$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Gen supresorowy nowotworu, p53, jest niezbędnym regulatorem wielu procesów komórkowych, w tym zatrzymania cyklu komórkowego, apoptozy i starzeniasię 1. Jest odpowiedzialny za utrzymanie stabilności genomu, a zatem ma kluczowe znaczenie dla utrzymania równowagi między śmiercią komórki a wzrostem komórki. Mutacje p53 są powszechne w raku i są główną przyczyną inaktywacji p53 prowadzącej do niekontrolowanej proliferacji komórek rakowych2. Co ciekawe, mutacje w p53 odpowiadają tylko za około 25% nowotworów piersi3, co sugeruje, że inne mechanizmy są odpowiedzialne za utratę funkcji p53. Wykazano, że niedawno odkryte izoformy p53 ulegają nadekspresji w wielu nowotworach u ludzi i mogą modulować funkcję p534,5. Wcześniej wykazaliśmy, że izoforma p53, Δ40p53, jest izoformą o najwyższej ekspresji w raku piersi i jest znacznie podwyższona w komórkach raka piersi w porównaniu z normalną sąsiednią tkanką6. Następnie stabilnie transdukowaliśmy ludzką linię komórkową raka piersi MCF-7 do nadekspresji Δ40p53 za pomocą wektora LeGO-iG2-puro + (GFP+)7. Komórki te wykorzystano do zbadania, czy wysoka ekspresja Δ40p53 zwiększa tempo proliferacji komórek w komórkach raka piersi.
Istnieje wiele bezpośrednich i pośrednich metod pomiaru proliferacji komórek hodowanych in vitro8,9. Można je wykonywać albo jako pomiary ciągłe w czasie, albo jako testy końcowe10. Nadal przydatne są konwencjonalne metody, takie jak zliczanie komórek za pomocą hemocytometru. Ten test jest tanią i bezpośrednią miarą liczby komórek, ale opiera się na dużej liczbie komórek i wysoko wykwalifikowanym szkoleniu w celu zminimalizowania błędów i dużych odchyleń standardowych od zliczeń. Potrzeba wykonywania pomiarów zgodnych z formatami o wysokiej przepustowości doprowadziła do opracowania testów na płytkach wielodołkowych. Te testy oparte na luminescencji mierzą liczbę komórek na podstawie sygnału luminescencyjnego, który jest proporcjonalny do aktywności metabolicznej komórki11,12. Niedawne wprowadzenie platform obrazowania o wysokiej zawartości umożliwiło opracowanie nowych narzędzi, które monitorują proliferację komórek, zapewniając jednocześnie ilościowe i jakościowe gromadzenie danych fenotypowych i obejmują różne systemy13. Wszystkie te metody zapewniają możliwości pomiaru wzrostu komórek, zarówno za pomocą pomiarów ciągłych, jak i testów końcowych, a każda z nich ma szereg zalet i wad w odniesieniu do czułości, przepustowości liczby próbek i informacji o komórkach, z których wszystkie można odpowiednio zważyć w zależności od pytania badawczego.
Ten protokół opisuje trzy różne metody pomiaru proliferacji komórek in vitro, z których każda wykorzystuje różne zakresy czułości, odtwarzalności i formatów płytek wielodołkowych. Protokół ten miał na celu porównanie wykorzystania komory zliczającej hemocytometru, testu żywotności komórek opartego na luminescencji i obrazowania komórek w pomiarze proliferacji komórek w ciągu 96 godzin. W tym celu porównano wzrost komórek transdukowanych wektorem (MCF-7-LeGO) z komórkami transdukowanymi w celu nadekspresji Δ40p53 (MCF-7-Δ40p53), przy użyciu trzech różnych gęstości komórek. Proliferację komórek mierzono co 24 godziny przez okres do 96 godzin. Stwierdzono, że każda metoda ma swoje zalety i wady, a w zależności od celu eksperymentu, każda z nich jest cenną metodą dostarczania informacji na temat tempa proliferacji.