Tutaj prezentujemy protokół do badania miękkiej materii i systemów biofizycznych w szerokiej mezoskopowej skali długości, od nm do μm, która obejmuje użycie dyfraktometru KWS-2 SANS o wysokiej intensywności i regulowanej rozdzielczości.
Artykuł metodologiczny
Tutaj prezentujemy protokół do badania miękkiej materii i systemów biofizycznych w szerokiej mezoskopowej skali długości, od nm do μm, która obejmuje użycie dyfraktometru KWS-2 SANS o wysokiej intensywności i regulowanej rozdzielczości.
Dyfraktometr KWS-2 SANS jest dedykowany do badania miękkiej materii i systemów biofizycznych w szerokiej skali długości, od nm do μm. Instrument jest zoptymalizowany pod kątem eksploracji szerokiego zakresu przenoszenia pędu Q od 1x10-4 do 0,5 A-1 poprzez połączenie klasycznej metody otworkowej, ogniskowania (z soczewkami) i czasu przelotu (z helikopterem), przy jednoczesnym zapewnieniu wysokiej intensywności neutronów o regulowanej rozdzielczości. Ze względu na możliwość regulacji intensywności i rozdzielczości w szerokich granicach podczas eksperymentu, w połączeniu z możliwością wyposażenia określonych środowisk próbek i urządzeń pomocniczych, KWS-2 wykazuje dużą wszechstronność w zakresie szerokiego zakresu badań strukturalnych i morfologicznych w tej dziedzinie. Struktury równowagi można badać w pomiarach statycznych, podczas gdy procesy dynamiczne i kinetyczne można badać w skalach czasowych od minut do dziesiątek milisekund przy użyciu podejść czasowo-rozdzielczych. Typowe systemy, które są badane za pomocą KWS-2, obejmują zakres od złożonych, hierarchicznych systemów, które wykazują wiele poziomów strukturalnych (np. żele, sieci lub makroagregaty) do małych i słabo rozpraszających systemów (np. Pojedyncze polimery lub białka w roztworze). Niedawna modernizacja systemu detekcji, która umożliwia detekcję szybkości zliczania w zakresie MHz, otwiera nowe możliwości badania nawet bardzo małych morfologii biologicznych w roztworze buforowym ze słabymi sygnałami rozpraszania w pobliżu poziomu rozpraszania buforowego przy wysokim Q.
W tym artykule przedstawiamy protokół do badania próbek o charakterystycznych poziomach wielkości obejmujących szeroką skalę długości i wykazujących uporządkowanie w strukturze mezoskalowej za pomocą KWS-2. Szczegółowo przedstawiamy, jak korzystać z wielu trybów pracy, które oferuje instrument i jaki jest osiągany poziom wydajności.
Materiały miękkie i biologiczne wykazują bogatą różnorodność morfologii, które charakteryzują się takimi cechami jak samoorganizacja i samomontaż jednostek elementarnych w większe, złożone agregaty. Wykazują one również kooperatywne oddziaływania z dużą liczbą stopni swobody; słabe oddziaływania między jednostkami strukturalnymi, a tym samym wysoką wrażliwość na pola zewnętrzne; oraz korelacje czasoprzestrzenne, które mogą obejmować szeroki zakres, od nanometrów do milimetrów i od nanosekund do dni. Ze względu na szeroki zakres istotnych skal długości i czasu, eksperymentalna charakterystyka właściwości tych materiałów jest bardzo wymagająca. Techniki rozpraszania neutronów odgrywają ważną rolę w badaniu struktury, dynamiki i właściwości termodynamicznych takich złożonych układów. Jako unikalne sondy, neutrony oferują korzyść w postaci różnych oddziaływań między izotopami wodoru 1H i 2H (deuterem, D). Duża różnica w gęstości długości rozpraszania koherentnego między wodorem a deuterem stanowi podstawę metod wariacji kontrastu i dopasowania kontrastu. Ponieważ większość materii miękkiej i układów biologicznych składa się z węglowodorów, podstawienie wodoru deuterem (H/D) daje możliwość zmiany gęstości długości rozpraszania koherentnego związku w szerokim zakresie. Dzięki tej technice wybrane składniki w złożonym układzie mogą zostać znakowane poprzez wymianę izotopową. W zależności od kontrastu – kwadratu różnicy między gęstością długości rozpraszania danego składnika a gęstością pozostałych komponentów – wybrane elementy lub obszary w złożonej morfologii materii miękkiej lub biofizycznej mogą stać się widoczne lub niewidoczne w eksperymencie rozpraszania bez chemicznego zmieniania układu. Ponadto neutrony mają wysoką przenikliwość i mogą być stosowane jako sondy nieniszczące oraz do badania próbek w specjalnych środowiskach, w których wkład materiałów dodatkowych umieszczonych w wiązce może być wiarygodnie zmierzony i skorygowany.
Eksperymenty z rozpraszania sprężystego dostarczają informacji o strukturze i morfologii próbki. Natężenie rozproszonego promieniowania mierzone jest w przestrzeni odwrotnej jako funkcja transferu pędu Q, gdzie Q=4π/λ sin Θ/2, przy czym λ to długość fali neutronów, a Θ to kąt rozpraszania; dane te są następnie przekształcane w przestrzeń rzeczywistą za pomocą odwrotnej transformaty Fouriera. Zatem duże wartości Q odnoszą się do krótkich skal długości, w których korelacje międzyatomowe są badane klasyczną dyfrakcją neutronową (ND). Przy małych wartościach Q można badać duże skale długości za pomocą małokątowego rozpraszania neutronów (SANS). Zazwyczaj pojedyncze lub agregujące syntetyczne bądź naturalne makrocząsteczki w roztworze, stopie, filmie lub próbkach objętościowych są charakteryzowane w szerokiej skali długości, od rozmiarów nanometrycznych do mikrometrycznych, poprzez zastosowanie klasycznej techniki SANS z otworkiem (pin-hole) oraz techniki ultra-SANS (opartej na ogniskowaniu lub dyfraktometrii monokryształowej). Jednakże połączenie różnych metod lub urządzeń w celu uzyskania pełnej charakterystyki strukturalnej jest niekiedy trudne ze względu na takie kwestie jak dostępna ilość próbki, stabilność próbek w długich odstępach czasu, powtarzalność efektów w specjalnych warunkach termodynamicznych oraz wspólna analiza danych eksperymentalnych uzyskanych w różnych geometriach doświadczalnych. Ponadto badania dotyczące struktur i szybkich zmian strukturalnych, które charakteryzują się wysoką rozdzielczością przestrzenną lub czasową, są bardzo wymagające i necessitate specjalistycznych układów eksperymentalnych. Dlatego rozwój wysoce wszechstronnych instrumentów SANS, w których granice możliwości mogą być łatwo i praktycznie przesuwane poza typową konfigurację, jest korzystny dla zaspokojenia wszystkich specjalnych wymagań społeczności użytkowników.
Dyfraktometr SANS KWS-2 (Rysunek 1), obsługiwany przez Jülich Centre of Neutron Science (JCNS) w Heinz Maier-Leibnitz Center (MLZ) w Garching, był pierwotnie klasycznym instrumentem SANS z otworkiem (pinhole), korzystającym z wysokiego strumienia neutronów (Rysunek uzupełniający 1) dostarczanego przez źródło neutronów FRM II1 i dedykowany system prowadnic2-4. Po wielokrotnych modernizacjach instrument został zoptymalizowany do badania szerokiego zakresu Q, od 1x10-4 do 0.5 Å-1, zapewniając wysoką intensywność neutronów i regulowaną rozdzielczość. Dzięki dostępności specyficznych środowisk próbkowych i urządzeń pomocniczych (Tabela 1), instrument może zostać wyposażony do badania materii miękkiej i układów biofizycznych w szerokiej skali długości, od nm do µm, poprzez pomiary statyczne; może również prowadzić badania struktur i morfologii w czasie, w stanie równowagi lub podczas transformacji wynikającej z procesów kinetycznych, obejmujące szeroką skalę czasową od minut do dziesiątek milisekund. W konwencjonalnym trybie pracy (Rysunek 2A), zakres Q od 7x10-4 Å-1 do 0.5 Å-1 można pokryć poprzez zmianę odległości próbki od detektora i/lub długości fali. W związku z tym w przestrzeni rzeczywistej (gdzie wymiar jest rozważany jako 2π/Q) można badać poziomy strukturalne i efekty korelacyjne w skali długości od 10 Å do 9,000 Å. Wybór długości fali, w zakresie od 4.5 Å do 20 Å, za pomocą mechanicznego monochromatora (selektora prędkości), który zapewnia rozrzut długości fali Δλ/λ= 20%, zmiana warunków kolimacji (długość kolimacji LC oraz otwory apertur: AC – apertura wlotowa, za ostatnim segmentem prowadnicy neutronowej w wiązce, oraz AS – apertura próbki, bezpośrednio przed próbką) oraz odległości detekcji LD odbywa się automatycznie, za pomocą sterowania komputerowego.
