$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Choroby grzybowe roślin stanowią jedno z największych zagrożeń dla rolnictwa. Potrzeba rozwoju upraw o zwiększonej odporności na choroby wzrasta ze względu na potrzeby żywnościowe rosnącej populacji świata. Patogeny roślin w naturalny sposób infekują rośliny uprawne na polu, powodując choroby, które negatywnie wpływają na plony6. Wykazano, że identyfikacja i wykorzystanie odpornych roślin może poprawić odporność i zmniejszyć straty plonów. Odporne odmiany zostały zidentyfikowane w wielu gatunkach roślin, w tym w kukurydzy, pszenicy, ryżu i sorgo, poprzez zaszczepienie roślin patogenem roślinnym i selekcję pod kątem odpornych linii7. W związku z tym opracowanie i zastosowanie skutecznej metody inokulacji pozwoliłoby na zaszczepienie wielu roślin i przeprowadzenie badań przesiewowych pod kątem odporności. Zastosowano różne metody inokulacji, w tym inokulację zanurzeniową, pipetowanie kultury zawiesiny komórek patogenu do wiru rośliny oraz inokulację igłową8-11. W przypadku każdej metody patogen musi być niezawodnie wprowadzony między liście rośliny, gdzie patogen dostaje się do rośliny poprzez tworzenie appresorii, aby zapewnić rozwój patogenu i infekcję roślin12,13.
Metoda inokulacji zanurzeniowej polega na zanurzeniu sadzonki rośliny w hodowli zawiesiny komórek patogenu, podczas gdy metoda pipetowania wymaga umieszczenia kultury zawiesiny komórek patogenu w wirze sadzonki rośliny. Istnieją jednak problemy z obiema metodami. Po pierwsze, obie metody zależą od naturalnego przemieszczania się patogenu z powierzchni liścia do tkanki roślinnej, która jest bardzo zmienna. Większość patogenów naturalnie dostaje się do rośliny przez otwory szparkowe lub rany na powierzchni liści rośliny. Istnieje jednak znaczna zmienność w zdolności patogenów do przenikania przez powierzchnię liścia rośliny przez aparaty szparkowe i/lub rany na powierzchni liścia. W związku z tym penetracji patogenów nie można kontrolować za pomocą żadnej z metod inokulacji, co może prowadzić do niespójnych danych. Po drugie, w przypadku badań przesiewowych dużej liczby roślin, zanurzenie sadzonek w kulturze zawiesiny komórek patogenu może być czasochłonne i może ograniczyć liczbę roślin, które można przesiewać. I odwrotnie, opisany tutaj protokół inokulacji metodą iniekcji igłowej dostarcza kulturę zawiesiny komórek patogenu między liśćmi rośliny, ułatwiając tworzenie appressorii14. Następnie patogen wykorzystuje nowo opracowaną apresorię, aby dostać się do rośliny, eliminując problem z penetracją patogenu. Dodatkowo, protokół inokulacji metodą iniekcji igłowej zapewnia szereg fenotypów dla roślin kukurydzy i teosinte, które zostały zaszczepione U. maydis i wykazują dobrą infekcję. Fenotypy można wykorzystać jako marker do określenia najlepszego stężenia dla hodowli zawiesiny komórek patogenu, co skutkuje spójnymi fenotypami roślin w ramach różnych eksperymentów i pomiędzy nimi.
Po zaszczepieniu roślin kulturą zawiesiny komórek patogenu, rośliny są zazwyczaj badane w celu wykrycia opornego lub podatnego fenotypu8-11,15. Podczas gdy skale oceny chorób są szeroko stosowane do badań przesiewowych i klasyfikacji fenotypów roślin, skale oceny różnią się w zależności od analizowanego patogenu. W związku z tym w przypadku podobnych patogenów grzybowych można zastosować protokół skali oceny choroby dla interakcji U. maydis i kukurydzy16.
Obecna seria protokołów szczegółowo opisuje inokulację metodą iniekcji igłowej za pomocą hodowli zawiesiny komórek U. maydis oraz badanie przesiewowe reakcji odporności na choroby kukurydzy, teosinte i kukurydzy x teosinte linii introgresji. Obecne protokoły nie ograniczają się do inokulacji igłami U. maydis w roślinach kukurydzy, ale mogą być stosowane do stosunkowo każdego patogenu grzybowego i gatunku roślin. W związku z tym włączenie szczegółów obu metod do tego samego protokołu umożliwi naukowcom bezpośrednie wykorzystanie protokołów do inokulacji i badań przesiewowych lub manipulowanie oryginalnymi protokołami, aby lepiej dopasować patogeny i gatunki roślin będące przedmiotem zainteresowania.