W typowym badaniu sekrecji w żywych komórkach stosuje się kilka trybów gromadzenia danych. Rysunek 3 przedstawia nałożenie obrazu LSPRi, który uwydatnia kwadratowe macierze, oraz obrazu w świetle przechodzącym, na którym w lewym dolnym rogu widoczna jest komórka. Dane są zazwyczaj zbierane przez okres 3 h, po czym wprowadza się nasycający roztwór anality przed opisanym poniżej obliczeniem normalizacji. Do rutyny gromadzenia danych można zintegrować obrazowanie fluorescencyjne poprzez automatyczną zmianę kostki filtra. Na Rysunku 4 komórka zabarwiona fluorescencyjnym barwnikiem błonowym rhodamine DHPE wykazuje wypustki przypominające lamellipodia (strzałki). Gdyby takie wypustki nałożyły się na macierze, mogłyby one dać wynik fałszywie dodatni w odniesieniu do sekrecji białek. Stosowanie wielu trybów obrazowania pozwala zidentyfikować takie zdarzenia.
Rysunek 5 przedstawia dane spektrometryczne przed i po wprowadzeniu nasyconego roztworu (400 nM) zakupionych komercyjnie przeciwciał anty-c-myc do matryc funkcjonalizowanych c-myc. W tym eksperymencie nie zastosowano komórek. Widmo wykazuje zarówno przesunięcie czerwone, jak i wzrost intensywności. Różnica między polami pod dwiema krzywymi skutkuje wzrostem intensywności obrazu matrycy w trybie LSPRi na kamerze CCD. Opracowano nieliniową metodę analizy danych metodą najmniejszych kwadratów w celu wyznaczenia frakcyjnego stopnia zajętości ligandów związanych z powierzchnią na podstawie widm.30,31
Na koniec eksperymentu wartości intensywności nasycenia (tj. zajętość frakcyjna ≈ 1) są wykorzystywane do obliczenia znormalizowanej odpowiedzi dla każdego układu przy użyciu następującego wzoru:
Gdzie odpowiednio: znormalizowana intensywność w punkcie czasowym t, intensywność początkowa na początku eksperymentu, końcowa intensywność nasycenia oraz zmierzona intensywność matrycy w punkcie czasowym t.
Znormalizowane wartości z dwóch macierzy przedstawiono na Rysunku 6. Jedna macierz znajdowała się w odległości 10 µm od badanej komórki, natomiast druga, wykorzystana jako kontrola, znajdowała się w odległości 130 µm od komórki. Nagły wzrost znormalizowanej odpowiedzi macierzy położonej najbliżej komórki w stosunku do płaskiej odpowiedzi macierzy kontrolnej wskazuje na lokalny wyrzut wydzielonych przeciwciał.

Rysunek 1. Projekt czujnika. Rysunek przedstawiający geometrię typowego eksperymentu z sekrecją żywych komórek. Komórka (niebieski sferoid) jest osadzana na chipie LSPR zawierającym macierze biofunkcjonalizowanych nanostruktur złota. W powiększeniu przedstawiono pomiar sekrecji komórkowej (w tym przypadku przeciwciał, ukazanych jako cząsteczki w kształcie litery Y) w momencie ich wiązania się z powierzchnią funkcjonalizowanych nanostruktur. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2. Układ optyczny. Światło z lampy halogenowej jest najpierw filtrowane przez filtr długoprzepustowy (LP). Światło jest polaryzowane liniowo (P1) i oświetla próbkę za pomocą obiektywu 40X/1.4 NA. Światło rozproszone jest zbierane przez obiektyw i przechodzi przez polaryzator skrzyżowany (P2). W torze zbieranego światła umieszczono dzielnik wiązki 50/50 (BS) w celu jednoczesnej analizy spektroskopowej i obrazowej. Prawy górny róg: Obraz z mikroskopii sił atomowych 9 pojedynczych nanostruktur oddzielonych rozstawem 300 nm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 3. Badanie LSPRi na żywych komórkach. Nałożony obraz światła przechodzącego i obraz LSPRi przedstawiający pojedynczą komórkę hybridoma (lewy dolny róg) otoczoną przez 12 macierzy. Jest to obraz z wzmocnionym kontrastem. Pasek skali wynosi 10 µm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 4. Badanie fluorescencji żywych komórek. Fluorescencyjny obraz w fałszywych kolorach pojedynczej komórki hybridoma barwionej rhodamine DHPE, który jest barwnikiem błonowym. W trybie obrazowania fluorescencyjnego macierze zazwyczaj nie są widoczne, jednak w prawym dolnym rogu można zaobserwować pobliską macierz w postaci czarnego kwadratu. Widać, że komórka jest oddzielona od macierzy, choć z komórek wyciekają wypustki przypominające macki (prawdopodobnie filopodia lub lamelipodia) (strzałki). Pasek skali wynosi 10 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 5. Modalność spektralna. Widma uzyskane z macierzy funkcjonalizowanej c-myc przed i po wprowadzeniu roztworu przeciwciał anty-c-myc o stężeniu 400 nM. W badaniu tym nie wykorzystano komórek. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 6. Sekrecja pojedynczej komórki. Odpowiedź macierzy znajdującej się w odległości 15 µm od pojedynczej komórki oraz macierzy oddalonej o 130 µm (Kontrola). Pasek skali wynosi 10 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.