W celu zwiększenia wydajności instrumentu przeprowadzono niedawno znaczące ulepszenia w zakresie intensywności próbki, rozdzielczości instrumentu, minimalnego przekazu pędu Qm oraz szybkiej detekcji przy wysokich liczbach zliczeń w zakresie MHz. W trakcie tego procesu instrument został wyposażony w dodatkowe funkcje.
Zastosowano siekacz dwutarczowy5 ze zmienną szerokością szczelin (Rycina uzupełniająca 2) oraz trybem akwizycji danych czasu przelotu (TOF). Siekacz może pracować z częstotliwością fchopper w zakresie od 10 Hz do 100 Hz oraz przy kątowym otwarciu dwóch okien siekacza w przedziale 0° ≤ Δφ ≤ 90°, co uzyskuje się poprzez zmianę wzajemnego położenia obu tarcz. Poprawę rozdzielczości długości fali Δλ/λ osiąga się poprzez skrócenie czasu otwarcia prowadnicy neutronów τw, co uzyskuje się poprzez zmniejszenie Δφ i/lub zwiększenie fchopper. Powstałe impulsy rejestrowane przez detektor są dzielone na odpowiednią liczbę kanałów czasowych, których szerokość odpowiada τw i które charakteryzują się zamierzoną rozdzielczością Δλ/λ.
Znajdują się tam również elementy skupiające w postaci soczewek parabolicznych z fluorku magnezu MgF26 o średnicy 50 mm (Rysunek 1). 26 soczewek MgF2 pogrupowano w trzy pakiety (4+6+16 soczewek), które mogą być niezależnie przesuwane w wiązce w celu uzyskania warunków ogniskowania dla różnych długości fal λ= 7-20 Å. Aby zwiększyć transmisję poprzez ograniczenie rozpraszania na fononach w materiale soczewek, są one utrzymywane w temperaturze 70 K przy użyciu specjalnego systemu chłodzenia.
Znajduje się tam wtórny detektor scyntylacyjny o wysokiej rozdzielczości, czuły na pozycję, z rozdzielczością pozycji 1 mm i rozmiarem piksela 0,45 mm. Detektor jest zazwyczaj umieszczony w wieży na górze zbiornika próżniowego w stałej odległości LD = 17 m i może być przemieszczany pionowo do wiązki lub poza nią (Rysunek 1). Detektor główny znajduje się w pozycji końcowej zbiornika przy 20 m, natomiast detektor wtórny jest wprowadzany w wiązkę podczas prowadzenia badań o wysokiej rozdzielczości (niskie Q) z użyciem soczewek4,7. Detektor wtórny jest umieszczony w jednej ogniskowej układu soczewek, podczas gdy mała apertura wlotowa przy LC = 20 m znajdowałaby się w tym przypadku w drugiej ogniskowej.
Zastosowano nowy główny system detekcji, który składa się z macierzy 144 lamp wypełnionych 3He (z globalną wydajnością pojedynczej lampy na poziomie 85% dla λ = 5 Å) i definiuje aktywny obszar detekcji o powierzchni 0,9 m2 (Rysunek 1). Innowacyjna elektronika szybkiego odczytu, zamontowana w zamkniętej obudowie z tyłu ramy lamp 3He, poprawia charakterystyki odczytu i redukuje szum tła. Nowy system, który zastąpił stary detektor scyntylacyjny (scyntylator 6Li i macierz 8x8 fotopowielaczy, Rysunek 1), charakteryzuje się efektywną stałą czasu martwego wynoszącą 25 nsec oraz całkowitą szybkością zliczeń sięgającą 5 MHz przy 10% czasie martwym dla profili płaskich. Właściwości te wynikają z faktu, że system zawiera niezależne kanały pracujące równolegle, co stanowi przewagę nad systemami, w których czas martwy występuje po każdym zdarzeniu. Znacznie wyższa szybkość zliczeń skraca czas pomiaru, a tym samym zwiększa liczbę eksperymentów, które można przeprowadzić w tym samym przedziale czasowym.
Dzięki wszystkim tym innowacjom instrument stał się niezwykle wszechstronnym narzędziem, które pozwala na realizację szerokiego zakresu badań strukturalnych poprzez oferowanie wielu trybów pracy (Tabela 2), które można wybierać i wykorzystywać w sposób bezpośredni i przyjazny dla użytkownika. W trybie wysokiej intensywności (Rycina 2B), dzięki zastosowaniu soczewek i zwiększeniu rozmiaru próbki, można osiągnąć do dwunastokrotnie większy wzrost intensywności w porównaniu do konwencjonalnego trybu z otworem (pinhole) przy tej samej rozdzielczości. W trybie rozdzielczości regulowanej z wykorzystaniem choppera i akwizycji danych TOF, lepsza charakterystyka cech rozpraszania w różnych zakresach Q jest możliwa dzięki możliwości zmiany rozdzielczości długości fali Δλ/λ w przedziale od 2% do 20%5. W trybie rozszerzonego zakresu Q (Rycina 2C), przy użyciu soczewek i wtórnego detektora o wysokiej rozdzielczości, można osiągnąć wartość Qm tak niską jak 1 x 10-4 Å-1, co w połączeniu z trybem z otworem pozwala na badanie rozmiarów w ciągłej skali długości od zakresu nm do mikronowego. Wykorzystanie choppera do zawężenia Δλ/λ zapewnia dokładne parametry wiązki poprzez eliminację efektów grawitacyjnych i chromatycznych podczas stosowania soczewek. W trybie czasu rzeczywistego, dzięki wysokiej intensywności i zewnętrznemu wyzwalaniu akwizycji danych przez środowiska próbkowania, zmiany strukturalne mogą być rozdzielane z rozdzielczością czasową sięgającą 50 msec. Poprzez poprawę rozdzielczości długości fali do Δλ/λ= 5% za pomocą choppera, można uzyskać rozdzielczość czasową rzędu 2 msec.
W niniejszej pracy szczegółowo przedstawiamy protokół przeprowadzania typowych eksperymentów na urządzeniu KWS-2 w jego różnych trybach pracy oraz sposób uzyskiwania informacji strukturalnych z badanych próbek na podstawie zebranych danych poprzez redukcję danych. W tej demonstracji wykorzystamy SANS do charakterystyki roztworów standardowych cząstek o różnych rozmiarach oraz jednego wysoce stężonego roztworu micelarnego polimeru, aby pokazać, w jaki sposób rozmiar i uporządkowanie mogą być badane w szerokich zakresach w sposób elastyczny i wydajny za pomocą KWS-2 podczas jednej sesji eksperymentalnej. Sferyczne cząstki polistyrenu o różnych rozmiarach (promienie R = 150, 350, 500, 1 000 i 4 000 Å) i polidyspersyjności rozmiarów σR
8% są rozproszone w roztworze wodnym (mieszaninie 90% D2O i 10% H2O) przy ułamku objętościowym 1%. Micele utworzone przez diblock kopolimery C28H57-PEO5 w D2O przy stężeniu 12% wykazują strukturę uporządkowaną.
1. Załadowanie komórek próbki
8% w roztworze wodnym (mieszanina 90% D2O i 10% H2O) przy ułamku objętościowym 1%.2. Pozycjonowanie uchwytu próbki/środowiska próbki na stole próbkowym
3. Planowanie eksperymentów
4. Przygotowanie oprogramowania pomiarowego, przeprowadzenie i wizualizacja eksperymentu
5. Analiza danych
Reprezentatywne wyniki pomyślnego eksperymentu przeprowadzonego za pomocą KWS-2 w różnych trybach pracy, dotyczącego struktury i morfologii dwóch reprezentatywnych typów układów materii miękkiej, przedstawiono na Rysunkach 8-11. Wyniki te pochodzą z badania serii cząstek polistyrenu o standardowych rozmiarach w roztworach D2O/H2O z zawartością D2O wynoszącą 90% oraz w pełni protonowanego kopolimeru diblokowego C28H57-PEO5 w D2O przy wysokiej frakcji objętościowej polimeru (12%). Cząstki polistyrenu o standardowych rozmiarach o promieniach R = 150, 350, 500 i 1 000 Å zostały wykorzystane do przetestowania konwencjonalnego trybu pinhole przy użyciu różnych kombinacji odległości detekcji LD i długości fal λ. Cząstki o większym rozmiarze (R = 4 000 Å) posłużyły do przetestowania i uruchomienia trybu rozszerzonego zakresu Q. Kopolimer diblokowy, który przy wysokich stężeniach D2O tworzy uporządkowaną strukturę micelarną, został wykorzystany do przetestowania i uruchomienia trybu rozdzielczości regulowanej.
