$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Wielokomórkowe sferoidy 3D są znane jako modele nowotworów od dziesięcioleci, jednak dopiero niedawno stały się bardziej powszechne jako model in vitro dla wielu nowotworów litych. Są one coraz częściej stosowane w wysokoprzepustowych badaniach przesiewowych odkrywania leków jako rozwiązanie pośrednie między złożonymi, drogimi i czasochłonnymi modelami in vivo a prostym, tanim monowarstwowym modelem 2D 1-6. Badania nad kulturą 2D często nie są możliwe do powtórzenia in vivo. Modele sferoidalne wielu typów nowotworów są w stanie naśladować charakterystykę wzrostu, wrażliwość na leki, penetrację leków, interakcje komórka-komórka, ograniczoną dostępność tlenu i składników odżywczych oraz rozwój martwicy, która jest obserwowana in vivo w guzach litych 6-11. Sferoidy rozwijają nekrotyczne jądro, spoczynkowy lub zatrzymany G1 obszar otaczający jądro i proliferujące komórki na obrzeżach sferoidy 7. Rozwój tych regionów może się różnić w zależności od gęstości komórek, tempa proliferacji i wielkości sferoidy 12. Postawiono hipotezę, że heterogeniczność komórkowa obserwowana w tych różnych podregionach może przyczyniać się do oporności na terapię nowotworową 13,14. Dlatego możliwość oddzielnej analizy komórek w tych regionach ma kluczowe znaczenie dla zrozumienia odpowiedzi na leki nowotworowe.
System wskaźnika cyklu komórkowego ubikwitynacji fluorescencji (FUCCI) opiera się na czerwonym (Kusabira Orange - KO) i zielonym (Azami Green - AG) fluorescencyjnym znakowaniu Cdt1 i gemininy, które są degradowane w różnych fazach cyklu komórkowego 15. W ten sposób jądra komórkowe są czerwone w G1, żółte we wczesnej fazie S i zielone w fazie S/G2/M. Opisujemy tutaj dwie uzupełniające się metody, zarówno wykorzystujące FUCCI do identyfikacji cyklu komórkowego, jak i użycie oprogramowania do obrazowania lub testu cytometrii przepływowej dyfuzji barwnika w celu określenia, czy komórki znajdują się w centrum zatrzymanym G1, czy w zewnętrznym pierścieniu proliferacyjnym, oraz odległości poszczególnych komórek od krawędzi sferoidy. Metody te zostały opracowane w naszej poprzedniej publikacji, w której wykazaliśmy, że komórki czerniaka w niedotlenionych regionach w środku sferoidy i/lub w obecności terapii celowanych są w stanie pozostać w zatrzymaniu G1 przez dłuższy czas i mogą ponownie wejść w cykl komórkowy, gdy pojawią się bardziej sprzyjające warunki 7.