Mitochondria komórek śródbłonka są niezbędne do utrzymania integralności bariery krew-mózg. Wprowadzamy protokół pomiaru funkcji bioenergetycznych w komórkach śródbłonka naczyń mózgowych.
Artykuł metodologiczny
Mitochondria komórek śródbłonka są niezbędne do utrzymania integralności bariery krew-mózg. Wprowadzamy protokół pomiaru funkcji bioenergetycznych w komórkach śródbłonka naczyń mózgowych.
Integralność bariery krew-mózg (BBB) jest kluczowa dla zapobiegania urazom mózgu. Komórki śródbłonka naczyń mózgowych (CVE) są jednym z typów komórek wchodzących w skład bariery krew-mózg; Komórki te mają bardzo duże zapotrzebowanie na energię, co wymaga optymalnego funkcjonowania mitochondriów. W przypadku choroby lub urazu funkcja mitochondriów w tych komórkach może zostać zmieniona, co prowadzi do choroby lub otwarcia bariery krew-mózg. W tym manuskrypcie przedstawiamy metodę pomiaru funkcji mitochondriów w komórkach CVE przy użyciu całych, nienaruszonych komórek i bioanalizatora. Test mitostresu służy do rzucenia wyzwania komórkom, które zostały zaburzone, fizycznie lub chemicznie, i oceny ich funkcji bioenergetycznej. Ponadto metoda ta stanowi również użyteczny sposób badania przesiewowego nowych terapii, które mają bezpośredni wpływ na funkcję mitochondriów. Zoptymalizowaliśmy gęstość komórek niezbędną do uzyskania wskaźników zużycia tlenu, które pozwalają na obliczenie różnych parametrów mitochondriów, w tym produkcji ATP, maksymalnego oddychania i wolnej pojemności. Pokazujemy również czułość testu, wykazując, że wprowadzenie mikroRNA, miR-34a, prowadzi do wyraźnego i wykrywalnego spadku aktywności mitochondriów. Chociaż dane przedstawione w tym artykule są zoptymalizowane pod kątem linii komórkowej bEnd.3, zoptymalizowaliśmy również protokół dla pierwotnych komórek CVE, co dodatkowo sugeruje użyteczność w modelach przedklinicznych i klinicznych.
Powszechnie uznaje się, że bariera krew-mózg (BBB) tworzona przez komórki śródbłonka naczyń mózgowych (CVE) ma bardzo wyraźne i unikalne funkcje kluczowe dla biologii naczyniowej. Te komórki śródbłonka wykorzystują mitochondria do generowania większości komórkowego zaopatrzenia w adenozynotrójfosforan (ATP) jako źródło energii chemicznej. Oprócz dostarczania ATP dla komórek CVE, mitochondria regulują różne procesy komórkowe w komórkach śródbłonka naczyń krwionośnych, takie jak sygnalizacja komórkowa1-4, apoptoza5 oraz kontrola cyklu komórkowego i wzrostu komórek6. Rozregulowanie bioenergetycznej funkcji mitochondriów w komórkach CVE może wpływać na biogenezę mitochondriów, prowadząc do upośledzenia aktywności śródbłonka naczyń krwionośnych oraz zaostrzać choroby naczyń mózgowych i zaburzenia neurodegeneracyjne, np. udarmózgu 7,8 i chorobę Alzheimera (AD)9. Wykazaliśmy, że uszkodzenia komórek CVE po ekspozycji na lipopolisacharyd (LPS) upośledzają funkcję mitochondriów w komórkach CVE i pogarszają wyniki udaru7. Tert-butylohydrochinon (tBHQ) zwiększa śmiertelność z powodu udaru mózgu poprzez zakłócanie fosforylacji oksydacyjnej w komórkach CVE10. W związku z tym ilościowy model funkcji bioenergetycznej w komórkach CVE nie tylko pilotuje serię badań związanych z mechanizmami chorób ośrodkowego układu nerwowego (OUN), ale także stanowi przełom w badaniach przesiewowych leków ukierunkowanych na funkcję mitochondriów w biologii naczyniowej.
