Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.

Artykuł metodologiczny

Łatwa metoda profilowania polisomów roślin

12.7K wyświetleń

DOI:

10.3791/54231

28 sierpnia 2016

W tym artykule

Podsumowanie

Ten protokół opisuje prostą metodę ekstrakcji i frakcjonowania transkryptów z tkanek roślinnych na podstawie liczby związanych rybosomów. Pozwala na globalne oszacowanie aktywności translacyjnej i określenie statusu translacyjnego określonych mRNA.

Streszczenie

Translacja mRNA na białko jest podstawowym i wysoce regulowanym procesem biologicznym. Profilowanie polisomów jest uważane za złoty standard w analizie regulacji translacyjnej. Opisana tutaj metoda to łatwy i ekonomiczny sposób frakcjonowania polisomów z różnych tkanek roślinnych. Gradient sacharozy jest wytwarzany bez potrzeby stosowania kreatora gradientu poprzez sekwencyjne zamrażanie każdej warstwy. Ekstrakty cytozolowe są następnie przygotowywane w buforze zawierającym cykloheksymid i chloramfenikol w celu unieruchomienia rybosomów cytozolowych i chloroplastycznych do mRNA i są ładowane na gradient sacharozy. Po odwirowaniu sześć frakcji jest zbieranych bezpośrednio od dołu do góry gradientu, bez przebijania probówki do ultrawirówki. Podczas zbierania absorbancja przy 260 nm jest odczytywana w sposób ciągły w celu wygenerowania profilu polisomowego, który daje obraz globalnej aktywności translacyjnej. Frakcje są następnie łączone w celu przygotowania trzech różnych populacji mRNA: polisomów, mRNA związanych z kilkoma rybosomami; monosomy, mRNA związane z jednym rybosomem; i mRNA, które nie są związane z rybosomami. Następnie ekstrahuje się mRNA. Protokół ten został zatwierdzony dla różnych roślin i tkanek, w tym siewek Arabidopsis thaliana i roślin dorosłych, Nicotiana benthamiana, Solanum lycopersicum i liści Oryza sativa.

Wprowadzenie

Synteza białek jest niezbędnym i kosztownym energetycznie procesem we wszystkich komórkach 1. Przede wszystkim komórki muszą inwestować energię w produkcję maszynerii translacyjnej, rybosomów. Na przykład aktywnie dzieląca się komórka drożdży wytwarza nawet 2000 rybosomów na minutę. Taka produkcja wymaga do 60% całkowitej aktywności transkrypcyjnej i do 90% całkowitej aktywności splicingowej komórki 2. Ponadto energia jest potrzebna do syntezy aminokwasów, aminoacylo-tRNA i wiązań peptydowych. W roślinach dodanie jednego aminokwasu do łańcucha peptydowego kosztuje od 4,5 do 5,9 cząsteczki ATP 3. Dlatego nie jest zaskakujące, że translacja mRNA na białko jest głównym miejscem regulacji, szczególnie jeśli chodzi o radzenie sobie ze zmieniającymi się warunkami środowiskowymi.

Etap inicjacji translacji, czyli powiązanie mRNA z rybosomem, jest głównym celem regulacji translacji4. W wyniku regulacji translacji, jak również innych potranskrypcyjnych etapów regulacyjnych, tylko 40% zmian w stężeniu białka można wyjaśnić obfitością mRNA 5,6. Tak więc badanie całkowitego mRNA daje stosunkowo słabe informacje na temat obfitości białek. Z drugiej strony, powiązanie mRNA z rybosomami daje lepszy wgląd w obfitość białek, dając dostęp do tych mRNA, które biorą udział w translacji. Aktywnie ulegające translacji mRNA są związane z kilkoma rybosomami w strukturach zwanych polisomami. I odwrotnie, słabo translowane mRNA będą związane tylko z jednym rybosomem (monosomem). W związku z tym status translacyjny mRNA można ocenić, monitorując jego związek z rybosomami7.