Rysunek 8 przedstawia wyniki dwuwymiarowych wzorów rozpraszania pomierzonych w trybie otworkowym z użyciem detektora głównego (starego detektora scyntylacyjnego) oraz w trybie rozszerzonego zakresu Q z użyciem soczewek skupiających i wysokorozdzielczego detektora pomocniczego. Rysunek 8A przedstawia wzór rozpraszania dla cząsteczek polistyrenu o R = 500 Å pomierzony przy LD = 8 m dla λ=5 Å. Rysunek 8B pokazuje wzór rozpraszania dla cząsteczek polistyrenu o R = 1 000 Å, zebrany przy LD = 20 m dla λ= 20 Å. W przypadku pomiarów przeprowadzonych dla λ = 5 Å wiązka bezpośrednia była przechwytywana przez centralny ogranicznik wiązki zainstalowany przed detektorem, a wiązkę przechodzącą monitorowano za pomocą małego licznika 3He zainstalowanego w środku ogranicznika wiązki. Jest to tzw. Monitor 3 (Rysunek uzupełniający 8). Instrument posiada dwa dodatkowe liczniki 3He, które są zainstalowane przed selektorem prędkości (Monitor 1) w celu monitorowania wiązki polichromatycznej oraz za selektorem prędkości (Monitor 2) w celu monitorowania wiązki monochromatycznej. Ze względu na ograniczenia techniczne pomiary dla λ = 20 Å przeprowadzono z wiązką bezpośrednią padającą na detektor, co było typową konfiguracją stosowaną ze starym detektorem KWS-2. Słabsza intensywność wiązki bezpośredniej przy długich długościach fal, która spada pod wpływem grawitacji, mogła zostać wykryta bez uszkodzenia detektora. Wiązka przechodząca w tym przypadku była monitorowana przez Monitor 3 przy krótkiej odległości detekcji LD = 2 m. W tym przypadku efekty grawitacyjne są słabe i wiązka bezpośrednia pada na ogranicznik wiązki (podobnie jak na Rysunku 8A). Dane zebrane dwuwymiarowo na detektorze dla rozmiaru piksela 5,25 mm x 5,25 mm zostały następnie skorygowane o czułość detektora, a wkłady z pustej celi, tła instrumentu oraz rozpuszczalnika zostały bezwzględnie skalibrowane przy użyciu rozpraszania z wtórnego wzorca z pleksiglasu4. Na koniec wzory rozpraszania, które były rozłożone izotropowo wokół pozycji Q→0, zostały uśrednione radialnie, co pozwoliło wyznaczyć dΣ/dΩ dla każdego systemu cząsteczek polistyrenu.
Dwuwymiarowy obraz rozproszenia cząstek polistyrenu o dużym rozmiarze (R = 4 000 Å) przedstawiono na Rysunek 8C, ponieważ zostało ono zmierzone za pomocą detektora o wysokiej rozdzielczości dla rozmiaru piksela 0,5 mm x 0,5 mm. Mała wiązka bezpośrednia jest ogniskowana przez układ soczewek na płaszczyźnie detekcji i przechwytywana przez mały ogranicznik wiązki (beam-stop) o wymiarach 4 mm x 4 mm, zainstalowany na powierzchni detektora. Cień rzucany przez kwadratowy ogranicznik wiązki można zaobserwować w Rysunek 8C w górnej lewej części aktywnego obszaru detektora. Efekty grawitacyjne powodują szeroki pionowy rozkład neutronów o różnych długościach fal na detektorze. Ponadto, dzięki idealnej ogniskowości soczewek, selektor prędkości dostarcza jedynie neutrony charakteryzujące się centralną długością fali λ rozkładu trójkątnego2,5; neutrony o długościach fal różniących się od centralnej docierają do detektora w stopniu lekkim poza ogniskiem. Te dwa efekty powodują powstawanie słabych śladów wiązki bezpośredniej, które można zaobserwować tuż powyżej i poniżej ogranicznika wiązki (beam-stop). W statycznym rozszerzonym Q-tryb szerokozakresowy z wykorzystaniem soczewek i detektora o wysokiej rozdzielczości, dane są zbierane w sposób ciągły. Aby zminimalizować wpływ efektów grawitacyjnych, dane rozproszone analizuje się w wąskim sektorze kątowym, który rozpoczyna się od blokera wiązki i rozciąga się poziomo w prawo, jak przedstawiono w Rycina 8CDane są następnie przetwarzane z wykorzystaniem typowego podejścia w celu wyznaczenia dΣ/dΩ. Rycina 8D Przedstawiono zależność natężenia od położenia – od przesłony wiązki (beam-stop) w stronę krawędzi detektora – zebraną w wąskim poziomym przekroju o szerokości 1 piksela (0,5 mm) na detektorze o wysokiej rozdzielczości. Dane z roztworu próbki oraz referencyjnego (rozpuszczalnika) przedstawiono w formie zebranej podczas krótkiego pomiaru testowego trwającego 5 min. Spadek natężenia przy najmniejszych wartościach położenia wynika z obecności przesłony wiązki. Na podstawie stosunku natężeń przy najmniejszych położeniach oszacowano transmitancję próbki (87%).
Skorygowane i skalibrowane wyniki uzyskane dla dΣ/dΩ dla roztworu cząsteczek polistyrenu o R = 500 Å przedstawiono na Rysunku 9, wraz z wynikami dla rozpuszczalnika. Wyniki te obrazują zakres Q, jaki można pokryć za pomocą KWS-2 w konwencjonalnym trybie pinhole poprzez zmianę pozycji detekcji LD oraz zastosowanie jednej lub więcej długości fal. Ujawniono również cechy czynnika kształtu8,9 cząsteczek sferycznych: obszar Guiniera przy niskich wartościach Q oraz oscylacje wynikające z funkcji Bessela dla sfer w średnim zakresie Q. W wysokim zakresie Q profil rozpraszania jest zdominowany przez rozpraszanie z rozpuszczalnika, w związku z czym wykazuje on płaski przebieg, podobny do przebiegu dla samego rozpuszczalnika. Minima czynnika kształtu są uwarunkowane z jednej strony przez rozdzielczość instrumentu5, a z drugiej przez polidyspersyjność wielkości cząsteczek. Rozdzielczość instrumentu w przypadku KWS-2 jest w głównej mierze określona przez rozrzut długości fal Δλ/λ= 20%. Polidyspersyjność wielkości dla wszystkich typów cząsteczek wynosiła około σR = 8%. Rysunek 10 przedstawia wyniki uzyskane w badaniu SANS dla wszystkich typów cząsteczek polistyrenu, wyrażone jako dΣ/dΩ po zastosowaniu korekty o wkład rozpuszczalnika. Obszary Guiniera są wyraźnie widoczne dla wszystkich cząsteczek przy niskich wartościach Q , natomiast w wysokich zakresach Q ujawnia się nachylenie -4, co jest typowe dla czynnika kształtu obiektów sferycznych. Parametry strukturalne cząsteczek o standardowej wielkości zostały potwierdzone poprzez dopasowanie danych do czynnika kształtu sfer polidyspersyjnych8,9 splotowanego z funkcją rozdzielczości instrumentu10-12.
Rysunek 11 przedstawia dwuwymiarowe i radialnie uśrednione jednowymiarowe wzory rozpraszania dla struktury uporządkowania miceli polimerowych C28H57-PEO5 w D2O przy ułamku objętości polimeru wynoszącym 12%. Wyniki zebrano dla różnych odległości detekcji LD, łącząc w jednej sesji pomiarowej konwencjonalny tryb otworkowy (pinhole) oraz tryb rozdzielczości regulowanej. Podczas badania układu w konwencjonalnym trybie otworkowym, przy rozsypie długości fal Δλ/λ= 20% zapewnionym przez selektor prędkości oraz ciągłym (statycznym) zbieraniu danych, we wzorach rozpraszania dla LD = 4 m obserwuje się trzy szerokie piki. W trybie rozdzielczości regulowanej, dzięki zastosowaniu choppera i akwizycji danych TOF w połączeniu z selektorem prędkości, możliwe jest poprawienie rozsypu długości fal w celu zweryfikowania, czy te cechy są rzeczywiste, czy też w rezultacie pojawi się ich struktura drobna. Pierwszy i drugi pik obserwowane przy Δλ/λ= 20% wykazują rozszczepienie podczas pomiaru z Δλ/λ= 5%, co umożliwiło jednoznaczną identyfikację uporządkowania miceli w kryształy regularne ściennie centrowane (fcc)5,13.
Są to dwa typowe przykłady pokazujące, w jaki sposób wszechstronność i wydajność dyfraktometru KWS-2 SANS może być wykorzystana w prosty i intuicyjny sposób, zgodnie z dostarczonym protokołem, do prowadzenia szczegółowych badań nad materią miękką i układami biofizycznymi wykazującymi złożone cechy strukturalne pod względem skali długości i uporządkowania.