Izolowane mitochondria zostały użyte do pomiaru funkcji bioenergetycznej. My7 i inni11 opisaliśmy oceny bioenergetyki komórkowej w nienaruszonych komórkach CVE przy użyciu bioanalizatora strumienia zewnątrzkomórkowego. Analizator zapewnia przewagę endogennej komórkowej oceny bioenergetycznej. Ten czuły i spójny test mierzy mitochondrialny metabolizm komórek CVE i może być wykorzystany do oceny upośledzenia bioenergetycznego przez bodźce, badania mechanizmów mitochondrialnych szlaków sygnałowych oraz badań przesiewowych leków lub terapii, które wpływają na funkcję mitochondriów w komórkach CVE. Wskaźnik zużycia tlenu (OCR) jest rejestrowany przez bioanalizator przy użyciu podejścia do profilowania farmakologicznego poprzez połączenie czterech mitochondrialnych substancji zaburzających: oligomycyny, cyjanku karbonylu-4 (trifluorometoksy), fenylohydrazonu (FCCP), rotenonu i antymycyny A. W tym protokole szczegółowo opisujemy zoptymalizowane podejście, które pozwala na pomiar i obliczenie parametrów funkcjonalnych mitochondriów w komórkach CVE, w tym podstawowego oddychania mitochondrialnego, produkcji ATP, wycieku protonów, maksymalnego oddychania i wolnej pojemności oddechowej, w jednym teście.
UWAGA: Schemat protokołu jest pokazany na rysunku 1, w tym oś czasu procedur.
1. Hodowla i przejście komórek CVE
2. Wysiewaj i traktuj komórki na płytkach do hodowli komórkowych
3. Ocena funkcji mitochondriów za pomocą bioanalizatora
4. Analizy danych
UWAGA: Obliczenia do analiz danych są sformułowane poniżej. Wartości są uzyskiwane z bioanalizatora jako OCR przedstawiony na rysunku 2.
Aby ocenić funkcję bioenergetyczną komórek CVE w odpowiedzi na stres oksydacyjny, wybrano linię komórkową śródbłonka mikrokrążenia mózgu myszy bEnd.3, która wykazuje podobne porównawcze właściwości barierowe jak pierwotne komórki śródbłonka mikrokrążenia mózgu12. Biorąc pod uwagę, że kinetyka i względna intensywność odpowiedzi różnią się w zależności od typu komórek, pierwsza seria eksperymentów została zaprojektowana w celu uzyskania mierzalnych poziomów OCR poprzez określenie optymalnej liczby komórek bEnd.3 do zastosowania w teście profilowania metabolicznego, co przedstawiono na Rysunku 2. Po dokonaniu oceny dane zostały skwantyfikowane i zaprezentowane na Rysunku 3. Oddychanie podstawowe, oddychanie maksymalne oraz rezerwy wydolności oddechowej wykazały odpowiedź proporcjonalną do gęstości komórek. Jednakże produkcja ATP spadła przy wyborze 64 × 103 komórek na dołek, co sugeruje, że nadmiernie konfluencyjna hodowla komórek nie nadaje się do tego eksperymentu. Optymalna gęstość komórek mieści się w przedziale od 8 do 32 × 103 komórek na dołek, w oparciu o odpowiedź na disruptory mitochondrialne.
W kolejnych eksperymentach zastosowano gęstość wysiewu 16 × 103 komórek na dołek, aby umożliwić optymalną detekcję zmian w OCR. Przy użyciu 16 × 103 komórek na dołek zaobserwowano oczekiwane odpowiedzi w OCR i wykazano, że mikroRNA miR-34a redukuje funkcję mitochondrialną w komórkach CVE (Rycina 4). Wcześniej zgłaszaliśmy, że miR-34a redukuje fosforylację oksydacyjną w tych komórkach13. Powtórzone eksperymenty wykazały również, że respiracja maksymalna oraz pojemność zapasowa zostały istotnie zmniejszone przez nadekspresję miR-34a w CVE w 24 h po transfekcji, mimo że respiracja podstawowa, produkcja ATP i wyciek protonów nie uległy istotnym zmianom (Rycina 4). Dane te demonstrują czułość bioanalizatora w wykrywaniu zmian funkcji mitochondrialnej w CVE.