Ten protokół opisuje izolację polisomów z sześciodniowych siewek Arabidopsis thaliana, późniejszą izolację RNA i analizę wyników. Polisomy i monosomy są oddzielone gradientem gęstości sacharozy. Gradienty są zebrane w sześć frakcji. Niektóre frakcje są łączone w celu uzyskania trzech dobrze oddzielonych frakcji: polisomów, monosomów i frakcji lekkiej (zwanej dalej supernatantem), która zawiera wolne podjednostki rybosomalne 60S i 40S oraz mRNA, które nie są związane z rybosomami. Globalną aktywność translacyjną można oszacować, generując stosunek polisomów do monosomów, który jest określany przez całkowanie obszaru pod krzywą oraz przez porównanie profili polisomów. mRNA i białka są następnie ekstrahowane z różnych frakcji i wykorzystywane do analizy za pomocą RT-PCR, qRT-PCR, Northern blot, mikromacierzy, western blot lub proteomiki. Protokół ten został zatwierdzony dla innych roślin i tkanek.

Sprzęt wymagany do wykonania tego protokołu jest powszechnie spotykany w większości laboratoriów: Nie ma potrzeby korzystania z kreatora gradientów. Zamrożenie każdej warstwy przed dodaniem kolejnej zapobiega jakiemukolwiek mieszaniu się lub zakłóceniu warstw. Do zbierania gradientu nie używa się przekłuwacza do probówek, co można osiągnąć poprzez zanurzenie szklanej rurki kapilarnej w gradiencie. Dzięki temu kosztowne probówki do ultrawirówek pozostają nieuszkodzone i mogą być wielokrotnie używane. Podsumowując, sprawia to, że obecny protokół jest łatwą i tanią metodą profilowania polisomów.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Protokół

1. Przygotowanie gradientów sacharozy o stężeniu od 20 do 50% (m/v)

Uwaga: Gradienty składają się z 4 warstw sacharozy (50%, 35% oraz 2 warstw 20%) w probówce do ultrawirówki o pojemności 13,2 ml. Z naszego doświadczenia wynika, że nalewanie 20% sacharozy w dwóch oddzielnych warstwach znacznie poprawia jakość preparatów polisomów.

  1. Przygotować roztwory stokowe. Należy upewnić się, że wszystkie roztwory są wolne od RNaz i DNaz.
    1. Przygotować 10X roztwór soli: 400 mM Tris-HCl pH 8,4, 200 mM KCl oraz 100 mM MgCl2.
    2. Przygotować 2 M roztwór sacharozy: aby otrzymać 200 ml, rozpuścić 137 g sacharozy w 1X roztworze soli.
  2. Rozcieńczyć roztwór sacharozy w roztworze soli zgodnie z opisem w Tabeli 1, aby przygotować gradienty. Podane objętości dotyczą sześciu gradientów.
Końcowe stężenie sacharozySacharoza 2M (ml)Roztwór soli 1X (ml)Obj. końcowa (ml)
50%8.83.212
35%12.912.125
20%7.417.625
20%5.814.220

Tabela 1. Rozcieńczenia roztworu sacharozy w celu przygotowania sześciu gradientów.

  1. Nalej warstwy zgodnie z Tabelą 2.
Warstwa sacharozy50%35%20%20%
Obj. (ml)1.853.653.651.35

Tabela 2. Objętość roztworu sacharozy na warstwę.

  1. Po nalaniu każdej warstwy należy przechowywać probówki w zamrażarce o temperaturze -40 °C lub -80 °C aż do całkowitego zamrożenia, przed dodaniem kolejnej warstwy sacharozy. Zamrożenie następuje zazwyczaj po 2 hr w -40 °C, jednak zaleca się odczekanie około 6 hr przed nalaniem następnej warstwy. Ostatnią warstwę 20% można zamrozić lub dodać na świeżo w dniu eksperymentu.
    Uwaga: Zamrażanie każdej warstwy przed dodaniem kolejnej zapobiega mieszaniu lub zaburzeniu granic warstw. Gradienty można przechowywać w zamrażarce o temperaturze -40 °C lub -80 °C przez co najmniej sześć miesięcy.
  2. Jeśli nie zostało to jeszcze zrobione, należy dodać ostatnią warstwę 20% do gradientów w dniu eksperymentu. Następnie należy pozwolić gradientom rozmrozić się w chłodni lub lodówce.

