Opisujemy protokół przygotowania dwuwarstw lipidowych i jego charakterystyki za pomocą mikroskopii sił atomowych i spektroskopii sił.
Method Article
Opisujemy protokół przygotowania dwuwarstw lipidowych i jego charakterystyki za pomocą mikroskopii sił atomowych i spektroskopii sił.
Mikroskopia sił atomowych (AFM) to wszechstronna technika obrazowania o wysokiej rozdzielczości, która umożliwia wizualizację błon biologicznych. Ma wystarczające powiększenie, aby zbadać podstruktury błony, a nawet pojedyncze cząsteczki. AFM może działać jako sonda siły do pomiaru oddziaływań i właściwości mechanicznych membran. Dwuwarstwy lipidowe są konwencjonalnie stosowane jako modele błonowe w badaniach AFM. W tym protokole pokazujemy, jak przygotować podparte dwuwarstwy oraz scharakteryzować ich strukturę i właściwości mechaniczne za pomocą AFM. Należą do nich grubość dwuwarstwy i siła przebicia.
Informacje dostarczane przez obrazowanie AFM i spektroskopię sił pomagają określić mechaniczne i chemiczne właściwości membran. Właściwości te odgrywają ważną rolę w procesach komórkowych, takich jak utrzymanie hemostazy komórkowej przed stresem środowiskowym, łączenie białek błonowych i stabilizacja kompleksów białkowych.
Mikroskopia sił atomowych (AFM) generuje obraz powierzchni poprzez skanowanie w poprzek obszaru próbki za pomocą wspornika z bardzo ostrą końcówką1. Ruch wspornika bada topologię powierzchni próbki. AFM jest szeroko stosowany do cząsteczek biologicznych - w tym białek, DNA i błon, ze względu na jego wszechstronność w analizie utrwalonych próbek w powietrzu lub w stanie zbliżonym do natywnego w cieczy2-5.
Oprócz możliwości obrazowania w wysokiej rozdzielczości w zakresie nanometrów, wspornik AFM działa jak sprężyna do badania sił oddziaływania (adhezji i odpychania) oraz właściwości mechanicznych próbki5,6. Jest to znane jako spektroskopia sił. W tym trybie sonda najpierw zbliża się do próbki i wywiera na nią siłę, a następnie jest chowana, aż straci kontakt z próbką (rysunek 1A). Wygenerowane krzywe pokazują siłę w funkcji odległości wspornika zarówno dla zbliżania, jak i cofania. Można wyprowadzić kilka właściwości, w tym moduł sprężystości do pomiaru sztywności materiału i siły przyczepności.
Obsługiwane dwuwarstwy lipidowe to błony modelu biologicznego leżące na solidnym podłożu - zwykle mika, szkło borokrzemianowe, stopiona krzemionka lub utleniony krzem7. Przygotowuje się je przy użyciu różnych technik, takich jak osadzanie pęcherzyków, metoda Langmuira-Blodgetta i powlekaniewirowe 8,9. Obrazowanie AFM zostało wykorzystane do śledzenia powstawania tych podpartych dwuwarstw10 i badania różnych struktur utworzonych przez błony o różnym składzie11-15.
Wykonanie spektroskopii sił na obsługiwanych dwuwarstwach powoduje pik na krzywej podejścia. Ten szczyt wskazuje siłę potrzebną do przebicia dwuwarstwy i nazywa się siłą przebicia. Grubość dwuwarstwy można również zmierzyć za pomocą krzywej siły6 . Typowa siła przebicia dwuwarstw mieści się w zakresie 1-50 nN6. Właściwości te zależą od upakowania lipidów (faza ciekła lub żelowa) i struktury (długość łańcucha acylowego i stopień nienasycenia) i są zmieniane przez środki czynne błonowo16. Teoria stojąca za pęknięciem została wyjaśniona17, a inne parametry eksperymentalne, takie jak miękkość wspornika, promień końcówki i prędkość zbliżania, również wpływają na siłę przebicia15,16,18. Spektroskopia sił została wykorzystana do analizy właściwości różnych faz lipidowych11,19, zmian zależnych od składu12,20, a także wpływu innych biomolekuł, takich jak peptydy, na stabilność błony21.
Płaska orientacja wspieranych dwuwarstw jest korzystna dla łączenia AFM z innymi metodami, takimi jak powierzchniowy rezonans plazmonów22 i mikroskopia fluorescencyjna11,19 w celu lepszego scharakteryzowania struktury i właściwości membran.
Ten szczegółowy protokół wideo ma na celu przygotowanie wspieranych dwuwarstw lipidowych za pomocą osadzania pęcherzyków i analizowanie ich za pomocą AFM i spektroskopii sił. Podczas gdy pęcherzyki o różnych rozmiarach mogą być używane do przygotowania dwuwarstw, protokół ten koncentruje się na małych i dużych pęcherzykach jednowarstwowych. Scharakteryzowano dwuwarstwy nośne, które rozdzielają fazę na fazę uporządkowaną cieczą (LO) i fazę nieuporządkowaną cieczą (LID)11,15. Błona składa się z di-oleoilo-fosfatydylocholiny (DOPC), sfingomieliny (SM) i cholesterolu (Chol) w stosunku 2:2:1. Kompozycja ta modeluje tratwy lipidowe, które mają zachowywać się jak platformy ważne dla transportu i sortowania białek, sygnalizacji komórkowej i innych procesów komórkowych23,24.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
1. Przygotowanie wspieranych dwuwarstw lipidowych (SLB)11,12,21
2. Pomiary mikroskopii sił atomowych11,12
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Obsługiwane dwuwarstwy lipidowe złożone z DOPC:SM:Chol (2:2:1) zostały zobrazowane w AFM (Rysunek 2 A-C). Ze względu na skład lipidowy zaobserwowano fazy Lo bogate w SM/Chol i Ld bogate w DOPC. Profil wysokości z obrazowania AFM może dostarczyć ważnych informacji na temat struktury membrany. Patrząc na profil wysokości, można zmierzyć grubość dwuwarstwy w obecności wad membrany (rysunek 2B) lub określić różnicę wysokości między fazami Lo/Ld. Po...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
SLB złożone z DOPC:SM:Chol (2:2:1) powstały na mice po adsorpcji pęcherzyków i pęknięciu wywołanym przez chlorek wapnia. Ta kompozycja lipidowa podzieliła się na fazy L, d i Lo. FazaL o jest wzbogacona w sfingomielinę i cholesterol i jest mniej płynna/bardziej lepka (Figura 1A) niż faza Ld 11. Oddzielenie fazy Lo od Ld objawia się okrągłymi strukturami wyniesionymi ponad otoczenie (Rysunek 1B, C). Platformy są f...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Autorzy oświadczają, że nie mają konkurencyjnych interesów finansowych.
