Przegląd zasady działania urządzenia ImageStream przedstawiono na Rysunku 1. Urządzenie to generuje wiele obrazów o wysokiej rozdzielczości dla każdej komórki w przepływie, w tym w polu jasnym (BF), polu ciemnym (DF lub światło rozproszone bocznie) oraz w kanałach fluorescencji, co zilustrowano na Rysunku 2 na przykładzie trzech różnych komórek znakowanych CNTs. Przedstawiono również nałożenia tych kanałów, co na pierwszy rzut oka obrazuje występującą korelację.
Biorąc pod uwagę, że cała analiza postprocesowa opiera się na obrazowaniu komórek, wybór komórek w ostrości ma kluczowe znaczenie dla badania (Rysunek 3). W rzeczywistości obecność CNT indukuje zmiany zarówno w kontraście, jak i gradiencie w porównaniu z komórkami nieznakowanymi: komórki w ostrości, które zinternalizowały znaczną ilość CNT, mają tendencję do niskiego gradientu rms (który zazwyczaj jest jedynym parametrem używanym do rozróżniania komórek w ostrości versus komórek poza ostrością), ale także wysoki kontrast, co wyjaśnia, dlaczego niezbędny jest wykres biparametryczny. Na Rysunku 3 przedstawiono rozróżnienie między komórkami poza ostrością (obszar żółty) versus komórkami w ostrości (obszar niebieski).
CNT zinternalizowane w komórkach są wyraźnie rozróżnialne – szczególnie w BF, gdzie jawią się jako silnie absorbujące ciemne punkty (patrz wpływ różnych stężeń znakowania, Rycina 4). Ponadto przeanalizowano średni sygnał piksela w BF, co pozwoliło na względną kwantyfikację poboru: wykresy na Rycynie 5 wykazują jego znaczący wzrost wraz ze stężeniem znakowania CNT (wyniki dla około 7 000 komórek na warunek eksperymentalny).
Po drugie, ilościowe oznaczenie CNT jest możliwe również poprzez zastosowanie masek, nakładanych albo na ograniczony zakres ciemnych pikseli w obrazowaniu BF, albo na piksele o wysokiej intensywności w obrazowaniu DF (patrz przykłady na Rysunku 6), odpowiadające plamkom wynikającym z obecności CNT. W związku z tym, wykreślenie powierzchni tych masek pozwala na uwydatnienie oraz wykazanie wzrostu poboru (zilustrowane na Rysunku 7 za pomocą powierzchni maski w BF, z wyborem pikseli w zakresie 0-533).
Dodatkowo korelacja między plamkami w BF a DF może zostać oceniona poprzez wykreślenie intensywności DF w funkcji średniego sygnału piksela BF (jak na Rysunku 8) (analiza niezależna od maski) lub powierzchni maski w BF (Maska 1) w funkcji powierzchni w DF (Maska 2).
W odniesieniu do procedury opracowanej w celu lokalizacji CNT wewnątrz komórek, Rycina 9A przedstawia stworzone różne maski. Należy pamiętać, że poprawność masek lokalizacji (opartych na erozji domyślnej maski komórki) musi zostać sprawdzona wizualnie na zbiorze komórek znakowanych i nieznakowanych. Te same maski są stosowane dla wszystkich próbek.
Wykreślenie całkowitej powierzchni czarnych plamek na błonie komórkowej w stosunku do powierzchni na całej komórce pozwala określić stopień internalizacji dla komórek inkubowanych przez 20 hr w 37 °C w porównaniu z inkubacją przez 2 hr w 4 °C (patrz Rycina 9B); wskazuje to, że w 4 °C CNTs znajdują się głównie na błonie, natomiast w 37 °C CNTs ulegają internalizacji w ponad 90% komórek.
Wreszcie, w odniesieniu do fluorescencji, parametr ten nie został wykorzystany jako wskaźnik do ilościowego oznaczania CNT ze względu na zbyt niską korelację między plamkami fluorescencyjnymi a plamkami w BF (i DF). Rzeczywiście, korelacja między intensywnością FITC a średnią wartością piksela w polu jasnym wskazuje współczynnik korelacji Pearsona wynoszący -0,2. Na Rysunku 10 przedstawiono dwa przypadki, w których sygnał fluorescencji odpowiednio pokrywa się lub nie pokrywa z czarną plamką w polu jasnym.

Rycina 1. Przegląd ogólnej zasady działania systemu ImageStream.Wielospektralny system obrazowania pozyskuje do 12 obrazów/komórki w trzech różnych trybach: w polu jasnym, polu ciemnym oraz fluorescencji. Układ składa się z 5 laserów wzbudzających, w tym 405, 488, 560 oraz 658 nm. Światło z komórek przepływających przez kuwetę jest zbierane za pomocą różnych obiektywów (w niniejszym badaniu użyto obiektywu 40X) i przekazywane do elementu dekompozycji spektralnej, który składa się z zestawu filtrów długoprzepustowych ułożonych w matrycy kątowej. Kamera CCD rejestrująca obrazy komórek pracuje w technice zwanej integracją z opóźnieniem czasowym (TDI), aby uniknąć smugowania obrazu. Opcjonalnie dostępna jest funkcja rozszerzonej głębi ostrości (EDF).

