Wizualizacja pełnej długości projekcji neuronalnych w zarodkach jest niezbędna do zrozumienia, jak rozwijają się sieci neuronalne ssaków. W tym miejscu opisujemy metodę oznaczania in situ podzbioru projekcji aksonów zwoju korzenia grzbietowego (DRG) w celu oceny ich cech fenotypowych przy użyciu kilku genetycznie zmodyfikowanych linii myszy. Neurony TrkA-dodatnie są neuronami nocyceptorowymi, przeznaczonymi do przekazywania sygnałów bólowych. Wykorzystujemy linię myszy TrkAtaulacZ do oznaczania trajektorii wszystkich TrkA-dodatnich aksonów obwodowych w nienaruszonym zarodku myszy. Następnie rozmnażamy linię TrkAtaulacZ na tle zerowym Bax, które zasadniczo znosi apoptozę neuronów, w celu oceny pytań związanych ze wzrostem niezależnie od możliwego wpływu manipulacji genetycznych na przeżycie neuronów. Następnie genetycznie zmodyfikowane myszy będące przedmiotem zainteresowania są hodowane z linią zerową TrkAtaulacZ / Bax, a następnie są gotowe do badania przy użyciu technik opisanych w niniejszym dokumencie. Prezentacja ta zawiera szczegółowe informacje na temat planów hodowlanych myszy, genotypowania w czasie sekcji, przygotowania tkanek, barwienia i oczyszczania, aby umożliwić wizualizację trajektorii aksonów na całej długości w preparacji całego wierzchowca.