Rycina 1. Planowanie strategiczne eksperymentu. Przedstawiono harmonogram przygotowania komórek, płytek oraz kartridży. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 2. Reprezentatywne surowe dane dotyczące funkcji bioenergetycznej w komórkach CVE o różnej gęstości komórkowej. Tempo zużycia tlenu mierzono w komórkach CVE o różnych gęstościach komórkowych. Dane przedstawiają średnią ± SD (n = 5); OCR: tempo zużycia tlenu; FCCP: karbonylocyjanid-4-(trifluorometoksy)fenylohydrazon; Rot/Anti-A: rotenon i antymycyna A. ①, ② i ③ oznaczają respirację podstawową; ④, ⑤ i ⑥ oznaczają respirację związaną z syntezą ATP; ⑦, ⑧ i ⑨ oznaczają respirację maksymalną; ⑩, ⑪ i ⑫ oznaczają respirację pozimitochondrialną. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 3. Reprezentatywne wyniki funkcji bioenergetycznej w komórkach CVE przy różnych gęstościach komórek. Oddychanie podstawowe, produkcja ATP, oddychanie maksymalne oraz pojemność rezerwowa zostały obliczone z surowych danych uzyskanych w teście funkcji bioenergetycznej przedstawionym na Rysunku 2, z wykorzystaniem wzorów wskazanych w sekcji 4. Dane przedstawiają średnią ± SD (n = 5); OCR: szybkość zużycia tlenu. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 4: Reprezentatywne wyniki obniżenia funkcji bioenergetycznej przez miR-34a. (A) Surowe dane dotyczące funkcji mitochondrialnej po nadekspresji miR-34a w 24 h po transfekcji. (B) Oddychanie podstawowe, produkcja ATP, oddychanie maksymalne oraz rezerwa wydolnościowa obliczone na podstawie surowych danych uzyskanych w teście funkcjonalnym bioenergetyki przedstawionym na Rycini 4A; parametry obliczono zgodnie ze wzorami wskazanymi w sekcji 4. Nadekspresja miR-34a obniża funkcję mitochondrialną w komórkach CVE w 24 h po transfekcji. Dane przedstawiają średnią ± SD (n = 5); OCR: tempo zużycia tlenu. ****, P < 0.0001. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Tabela 1. Protokół pracy urządzenia.
Protokół ten stanowi metodę oceny fenotypu bioenergetycznego w komórkach śródbłonka naczyń mózgowych. Służy jako podstawowy test do oceny mitochondriów komórek śródbłonka i jest optymalny do eksperymentów mających na celu zbadanie mechanizmów bodźców, które mogą wpływać na mitochondrialny szlak sygnałowy w komórkach CVE. Stanowi również metodę testowania potencjalnych metod leczenia chorób związanych z zaburzeniem bariery krew-mózg.
Kluczowe kroki w ramach protokołu
Bioanalizatory strumienia zewnątrzkomórkowego mają możliwość pomiaru OCR w czasie rzeczywistym. W tym teście określenie odpowiedniej gęstości komórek ma kluczowe znaczenie. Jeśli gęstość komórek jest mniejsza niż 8 × 103 komórek na studzienkę, podstawowy OCR jest zbyt niski, aby można go było analizować (ryc. 2 i ryc. 3); jeśli gęstość komórek przekracza 32 × 103 komórek na studzienkę, komórki nie reagują na leczenie oligomycyną lub FCCP (ryc. 2 i ryc. 3). Optymalna gęstość komórek dla tej linii komórkowej w naszym modelu eksperymentalnym wynosi 16 × 103 komórek na studzienkę, co świadczy o powtarzalnych wynikach i wrażliwości na bodźce7 i zabiegi10,14. Jeśli używany jest bioanalizator 24-dołkowy, do testu wymagane byłoby nowe miareczkowanie gęstości komórek.