2. Przygotowanie ekstraktów cytozolowych

Uwaga: Zalecamy stosowanie dwóch gradientów na jedną próbkę biologiczną. 300 mg to optymalna ilość materiału roślinnego do przygotowania dwóch gradientów podczas pracy z 6-dniowymi siewkami Arabidopsis thaliana. W przypadku pracy z tkankami o mniejszej aktywności translacyjnej ilość materiału roślinnego można zwiększyć do 600 mg.

  1. Zebrać sześcio-dniowe siewki hodowane na pożywce ½ Murashige and Skoog8 uzupełnionej o 1% sacharozy lub pożywkach równoważnych poprzez szybkie zamrażanie w ciekłym azocie
  2. Rozetrzeć materiał roślinny w schłodzonym moździerzu z tłuczkiem przy użyciu ciekłego azotu.
  3. Odważyć 300 mg sproszkowanego materiału do schłodzonej łódki wagowej. Krok ten należy wykonać szybko, aby uniknąć rozmrożenia próbki.
    Uwaga: Zamrożone próbki należy przechowywać w zamrażarce w temperaturze -80 °C nie dłużej niż przez jeden tydzień.
  4. Dodać 2,4 ml schłodzonego buforu do polisomów (Salt Solution 4X, 5,26 mM EGTA, 0,5% (v/v) Octylphenoxy poly(ethyleneoxy)ethanol, branched, 50 µg.ml-1 cykloheksymidu, 50 µg.ml1 chloramfenikolu) i homogenizować poprzez mieszanie końcówką pipety. Przenieść do dwóch probówek o pojemności 1,5 ml. Pracować szybko, aby zapobiec ogrzaniu się próbek.
  5. Wirować w mikrowirówce przy 16,000 x g przez 15 min w temperaturze 4 °C w celu osadzenia resztek komórkowych.
    Uwaga: Aby zapobiec degradacji RNA, próbki należy zawsze utrzymywać w temperaturze 4°C, stosować roztwory wolne od RNaz/DNaz i pracować w warunkach wolnych od RNaz/DNaz. Do buforu do polisomów można dodać heparynę do stężenia końcowego 300 µg.ml-1, aby zwiększyć ochronę RNA. Jednakże, ponieważ heparyna może zakłócać dalsze analizy, musi zostać usunięta podczas etapu precypitacji RNA poprzez przeprowadzenie precypitacji chlorkiem litu zamiast precypitacji etanolem (patrz uwaga 4.7).

3. Profilowanie polisomów

  1. Ostrożnie odpipetować supernatant, nie naruszając pelletu. Jeśli odpipetowano fragmenty roślin, powtórzyć krok 2.5. Nałożyć supernatant na gradient, delikatnie pipetując go na ściankę probówki w jednostajnym strumieniu. Użyć jednego gradientu dla każdej probówki 1,5 ml.
  2. Przenieść do schłodzonych wcześniej koszy i wirować w ultrawiroworce przy 175 000 x g przez 2 godz. 45 min w temperaturze 4 °C (np. 32 000 rpm przy użyciu rotora SW41).
  3. Przygotować system zbierania frakcji gradientu zgodnie z opisem na Rysunku 1. Kuweta UV ma długość drogi optycznej 1 mm.

Schemat chromatografii: układ spektrofotometru, UV przy 260 nm, pompa perystaltyczna, kolektor frakcji.
Rycina 1. System zbierania gradientu.Kuweta UV jest połączona za pomocą rurek z polichlorku winylu z szklaną rurką kapilarną, która schodzi do dna gradientu. Gradient przemieszcza się przez układ dzięki pompie perystaltycznej. Wartość OD260 jest odczytywana w sposób ciągły, a zbierane są frakcje o objętości 2 ml. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.

  1. Ustaw kolektor frakcji w temperaturze pokojowej (RT) i dostosuj prędkość karuzeli tak, aby umożliwić zbieranie frakcji o objętości 2 ml. Użyj schłodzonych wcześniej probówek do zbierania frakcji.
  2. Zbieraj frakcje od dołu do góry, używając szklanej kapilary połączonej rurką z polichlorku winylu z systemem zbierania gradientu. Do zabezpieczenia połączenia między rurką z polichlorku winylu a szklaną kapilarą użyj plastikowej folii parafinowej.
  3. Zmierz absorbancję przy 260 nm od dołu do góry gradientu. Po zebraniu całego gradientu umieść probówki na lodzie przed ekstrakcją RNA.

