Urządzenie 3D może być przydatną technologią do badań w różnych dziedzinach, w tym biologii komórek macierzystych, biologii naczyniowej, hematologii, onkologii, autoimmunizacji i zapaleń. Urządzenie 3D będzie szczególnie przydatne dla naukowców zajmujących się komórkami krwiotwórczymi, mezenchymalnymi, nerwowymi i innymi komórkami macierzystymi w celu zbadania mechanizmów molekularnych regulujących każdy etap kaskady wynaczynienia komórek macierzystych. Naukowcy badający migrację komórek mogą również używać tego urządzenia do badania różnych mechanizmów migracji limfocytów T i B, monocytów, neutrofili, eozynofili, komórek NK i innych komórek migrujących. W biologii naczyniowej urządzenie będzie przydatne do oceny wpływu lokalnego mikrośrodowiska na zdolność EC do wspomagania rekrutacji komórek i naśladowania bariery krew-mózg in vitro. Dla naukowców zajmujących się patogenezą chorób urządzenie może być wykorzystywane do badania migracji cytotoksycznych limfocytów T do trzustki podczas cukrzycy typu I, migracji eozynofili do płuc pacjentów z astmą, migracji neutrofili, monocytów i limfocytów do miejsc zapalenia w różnych zaburzeniach, rekrutacji komórek do miejsc gojenia się ran, oddziaływanie cytotoksycznych limfocytów T z neowaskulaturą i rekrutacja cytotoksycznych limfocytów T do nowotworów.
Nowatorskie urządzenie 3D będzie również użytecznym narzędziem w naukach translacyjnych oraz w przedklinicznym opracowywaniu leków i badaniach przesiewowych. Na przykład urządzenie może być wykorzystywane do optymalizacji przygotowania zawiesin komórek terapeutycznych do podawania dożylnego, do testowania rekrutacji komórek terapeutycznych do uszkodzonych tkanek w porównaniu z normalnymi tkankami oraz do badania roli określonego narządu lub śródbłonka tkankowego i mikrośrodowiska w tym procesie. W celu opracowania leku urządzenie może być wykorzystywane do testowania kandydatów na leki, które celują w komórki nowotworowe i blokują każdy etap kaskady wynaczynienia, do testowania migrujących komórek jako nośnika leku do miejsc guza, do testowania leków, które regulują funkcję śródbłonka specyficznego dla narządu ludzkiego lub lokalnego mikrośrodowiska specyficznego dla tkanki, oraz do testowania kombinacji leków, które regulują różne etapy kaskady naprowadzającej. Wreszcie, po przekształceniu w system o wysokiej przepustowości, urządzenie może być używane do badań przesiewowych małych cząsteczek, peptydów i przeciwciał, które celują w cząsteczki pośredniczące w transporcie komórkowym.
Szczegóły techniczne i wskazówki
Walcowanie i adhezja pod przepływem są krytycznymi etapami kaskady wynaczynienia i znacząco przyczyniają się do efektywności migracji komórek in vivo. Warto zauważyć, że etapy te nie przyczyniają się do statycznych testów in vitro. Jednak statyczne testy transmigracji są przydatne jako kontrole ujemne w eksperymentach testujących wpływ naprężeń ścinających na przeżycie i funkcję komórek, w tym zdolność EC do wspierania interakcji o niskim powinowactwie (toczenia) i mocnej adhezji.
Ważny jest wybór podłoża do eksperymentów w urządzeniu 3D. Pożywki zawierają różne czynniki wzrostu, które mogą wpływać na przeżycie krążących komórek, szczególnie podczas długich okresów inkubacji. Ponadto stężeniaCa2+ iMg2+, które mogą wpływać na interakcje adhezyjne w warunkach przepływu fizjologicznego, różnią się znacznie w komercyjnych pożywkach hodowlanych. Inne szczegóły techniczne, które należy wziąć pod uwagę przy planowaniu eksperymentów z urządzeniem 3D, omówiono poniżej.
Wybór monowarstwy EC
Na sygnaturę EC na powierzchni komórki mają wpływ różne parametry, w tym gatunek i tkanka, z której pochodzą, oraz warunki hodowli komórkowej, które powinny być uwzględnione w projekcie doświadczalnym. Niektóre powszechnie stosowane EC obejmują EC mikronaczyniowe pochodzące z płuc (LDMVEC), EC pochodzące ze szpiku kostnego (BMDEC), EC pochodzące z mózgu (BDEC) i HUVEC. Właściwości EC różnią się również w zależności od ich pochodzenia. Na przykład BMDEC konstytutywnie eksprymują selektyny i VCAM-1, które są odpowiedzialne za walcowanie i adhezję, podczas gdy BDEC, LDMVEC i HUVEC nie wyrażają tych cząsteczek w normalnych warunkach. Dlatego wkładki pokryte BDEC, LDMVEC i HUVEC mogą być wstępnie traktowane α TNF (10 ng / ml, 4 godz.) lub innymi czynnikami w celu naśladowania stanu zapalnego i indukowania ekspresji cząsteczek naprowadzających.