Rycina 1: Układ instrumentu SANS KWS-2, uwzględniający wszystkie modernizacje przeprowadzone między 2010 a 2015 rokiem. (A) Widok ogólny instrumentu. (B) Wtórny detektor wysokiej rozdzielczości i jego wieża na górze zbiornika próżniowego. (C) Soczewki skupiające MgF2, zgrupowane w trzy pakiety, oraz ich układ chłodzenia (głowica chłodząca). (D) Stary detektor główny (scyntylacyjny) z macierzą 8 x 8 fotopowielaczy. (E) Nowy detektor główny (lampy 3He) o większej powierzchni detekcji. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 2: Schematyczny widok trzech trybów pracy oferowanych na KWS-2. (A) Konwencjonalny tryb otworkowy (pinhole). Dla LC = LD, gdzie LC i LD oznaczają odpowiednio długość kolimacji i detekcji, oraz optymalnego warunku otworu AC =2AS, gdzie AC i AS oznaczają odpowiednio wlotową aperturę kolimacyjną i aperturę próbki, profil wiązki I'P na detektorze jest w przybliżeniu trójkątny z szerokością podstawy równą 2AC. (B) Tryb ogniskowania o wysokiej intensywności. Dzięki zastosowaniu soczewek można mierzyć większe próbki z taką samą rozdzielczością jak w konwencjonalnym trybie otworkowym (w tym przypadku profil wiązki I'P na detektorze jest prostokątny). (C) Tryb ogniskowania o rozszerzonym zakresie Q. Dzięki zastosowaniu soczewek i małej apertury wlotowej AC (zazwyczaj 4 mm x 4 mm), która jest umieszczona w jednym punkcie ogniskowym układu soczewek, na detektor, umieszczony w drugim punkcie ogniskowym soczewek, przekazywana jest wąska wiązka. W związku z tym można osiągnąć niższą wartość minimalnego przeniesienia wektora falowego Qm niż w konwencjonalnym trybie otworkowym. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Widok próbek zamontowanych w aluminiowym wkładzie uchwytu próbek do pomiarów w temperaturze otoczenia. W zagłębieniach wkładu Al można umieścić (A) kuwetowe kwarcowe (B) wypełnione próbkami i zamknięte korkami (C). Pozycje w wkładzie Al zostały zajęte przez próbki w następujący sposób: w pozycjach od nr 1 do nr 5 znajdują się cząstki polistyrenu o rozmiarach R = 150, 350, 500, 1,000 i 4,000 Å w rozpuszczalniku D2O/H2O; w pozycji nr 6 diblokowy kopolimer C28H57-PEO5 w D2O; w pozycjach nr 7 i nr 8 rozpuszczalniki D2O/H2O oraz D2O; w pozycji nr 9 pusta kuweta kwarcowa (referencyjna); w pozycji nr 10 Pleksiglas (standard); w pozycji nr 11 nic (do pomiaru pustej wiązki); w pozycji nr 12 płytka B4C (przyklejona taśmą od tyłu; do pomiaru tła instrumentu przy zablokowanej wiązce). Aluminiowa płyta pokrywy (D), pokryta maską z Cd na zewnętrznej powierzchni, jest przymocowana do góry wkładu za pomocą śrub (E) w celu zabezpieczenia kuwet z próbkami i zdefiniowania okna neutronowego (F). Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Widok jednego z wielopoziomowych i wielopozycyjnych uchwytów do komórek stosowanych w KWS-2 do pomiarów w warunkach otoczenia. Próbki dla bieżącej sesji eksperymentalnej zostały zainstalowane na poziomie środkowym. Trzy poziomy mogą być wyposażone w wkłady (A) zaprojektowane dla różnych geometrii komórek, które są zamykane pokrywami z Al powlekanymi maskami z Cd na zewnętrznej powierzchni (skierowanej w stronę neutronów). Montaż wkładów w uchwycie odbywa się za pomocą śrub (B). Uchwyt posiada podstawę wsporczą (C), która umożliwia jego instalację w określonej pozycji na stole z próbką. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 5: Schematyczny widok z góry obszaru próbki urządzenia KWS-2. (A) Przedstawienie dwóch skrajnych konfiguracji nosa kolimatora, pokazujące dostępną przestrzeń do instalacji różnych środowisk próbek w wiązce (neutrony nadlatują z dołu, co wskazują żółte strzałki). (B) Panel sterowania drzwi ołowianych z klawiszami otwierania i zamykania (odpowiednio 1 i 2). Silnik drzwi pracuje tylko tak długo, jak klawisze są stale wciśnięte. Krawędzie drzwi wyposażone są w czujniki, które powodują wyłączenie silnika po wykryciu przeszkody. Po usunięciu przeszkody blokadę silnika można znieść górnym klawiszem (3), a następnie wznowić proces otwierania lub zamykania. (C) Panel sterowania nosem kolimatora. Z panelu nosa można wybrać odpowiednią konfigurację za pomocą klawisza (4). Nos jest przemieszczany poprzez ciągłe naciśnięcie klawisza (5) aż do osiągnięcia wybranej pozycji i automatycznego zatrzymania ruchu. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 6: Instalacja wielopoziomowego i wielopozycyjnego uchwytu próbek na stole pomiarowym do pomiarów SANS w temperaturze otoczenia (Źródło zdjęcia: Wenzel Schürmann, Technische Universität München, Niemcy). Główne komponenty w pozycji próbki to nos kolimacyjny z aperturą próbki na jego końcu (A), stół pomiarowy zapewniający poziome i pionowe pozycjonowanie próbek w wiązce (B), okno wlotowe próżniowej komory detektora (C), ołowiane drzwi z czujnikami na krawędzi (D) oraz podstawa uchwytu celi (E), która umożliwia montaż uchwytu na stole optycznym (F) stołu pomiarowego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 7: Zakres dynamiczny dla różnych konfiguracji aparatury na KWS-2. I0 oznacza strumień neutronów w pozycji próbki. Wyznaczone obszary wskazują dostępny zakres Q, który można pokryć przy zmianie długości fali w przedziale od 4,5 Å do 20 Å dla konkretnych konfiguracji kolimacji i detekcji. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 8: Przykłady dwuwymiarowych wzorów rozpraszania zebranych podczas sesji eksperymentalnej zgodnie z aktualnym protokołem. (A) Wzór rozpraszania zebrany przy LD = 8 m dla cząstek polistyrenu o promieniu R = 500 Å w D2O/H2O, pomiar przeprowadzony dla λ= 5 Å. Wzór rozpraszania jest rozłożony izotropowo wokół przysłony wiązki (beam-stop), która blokuje wiązkę bezpośrednią w centrum detektora. (B) Wzór rozpraszania zebrany przy LD = 20 m dla cząstek polistyrenu o promieniu R = 1 000 Å w D2O/H2O, pomiar przeprowadzony dla λ= 20 Å. Wzór rozpraszania jest rozłożony izotropowo wokół pozycji wiązki przechodzącej, która dla tej długości fali znajduje się pod przysłoną wiązki i jest maskowana wraz z nią za pomocą funkcji oprogramowania do wizualizacji. (C) Wzór rozpraszania zebrany za pomocą detektora wysokiej rozdzielczości przy LD = 17 m dla cząstek polistyrenu o rozmiarze R = 4 000 Å w D2O/H2O, pomiar przeprowadzony dla λ= 7 Å w rozszerzonym zakresie Q, z użyciem soczewek i detektora wysokiej rozdzielczości. Wzór rozpraszania jest rozłożony izotropowo wokół małej przysłony wiązki (4 mm x 4 mm), która blokuje skupioną wiązkę bezpośrednią. Sektor kątowy, w którym dane są dalej analizowane, zaznaczono po prawej stronie przysłony wiązki. (D) Intensywność w funkcji odległości od przysłony wiązki, zebrana podczas krótkiego pomiaru testowego w wąskim poziomym pasie o szerokości 1 piksela (0,5 mm) na detektorze wysokiej rozdzielczości. Przedstawiono dane dla roztworu próbki oraz referencji (rozpuszczalnika). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 9: Wzory rozpraszania dla cząsteczek polistyrenu w roztworze D2O/H2O (symbole) oraz dla rozpuszczalnika (linie). Dane zostały zebrane w konwencjonalnym trybie otworkowym (pinhole) przy różnych konfiguracjach instrumentu, które są oznaczone różnymi kolorami. