1. Odczynniki i materiały eksploatacyjne
Przed rozpoczęciem tego eksperymentalnego protokołu przygotuj następujące odczynniki:
- 70% etanolu
- 1X PBS
- 1X DPBS (bez Ca i Mg) uzupełniony o 0,5% BSA
- Bufor FACS: 1X DPBS (bez Ca i Mg), 2 mM EDTA i 1% FCS
- Bufor ACK: 150 mM NH4Cl, 10 mM KHCO3 i 0,1 mM Na2EDTA w wodzie
2. Pobieranie i przygotowanie tkanki tłuszczowej
- Eutanazja myszy odbywa się zgodnie z zatwierdzonymi przez IACUC procedurami specyficznymi dla każdej instytucji.
- Dokładnie zwilż futro 70% etanolem.
- Wykonaj nacięcie na poziomie wyrostka mieczykowatego (dolna część mostka) i otwórz klatkę piersiową, aby odsłonić serce, uważając, aby nie przeciąć żadnych głównych naczyń krwionośnych.
Uwaga: W tym momencie pomocne jest również pozostawienie przepony nienaruszonej w miarę możliwości i wycięcie wcięcia po prawej stronie klatki piersiowej, aby krew i perfuzat mogły wypłynąć z klatki piersiowej.
- Przypnij prawy przedsionek, aby krew i perfuzat mogły uciec z układu krążenia.
Uwaga: Gdy mamy do czynienia z otyłymi myszami, może być konieczne usunięcie nadmiaru osierdziowego AT, aby umożliwić dostęp do serca.
- Chwyć serce kleszczami i delikatnie włóż igłę do lewej komory przez wierzchołek. Powoli przetapiaj mysz za pomocą 15 ml sterylnego PBS.
Uwaga: Zmniejsz szybkość perfuzji, jeśli płuca zaczną się wypełniać i rozszerzać.
- Otwórz jamę otrzewnej i usuń okołogonadchodzące poduszeczki tłuszczowe, uważając, aby uniknąć tkanek gonadalnych.
- Umieść poduszeczki tłuszczowe w łodzi wagowej na lodzie zawierającej 2 ml 1X DPBS (bez Mg lub Ca) uzupełnionego 0,5% BSA i zmiel AT na drobne kawałki.
Uwaga: Ogranicz ilość AT na łódź wagową do 1,2 g. Jeśli ilość AT przekracza 1,2 g, podziel ją równo między dwie łodzie wagowe.
- Próbki AT należy przechowywać na lodzie i przygotować 3 ml roztworu do trawienia kolagenazy na próbkę AT, składającego się z 1X DPBS uzupełnionego 0,5% BSA, 10 mM CaCl2 i 4 mg / ml kolagenazy typu II.
3. Trawienie kolagenazy
- Przenieść AT do stożkowych probówek o pojemności 50 ml, wlewając homogenat i przepłukując łódkę wagową 1 ml DPBS (0,5% BSA) i 3 ml roztworu trawiącego kolagenazy II.
- Inkubować homogenat w wytrząsarce rotacyjnej (200 obr./min) w temperaturze 37 °C przez 20 min.
- Dodaj 10 ml DPBS (0,5% BSA) do stożkowych probówek i umieść na lodzie.
- Rozcierać, wielokrotnie homogenizować za pomocą pipety serologicznej o pojemności 10 ml i przepuszczać zawiesiny komórek przez filtr 100 μm do nowej stożkowej probówki o pojemności 50 ml.
- Zawiesinę komórek odwirować w temperaturze 500 x g przez 10 minut w temperaturze 4 °C.
- Zdekantować supernatant i ponownie zawiesić osad komórek SVF w 3 ml buforu ACK w celu lizy zanieczyszczających erytrocytów.
- Dodać 12 ml buforu FACS i zawiesiny komórek wirówkowych o sile 500 x g przez 10 minut w temperaturze 4 °C.
- Zdekantować supernatant i ponownie zawiesić osad komórek SVF w buforze FACS.
Uwaga: Użyj rozmiaru komórki jako wskazówki, ile bufora FACS należy ponownie zawiesić. Jeśli osad komórkowy pokrywa dno stożkowej probówki o pojemności 50 ml, należy użyć 0,5-1 ml buforu FACS; W przeciwnym razie ponownie zawiesić w 0,25-0,5 ml.
- Umieścić próbki na lodzie i przygotować porcje każdej próbki o rozcieńczeniu 1:10 do zliczania komórek, mieszając 40 μl buforu FACS, 50 μl roztworu błękitu trypanowego (0,2%) i 10 μl zawiesiny komórek.
- Policz żywe komórki na podstawie wykluczenia błękitu trypanowego i rozcieńczonych zawiesin komórek do końcowego stężenia 5-10 x10 6 komórek/ml.
4. Barwienie antygenów na powierzchni komórki
- Dodać przeciwciało anty-mysie CD16/CD32 (blok Fc) do końcowego stężenia 0,5-1 μg/106 komórek i inkubować na lodzie przez 10 minut.
- Przenieść próbki (≥10,6 komórek) do probówek z okrągłym dnem z polistyrenu o wymiarach 12 x 75 mm. Przygotuj oddzielne probówki podczas analizy ATM i limfocytów T i połącz dodatkowe ogniwa, aby przygotować odpowiednią liczbę probówek, aby pomieścić wymaganą kompensację i zmodyfikowaną fluorescencję minus jeden (FMO) kontrole.
