$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Przegląd zasady działania urządzenia ImageStream jest podany na rysunku 1. Tworzy wiele obrazów o wysokiej rozdzielczości każdej komórki w przepływie, w tym jasnego pola (BF), ciemnego pola (DF lub światło rozproszone bocznie) i kanału (kanałów) fluorescencji, jak pokazano na rysunku 2 z trzema różnymi komórkami oznaczonymi CNT. Pokazane są również nakładki tych kanałów, które na pierwszy rzut oka ilustrują korelację.
Biorąc pod uwagę, że cała analiza post-processingu opiera się na obrazowaniu komórek, wybór skoncentrowanych komórek jest kluczowy dla badania (Rysunek 3). W rzeczywistości obecność CNT wywołuje zmiany zarówno w kontraście, jak i gradiencie w porównaniu z komórkami nieznakowanymi: skoncentrowane komórki, po zinternalizowaniu znacznej ilości CNT, mają zwykle niski gradient rms (który jest zwykle unikalnym parametrem używanym do dyskryminacji komórek skupionych i nieostrych), ale także ważny kontrast, wyjaśniający, dlaczego wykres dwuparametryczny jest niezbędny. Na rysunku 3 pokazano rozróżnienie między komórkami nieostrymi (żółty obszar) a komórkami zogniskowanymi (obszar niebieski).
Uwewnętrznione przez komórki CNT są wyraźnie rozróżnialne - szczególnie na BF wyglądają jak silnie absorbujące ciemne plamy (zobacz efekt zróżnicowanego stężenia znakowania, Rysunek 4). Co więcej, przeanalizowano średni sygnał pikselowy na BF, dając względną kwantyfikację wychwytu: wykresy na rysunku 5 pokazują jego znaczny wzrost wraz ze stężeniem znakowania CNT (wyniki dla około 7000 komórek na warunki eksperymentalne).
Po drugie, kwantyfikacja CNT jest również możliwa za pomocą masek, nakładanych albo na ograniczony zakres ciemnych pikseli BF, albo na piksel o dużej intensywności DF (patrz przykłady na rysunku 6), odpowiadające plamom wynikającym z obecności CNT. W ten sposób wykreślenie obszaru tych masek pozwala na podświetlenie, a także zwiększenie absorpcji (zilustrowane na rysunku 7 z obszarem maski na BF, wybierając piksele w zakresie od 0 do 533).
Ponadto korelację między plamkami na BF i DF można ocenić, wykreślając intensywność DF w stosunku do średniego sygnału piksela BF (jak na rysunku 8) (analiza niezależna od maski) lub obszar maski na BF (Maska 1) w porównaniu z obszarem na DF (Maska 2).
Jeśli chodzi o procedurę stworzoną do lokalizacji CNT wewnątrz komórek, Rysunek 9A pokazuje różne maski, które zostały utworzone. Należy pamiętać, że niezawodność masek lokalizacji (na podstawie erozji domyślnej maski komórki) musi być sprawdzana wizualnie w kolekcji komórek oznaczonych i nieoznaczonych. Te same maski są używane do wszystkich próbek.
Wykreślenie całkowitej powierzchni czarnych plam na błonie komórkowej w porównaniu z obszarem na całej komórce zapewnia wynik internalizacji dla komórek, które były inkubowane przez 20 godzin w temperaturze 37 °C w porównaniu do 2 godzin inkubacji w temperaturze 4 °C (patrz Rysunek 9B); wskazuje, że CNT są najczęściej zlokalizowane na błonie w temperaturze 4 °C, natomiast w temperaturze 37 °C CNT są internalizowane w ponad 90% komórek.
Na koniec, jeśli chodzi o fluorescencję, ten parametr nie był używany jako wskaźnik do kwantyfikacji CNT z powodu zbyt niskiej korelacji między plamkami fluorescencyjnymi a plamami na BF (i DF). Rzeczywiście, korelacja między intensywnością FITC a średnim pikselem jasnego pola wskazuje na współczynnik korelacji Pearsona wynoszący -0,2. Na rysunku 10 zilustrowano dwa przypadki, w których sygnał fluorescencji pasuje prawidłowo lub nie do czarnej plamki w jasnym polu.

Rysunek 1. Przegląd ImageStream - ogólna obsługa. System obrazowania wielospektralnego rejestruje do 12 obrazów/komórkę w trzech różnych trybach: jasnego pola, ciemnego pola i fluorescencji. Układ składa się z 5 laserów wzbudzających, w tym 405, 488, 560 i 658 nm. Światło jest zbierane z komórek przepływających w kuwecie z różnymi soczewkami obiektywowymi (w tym badaniu użyto soczewki obiektywu 40X) i przekazywane do elementu dekompozycji widmowej, który składa się z zestawu filtrów długoprzepustowych w układzie kątowym. Kamera CCD zbierająca obrazy z komórek jest obsługiwana przy użyciu techniki zwanej integracją z opóźnieniem czasowym, aby uniknąć smug obrazu. Rozszerzona głębia ostrości (EDF) jest opcją.

