$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Powierzchnia komórki roślinnej, w tym błona plazmatyczna i bezpośrednio przylegająca do niej cytoplazma, jest głównym regionem percepcji komórki roślinnej i integracji sygnałów biotycznych i abiotycznych ze środowiska zewnątrzkomórkowego. W odpowiedzi na te sygnały składniki powierzchni komórki, w tym białka błony plazmatycznej i cytoszkielet korowy, ulegają dynamicznym zmianom w skali czasu od sekund do minut1-4. W ten sposób obrazowanie białek fluorescencyjnych na powierzchni komórki w czasie rzeczywistym i w wysokiej rozdzielczości może rzucić światło na reakcje rośliny na sygnały środowiskowe na poziomie molekularnym.
Konfokalna laserowa mikroskopia skaningowa jest potężnym narzędziem do określania lokalizacji białek znakowanych fluorescencyjnie3, jednak często trudno jest monitorować dynamikę białek w czasie rzeczywistym ze względu na stosunkowo długi czas ich przechwytywania. Nową techniką monitorowania białek w komórce roślinnej w czasie rzeczywistym jest mikroskopia epifluorescencyjna o zmiennym kącie nachylenia (VAEM), która jest adaptacją sprzętu zwykle używanego do mikroskopii fluorescencji całkowitego wewnętrznego odbicia (TIRF). W mikroskopii TIRF fluorescencyjno-wzbudziające źródło światła jest ulotnym polem świetlnym, które jest generowane, gdy kąt wejścia lasera jest wystarczająco płytki, aby całkowicie wewnętrznie odbijać światło na granicy szkła i wody. Głębokość penetracji ulotnego pola świetlnego wynosi około 100 nm. Mikroskopia TIRF jest znakomitym narzędziem do obrazowania pojedynczych cząsteczek, takich jak wykrywanie egzocytozy w komórkach zwierzęcych5. Jednak ulotne światło nie może dotrzeć do błon plazmatycznych ani cytoplazmy korowej w komórkach roślinnych, ponieważ mają one grube ściany komórkowe. Ostatnio sprzęt do mikroskopii TIRF został zaadaptowany przez biologów komórek roślinnych, obserwując, że laser, jeśli jest ustawiony pod nieco większym kątem niż wtedy, gdy jest używany do wywoływania zjawisk całkowitego wewnętrznego odbicia, może wzbudzić powierzchnię próbek komórek roślinnych, co skutkuje wysokiej jakości obrazowaniem komórek roślinnych6,7. Głębokość oświetlenia wzbudzenia zmienia się poprzez regulację kąta wejścia lasera; dlatego ta technika jest opisana jako VAEM. Ten układ optyczny jest również nazywany mikroskopią TIRF o zmiennym kącie (VA-TIRFM), ponieważ istnieje możliwość, że całkowite odbicie może mieć miejsce na granicy ściana komórkowa-peryplazma7, jednak termin VAEM jest używany w tym artykule, zgodnie z pierwszym raportem w roślinach6.
Celem tego protokołu jest zademonstrowanie praktycznych procedur użycia VAEM do wizualizacji fluorescencyjnie znakowanej dynamiki białek na powierzchni komórek roślinnych. Dodatkowo opisano protokół analizy obrazu w celu ilościowego określenia czasu przebywania (czasu obecności) cząsteczek do analizy filmu VAEM. Jako przykład posłużono się kropką GFP-PATROL1 na komórkach kompleksu szparkowego u liścieni Arabidopsis thaliana. PATROL1 został zidentyfikowany za pomocą zaawansowanych metod genetycznych jako gen przyczynowy mutanta defektu odpowiedzi szparkowej u A. thaliana8. PATROL1 jest roślinnym homologiem MUNC-13, który jest czynnikiem primingowym w egzocytozie pęcherzyków synapsowych8. W odpowiedzi na sygnały środowiskowe, takie jak światło lub wilgotność, uważa się, że PATROL1 odwracalnie reguluje dostarczanie pompy protonowej do błon plazmatycznych w kompleksie szparkowym. Każdy kompleks szparkowy składa się z pary komórek ochronnych8 i komórek pomocniczych9 i wymaga pompy protonowej do ruchu aparatów szparkowych. W tych komórkach PATROL1 znakowane GFP lokalizuje się w kropkowatych strukturach, które pozostają na błonie plazmatycznej przez mniej niż 1 minutę9.