4. Ekstrakcja RNA

  1. Zgrupuj frakcje zebrane z dwóch gradientów w 50 ml zakręcanych probówkach do wirowania w następujący sposób:
    Polizomy: frakcje od 1 do 3 (12 ml)
    Monosomy: frakcja 4 (4 ml)
    supernatant: frakcje 5 i 6 (8 ml)
  2. Do każdej frakcji dodaj 1 obj. 8M chlorku guanydyny, 50 µg nośnika akrylowego oraz 1,5 obj. izopropanolu.
    Uwaga: Nośnik akrylowy to liniowa akrylamida, stosowana jako koprecypitant w celu poprawy odzysku kwasów nukleinowych podczas wytrącania alkoholem.
  3. Wymieszaj poprzez odwracanie probówek i wytrącaj przez noc (O/N) w temperaturze -20 °C.
  4. Wirowanie przeprowadź przy 175 000 x g przez 1 h w 4 °C w ultrawirowarce (32 000 rpm w rotorze SW32). Jeśli etap wytrącania odbywał się w probówce niekompatybilnej z ultrawirowaniem, przenieś zawartość do odpowiedniej probówki.
  5. Odlej supernatant i rozpuść osad w 200 µl buforu TE wolnego od RNaz (10 mM Tris-HCl pH 7,5 - 1 mM EDTA). Przenieś do nowej probówki 1,5 ml.
  6. Wyodrębnij RNA, dodając 1 obj. wody z nasyconym fenolem (pH 6,6) oraz 1 obj. chloroformu:alkoholu izoamylowego (24:1). Wymieszaj energicznie. Wirowanie przeprowadź przy 15 000 x g przez 20 min w 4 °C. Przenieś fazę wodną do nowej probówki 1,5 ml.
    Uwaga: Aby zminimalizować zanieczyszczenie DNA, można zastosować fenol kwaśny (pH 4,5).
  7. Wytrącaj RNA, dodając 1/10 obj. 3 M octanu sodu i 3 obj. 100% etanolu. Pozostaw do wytrącenia w -80 °C przez 20 min lub przez noc (O/N) w -20 °C. Wirowanie przeprowadź przy 15 000 x g przez 15 min w 4 °C.
    Uwaga: Jeśli w buforze do polizomów zastosowano heparynę (patrz uwaga 2.5), zamiast wytrącania etanolem przeprowadź wytrącanie chlorkiem litu (LiCl), aby skutecznie usunąć wszelkie ślady heparyny, która mogłaby zakłócić dalsze analizy9. Po ekstrakcji dodaj LiCl do końcowego stężenia 2,5 M. Pozostaw do wytrącenia przez 30 min w -20 °C lub przez noc (O/N) w 4 °C. Wirowanie przeprowadź przy 15 000 x g przez 15 min w 4 °C.
  8. Przemyj osad 500 µl 75% etanolu. Osusz osad na powietrzu i rozpuść w 30 µl buforu TE. Oceń jakość RNA za pomocą elektroforezy na wolnym od RNaz 1,2% żelu agarozowym (100V, 15 min) lub metodami elektroforezy kapilarnej.

5. Analiza danych

  1. Wyeksportuj surowe dane do oprogramowania do analizy danych i grafiki.
    Uwaga: Jak pokazano na Rysunku 2A i B, surowe profile dostarczają informacji jakościowych: liczby widocznych pików polisomów, wysokości piku monosomów oraz obecności ramienia odpowiadającego wolnym podjednostkom rybosomalnym.
  2. Połącz profile, aby umożliwić porównanie ich pomiędzy próbkami. Użyj narzędzia odczytu ekranowego, aby wyznaczyć wartość X piku monosomów dla każdej próbki, a następnie wyrównaj piki monosomów, usuwając nadmiarowe punkty danych na początku krzywych. Zidentyfikuj najniższy punkt krzywej i wyznacz jego wartość Y (za pomocą narzędzia odczytu ekranowego). Ustaw wartość Y najniższego punktu na 0, korzystając z funkcji „set columns value”.
  3. Wyznacz stosunek polisomów do monosomów poprzez całkowanie pola pod krzywą z surowych profili (Rysunek 3C). Użyj narzędzia wyboru danych, aby zdefiniować granicę obszaru do całkowania. Następnie użyj funkcji całkowania (Analiza-Matematyka).
  4. Znormalizuj krzywe względem piku monosomów, dzieląc wszystkie punkty danych krzywej przez wartość Y wierzchołka piku monosomów (wyznaczoną za pomocą narzędzia odczytu ekranowego). Wybierz kolumnę, a następnie w sekcji Analiza-Matematyka wybierz opcję Normalizuj i wybierz metodę „podzielone przez określoną wartość”. Ten krok umożliwia porównanie względnego poziomu polisomów (Rysunek 3D).