Uwaga: Na przykład, przy ilościowym określaniu proporcji bankomatów na podstawie F4/80 i CD11b, konieczne będzie przygotowanie następujących kontroli kompensacji i FMO:
- Niebarwione (komórki)
- DAPI lub jodek propidyny (PI) pojedyncze barwienie (komórki; nie dodawaj barwnika żywotności aż do kroku 5.1)
- F4/80 APC pojedyncza plama (komórki lub koraliki kompensacyjne)
- CD11b FITC pojedyncza plama (komórki lub koraliki kompensacyjne)
- FMO 1 (komórki): kontrola izotypu κ IgG2a szczura APC + CD11b FITC + barwnik żywotności (dodany w kroku 5.1)
- FMO 2 (komórki): F4/80 APC + Rat IgG2b κ kontrola izotypu FITC + barwnik żywotności (dodany w kroku 5.1)
- Dodać sprzężone z fluoroforem przeciwciała pierwszorzędowe i/lub kontrole izotypu w odpowiednim stężeniu (patrz Tabela odczynników i materiałów).
- Chronić próbki przed światłem i inkubować w temperaturze 4 °C przez 30 minut.
- Dodać 2 ml buforu FACS i zawiesiny komórek wirówek o sile 500 x g przez 5 minut w temperaturze 4 °C.
- Zdekantować supernatant i ponownie zawiesić osad komórek SVF w 2 ml buforze FACS.
- Zawiesinę komórek SVF odwirować 500 x g przez 5 minut w temperaturze 4 °C i ponownie zawiesić osad komórek SVF w buforze FACS o pojemności ≥400 μl.
- Próbki należy przenieść do probówek z okrągłym dnem z polistyrenu o wymiarach 12 x 75 mm, wyposażonych w górną rurkę z sitkiem o średnicy 35 μm.
- Chronić przed światłem i przechowywać próbki w temperaturze 4 °C do czasu analizy FACS.
Uwaga: Dla optymalnych wyników komórki powinny być analizowane natychmiast; jednak analiza FACS za pomocą tego protokołu została pomyślnie przeprowadzona na znakowanych komórkach przechowywanych w buforze FACS przez 1-2 godziny w temperaturze 4 °C. Jeśli konieczne jest utrwalenie komórek w celu wydłużenia czasu przechowywania, oznakowane komórki można utrwalić za pomocą 2% paraformaldehydu w temperaturze 4 °C przez 24 godziny przed analizą FACS. Firmy produkujące przeciwciała sugerują, że znakowane komórki mogą być przechowywane przez okres do jednego tygodnia; Nie zostało to jednak przetestowane w ramach tej procedury.
5. Analiza FACS
- Przed analizą FACS należy dodać do próbek barwnik żywotności i odpowiednie kontrole, aby umożliwić dyskryminację żywych i martwych komórek.
Uwaga: Liczne barwniki żywotności są dostępne na rynku, ale DAPI i PI są zalecane w zależności od profili wzbudzenia/emisji używanych przeciwciał sprzężonych z fluoroforem. DAPI i jodek propidyny dodaje się do każdej próbki w końcowym stężeniu 0,2 mg/ml.
- Użyć niebarwionej ujemnej próbki kontrolnej, najlepiej komórek wyizolowanych z tej samej tkanki co próbki doświadczalne, w celu dostosowania rozproszenia bocznego (SSC) i rozproszenia do przodu (FSC) tak, aby populacja komórek będących przedmiotem zainteresowania była zgodna ze skalą.
Uwaga: Do analizy komórek AT SVF zaleca się, aby SSC było wyświetlane w skali logarytmicznej, a FSC w skali liniowej. Użycie skali logarytmicznej dla SSC jest szczególnie ważne podczas analizy bankomatów, które często są bardzo duże i szczegółowe.
- Narysuj początkową bramkę rozpraszania światła w oparciu o typ analizowanych komórek i dostosuj wzmocnienie lampy fotopowielacza (PMT) tak, aby niebarwione komórki znajdowały się po lewej stronie histogramu z jednym parametrem (w przybliżeniu wyśrodkowanym na 102) dla odpowiednich kanałów.
Uwaga: Zaleca się, aby limfocyty i makrofagi (lub inne komórki szpikowe) były analizowane oddzielnie ze względu na różnice w autofluorescencji.
- Użyj pojedynczych barwionych kontrolek lub koralików kompensujących wychwytywanie przeciwciał, aby wykonać kompensację wielokolorową.
Uwaga: Zaleca się stosowanie koralików kompensacyjnych; jednak zgodność każdego przeciwciała musi być zapewniona. Na przykład kulki kompensacyjne mogą nie reagować krzyżowo z przeciwciałami królików, w którym to przypadku izolowane komórki są wymagane do uzyskania odpowiedniej kontroli pojedynczego barwienia.
- Ustawianie bramek eksperymentalnych w oparciu o zmodyfikowane kontrolki FMO.
- Ustaw cytometr przepływowy tak, aby zbierał odpowiednią liczbę zdarzeń w oparciu o rozpowszechnienie populacji będącej przedmiotem zainteresowania i rejestrował dane eksperymentalne.
- Eksport plików danych FCS do analizy w trybie offline. Dostępnych jest wiele programów do analizy danych cytometrii przepływowej. Polecamy Cytobank, platformę internetową, która umożliwia śledczym przechowywanie i analizowanie danych oraz generowanie danych z dowolnego komputera z dostępem do Internetu 18. Dodatkowo Cytobank oferuje możliwość publicznego udostępniania danych lub ograniczania dostępu do współpracowników.