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 10: Wzory rozpraszania z cząsteczek polistyrenu o różnych rozmiarach w D2O/H2O po zastosowaniu korekcji na rozpraszanie przez rozpuszczalnik. Linie czerwone przedstawiają dopasowania z zastosowaniem sferycznego czynnika kształtu9, uwzględniające rozdzielczość urządzenia10, 11 oraz polidyspersyjność rozmiaru. Typowe asymptotyczne zachowanie Q-4 dla sferycznego czynnika kształtu jest wskazane przez linię prostą w zakresie wysokich Q. Dolna granica zakresu Q objęta różnymi długościami fal lub układami jest specjalnie zaznaczona. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rycina 11: Dwuwymiarowe oraz jednowymiarowe uśrednione radialnie obrazy rozpraszania micel polimerowych C28H57-PEO5k w D2O (przy ułamku objętości polimeru wynoszącym 12%), pomierzone w konwencjonalnym trybie pinhole z Δλ/λ= 20% (góra) oraz w trybie z regulowaną rozdzielczością, z Δλ/λ= 5% przy LD = 4m (lewa strona) i LD = 8m (prawa strona). W trybie konwencjonalnym można zaobserwować trzy szerokie piki. Dzięki poprawionej rozdzielczości Δλ/λ ujawniona zostaje struktura subtelna dwóch pierwszych pików5, 13. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rysunek 12: Wzór rozpraszania w pełni protonowanych miceli diblokowego kopolimeru PHO10k-PEO10k w D2O2O (po zastosowaniu korekcji na rozproszenie od rozpuszczalnika), zmierzone poprzez połączenie konwencjonalnego otworu (pinhole) i rozszerzonego Qtryby zakresów. Morfologia cylindryczna typu rdzeń-otoczka jest wskazana przez Q-1 zależność natężenia rozproszonego przy wartościach pośrednich Q oraz Q-5/3 zależność (rozproszenie plam) obserwowana przy wysokich QPlateau intensywności przy niskich Q or zgięcie w stopniu pośrednim Q ujawniają odpowiednio długość i grubość cylindrów. Czerwona krzywa przedstawia dopasowanie danych eksperymentalnych do modelu cylindra typu rdzeń-powłoka9z uwzględnieniem rozdzielczości aparatury10-12. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 13: Wzory rozproszenia cząsteczek polistyrenu (R = 150 Å) w D2O/H2O, zmierzone w konwencjonalnym trybie z otworkiem (pinhole) oraz w trybie wysokiej intensywności (z soczewkami). (A) Jednowymiarowe wzory rozproszenia zmierzone przy λ = 7 Å dla LD = 8 m w trybie konwencjonalnym oraz dla LD = 20 m w trybie wysokiej intensywności z soczewkami. W trybie wysokiej intensywności zastosowano różne rozmiary wiązki na próbce w celu zwiększenia intensywności. Przy zastosowaniu 26 soczewek uzyskano do 12-krotny wzrost intensywności w porównaniu z konwencjonalnym trybem z otworkiem. Duża próbka została umieszczona w wiązce przy użyciu okrągłej kuwarcowej celi o średnicy 5 cm. (B) Dwuwymiarowy wzór rozproszenia zarejestrowany na detektorze w trybie z otworkiem dla rozmiaru wiązki 10 mm x 10 mm. (C) Dwuwymiarowy wzór rozproszenia zarejestrowany na detektorze w trybie wysokiej intensywności przy użyciu 27 soczewek i rozmiaru wiązki 30 mm x 30 mm. Rozmiar (rozdzielczość) wiązki bezpośredniej skupionej na detektorze jest taki sam jak w trybie z otworkiem. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 14: Obraz rozpraszania z roztworu buforowego oraz z monomerów białka beta-amyloidu (Aβ 1-42, masa cząsteczkowa MW = 4,5 kDa) w buforze z deuterowanego heksafluoroisopropanolu dHFIP o stężeniu 5,6 mg/ml po trzech tygodniach inkubacji. Pełne kropki reprezentują krzywą rozpraszania z roztworu białka, natomiast pełne trójkąty przedstawiają krzywą rozpraszania z roztworu buforowego. Niebieskie kropki oznaczają przekrój czynny na rozpraszanie (na prawej skali pionowej) dla monomerów po zastosowaniu korekty o wkład buforu. Słupki błędów reprezentują odchylenia standardowe wyznaczone z liczby zliczeń neutronów. Czerwona linia ciągła przedstawia dopasowaną funkcję Beaucage'a z ustaloną wymiarowością d=214. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 15: Wzory rozproszeniowe dla lizozymu 50 mg/ml w 50 mM buforze octanowym w D2O oraz dla roztworu buforowego, mierzone przy różnych ciśnieniach, od ciśnienia otoczenia do 5 000 bar. Symbole reprezentują dane z roztworu białka, natomiast linie przedstawiają dane z buforu. Dane zbierano dla dwóch odległości detekcji, LD = 4 m (symbole puste) oraz LD = 1 m (symbole pełne). Wstawka pokazuje zależność intensywności rozproszenia w przód I(Q→0) dla roztworu białka, buforu oraz samego białka (po zastosowaniu korekcji o wkład buforu) od ciśnienia. Aby wyświetlić większą wersję tego rysunku, kliknij tutaj.
| Parametr / Funkcja | Wyposażenie pomocnicze | Zakres zastosowania | Dokładność | Szczegóły techniczne |
| Pozycjonowanie | Stół próbkowy | maks. obciążenie 600 kg | ||
| X | 0 - 360 mm | 0.05 mm | ||
| Y | 0 - 330 mm | 0.05 mm | ||
| Z (oś wiązki) | ręcznie, 600 mm | |||
| θr (rotacja) | 0° - 360° | 0.002° | ||
| θt (kołyska) | ± 30° | 0.002° | ||
| Temperatura otoczenia | trzystopniowy wielopozycyjny uchwyt Al (maski Cd) | 3x9=27 szerokich kuwet kwarcowych | ||
| 3x12=36 wąskich kuwet kwarcowych | ||||
| trzy pozycje | 3 duże kuwety kwarcowe (średnica Φ = 5 cm) | |||
| uchwyt Al (maska B4C) | ||||
| Temperatura | termostat (łaźnia olejowa) + | od -25 °C do 200 °C | ± 0.5 °C | 4 pozycje |
| mały blok miedziany | w powietrzu lub w komorze próżniowej (z uszczelnionymi kuwetami) | |||
| termostat (łaźnia wodna) + dwustopniowy wielopozycyjny | od 5 °C do 85 °C | ± 0.2 °C | 2x9=18 szerokich kuwet kwarcowych; 2x12=24 wąskie kuwety kwarcowe | |
| blok Al | ||||
| termostat + piec wysokoprecyzyjny | od 10 °C do 120 °C | < 0.1 °C | 1 pozycja, szeroka kuweta kwarcowa | |
| uchwyt kuwet z termostatem Peltiera | od -20 °C do 140 °C | ± 0.2 °C | 8 pozycji (wszystkie typy kuwet kwarcowych lub kuwety typu sandwich z mosiądzu); kontrolowana atmosfera poniżej 5 °C | |
| (maska B4C) | ||||
| Ciśnienie | komórka wysokociśnieniowa SANS + termostat (łaźnia wodna) | do 5,000 bar | Temperatura w zakresie od 5 °C do 85 °C | |
| Niska temperatura | Kriostat z szafirowymi oknami | do 50 K | ||
| Reometria | Reometr; tryby stanu stacjonarnego i oscylacyjny | |||
| Wilgotność | Komórka wilgotności | od 5% do 95% | Temperatura w zakresie od 15 °C do 60 °C | |
| In-situ FT-IR20 | Spektrometr FT-IR | Komórki próbkowe z oknami ZnSe |
Tabela 1: Lista urządzeń pomocniczych dostępnych dla dyfraktometru KWS-2 SANS, zawierająca zakres stosowania, dokładność oraz szczegóły każdego urządzenia.
| Tryb pomiaru | Układ eksperymentalny | Rozdzielczość | wielkość wiązki/próbki | maks. intensywność [n/s] | zakres Q [Å-1] |
| Δλ/λ | |||||
| Konwencjonalna przysłona otworkowa | λ = 7 Å | 20% | 10 x 10 mm2 | 1.3 x 108 | 0.002 .. 0.3 |
| LC = 2 m - 20 m | |||||
| LD = 1 m - 20 m | |||||
| λ = 4.5 Å, LC = 2 m, LD = 1 m | 20% | 10 x 10 mm2 | 2 x 108 | 0.01 .. 0.5 | |
| λ = 10 Å, LC = 20 m, LD = 20 m | 20% | 10 x 10 mm2 | 7.5 x 105 | 0.001 .. 0.02 | |
| λ = 20 Å, LC = 20 m, LD = 20 m | 20% | 10 x 10 mm2 | 4 x 104 | 7x10-4 .. 1.5x10-2 | |
| Ogniskowanie wysokiej intensywności | λ = 7 Å, LC = 20 m, LD = 17 m | 20% | Φ = 50 mm | 3 x 107 | ≈ 0.002 .. 0.03 |
| Ogniskowanie wysokiej rozdzielczości (rozszerzony zakres Q) | λ = 7 Å, LC = 20 m, LD = 17 m, AC = 4 x 4 mm2 | 20% | 10 x 10 mm2 | 1.6 x 104 | ≈ 2x10-4 .. 0.02 |
| Regulowana rozdzielczość | λ = 4.5 Å, | 5% | 10 x 10 mm2 | ok. 7% względem trybu konwencjonalnego | 0.002 .. 0.5 |
| LC = 20 m, | |||||
| LD = 1 m .. 20 m |
Tabela 2: Konfiguracje eksperymentalne dostępne na dyfraktometrze SANS KWS-2.
Rysunek uzupełniający 1: Bezwzględny strumień neutronów w pozycji próbki instrumentu KWS-2 jako funkcja długości fali λ dla różnych długości kolimacji LC oraz optymalnego wypełnienia zimnego źródła reaktora. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten rysunek.
