Podczas wyjaśniania mechanizmów leżących u podstaw różnych zdarzeń rozwojowych, takich jak wzorowanie komórkowe, różnicowanie i prowadzenie aksonów, istotna jest możliwość wizualizacji komórek w kontekście ich tkanki. Defekty wzorowania grzbietowo-brzusznego przejawiają się zazwyczaj jako przesunięcie brzuszne lub grzbietowe domeny ekspresji czynników transkrypcyjnych z rodzin pax, nkx lub dbx4. Niekiedy zmiany mogą być subtelne i obejmować zaledwie kilka średnic komórek4. Analiza w przekroju poprzecznym umożliwia przeprowadzenie tego typu badań. Jednakże odczynniki generujące słabsze sygnały lub przekroje, które nie są prostopadłe do osi AP, mogą ograniczać interpretację. Ponadto analiza w przekroju poprzecznym nie uwzględnia w łatwy sposób tego, czy zmiany utrzymują się wzdłuż osi AP, i jest zależna od dostępności kriotoma. Ograniczenie to jest omijane poprzez obrazowanie rdzenia kręgowego w rzucie bocznym. Jak widać na Rysunku 2B, mRNA nkx6.1 jest rozłożone w przybliżeniu w połowie brzusznej rdzenia kręgowego 24 h po zapłodnieniu (hpf), w obrębie domeny progenitorowej. Komórki progenitorowe można odróżnić od komórek pomitotycznych dzięki obecności płytki dna, która znajduje się w części przyśrodkowej rdzenia kręgowego. W obrazowaniu z wykorzystaniem optyki DIC poszczególne komórki są wyraźnie rozróżnialne, a widoczna jest zdefiniowana granica między komórkami wykazującymi ekspresję a komórkami jej pozbawionymi.
Wyjście komórek progenitorowych z cyklu komórkowego wiąże się ze zmianami w ekspresji genów. Na przykład wszystkie neurony pomitotyczne wykazują ekspresję HuC/D, którą można wykryć za pomocą immunocytochemii1,5. Sondy mRNA dla rodzin islet, gata i vsx znakują specyficzne neurony pomitotyczne o stałej pozycji i liczbie w obrębie każdego hemisegmentu rdzenia kręgowego6. Ponadto receptory prowadzące aksony, takie jak te z rodziny robo, są ekspresjonowane w ograniczonych populacjach neuronów pomitotycznych (Rysunek 2C)2,7,8. Montaż embrionów w pozycji bocznej pozwala na dokładne przeliczenie neuronów pomitotycznych. Podobnie, progenitorów, które nadal się dzielą, można określić ilościowo za pomocą immunocytochemii przeciwko fosfo-histonie 3 oraz znakowania BrdU. Ponadto śmierć komórek można ocenić za pomocą znakowania TUNEL4-6.
W 24 hpf aksony następujących neuronów postmitotycznych mogą być wizualizowane za pomocą różnych metod i są rozróżnialne na poziomie pojedynczych komórek: Dorsal Lateral Ascending (DoLA), Commissural Primary Ascending (CoPA), Commissural Secondary Ascending (CoSA), Ventral Longitudinal Descending (VeLD), Kolmer-Agdur (KA), Commissural Bifurcating/Longitudinal (CoB/L), Circumferential Ascending (CiA), Circumferential Descending (CiD), Unipolar Commissural Descending (UCoD), Rohon-Beard (R-B) oraz motoneurony (M)9. Aksony tych neuronów rozciągają się w kierunkach grzbietowym, brzusznym, przednim i tylnym. Rozgałęziają się, przekraczają linię środkową i opuszczają rdzeń kręgowy zarówno od strony grzbietowej, jak i brzusznej. Przy zastosowaniu konfokalnej mikroskopii skaningowej te zróżnicowane zachowania komórkowe są widoczne w embrionach zamontowanych bocznie, z wykorzystaniem immunocytochemii i genetycznie kodowanych białek fluorescencyjnych, takich jak GFP2. Na rysunku 2D immunocytochemia znp-1 została wykorzystana do znakowania rozwijających się motoneuronów. Motoneurony opuszczają rdzeń kręgowy od strony brzusznej, aby unerwić otaczającą go rozwijającą się muskulaturę.

Rycina 1. Disekcja i montaż boczny embrionów danio pręgowanego. (A) Po przygotowaniu do immunofluorescencji, in situ hybrydyzacja, itp.zarodki umieszcza się w 35 mm szalce Petriego wypełnionej PBT (PBS z 0,5% Triton X-100) lub PTw (PBS z 0,1% Tween-20). Widoczna jest kuleczka żółtka (YB). (B) Żółtko usuwa się poprzez unieruchomienie głowy zarodka, a następnie przeprowadzenie ostrożnej sekcji. (C) Do oddzielenia embrionów od resztek żółtka używa się tzw. embryo pokera (żyłki wędkarskiej przyklejonej do pipety Pasteura) (D). Oczyszczone embriony przenosi się pipetą na szkiełko przedmiotowe (E) i wyrównane (F). (GW narożnikach szkiełka nakrywnego nanosi się wazelinę.H) Szkiełko nakrywkowe ostrożnie umieszcza się na zarodkach w medium montażowym. (I) Do uszczelnienia krawędzi szkiełka nakrywkowego używa się laku do paznokci. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony obraz.

Rycina 2. Analiza wzorców ekspresji genów i prowadzenia aksonów w zarodkach danio pręgowanego zamontowanych bocznie. (A) Rysunek zarodka danio pręgowanego w 24 hpf. Na zdjęciach B-D zwizualizowano około czterech hemisegmentów powyżej przedłużenia worka żółtkowego (obszar w ramce). (B) nkx6.1 jest eksprymowany w brzusznej części rdzenia kręgowego, w tym w płytce dna (FP). (C) robo3 jest eksprymowany w neuronach pomitotycznych (PMN). Płytka dna i strefa progenitorowa nie są widoczne w tej, bardziej bocznej płaszczyźnie ogniskowania. Na zdjęciach B,C rdzeń kręgowy jest ograniczony nawiasem po lewej stronie obrazu. (D) Do obrazowania immunofluorescencji znp-1, która znakuje aksony ruchowe opuszczające rdzeń kręgowy od strony brzusznej, wykorzystano mikroskopię konfokalną. Na wszystkich zdjęciach strona przednia znajduje się po lewej, a grzbietowa u góry. Użyto obiektywu z dużym odstępem roboczym, imersyjnego w wodzie (N.A. 0.8) o powiększeniu 40X (3.3 mm). Kliknij tutaj, aby wyświetlić większy obraz.