Rysunek 2. Galeria zdjęć komórek znakowanych nanorurkami węglowymi (50 μg/ml) przechwyconych przez ImageStream przez różne kanały (jasne pole (BF), ciemne pole (DF), fluorescencja (FITC) i ich nakładki). CNT zamknięte w lizosomach wewnątrzkomórkowych pojawiają się jako duże czarne plamy na obrazach w jasnym polu. I odwrotnie, tworzą jasne plamy na ciemnym polu i na obrazach fluorescencyjnych.

Rysunek 3. Zaznaczanie komórek, na których ustawiona jest ostrość. Dwuwymiarowy wykres punktowy reprezentujący gradient średniej kwadratowej (rms) w funkcji kontrastu na obrazach BF umożliwia wykluczenie nieostrych komórek. Tutaj żółty obszar reprezentuje nieostre komórki, podczas gdy skoncentrowane komórki są reprezentowane na niebiesko. Nieostre komórki charakteryzują się zarówno niskim kontrastem, jak i niskim gradientem rms na obrazie w jasnym polu. Oprócz gradientu rms, funkcja kontrastu jest wymagana do rozróżniania skoncentrowanych komórek po ich znakowaniu CNT.

Rysunek 4. Wychwyt CNT zależny od dawki wizualizowany przez ImageStream. Liczba i obszar czarnych plam na obrazach jasnego pola zwiększa się wraz z dawką CNT podczas inkubacji z komórkami (w zakresie 0-50 μg/ml). Zwróć uwagę, że komórki kontrolne są pozbawione czarnych plam.

Rysunek 5. Względna kwantyfikacja wychwytu CNT na podstawie obrazów jasnego pola. Histogramy cechy średniego piksela zastosowane do "obiektu" maski obejmującego całą komórkę wyraźnie pokazują zachowanie zależne od dawki, które można wykorzystać do oceny ilościowej. Zakres R9 otacza komórki CNT-dodatnie.

Rysunek 6. Tworzenie masek zaznaczających czarne punkty na obrazach BF i jasne punkty na obrazach DF. Ponieważ CNT pojawiają się jako silnie absorbujące ciemne plamy na obrazie BF, tworzona jest maska progowa w celu wybrania ograniczonego zakresu pikseli o niskiej intensywności mieszczącego się w zakresie 0-533 w tym badaniu (Maska 1, notacja: Intensywność (M01, BF, 0-533)). I odwrotnie, maska dopasowana do pikseli o dużej intensywności (w tym przypadku 150-4095) na obrazie DF (Maska 2, notacja: Intensywność (M06, DF, 150-4095)) służy do wyboru jasnego punktu na DF, odpowiadającego obszarom o wysokim rozproszeniu.

Rycina 7. Zależny od dawki wychwyt CNT wykazano poprzez ilościowe określenie obszaru czarnej plamki na obrazach BF. Za pomocą maski progowej (maski 1) nałożonej na BF, obszar czarnych plam można określić ilościowo dla każdej komórki, pokazując rozkład zależny od dawki.

Rysunek 8. Metody kwantyfikacji CNT oparte na obrazach BF (absorpcja) i DF (rozpraszanie) są ze sobą skorelowane. Po lewej stronie średni piksel na obrazie BF w porównaniu z intensywnością na obrazie DF wykazuje dobrą korelację dla komórek znakowanych CNT (50 μg / ml) (współczynnik korelacji Pearsona r = -0,68). Po prawej stronie obszar maski pasujący do ciemnych plam na BF w porównaniu z obszarem maski pasującym do jasnych punktów na DF dla komórek znakowanych CNT (50 μg/ml). Współczynnik korelacji Pearsona wynosi r = -0,83.Wykreślane są wartości z 7 000 komórek.

Rysunek 9. Lokalizacja CNT w komórkach przy użyciu określonych masek. (A) Maski są tworzone aby pasowały do określonego miejsca komórki, mianowicie od lewej do prawej - całej komórki, tylko błony, oraz wnętrza komórki. Kolejna maska dopasowuje się do czarnych plam dzięki intensywności progowej (Maska 1, notacja: Intensywność (M01, BF, 0-533)). (B) Ocenę lokalizacji CNT można uzyskać, mierząc obszar czarnych plam w różnych lokalizacjach komórek przy użyciu masek lokalizacyjnych opisanych w A. Inkubację z CNT (50 μg/ml) przeprowadzono zarówno w temperaturze 37 °C, jak i w 4 °C w celu zahamowania szlaku internalizacji. Wykres przedstawiający obszar na błonie w porównaniu z czarnym obszarem na całej komórce pokazuje zależne od dawki wchłanianie CNT na błonie w temperaturze 4 °C, podczas gdy pełna internalizacja CNT jest skuteczna w temperaturze 37 °C.

Rysunek 10. Kolokalizacja czarnych plam wywołanych CNT na BF z fluorescencyjnymi jasnymi plamami na obrazie FITC. Jasne plamy fluorescencji nie zawsze są kolokalizowane z czarnymi plamami na BF. Są one prawidłowo dopasowane do pierwszych dwóch wyświetlanych komórek, ale nie do dwóch ostatnich komórek.