Testowanie przesłuchów z lokalnym mikrośrodowiskiem
Rośnie zainteresowanie zrozumieniem, w jaki sposób lokalne mikrośrodowisko reguluje funkcje EC i uczestniczy w wynaczynieniu komórek. Nasze wyniki pokazują, że wprowadzenie monowarstwy komórek zrębu pod monowarstwę EC znacznie zwiększa wynaczynienie krążących komórek. Odkrycie to pokazuje, że przesłuch między EC a zrębem zwiększa zdolność EC do wspierania wynaczynienia krążących komórek. Co więcej, wprowadzenie komórek z różnych mikrośrodowisk (np. mezenchymalnych komórek macierzystych, fibroblastów płuc, komórek nowotworowych, astrocytów) może pomóc w naśladowaniu określonych łożysk naczyniowych. W szczególności połączenie EC pochodzącego z mózgu i astrocytów może być użytecznym podejściem do naśladowania bariery krew-mózg. Podobnie, komórki uzyskane od pacjentów lub normalne komórki zmanipulowane in vitro, mogą pomóc naśladować określone chore mikrośrodowisko.
W naszych badaniach zastosowaliśmy dolne wkładki z komórkami zrębu wyhodowanymi do 50% konfluencji. Chociaż optymalna gęstość komórek mikrośrodowiskowych na wkładkach będzie zależeć od celów badania, można nią łatwo manipulować i kontrolować.
Wybór szybkości naprężenia ścinającego
Wykorzystano tutaj naprężenie ścinające 0,8 dyn/cm2 , ponieważ zostało to wykazane przez Von Andriana i wsp. być naprężeniem ścinającym w mikrokrążeniu szpiku kostnego, w którym krwiotwórcze komórki progenitorowe opuszczają krążenie i dostają się do tkanek w normalnych warunkach fizjologicznych 15. Natomiast wyższe poziomy naprężeń ścinających obserwuje się w większych naczyniach, w których wynaczynienie komórek jest ograniczone. W związku z tym wysokie wskaźniki naprężeń ścinających mogą być wykorzystywane jako dodatkowe kontrole w eksperymentach badających wynaczynienie różnych typów komórek.
Przeżywalność komórek pod wpływem naprężeń ścinających zależy od kilku czynników, w tym od typu komórki i leczenia komórkami ex vivo (Goncharova i wsp., niepublikowane obserwacje), a zatem powinna być dokładnie oceniona podczas badania. Wrażliwość ogniwa na różne poziomy naprężeń ścinających (odporność na naprężenia ścinające) można ocenić, programując pompę perystaltyczną tak, aby stopniowo zwiększała szybkość naprężeń ścinających z 0,8 dyn/cm2 do 6 dyn/cm2. Podczas tych testów komórki mogą być okresowo pobierane z komory wymiany gazowej w celu monitorowania śmierci komórek za pomocą testów, takich jak wykluczenie błękitu trypanowego, barwienie aneksyną V i PI oraz ekspresja markera apoptozy.
Jeżeli eksperymenty mają na celu zbadanie odporności na naprężenia ścinające komórek zmodyfikowanych ex vivo lub komórek pochodzących z miąższu, zaleca się włączenie do doświadczeń dodatkowych kontroli pozytywnych, takich jak komórki przenoszone przez krew.
Wybór wielkości porów płytki i powłoki ECM
Wkładki są dostępne z kilkoma wielkościami porów (3, 5 i 8 μm). Wybór wielkości porów będzie zależał od wielkości i właściwości krążących komórek testowych, co ma również miejsce w przypadku statycznych testów Transwell. Wkładki o dużej wielkości porów (8 μm) są zalecane do badania wynaczynienia dużych komórek, takich jak komórki nowotworowe pochodzenia nabłonkowego. Leukocyty lub krwiotwórcze komórki macierzyste są częściej testowane za pomocą wkładek porów 5 μm, a wkładki porów 3 μm są najlepiej zarezerwowane do testowania wynaczynienia mniejszych komórek. Jednak sam rozmiar komórki testowej nie jest jedynym ważnym czynnikiem i zalecamy testowanie wkładek o kilku rozmiarach porów.