Schemat profilowania polisomów z użyciem gradientu sacharozy; analiza translacji mRNA; rysunek zawiera wykresy.
Rysunek 2. Reprezentatywne profile polisomów. Siewki typu dzikiego (wt, ekotyp Col-0) oraz siewki mutantów Arabidopsis thaliana hodowano przez sześć dni na pożywce ½ Murashige and Skoog w warunkach długiego dnia (16 h światła, 8 h ciemności). A: surowe profile polisomów z siewek wt. B: surowe profile polisomów z siewek mutantów. C: Wyznaczenie procentowego udziału polisomów i monosomów poprzez całkowanie pola pod krzywą D: Profile polisomów znormalizowane względem piku monosomów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Wyniki

W literaturze profile polisomów są często przedstawiane od frakcji lekkiej do ciężkiej, co wynika ze sposobu zbierania gradientów, tj. od góry do dołu. Ponieważ w opisanym tutaj protokole gradienty są zbierane od dołu do góry, prezentowane przez nas profile zaczynają się od frakcji ciężkiej (polisomów) i przechodzą do frakcji lekkiej (wolnych podjednostek rybosomalnych i RNA) (Rysunek 2A). Następnie każdy gradient zbieramy w sześciu frakcjach o objętości 2 ml, jednak możn...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Dyskusja

Przedstawiony przez nas protokół jest łatwą i tanią metodą generowania profili polisomowych i izolowania mRNA związanych z polisosomami, pojedynczymi rybosomami lub wolnymi od rybosomów. W literaturze opisano szeroki zakres różnych metod frakcjonowania polisomów. Opisana przez nas metoda została zoptymalizowana tak, aby zachować tylko niezbędne związki i została dostosowana do materiału roślinnego. W szczególności zmniejszyliśmy ilość detergentu11 i dodaliśmy chloramfenikol do buforu, aby związać rybosomy chlo...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Oświadczenia

Autorzy nie mają nic do ujawnienia

Podziękowania

Ta praca była wspierana przez Francuską Narodową Agencję Badawczą (ANR-14-CE02-0010). Dziękujemy dr Benjaminowi Fieldowi i dr Elodie Lanet za krytyczną lekturę manuskryptu. Dziękujemy Panu Michelowi Terese za pomoc w edycji wideo.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Materiały

Lista materiałów użytych w tym artykule
NazwaFirmaNumer katalogowyKomentarze
Probówka do ultrawirówek, cienkościenna, poliallomer - 13,2 mlBeckman Coulter331372
Probówka do ultrawirówek, cienkościenna, polialomerowa - 38,5 mlBeckman Coulter326823
Szklana rurka kapilarnaDrummond Scientific1-000-1000
Ultrawirówka Beckman Coulterserii Optima
SW41 Rotor ultrawirówkiBeckman Coulter331362
SW32Beckman Coulter369650
Pompa perystaltycznaDowolna
rurka z polichlorku winylu Tygon R3607 Fisher Scientific070534-22Rurka z polichlorku winylu, 2,29 mm 
Kolektor frakcji Model 2110Bio-Rad731-8120
Kuweta UVHellma170.700-QSKwarcowa kuweta przepływowa
Spektrofotometr UVVarianCary50Odczyt co 0,0125 sekundy
Wszystkie chemikaliaTylkodo użytku Biologia molekularna Klasa
Murashige i Skoog Mieszanina soli bazalnej (MS)Sigma-AldrichM5524
Woda wolna od rnazyDowolne
szalki PetriegoFisher Scientific10083251 
Oktylofenoksyetanol poli(etylenoksy)etanol, rozgałęziony (Nonidet P40)EuromedexUN3500
Liniowy akryloamid (nośnik akrylowy)ThermoFischer scientificAM9520Nośnik wytrącania RNA
OriginPro 8Oprogramowanie analityczneOriginLab
Wirnik ultrawirówkowy