Rycina uzupełniająca 2: Schematyczny widok siekacza dwutarczowego ze zmiennym otworem szczeliny. Szerokość szczeliny Δφ może być regulowana w zakresie od 0° do 90°, dzięki czemu, w zależności od częstotliwości siekacza fchopper, można zmieniać czas otwarcia τw prowadnicy (czerwony prostokąt na prawym pionowym szeregu obrazów). Kliknij tutaj, aby pobrać tę figurę.
Rysunek uzupełniający 3: Główny interfejs użytkownika oprogramowania do sterowania pomiarami i wizualizacji systemu KWS-2. Funkcje po lewej stronie (A) mogą być używane przez osoby przeprowadzające eksperyment, natomiast funkcje i wskaźniki po prawej stronie (B) służą osobie odpowiedzialnej za instrument. Serwer lub proces wyświetlany w menu po prawej stronie jest aktywny i działa prawidłowo, gdy jest zaznaczony na zielono. Komponenty zaznaczone na żółto nie są aktywne. Wszelkie nieprawidłowości są sygnalizowane kolorem czerwonym. Kliknij tutaj, aby pobrać ten rysunek.
Rycina uzupełniająca 4: Widok menu konfiguracji kws2 oraz funkcji konfiguracji próbek. Użytkownicy muszą najpierw wprowadzić informacje w polach UserData, a następnie przeprowadzić konfigurację próbek. Pola, które należy wypełnić, oraz działania, które należy podjąć, są zaznaczone na czerwono. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać tę rycinię.
Rysunek uzupełniający 5: Widok menu Definicji kws2 oraz funkcji Wyboru Próbki. Działania, które musi podjąć użytkownik, opisano w kroku 4.3. Kliknij tutaj, aby pobrać ten rysunek.
Rysunek uzupełniający 6: Widok menu Definition w programie kws2 oraz funkcji Definition of Measurements. Działania, które musi podjąć użytkownik, są opisane w kroku 4.3. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten rysunek.
Rycina uzupełniająca 7: Program pomiarowy wygenerowany poprzez połączenie zdefiniowanych próbek i określonych warunków eksperymentalnych. Czynności, które musi wykonać użytkownik, opisano w kroku 4.3. Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinę.
Rycina uzupełniająca 8: Menu sterowania pomiarem kws2 oraz opcja Bieżące wartości (Current Values). Wyświetlone są parametry stałe (pozycje, nazwy, długość fali itp.) oraz zmienne (czas, natężenia, szybkość zliczania itp.) charakteryzujące przeprowadzany pomiar. Czynności, które musi wykonać użytkownik, opisano w kroku 4.4. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać tę rycinię.
Rycina dodatkowa 9: Opcja Live-Display z menu KWSlive_MainWindow i różnymi opcjami wizualizacji danych. Wybrany został tryb wizualizacji Surface. Po wybraniu trybu Radial average (obraz po prawej stronie), ustawienia parametrów znajdują się w menu Options Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinę.
Rysunek uzupełniający 10: Główny interfejs oprogramowania do redukcji danych qtiKWS z opcjami wyboru instrumentu oraz lokalizacji danych eksperymentalnych i przetworzonych. Kliknij tutaj, aby pobrać ten rysunek.
Rycina uzupełniająca 11: Funkcje definiowania dziennika dla zestawu danych do przetworzenia (tabela informacji). Działania, które musi podjąć użytkownik, opisano w kroku 5.3. Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinę.
Rycina uzupełniająca 12: Funkcje służące do definiowania maski detektora, dla której dane zostaną przetworzone. Czynności, które musi wykonać użytkownik, opisano w kroku 5.4. Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinię.
Rycina uzupełniająca 13: Funkcje służące do definiowania map czułości detektora. Czynności, które musi podjąć użytkownik, opisano w kroku 5.5. Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinę.
Rycina uzupełniająca 14: Funkcje służące do generowania tabeli skryptów dla korekcji, kalibracji i uśredniania radialnego danych. Działania, które musi podjąć użytkownik, opisano w kroku 5.6. Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinę.
Rycina uzupełniająca 15: Funkcje służące do wykreślania przetworzonych danych. Czynności, które musi wykonać użytkownik, opisano w kroku 5.6.5. Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinę.
Rycina uzupełniająca 16: Funkcje przygotowania i podziału danych pomierzonych w trybie rozdzielczości regulowanej. Dane z dwóch impulsów dostarczonych przez przerywacz i zebrane początkowo w 64 kanałach TOF są scalane w jeden impuls. Kilka kanałów jest grupowanych w taki sposób, aby wynikowe kanały czasowe charakteryzujące się Δλ/λaimed mogły zostać zapisane jako oddzielne pliki. Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinę.
Rysunek uzupełniający 17: Główny interfejs oprogramowania do redukcji danych qtiKWS z wybraną opcją przetwarzania danych pomiarowych uzyskanych za pomocą detektora o wysokiej rozdzielczości. Kliknij tutaj, aby pobrać ten rysunek.
Rycina uzupełniająca 18: Funkcje służące do definiowania masek detektora o wysokiej rozdzielczości, dla których przetwarzane będą dane. Działania, które musi podjąć użytkownik, opisano w kroku 5.8. Kliknij tutaj, aby pobrać tę rycinę.
Rycina uzupełniająca 19: Przegląd wszystkich typów ogniw z próbkami zazwyczaj stosowanych w KWS-2 do badania materii miękkiej i próbek biologicznych w temperaturze otoczenia lub temperaturze zmiennej. (A) Widok dużych ogniw kwarcowych dostępnych dla trybu wysokiej intensywności z soczewkami i dużym rozmiarem wiązki. Uchwyt ogniwa, wyposażony w maski z borowanego tworzywa sztucznego (1), umożliwia zaplanowanie i przeprowadzenie trzech pomiarów w jednej sesji. (B) Widok ogniw kwarcowych lub mosiężnych, które służą jako pojemniki na próbki, oraz uchwytu z kontrolą temperatury (typu Peltiera) wyposażonego w kasety 8-pozycyjne odpowiednie dla każdego typu ogniwa. Uchwyt jest osłonięty maskami z borowanego tworzywa sztucznego (1) z obu stron. (C) Widok ogniwa ciśnieniowego podczas pracy w KWS-2. Ogniwo może wywierać nacisk na próbkę od ciśnienia otoczenia do 5 000 bar w trybie automatycznym, sterowanym przez program pomiarowy. Okrągła maska z Cd (1) z małą aperturą w środku określa rozmiar wiązki na próbce. Kliknij tutaj, aby pobrać tę figurę.
Materia miękka i systemy biofizyczne charakteryzują się zazwyczaj korelacjami strukturalnymi oraz powiązanymi poziomami mikrostrukturalnymi i morfologicznymi, które obejmują szeroką skalę długości, od nm do mikronów. Aby zrozumieć mechanizm formowania się i ewolucji morfologii takich systemów oraz związek między ich cechami mikroskopowymi a właściwościami makroskopowymi, ważne jest zbadanie ich mikrostruktury w całej skali długości i w odpowiednich warunkach środowiskowych (np. temperatura, ciśnienie, pH, wilgotność itp.). W takich badaniach zazwyczaj wykorzystuje się techniki rozpraszania w małych kątach za pomocą neutronów (SANS) lub synchrotronowskiego promieniowania rentgenowskiego (SAXS). Niższa intensywność neutronów w porównaniu z synchrotronowym promieniowaniem rentgenowskim jest kompensowana przez zastosowanie stosunkowo dużego Δλ/λ, co jednak prowadzi do pogorszenia rozdzielczości instrumentalnej. Niemniej jednak SANS oferuje unikalne zalety dzięki możliwościom zapewnianym przez wariację kontrastu, szczególnie między izotopami wodoru. Dlatego SANS jest metodą eksperymentalną stosowaną specjalnie w badaniu materii miękkiej i systemów biofizycznych, dla których dostarcza ona unikalnych informacji strukturalnych i morfologicznych. Większość dyfraktometrów SANS na świecie21 działa w oparciu o zasadę otworkową (Rycina 2A), która umożliwia pożądaną rozdzielczość dla niskich wartości Q. Praktycznie wszystkie dyfraktometry SANS o wysokim strumieniu mają podobny maksymalny strumień rzędu 1 x 108 n cm-2 sec-1. Dzięki złagodzonej rozdzielczości długości fali, KWS-2 posiada niemal dwukrotnie większy strumień2, 4. Niedawno uruchomiono bardzo specjalistyczne dyfraktometry SANS, które służą zoptymalizowanymi charakterystykami dla konkretnego zakresu zastosowań, na przykład do badań przy bardzo małych wektorach rozpraszania22, 23. Wraz z niedawnym oddaniem do użytku specjalistycznych dyfraktometrów TOF-SANS w reaktorach stanu stacjonarnego24 lub źródłach spallacyjnych 25, 26, oferowany jest znacznie zwiększony dynamiczny zakres Q w danej konfiguracji eksperymentalnej oraz większa elastyczność i optymalizacja w kwestii wyboru rozdzielczości eksperymentalnej. W przypadku dyfraktometru SANS KWS-2, na klasycznym instrumentie SANS możliwe jest uzyskanie wysokiego poziomu wszechstronności i wydajności wymaganej do bardzo specyficznych badań strukturalnych w dziedzinie materii miękkiej i biofizyki. Optymalizacja, elastyczność i spontaniczność w projektowaniu i prowadzeniu złożonych badań, wspierana przez opisany protokół, jest osiągana dzięki połączeniu zoptymalizowanych parametrów eksperymentalnych (np. intensywności, skali długości, rozdzielczości przestrzennej i rozdzielczości czasowej) oraz złożonych środowisk próbek. Wykorzystując wiele trybów pracy wymienionych we Wstępie i wspierając się wynikami przedstawionymi na Ryciniach 8-15, KWS-2 w łatwy i praktyczny sposób zwiększa wydajność klasycznego dyfraktometru SANS w stacjonarnym źródle neutronów (reaktorze) poza konwencjonalne granice takich instrumentów.