W naszych wstępnych badaniach przetestowaliśmy różne ECM pod kątem ich zdolności do podtrzymywania wzrostu EC na płytkach i wytrzymywania naprężeń ścinających przez >4 godziny. Testowane ECM obejmowało Matrigel, poli-D-lizynę, fibronektynę, lamininę, kolagen typu I, hydrożel, meta-keratynę I, II, III, IV i Extracel. Najlepsze wyniki dla wzrostu EC uzyskano przy użyciu Extracel, fibronektyny i kolagenu. Jednak w naszych rękach Extracel w stężeniu 0,8 μg/cm2 znacznie zmniejszył transmigrację komórek testowych przez błonę. Dlatego teraz używamy fibronektyny (5 μg/cm2) lub kolagenu (5 μg/cm2) do powlekania wkładek. Jednak na optymalny wybór ECM będzie prawdopodobnie miał wpływ zarówno rodzaj EC, jak i właściwości transmigracyjne badanych komórek. Należy przeprowadzić wstępny eksperyment w celu sprawdzenia integralności monowarstwy EC wyhodowanej na wybranym ECM. Na przykład, umieścić wstępnie powlekane wkładki z monowarstwami EC na szalkach Petriego wypełnionych pożywką hodowlaną, umieścić szalki na wytrząsarce w celu wytworzenia naprężenia ścinającego (niskie ustawienie) i inkubować w temperaturze 37 °C i 5% CO2 przez 12 godzin. Integralność EC po wystawieniu na naprężenie ścinające można ocenić za pomocą barwienia fioletem krystalicznym.
Dobór optymalnych stężeń w komorze testowej
Zdolność komórek testowych do wyjścia z krążenia zależy od wielu cech charakterystycznych dla każdego typu komórki. Aby uzyskać statystycznie istotne wyniki, gęstość komórek krążących musi być zoptymalizowana, aby zapewnić migrację wystarczającej liczby komórek do studzienek kontroli dodatniej. Dlatego zalecamy wykonanie wstępnych testów z różnymi gęstościami komórek (np. 103/ml do 107/ml), aby zrozumieć zależność między liczbą komórek załadowanych do systemu a liczbą komórek, które przechodzą transmigrację.
Ponadto optymalne stężenie we krwi może się różnić dla tego samego typu ogniwa uzyskanego z różnych źródeł. Na przykład komórki CD34+ są niejednorodną populacją komórek zawierającą zarówno hematopoetyczne komórki macierzyste, jak i zaangażowane komórki progenitorowe specyficzne dla linii. Można je uzyskać ze szpiku kostnego, zmobilizowanej krwi obwodowej i krwi pępowinowej. Komórki CD34+ pochodzące z tych trzech źródeł mają różne zdolności naprowadzania i wszczepiania 16-18, więc warunki testowania tych komórek w urządzeniu 3D powinny być zoptymalizowane przed badaniem na pełną skalę.
Dobór optymalnego czasu krążenia komórek
Optymalny czas krążenia należy określić empirycznie dla każdego typu komórki. Minimalny czas wymagany do krążenia można ekstrapolować na podstawie wyników statycznych testów migracji, ale może on zostać wydłużony, gdy komórki są poddawane naprężeniom ścinającym. Zaleca się przeprowadzenie badań pilotażowych sprawdzających czas cyrkulacji od 4 do 96 godzin.
Jednostka wymiany gazowej
Głównym zadaniem centrali gazowej jest utrzymanie optymalnego stężenia CO2 w pożywce krążącej przez urządzenie 3D, podobnie jak w standardowych inkubatorach do hodowli tkankowych. Jednostka wymiany gazowej może być również używana do dodawania komórek testowych i związków oraz do pobierania sond i próbek podczas testu.
Ocena liczby komórek testowych
Próbki z komórek krążących mogą być pobierane w różnych momentach eksperymentu za pomocą jednostki wymiany gazowej. Pod koniec eksperymentu komórki pozostające w krążeniu można było pobrać z wylotu. Kiedy urządzenie 3D zostanie zdemontowane pod koniec eksperymentu, transmigrowane komórki mogą zostać pobrane z dolnych studzienek i zebrane do dalszej analizy. Jeśli komórki wejściowe są nieoznakowane, transmigrowane komórki można zabarwić błękitem trypanowym, a żywe/martwe komórki wyliczyć mikroskopijnie. Alternatywnie, komórki wejściowe mogą być oznaczone jednym z wielu barwników "śledzących komórki" dostępnych do obrazowania żywych komórek przed załadowaniem do urządzenia 3D; W takim przypadku pobrane transmigrowane komórki należy poddać lizie w celu ilościowego określenia fluorescencji.