Bibliografia

  1. Nelson, C. J., Millar, A. H. Protein turnover in plant biology. Nat Plants. 1 (3), 15017(2015).
  2. Warner, J. R. The economics of ribosome biosynthesis in yeast. Trends Biochem Sci. 24 (11), 437-440 (1999).
  3. Amthor, J. S. The McCree-de Wit-Penning de Vries-Thornley Respiration Paradigms: 30 Years Later. Ann Bot. 86 (1), 1-20 (2000).
  4. Preiss, T., W Hentze, M. Starting the protein synthesis machine: eukaryotic translation initiation. BioEssays news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. 25 (12), 1201-1211 (2003).
  5. Vogel, C., Marcotte, E. M. Insights into the regulation of protein abundance from proteomic and transcriptomic analyses. Nat Rev Genet. 13 (4), 227-232 (2013).
  6. Baerenfaller, K., et al. Genome-scale proteomics reveals Arabidopsis thaliana gene models and proteome dynamics. Science. 320 (5878), 938-941 (2008).
  7. Zanetti, E., Chang, I., Gong, F., Galbraith, D. W., Bailey-Serres, J. Immunopurification of Polyribosomal Complexes of Arabidopsis for Global Analysis of Gene Expression. Plant physiol. 138 (2), 624-635 (2005).
  8. Murashige, T., Skoog, F. A revised medium for rapid growth and bioassays with tobacco tissue cultures. Physiol plant. 15 (3), 473-497 (1962).
  9. del Prete, M. J., Vernal, R., Dolznig, H., Müllner, E. W., Garcia-Sanz, J. A. Isolation of polysome-bound mRNA from solid tissues amenable for RT-PCR and profiling experiments. RNA. 13 (3), 414-421 (2007).
  10. Arabidopsis protocols. Salinas, J., Sanchez-Serrano, J. J. , Methods in molecular biology; 323. Clifton, N.J. (2006).
  11. Piques, M., et al. Ribosome and transcript copy numbers, polysome occupancy and enzyme dynamics in Arabidopsis. Mol syst biol. 5 (314), 314(2009).
  12. Morita, M., Alain, T., Topisirovic, I., Sonenberg, N. Polysome Profiling Analysis. bio-protocol. 3 (14), 3-8 (2013).
  13. Yángüez, E., Castro-Sanz, A. B., Fernández-Bautista, N., Oliveros, J. C., Castellano, M. M. Analysis of genome-wide changes in the translatome of Arabidopsis seedlings subjected to heat stress. PloS One. 8 (8), (2013).
  14. Sormani, R., et al. Sublethal cadmium intoxication in Arabidopsis thaliana impacts translation at multiple levels. Cell Physiol. 52 (2), 436-447 (2011).
  15. Lanet, E., et al. Biochemical evidence for translational repression by Arabidopsis microRNAs. Plant cell. 21 (6), 1762-1768 (2009).
  16. Jabnoune, M., Secco, D., Lecampion, C., Robaglia, C., Shu, Q., Poirier, Y. A Rice cis-Natural Antisense RNA Acts as a Translational Enhancer for Its Cognate mRNA and Contributes to Phosphate Homeostasis and Plant Fitness. Plant cell. 25 (10), 4166-4182 (2013).
  17. Ingolia, N. T. Genome-wide translational profiling by ribosome footprinting. Methods Enzymol. 470 (10), Elsevier Inc. (2010).
  18. Juntawong, P., Girke, T., Bazin, J., Bailey-Serres, J. Translational dynamics revealed by genome-wide profiling of ribosome footprints in Arabidopsis. PNAS. 111 (1), 203-212 (2013).
  19. Ingolia, N. T. Ribosome profiling: new views of translation, from single codons to genome scale. Nat Rev Genet. 15 (3), 205-213 (2014).

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Przedruki i uprawnienia

Tagi

Tkanki ro linnegradient sacharozyekstrakcja RNAultrawirowanieekstrakt cytosolowypobieranie frakcjipomiar ODArabidopsis thalianaNicotiana benthamiana