Niniejszy protokół przedstawia kroki, które zwykły użytkownik musi wykonać, aby zdefiniować i przeprowadzić prosty program eksperymentalny obejmujący wyłącznie badanie próbek w otoczeniu termodynamicznym (temperatura, ciśnienie, wilgotność względna) oraz w warunkach statycznych (brak kinetyki tworzenia lub transformacji struktury, brak ścinania lub przepływu). Dostępnych jest kilka uchwytów z kontrolą temperatury lub specjalnych środowisk dla próbek (Tabela 1 i Rycina uzupełniająca 19), takich jak celi ciśnieniowe, reometry lub cele wilgotnościowe, które mogą zostać optymalnie zainstalowane i dostrojone przy specjalnej pomocy zespołu instrumentu. Niniejszy protokół nie zawiera instrukcji dotyczących ustawień i sterowania takim sprzętem. Definiowanie i aktywacja zewnętrznych kontrolerów wymagają zastosowania innego, bardziej złożonego protokołu. Protokół ten przedstawia przypadek pracy z kwarcowymi celami do próbek o wąskim prostokątnym kształcie (Rycina 3). Jednakże użytkownikom oferowany jest szeroki zakres geometrii i typów cel (Rycina uzupełniająca 19>, aby zapewnić większą elastyczność i wydajność w prowadzeniu eksperymentów. W przypadku korzystania z takich cel można postępować zgodnie z niniejszym protokołem, korygując parametry omówione w kroku 4.2.2. Oprogramowanie sterujące pomiarami zostało opracowane w celu zapewnienia użytkownikom większej elastyczności w realizacji celów naukowych oraz optymalizacji technicznej obsługi instrumentu. Wszystkie regulacje i konfiguracje specjalnych funkcji oraz komponentów instrumentu są wykonywane przez zespół instrumentu. Zaangażowanie użytkowników naukowych w konfigurację, definiowanie i wykorzystanie instrumentu jest uproszczone i ograniczone wyłącznie do tych aspektów, które wiążą się z kwestiami naukowymi sesji eksperymentalnej. Pliki konfiguracyjne są zdefiniowane wcześniej, aby objąć wszystkie specjalne kwestie eksperymentalne, takie jak pozycjonowanie specjalnych uchwytów w wiązce, pozycjonowanie próbki w wiązce (współrzędne x, y, Φ i ω na stole próbek, stole obrotowym lub kolebce na Rycini uzupełniającej 5), dostrojenie pozycji detektora i beam-stopu dla różnych długości fal, dostrojenie parametrów choppera (częstotliwość i okno otwarcia) dla różnych długości fal, odległości detekcji i zakładana rozdzielczość, itp. Ponadto obecny protokół nie opisuje sposobu wykorzystania trybu czasu rzeczywistego na KWS-2. Przeprowadzenie eksperymentów SANS z rozdzielczością czasową również wymaga zastosowania bardziej złożonego protokołu.
Ponadto protokół ten przedstawia sposób korygowania zmierzonych danych o różne wkłady rozproszenia pochodzące z instrumentu oraz wzorców, a także ich kalibrację w celu uzyskania różnicowego przekroju czynnego na rozproszenie próbki, dΣ/dΩ, wyrażonego w cm-1. Wielkość ta zawiera pełne informacje strukturalne i morfologiczne o próbce i jest mierzona w szerokim zakresie Q, odpowiadającym szerokiej skali długości, w której pojawiają się korelacje strukturalne i powiązane poziomy wielkości charakterystyczne dla badanego układu. Zatem przekrój czynny na rozproszenie dΣ/dΩ wiąże intensywność zmierzoną w statycznym eksperymencie rozproszeniowym pod kątem Θ, Is=f(Θ) z właściwościami strukturalnymi próbki.
Aby ocenić dΣ/dΩ dla badanego układu, poza pomiarem samego układu, konieczne są dodatkowe pomiary w celu skorygowania danych o wszelkie rozpraszanie zewnętrzne (t.j. środowisko, kuweta pomiarowa, rozpuszczalnik lub roztwór buforowy w przypadku układów z substancją rozpuszczoną itp.) oraz skalibrowania skorygowanych danych w jednostkach bezwzględnych8. Należy również zmierzyć tło zewnętrzne (kuweta lub pojemnik na próbkę), próbkę odniesienia (roztwory rozpuszczalnika lub buforu), transmitancję próbki (niezbędną do prawidłowego odjęcia tła i kalibracji skorygowanych wyników w jednostkach bezwzględnych), tło elektroniczne detektora, czułość detektora (niejednorodność sprawności detektora immanentną dla detektorów powierzchniowych) oraz znormalizowaną próbkę wzorcową. W przypadku KWS-2 jako próbki wzorcowej stosuje się pleksiglas (PMMA). Jest to tzw. wzorzec wtórny, który jest okresowo kalibrowany względem wzorca pierwotnego, którym jest wanad. Wanad wykazuje bardzo słabą intensywność rozproszonego promieniowania i wymaga bardzo długich czasów pomiaru w celu zebrania odpowiedniej statystyki, przez co jest niepraktyczny w badaniach SANS. Intensywność zebrana z badanej próbki IS oraz z próbki wzorcowej ISt może być wyrażona w następujący sposób:
[1]
[2]
gdzie I0 oznacza intensywność padającą (dostarczaną przez układ kolimacyjny), t to grubość, A to powierzchnia naświetlana wiązką, T to transmitancja, a Δψ to kąt bryłowy, pod którym komórka detekcyjna jest widoczna z pozycji próbki. Jeśli zarówno próbka, jak i wzorzec są mierzone w tych samych warunkach w odniesieniu do wiązki padającej (t.j. LC, AC i AS, a także λ i Δλ/λ), I0 i A są takie same, a kąt bryłowy wyraża się jako AD/LD (gdzie AD oznacza powierzchnię komórki detekcyjnej). Dzieląc oba związki, otrzymuje się przekrój czynny na rozpraszanie próbki w postaci:
[3]
gdzie ISt jest wyrażone jako średnia (standard jako niespójny układ rozpraszający generuje płaski obraz rozproszenia). Wartość IS uzyskuje się po skorygowaniu zmierzonej intensywności próbki w ogniwie (pojemniku) o wkład pustego ogniwa IECell oraz tło detektora przy zamkniętej wiązce, IB. Współczynnik tStTSt(dΣ/dΩ)St, który zawiera parametry rozpraszania i parametry fizyczne próbki standardowej, zależy od długości fali neutronów λ i jest zazwyczaj znany z kalibracji próbki standardowej. W związku z tym jest on wyszczególniony w tablicach oprogramowania do redukcji danych4. Parametry i wielkości w równaniu 3, które są znane z procedur kalibracyjnych i definicji układu eksperymentalnego (tS, LD), tworzą tzw. czynnik kalibracyjny k. Intensywności oraz transmisja próbki TS występujące w równaniu 3 muszą zostać zmierzone. Program do analizy danych qtiKWS umożliwia korekcję, kalibrację i uśrednianie radialne danych eksperymentalnych oraz wyznaczenie dΣ/dΩ dla badanych próbek w elastycznym i wszechstronnym trybie pracy. Końcowe wyniki wygenerowane za pomocą oprogramowania qtiKWS są prezentowane w formie tabel z czterema kolumnami: Q, I, ΔI, Δσ, gdzie I reprezentuje dΣ/dΩ, a Δσ jest rozdzielczością Q5.
