Migracja to złożona funkcja komórkowa, która jest ważna dla wielu procesów fizjologicznych w organizmach wielokomórkowych, w tym rozwoju, odpowiedzi immunologicznych i regeneracji tkanek. Ponadto niektóre sytuacje patologiczne, takie jak inwazja guza i przerzuty, zależą od ruchliwości komórek1. Z tych powodów migracja komórek stała się głównym obszarem badań zarówno w kontekście badań podstawowych, jak i translacyjnych. In vivo większość tkanek charakteryzuje się bogatą macierzą zewnątrzkomórkową i dużą gęstością komórek. Migracja komórek w warunkach fizjologicznych zachodzi zatem w złożonym, zamkniętym środowisku. Klasycznie, najprawdopodobniej ze względów historycznych i ograniczeń technicznych, migrację komórek badano w płaskich systemach 2D, które nie odtwarzają wielu właściwości środowiskowych występujących w tkankach, takich jak uwięzienie. Co więcej, ostatnio wykazano, że czynniki takie jak adhezja komórek, które są niezbędne dla ruchliwości w 2D, niekoniecznie są wymagane do migracji in vivo lub wewnątrz żeli, co sugeruje, że mechanizmy rządzące lokomocją, które rządzą lokomocją, w 2D i w innych środowiskach, są odrębne2. Opracowano kilka systemów naśladujących złożone właściwości tkanek, z których najbardziej znane to żele kolagenowe, które mają na celu rekapitulację właściwości kompozycji macierzy zewnątrzkomórkowej3. W tym miejscu proponujemy mikrokanały jako prostą metodę uzupełniającą, która umożliwia badanie migracji komórek w jednym wymiarze w ograniczonym środowisku.
W tym systemie komórki migrują wzdłuż mikrokanałów, do których wchodzą spontanicznie. Komórki wędrowne nabierają następnie kształtu kanałów, przyjmując geometrię rurkową, która najprawdopodobniej wzmacnia ich polarność. Liniowy ruch komórek w kanałach umożliwia automatyczne śledzenie komórek i ekstrakcję parametrów ilościowych z eksperymentów. Z technicznego punktu widzenia system ten jest łatwy i elastyczny. Powłoką ścianek kanałów można manipulować, dostosowywać rozmiar i kształt kanałów, a w pojedynczych eksperymentach można analizować dużą liczbę komórek. System ten można również rozbudować w celu przeprowadzenia analizy przesiewowej cząsteczek biorących udział w ruchliwości komórek w średnim zakresie. Opisany tutaj protokół został ustandaryzowany przy użyciu komórek dendrytycznych (DC) jako modelu komórkowego. Komórki te mają kluczowe znaczenie dla układu odpornościowego, ponieważ uczestniczą w inicjacji i utrzymaniu specyficznych odpowiedzi immunologicznych4. W badaniach in vitro wykazano, że DC spontanicznie migrują w ograniczonych środowiskach i dlatego są dobrym modelem do badania ruchliwości komórek w mikrokanałach5,6. Co ważne, system ten można rozszerzyć o analizę migracji dowolnego innego typu komórek ruchliwych, takich jak limfocyty T, neutrofile lub komórki nowotworowe7-9.