analiza wariancji (ANOVA) może być używana do porównywania wielu grup. Należy dołożyć starań, aby wybrać odpowiednie badanie post hoc dla danych parametrycznych i nieparametrycznych.