Z praktycznego punktu widzenia, dzięki KWS-2 możliwe jest przeprowadzenie połączonych badań SANS i USANS, co daje tę zaletę, że geometria próbki oraz warunki termodynamiczne pozostają stałe. W bezpośredni sposób można badać duże morfologie wykazujące wiele poziomów strukturalnych obejmujących szeroką skalę długości, od rozmiarów nanometrowych do mikrometrowych, co przedstawiono na Rysunku 12. Oprócz granicy strukturalnej w małej skali RC zaobserwowanej na krzywej rozpraszania zmierzonej w konwencjonalnym trybie otworkowym (pinhole), poprzez aktywację soczewek i detektora o wysokiej rozdzielczości, można było zaobserwować granicę strukturalną w dużej skali LC cylindrycznych miceli rdzeń-powłoka utworzonych przez diblokowy kopolimer poli(tlenek heksylenu-ko-tlenek etylenu) PHO10k-PEO10k (w pełni protonowany) w D2O14 przy bardzo niskich wartościach Q w rozszerzonym trybie pracy w zakresie Q. Cylindryczne micele charakteryzują się całkowitą grubością około 300 Å i długością około 7 000 Å, co ujawniono poprzez dopasowanie wyników doświadczalnych do czynnika kształtu cylindrów rdzeń-powłoka9,14. W związku z tym, określone wrażliwe efekty, takie jak żele termoresponsywne lub tworzenie i wzrost morfologii krystalicznych bądź częściowo krystalicznych, mogą być jednoznacznie badane za pomocą KWS-2, w przeciwieństwie do klasycznego podejścia wymagającego użycia dwóch lub więcej różnych instrumentów i geometrii próbek.
Jak przedstawiono na Rysunku 11, układy skorelowane i struktury uporządkowane można badać z dostosowaną rozdzielczością w bardzo elastyczny sposób, bez poświęcania czasu i wysiłku na instalację złożonych systemów monochromatyzacji, co wiązałoby się z dodatkowymi kwestiami dotyczącymi pielęgnacji i bezpieczeństwa. Co więcej, dzięki zastosowaniu przerywacza wiązki (choppera) i trybu akwizycji danych TOF, monodyspersyjne układy materii miękkiej lub kompleksy o niskiej polidyspersyjności rozmiarów mogą być charakteryzowane bardzo precyzyjnie przy zachowaniu wysokich intensywności5.
Utrudnienia wynikające ze słabego rozpraszania, spowodowane zastosowaniem systemów o wysokim rozcieńczeniu lub niekorzystnymi warunkami kontrastu, można pokonać poprzez zastosowanie jeszcze wyższych intensywności opartych na większym rozmiarze wiązki na próbce, przy jednoczesnym zachowaniu rozdzielczości. Rysunek 13A przedstawia wzory rozpraszania dla cząsteczek polistyrenu o promieniu R = 150 Å, zmierzone w trybie wysokiej intensywności z użyciem soczewek i kwadratowego rozmiaru wiązki w zakresie od 10 mm x 10 mm, co jest typowym rozmiarem stosowanym w konwencjonalnym trybie otworkowym, do 30 mm x 30 mm. Dodatkowo pokazano wynik pomiaru z okrągłą wiązką o średnicy 50 mm (pełny rozmiar soczewki). Równolegle przedstawiono znormalizowany wynik uzyskany w konwencjonalnym trybie otworkowym. Stosując 26 soczewek z neutronami o λ= 7 Å i tym samym rozmiarem apertury wlotowej AC co w konwencjonalnym trybie otworkowym (Rysunek 2B), uzyskano wzrost intensywności na próbce około 12-krotny przy zachowaniu stałego rozmiaru wiązki (rozdzielczości) na detektorze, co pokazano na Rysunku 13B-C. System 27 soczewek ma transmitancję wynoszącą około 32% w temperaturze otoczenia. Po schłodzeniu do temperatury 50 K transmitancja soczewek wzrasta ze względu na tłumienie rozpraszania na fononach w materiale soczewki. System 26 soczewek parabolicznych ma transmitancję około 65% dla okrągłego rozmiaru wiązki 50 mm, gdy wiązka przechodzi przez całą objętość soczewki, oraz około 92% dla kwadratowego rozmiaru wiązki 10 mm x 10 mm, gdy w wiązce znajduje się tylko niewielka ilość materiału soczewki. Tryb wysokiej intensywności z soczewkami oferuje korzyści w przypadku słabego rozpraszania, które zazwyczaj występuje przy dużej odległości detekcji i jest szczególnie problematyczne w warunkach słabego kontrastu. Ponadto, gdy próbka jest stabilna tylko przez krótki czas, zastosowanie tego trybu stanowi wyraźną zaletę, co wykazano w innym opracowaniu15.
Z drugiej strony, w przypadku układów biologicznych do eksperymentów zazwyczaj dostępne są małe objętości próbek. Małe cząsteczki biologiczne w warunkach fizjologicznych o rozmiarach kilku nanometrów generują słabe sygnały rozproszenia ponad dominującym rozproszeniem z roztworów buforowych. Takie sygnały można mierzyć za pomocą KWS-2, korzystając z wysokiej intensywności instrumentu w konfiguracji niskiej rozdzielczości w trybie otworu (pinhole), przy zastosowaniu krótkich długości kolimacji LC = 2 m lub 4 m i krótkich odległości detekcji LD = 1 m, 2 m lub 4 m. Rycina 14 przedstawia wzory rozproszenia monomerów białka beta-amyloidu (Aβ 1-42, MW = 4,5 kDa) w deuterowanym heksafluoroisopropanolu dHFIP, uzyskane po zastosowaniu korekcji o sygnał rozproszenia z buforu. Dopasowanie modelu do danych wskazało rozmiar monomeru wynoszący około 16 ± 1 Å16. Wymagany był długi czas pomiaru wynoszący kilka godzin dla każdego warunku eksperymentalnego (odległość detekcji LD i rodzaj próbki), mimo że pomiary prowadzono przy krótkich odległościach detekcji. Stary detektor, który wykazywał ograniczenia w zakresie szybkości zliczania, utrudniał zastosowanie krótkich odległości kolimacji LC, co wymusiło użycie maksymalnego strumienia instrumentu. Dzięki uruchomieniu nowego systemu detekcji, umożliwiającego wykorzystanie pełnego strumienia neutronów, tak słabe intensywności będą w przyszłości mierzone w krótszym czasie i z lepszą statystyką.
W końcu, efekty wrażliwości na bodźce można badać w elastyczny i łatwy sposób, wykorzystując specjalistyczny sprzęt pomocniczy KWS-2. Przykład przedstawiono na Rysunku 15, który ukazuje wzory SANS dla białka lizozymu w buforze D2O oraz dla buforu zebranego przy różnych ciśnieniach. Szczególną uwagę poświęcono badaniu tła i rozpraszania w przód cząsteczek lizozymu, wykorzystanych w teście wydajności nowej komory ciśnieniowej wykonanej wewnętrznie zgodnie z projektem opracowanym przez PSI w Szwajcarii. Wyniki były podobne do tych uzyskanych przez Kohlbrechera et al. w analogicznym badaniu mającym na celu przetestowanie oryginalnego modelu komory ciśnieniowej zbudowanej w tej instytucji17, 18. Przy użyciu KWS-2 pozyskano dalsze dane, ponieważ osiągnięto ciśnienie 5,000 bar. Ewolucja intensywności rozpraszania w przód białka wykazuje zachowanie liniowe, co zaobserwowano w badaniu w PSI w Szwajcarii18.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Dziękujemy Dr. Dietmarowi Schwahnowi (Forschungszentrum Jülich GmbH) za wsparcie i stymulowanie dyskusji na temat modernizacji KWS-2 w latach 2010-2015. Z wdzięcznością dziękujemy za stałą pomoc ze strony Centralnego Instytutu Inżynierii, Elektroniki i Analityki (ZEA) oraz instytutów JCNS-1 (rozpraszanie neutronów) i JCNS-2 (metody rozpraszania) w Forschungszentrum Jülich GmbH podczas projektowania, instalacji i uruchamiania komponentów, urządzeń i oprogramowania sterującego dla nowych trybów pracy KWS-2. Jesteśmy wdzięczni Matthew Binnsowi i Christopherowi J. Van Leeuwenowi (obaj z Uniwersytetu Stanowego Luizjany) za profesjonalną redakcję tego manuskryptu.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| ciężka woda D2O | Sigma-Aldrich | 151882 | |
| ciężka woda D2O/H2O | Sigma-Aldrich | 151882 | 90% D2O i 10% H2O |
| Standardy rozmiaru nanosfery serii 3000 (polistyren) | Thermo Scientific | 3030A | 90% D2O i 10% H2O |
| Standardy rozmiaru nanospher serii 3000 (polistyren) | Thermo Scientific | 3070A | 90% D2O i 10% H2O |
| Standardy rozmiaru nanosfery serii 3000 (polistyren) | Thermo Scientific | 3100A | 90% D2O i 10% H2O |
| Rozmiar nanospher serii 3000 Standardy (polistyren) | Thermo Scientific | 3200A | 90% D2O i 10% H2O |
| Standardy rozmiaru nanosfery serii 3000 (polistyren) | Thermo Scientific | 3800A | 90% D2O i 10% H2O |
| Kopolimer diblokowy C28H57-PEO5k | syntetyzowany we własnym zakresie | w D2O | |
| Ogniwa kwarcowe 110-QX | Hellma analytics | 110-1-46 | |
| Aluminiowy uchwyt na kuwetę | wyprodukowany we własnym zakresie | do pomiarów w temperaturze otoczenia | |
| śrubokręt | |||
| imbusowy klucze imbusowe |