Podczas rekombinacji przełącznika (CSR) klasy ciężkiego łańcucha immunoglobuliny (IgH) u myszy i ludzi, eksony IgH μ stałego regionu (Cμ) są usuwane i zastępowane przez jeden z kilku zestawów dalszycheksonów ostałym regionie (CH, s) (np. Cγ, Cε i Cα), co powoduje przejście z produkcji IgM na produkcję innych klas Ig (np. IgG, IgE lub IgA). CSR występuje w obszarach przełączania (S), które są sekwencjami 1-10 kb położonymi 5' do każdego zestawu CHs 1. Enzym deaminaza cytydyny indukowana aktywacją (AID) inicjuje CSR poprzez aktywność deaminacji cytydyny.
IgE jest kluczowym mediatorem choroby alergicznej2, a lepsze zrozumienie, w jaki sposób IgE jest wytwarzane i regulowane, może otworzyć drzwi do nowych podejść terapeutycznych do choroby atopowej. U myszy i ludzi IgE jest najściślej regulowanym izotypem Ig. IgE jest zwykle wykrywana na poziomach tysiące razy niższych niż inne izotypy IgH3, ale może być bardzo podwyższona w stanach chorobowych4. Jednak CSR do IgE nie jest w pełni zrozumiały. Aktywacja in vitro limfocytów B za pomocą IL-4 w połączeniu z anty-CD40 lub LPS indukuje CSR zarówno do IgG1, jak i IgE5. Aktywowane limfocyty B wyrażają receptor IgE o niskim powinowactwie FcεRII/CD232,6, który wiąże rozpuszczalne IgE wydzielane w hodowli po CSR. Dlatego podczas analizy za pomocą cytometrii przepływowej komórki B z IgE związanymi z receptorem barwią się podobnie jak komórki B endogennie eksprymujące IgE7. Chociaż wiadomo, że mysie limfocyty B wyrażają receptor IgG o niskim powinowactwie FcγRIIB1 (CD32)8, z naszego doświadczenia wynika, że nie wydaje się, aby przeszkadzało to w pomiarze przejścia klasy na IgG1. Jednak podczas pomiaru przełączania IgE po aktywacji limfocytów B w hodowli, niespecyficzne IgE związane powierzchniowo mogą zaciemniać analizę. W przypadku typowych metod barwienia komórki bez ekspresji IgE barwią się dodatnio na obecność IgE.
Opisana tutaj jest strategia, która została wykorzystana do przeprowadzenia testów CSR i wykrycia prawdziwych limfocytów B z ekspresją IgE od myszy 9-11. Traktowanie aktywowanych limfocytów B trypsyną, powszechnym odczynnikiem laboratoryjnym do trawienia białka, usuwa zarówno cytofilowe, jak i związane z błoną powierzchniową IgE. Późniejsza przepuszczalność i barwienie cytoplazmatycznych IgE ujawnia zatem prawdziwe komórki wytwarzające IgE.