Ta praca była wspierana przez Towarzystwo Maxa Plancka, Niemieckie Centrum Badań nad Rakiem, Uniwersytet w Tybindze oraz Bundesministerium für Bildung und Forschung (grant nr 0312040).
Dziękujemy Eduardowi Hermannowi za pomoc w automatyzacji analizy danych z krzywej siły oraz dr Jakobowi Suckale za uważne przeczytanie tego manuskryptu.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| 1,2-dioleoilo-sn-glicero-3-fosfocholina | Avanti Polar Lipids, Inc. | 850375P | Występuje w postaci liofilizowanego proszku w szczelnie zamkniętych fiolkach. Po otwarciu rozpuścić cały proszek w chloroformie. Przechowywać dodatkowe w postaci wysuszonych filmów lipidowych, w atmosferze obojętnej, w temperaturze -20 °C. Odwiedź stronę tutaj aby uzyskać więcej informacji na temat przechowywania i obsługi. |
| Sfingomielina (mózg, świnia) | Avanti Polar Lipids, Inc. | 860062P | Występuje w postaci liofilizowanego proszku w dużych, szczelnie zamkniętych plastikowych pojemnikach. Po otwarciu rozpuścić szpatułkę z proszkiem w chloroformie. Przechowywać dodatkowe w postaci wysuszonych filmów lipidowych, w atmosferze obojętnej, w temperaturze -20 °C. Odwiedź tutaj aby uzyskać więcej informacji na temat przechowywania i obsługi. |
| Cholesterol | Avanti Polar Lipids, Inc. | 700000P | Występuje w postaci liofilizowanego proszku w dużych, szczelnie zamkniętych plastikowych pojemnikach. Po otwarciu rozpuścić szpatułkę z proszkiem w chloroformie. Przechowywać dodatkowe w postaci wysuszonych filmów lipidowych, w atmosferze obojętnej, w temperaturze -20 °C. Odwiedź tutaj aby uzyskać więcej informacji na temat przechowywania i obsługi. |
| Chlorek sodu (NaCl), 99,8% | Carl Roth GmbH + Co. KG | 9265.1 | |
| Chlorek potasu (KCl), 88% | Sigma | P9541 | |
| Wodorofosforan sodu (Na2HPO4), >99% | AppliChem GmbH | A1046 | |
| Diwodorofosforan potasu (KH2PO4), 99% | Carl Roth GmbH + Co. KG | 3904.1 | |
| Dwuwodny chlorek wapnia (CaCl2), klasa biologii molekularnej | AppliChem GmbH | A4689 | |
| HEPES, klasa biologii molekularnej | AppliChem GmbH | A3724 | |
| Szkiełko nakrywkowe, 24 x 60 mm, 1 mm grubości | Duran Group | 2355036 | |
| Zestaw dziurkaczy i matryc | Precision Brand Products, Inc | 40105 | |
| Klej optyczny | Norland Products, Inc. | NOA 88 | Płynny klej, który twardnieje po utwardzeniu w świetle UV o dużej długości fali. |
| [nagłówek] | |||
| Mica blokuje | NSC Mica Exports Ltd. | Są to kawałki miki o powierzchni co najmniej 1 cala kwadratowego i grubości od 0,006 cala do 0,016 cala. Są one przycinane przez firmę do określonego rozmiaru do wysyłki. Małe krążki miki można wykrawać z bloków miki za pomocą zestawu dziurkacza i matrycy. Zawsze obchodź się z miką w rękawiczkach lub pęsety. | |
| Sprzęt laboratoryjny Smarownica | Chemie AG | Glisseal N | |
| Wytłaczarka do liposomów | Avestin | LiposoFast-Basic | Jako alternatywę można również zapoznać się z ofertami Northern Lipids, Inc. |
| Taśma klejąca | 3M | Scotch(R) Magic (TM) Tape 810 (1-calowa) | |
| Sonikator do kąpieli | Bandelin Sonorex Digitec | DT-31 | Bez grzania, Częstotliwość: 35 kHz, Moc szczytowa ultradźwięków: 160 W, Moc HF: 40 W. (Karta katalogowa) |
| Wspornik z azotku krzemu AFM | Sondy AFM firmy Bruker | DNP-10 | Każdy wspornik ma cztery końcówki, a ich nominalny promień końcówki wynosi 20 nm (z możliwym maksimum przy 60 nm). W oparciu o specyfikację stosujemy końcówkę D o częstotliwości rezonansowej 18 kHz i nominalnej stałej sprężystości 0,06 N/m. |
| AFM | JPK | JPK Nanowizard II zamontowany na Zeiss Axiovert 200 | |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission