Metoda ekstrakcji służąca do izolacji całkowitych lipidów z tkanki opisana przez Folcha30 jest prostą procedurą, która została tutaj zaadoptowana. Po ekstrakcji tkanki i odparowaniu rozpuszczalnika lipidy często występują w postaci żółtawej warstwy. Żółty kolor wynika najprawdopodobniej z zanieczyszczeń białkowych, które można usunąć poprzez przeprowadzenie ekstrakcji ciecz-ciecz. To dodatkowe przetwarzanie próbki nie jest wymagane w niniejszej procedurze, ponieważ preparatywna TLC oddziela frakcję TAG od takich zanieczyszczeń. Dodawanie świeżego bezwodnego siarczanu sodu na wszystkich etapach filtrowania pomaga zmniejszyć zanieczyszczenie wodą, co wpływa na dokładne oznaczenie masy lipidów.
Analizy lipidów powłoki skórnej ssaków za pomocą preparatywnej TLC z fazą ruchomą H:E:A zazwyczaj pozwalają na rozdzielenie czterech wyraźnych prążków odpowiadających (począwszy od linii startu) sterolom, wolnym kwasom tłuszczowym (FFA), triacyloglicerolom (TAG) oraz estrom steroli/estrom woskowym/skwalenowi (Rycina 1). W niektórych przypadkach podczas stosowania analitycznej wysokorozdzielczej (HP) TLC z fazą ruchomą H:E:A, estry steroli, estry woskowe i skwalen rozdzielają się i pojawiają się jako trzy osobne prążki. W warunkach zastosowanych w niniejszym badaniu estry steroli/woskowe nie uległy rozdzieleniu. Jeśli prążki te są przedmiotem zainteresowania, fazę ruchomą można zmienić na izooktan:eter etylowy (95:5 v/v), a płytkę HPTLC można przeanalizować za pomocą densytometrii skanującej. Inne czynniki mogą powodować słabą separację. W celu uzyskania powtarzalnej jakości rozdzielania TLC i wiarygodnych danych, zazwyczaj eliminuje się je poprzez umieszczenie papieru filtracyjnego w komorze, zastosowanie smaru dla zapewnienia szczelności pokrywy, równoważenie komory przez noc oraz utrzymywanie czystości komór TLC.
Reprezentatywne widma mas MALDI-TOF uzyskane dla TAG wyizolowanych z rudego nietoperza wschodniego przedstawiono na Rysunkach 2 i 3. Widma te zawierają piki jonów TAG w zakresie mas między m/z 850 - 910, co jest typowe dla TAG izolowanych z ssaków nienadwodnych. Dodatek 1,0 M NaOH sprzyja powstawaniu jednokrotnie naładowanych jonów Na+, które są bardziej stabilne niż jony H+. Poza stabilnością, brak jonów H+ i K+ ułatwia analizę widma. Piki jonowe w zakresie m/z 850 - 910 odpowiadają resztom FA 16:0, 18:0, 18:1 oraz 18:2, będącym dominującymi składnikami acylowymi w TAG (Tabela 1). Możliwe reszty FA w TAG mogą być wstępnie określone na podstawie całkowitego m/z jonów obecnych w widmach MALDI-TOF MS, co pozwala na wyciągnięcie wniosków dotyczących różnic między gatunkami i osobnikami. Jeśli jednak wymagane są dokładne proporcje zawartości acylowej, należy zastosować MS/MS lub chromatografię gazową (GC/MS). Dalsze informacje na temat proporcji acylowych można uzyskać, obserwując piki w obszarze diacyloglicerydów na widmie (Rysunek 4). Diacyloglicerydy powstają w wyniku fragmentacji TAG w źródle MALDI i można je znaleźć w regionie m/z 590 - 650. Fragmentację TAG można zwiększyć, pomijając dodatek 1,0 M NaOH16. Tkanka skrzydła rudego nietoperza wschodniego charakteryzuje się dominującym pikiem przy m/z 879,7, natomiast tkanka włosa dominującym pikiem przy m/z 881,8 (odpowiednio Rysunek 2 i 3). Piki przy m/z 907,8, 879,7 i 855,7 (POP, PPoS) mają w tkance włosa zbliżoną intensywność (~50%), przy czym pik przy 853,7 wynosi ~40%.
| Skład | Skład pierwiastkowy | Masa obserwowana |
| Na+TAGs | | Na+TAGs |
| SSO | C57H108O6 | 911.8 |
| OOS, LSS | C57H106O6 | 909.8 |
| OOO, LnSS, LSO | C57H104O6 | 907.8 |
| LOO, LLS | C57H102O6 | 905.8 |
| LLO, OOLn | C57H100O6 | 903.7 |
| LLL | C57H98O6 | 901.7 |
| LLLn | C57H96O6 | 899.7 |
| LLnLn | C57H94O6 | 897.7 |
| LnLnLn | C57H92O6 | 895.7 |
| OSP | C55H104O6 | 883.8 |
| LSP, OOP, SOPo | C55H102O6 | 881.8 |
| LOP, LnSP, LSPo | C55H100O6 | 879.7 |
| LLP, LnOP, LOPo | C55H98O6 | 877.7 |
| LnLP, LLPo, LnOPo | C55H96O6 | 875.7 |
| LnLnP, LnLPo | C55H94O6 | 873.7 |
| LnLnPo | C55H92O6 | 871.7 |
| PPS | C53H102O6 | 857.8 |
| POP, PPoS | C53H100O6 | 855.7 |
| OOM, PPL, PoPoS, POPo | C53H98O6 | 853.7 |
| PPLn, PPoL, PoPoO, MyOO | C53H96O6 | 851.7 |
| LLM, LnOM | C53H94O6 | 849.7 |
| PPP, SSLa | C51H98O6 | 829.7 |
| PPPo, OSLa | C51H96O6 | 827.7 |
| PPoPo, PMyO | C51H94O6 | 825.7 |
| LnLnLa | C51H86O6 | 817.6 |
| MMS, SLaP, PPM | C49H94O6 | 801.7 |
| SLaPo, PPoM, PPMy | C49H92O6 | 799.7 |
| PoPoM, OOCa | C49H90O6 | 797.7 |
| MMP | C47H90O6 | 773.7 |
| MMPo, OCaP | C47H88O6 | 771.7 |
| OCaPo | C47H86O6 | 769.6 |
| MMM, PPCa, PMLa | C45H86O6 | 745.6 |
| PoPCa, PoMLa | C45H84O6 | 743.6 |
| PoPoCa | C45H82O6 | 741.6 |
| LaLaP, MMLa, MCaP | C43H82O6 | 717.6 |
| LaLaPo | C43H80O6 | 715.6 |
| OO | C39H72O5 | 643.5 |
| OL | C39H70O5 | 641.5 |
| LL | C39H68O5 | 639.5 |
| SP | C37H72O5 | 619.5 |
| OP | C37H70O5 | 617.5 |
| LP | C37H68O5 | 615.5 |
Tabela 1. Skład kwasów tłuszczowych, skład pierwiastkowy i masa izotopowa adduktów sodowych triacylogliceroli i diacylogliceroli. Ln=kwas linolenowy (18:3), L=kwas linolowy (18:2), O=kwas oleinowy (18:1), S=kwas stearynowy (18:0), P=kwas palmitynowy (16:0), Po=kwas palmitoleinowy (16:1), M=kwas mirystynowy (14:0), My=kwas mirystoleinowy (14:1), La=kwas laurowy (12:0), Ca=kwas kaprylowy (10:0).