Rycina 2. Galeria obrazów komórek znakowanych nanorurkami węglowymi (50 μg/mL) wykonana za pomocą systemu ImageStream w różnych kanałach (pole jasne (BF), pole ciemne (DF), fluorescencja (FITC) oraz ich nałożenia). CNTs uwięzione w wewnątrzkomórkowych lizosomach widoczne są jako duże czarne plamy na obrazach w polu jasnym. Z kolei na obrazach w polu ciemnym i fluorescencyjnych tworzą one jasne plamy.

Rysunek 3. Wybór komórek w ostrości. Bivariantny wykres punktowy przedstawiający pierwiastkową średnią kwadratową (rms) gradientu w zależności od kontrastu na obrazach BF umożliwia wykluczenie komórek nieostrych. Tutaj obszar żółty reprezentuje komórki nieostre, natomiast komórki ostre są reprezentowane w kolorze niebieskim. Komórki nieostre charakteryzują się zarówno niskim kontrastem, jak i niską wartością rms gradientu na obrazie w jasnym polu. Oprócz gradientu rms, cecha kontrastu jest wymagana do rozróżnienia komórek ostrych po ich oznakowaniu CNTs.

Rycina 4. Zależne od dawki pobieranie CNT wizualizowane za pomocą systemu ImageStream. Liczba i powierzchnia czarnych punktów na obrazach w polu jasnym zwiększają się wraz z dawką CNT podczas inkubacji z komórkami (w zakresie od 0-50 µg/ml). Należy zauważyć, że komórki kontrolne są pozbawione czarnych punktów.

Rycina 5. Względna kwantyfikacja poboru CNT na podstawie obrazów w polu jasnym. Histogramy średniej cechy pikseli zastosowanej do maski „obiekt” obejmującej całą komórkę wyraźnie wykazują zależność od dawki, co może być wykorzystane do kwantyfikacji. Zakres R9 obejmuje komórki pozytywne pod kątem CNT.

Rycina 6. Tworzenie masek wybierających ciemne punkty na obrazach BF i jasne punkty na obrazach DF. Ponieważ CNT pojawiają się jako silnie absorbujące ciemne punkty na obrazie BF, utworzono maskę progową w celu wybrania ograniczonego zakresu pikseli o niskiej intensywności, mieszczącej się w tym badaniu w przedziale 0-533 (Maska 1, oznaczenie: Intensity(M01, BF, 0-533)). Z kolei maska dopasowana do pikseli o wysokiej intensywności (w tym przypadku 150-4095) na obrazie DF (Maska 2, oznaczenie: Intensity (M06, DF, 150-4095)) służy do wyboru jasnych punktów na obrazie DF, odpowiadających obszarom o wysokim rozproszeniu.

Rysunek 7. Zależne od dawki pobieranie CNT wykazane przez kwantyfikację powierzchni czarnych plamek na obrazach BF. Dzięki zastosowaniu maski progowej (mask 1) na obrazach BF, powierzchnię czarnych plamek można skwantyfikować dla każdej komórki, co wykazuje rozkład zależny od dawki.

Rycina 8. Korelacja metod ilościowego oznaczania CNT w oparciu o obrazy BF (absorpcja) i DF (rozpraszanie). Po lewej stronie: średnia wartość piksela na obrazie BF w stosunku do intensywności na obrazie DF, wykazująca dobrą korelację dla komórek znakowanych CNTs (50 µg/ml) (współczynnik korelacji Pearsona r = -0,68). Po prawej stronie: powierzchnia maski dopasowanej do ciemnych punktów na BF w stosunku do powierzchni maski dopasowanej do jasnych punktów na DF dla komórek znakowanych CNTs (50 µg/ml). Współczynnik korelacji Pearsona wynosi r = -0,83. Wykreślono wartości z 7 000 komórek.

Rysunek 9. Lokalizacja CNT w komórkach z wykorzystaniem specyficznych masek. (A) Maski zostały utworzone tak, aby dopasować do konkretnych obszarów komórki, mianowicie od lewej do prawej – całej komórki, samej błony oraz wnętrza komórki. Kolejna maska dopasowuje do czarnych plamek dzięki progowi intensywności (Maska 1, oznaczenie: Intensity(M01, BF, 0-533)). (B) Ocenę lokalizacji CNT można uzyskać poprzez pomiar powierzchni czarnych plamek w różnych lokalizacjach komórek przy użyciu masek lokalizacji opisanych w części A. Inkubację z CNT (50 µg/ml) przeprowadzono zarówno w 37 °C, jak i w 4 °C w celu zahamowania ścieżki internalizacji. Wykres przedstawiający czarną powierzchnię na błonie w stosunku do czarnej powierzchni całej komórki wskazuje na zależną od dawki absorpcję CNT na błonie w 4 °C, podczas gdy pełna internalizacja CNT jest efektywna w 37 °C.

Rycina 10. Kolokalizacja czarnych punktów indukowanych przez CNT w polu jasnym (BF) z jasnymi punktami fluorescencyjnymi na obrazie FITC. Jasne punkty fluorescencyjne nie zawsze kolokalizują z czarnymi punktami w BF. Odpowiadają one prawidłowo dla dwóch pierwszych wyświetlonych komórek, ale nie dla dwóch ostatnich.