Dobór optymalnej wielkości próby
Aby umożliwić analizę statystyczną, należy wybrać wielkość próby, która zapewni około 80% mocy do wykrycia hipotetycznej różnicy w średnich procentowych zmianach między dwiema grupami podczas testowania na poziomie istotności 0,05 przy użyciu dwustronnego testu t. Opierając się na naszym doświadczeniu z komórkami szpiku kostnego, używamy trzech studzienek na warunki eksperymentalne do eksperymentów z urządzeniem 3D. Jednak optymalna wielkość próby będzie się różnić w zależności od celu eksperymentu i powinna zostać określona empirycznie. Testy statystyczne regresji wielorakiej, dwustronne testy t i analizy wariancji mogą być wykorzystywane do weryfikacji istotności statystycznej wyników.
Wybór chemokin
Podobnie jak w przypadku wszystkich testów transmigracji, wybór chemoatraktantu będzie podyktowany właściwościami komórek testowych i celem badania. SDF-1 jest dobrze znanym chemoatraktantem dla komórek krwiotwórczych. W naszych rękach stężenie 50 ng/ml SDF-1 było optymalne do stymulowania wynaczynienia krwiotwórczych komórek progenitorowych pochodzących ze szpiku kostnego. Używamy również C3a i bFGF jako chemoatraktantów dla mezenchymalnych komórek macierzystych 19. Zalecamy jednak miareczkowanie każdej chemokiny i mieszanie kombinacji chemokin w celu określenia optymalnego zakresu stężeń przed badaniem na pełną skalę. W przypadku niektórych typów komórek korzystna może być kombinacja czynników chemotaktycznych. Jeśli chemokiny dla określonych komórek testowych są nieznane lub niedostępne, jako źródło chemoatraktantów można użyć kondycjonowanych pożywek ze stymulowanych limfocytów, fibroblastów i innych komórek.
Dobór parametrów odczytu
Wszechstronność urządzenia 3D rozszerzy rodzaj eksperymentów transmigracyjnych, które można przeprowadzić, a powodzenie eksperymentów będzie zależało od przemyślanego rozważenia i zaprojektowania parametrów odczytu. Z reguły komórki pobrane z górnego (krążącego) komory i dolnego (statycznego) komory powinny być badane pod kątem żywotności w tym samym czasie, co liczenie komórek. Niektóre komórki mają niską tolerancję na fizjologiczne naprężenia ścinające obserwowane w mikrokrążeniu. W takim przypadku liczba martwych komórek zostanie zwiększona w górnej komorze. Liczba przylegających komórek zatrzymanych (lub uwięzionych) na warstwie EC może być oceniona za pomocą immunocytochemii markerów wyrażonych specyficznie przez komórki testowe. Przeciwciała specyficzne dla CD31 i vWF mogą być stosowane do wykrywania EC i umożliwienia dyskryminacji między komórkami testowymi a EC. Ponadto integralność monowarstwy EC powinna być monitorowana na końcu każdego badania.
Rodzaje analiz wykonywanych na pobranych komórkach będą zależeć od celów eksperymentalnych badaczy, ale mogą obejmować analizę zmian w ekspresji genów za pomocą mikromacierzy i qPCR, ekspresji cząsteczek powierzchniowych za pomocą analizy FACS, aktywacji szlaków sygnałowych przez FACS i western blotting oraz wydzielania czynników przez ELISA. Na pobranych komórkach in vitro możliwy jest ogromny wachlarz testów funkcjonalnych, o czym świadczy nasza własna praca, w której hodowaliśmy transmigrujące komórki szpiku kostnego w celu zliczenia hematopoetycznych komórek progenitorowych (ryc. 3). Pobrane próbki mogą być również testowane w różnych testach in vivo .
Jednym z ważnych parametrów, który może pomóc w przewidywaniu zachowania komórek testowych in vivo , jest tendencja niektórych komórek do tworzenia agregatów pod wpływem różnych naprężeń ścinających. Na przykład komórki terapeutyczne, które ulegają tworzeniu agregatów w urządzeniu 3D, mogą mieć większą tendencję do tworzenia grudek po podaniu dożylnym i powodować ostrą niedrożność naczyń in vivo (Goncharova i wsp., niepublikowane obserwacje). Tworzenie się agregatów można monitorować pod mikroskopem, pobierając próbki z komórek testowych w trakcie lub po zakończeniu eksperymentu z urządzeniem 3D.