Rycina 1. Chromatogram cienkowarstwowy rozdzielania głównych klas lipidów z zastosowaniem układu heksan:eter dietylowy:kwas octowy (80:20:2 v/v/v) jako fazy ruchomej. Prążka między sterolami a FFA nie zidentyfikowano za pomocą wzorca, lecz może on reprezentować alkohol tłusty lub woskowy diester.

Rycina 2. Powiększony obszar TAG widma masowego MALDI-TOF dla sodowanych TAG (m/z 700 - 950) z tkanki skrzydła rudego nietoperza wschodniego (L. borealis). Piki zidentyfikowane przy m/z 853,7 (OOM, PPL, PoPoS, POPo) oraz m/z 879,7 (LOP, LnSP, LSPo). Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą rycinię.

Rysunek 3. Powiększony region TAG widma masowego MALDI-TOF sodowanych TAG (m/z 700 - 950) z tkanki włosów rudego nietoperza wschodniego (L. borealis). Piki zidentyfikowane przy m/z 905,8 (LOO, LLS) oraz m/z 907,8 (OOO, LnSS, LSO). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększony rysunek.

Rycina 4. Obszar DAG widma mas MALDI-TOF sodowanych fragmentów DAG (m/z 530 - 730) z tkanki skrzydła nietoperza czerwonego (L. borealis). Piki zidentyfikowane przy m/z 643,5 (OO) oraz m/z 615,5 (LP). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną rycinę.