Udokumentowano, że CVE mają dużą objętość mitochondriów w porównaniu z innymi komórkami śródbłonka lub typami tkanek15,16, co sugeruje potrzebę większej produkcji energii i mniejszej liczby komórek do pomiaru metabolizmu bioenergetycznego. Przetestowaliśmy kilka typów komórek śródbłonka mózgu, takich jak pierwotne i unieśmiertelnione mysie komórki śródbłonka naczyń mózgowych7 oraz unieśmiertelnione ludzkie komórki śródbłonka naczyń mózgowych (dane niepublikowane). Komórki te wymagały podobnej gęstości komórek, aby osiągnąć akceptowalny OCR (OCR oddychania podstawowego w zakresie 40 - 160 pmol/min dla płytek 96-dołkowych i 50 - 400 pmol/min dla płytek 24-dołkowych) podczas wykonywania testu bioenergetycznego. Kaczara i wsp. poinformowali o pomiarze metabolizmu bioenergetycznego w ludzkich komórkach śródbłonka żyły pępowinowej (HUVEC), w których wykorzystano większą gęstość komórek17.
Nasza grupa nie oceniała komórek naczyń krwionośnych z innych tkanek lub narządów. Teoretycznie bioanalizator może być potencjalnie stosowany na każdym typie komórek, ale wymaga optymalizacji testu pod kątem gęstości komórek, pożywki do hodowli komórkowej i warunków hodowli (niektóre określone komórki mogą wymagać powlekanych płytek, aby dobrze rosnąć). Wymagane jest, aby eksperymenty zostały zakończone, aby upewnić się, że szybkość OCR mieści się w dopuszczalnym zakresie. Jeśli OCR w komórkach śródbłonka z innych narządów jest niższy niż CVE z mózgu, zwiększenie gęstości komórek może pomóc w osiągnięciu akceptowalnego zakresu OCR. Alternatywnie, jeśli komórki nie wykorzystują fosforylacji oksydacyjnej jako głównego źródła energii, bioanalizator nie byłby optymalnym testem.
Bioanalizator pozwala na sekwencyjne przerwanie łańcucha transportu elektronów, w oparciu o kolejność, w jakiej odczynniki są stosowane. Najpierw stosuje się oligomycynę, która hamuje mitochondrialny kompleks V (syntazę ATP). Po drugie, stosuje się FCCP, czyli rozprzęgacz elektronów, który prowadzi do zakłócenia gradientu protonów. Wreszcie, rotenon i antymycyna A, które hamują odpowiednio kompleksy mitochondrialne I i III, są stosowane w celu doprowadzenia do całkowitego zahamowania przepływu elektronów. Kolejność ekspozycji na leki jest istotna, ponieważ leki blokują specyficzną reakcję łańcuchową transportu elektronów, a sekwencyjne zmiany można zmierzyć, aby odzwierciedlić funkcję mitochondriów.
Modyfikacje i rozwiązywanie problemów
Aby ocenić odpowiedź mitochondriów na bodźce w komórkach CVE, zaleca się, aby bodźce były podawane do komórek po przyklejeniu komórek do dna płytki hodowli komórkowej (patrz oś czasu pokazana na rysunku 1; zwykle trwa to co najmniej 6 godzin). Aby uzyskać powtarzalne wyniki za pomocą zabiegów, niezwykle ważne jest utrzymanie stałej gęstości komórek. Jeżeli obróbka wstępna jest projektowana przed wysiewem komórek, gęstość komórek dla każdego zabiegu wstępnego powinna być dokładnie zmierzona, z wyłączeniem martwych komórek przeznaczonych do wysiewu. Jeżeli transfekcja jest uwzględniona w projekcie doświadczalnym, należy zapoznać się z protokołem transfekcji producenta. Jak wykazano w danych przedstawionych na rycinie 4, miR-34a transfekowano do komórek CVE przy użyciu zestawu do transfekcji lipofektaminy, który wymaga pożywki do hodowli komórkowej wolnej od antybiotyków i testu mito-stresu w celu oceny zmian w funkcji metabolicznej z nadekspresją miR-34a. Dawki plazmidu mogą być również zoptymalizowane, jak wcześniej opublikowano13. Kolejną zmianą, którą można wprowadzić do protokołu, jest zmiana stężeń odczynników. Można ukończyć krzywą miareczkowania oligomycyny, FCCP i/lub rotenonu i antymycyny A.
Ponadto, jeśli test ten jest używany do wysokoprzepustowych analiz różnych leków, sugeruje się, aby uwzględnić równoległy test do pomiaru żywotności komórek i proliferacji komórek, co zostało opisane w naszych poprzednich publikacjach7,13. Na wartości OCR znaczący wpływ ma liczba komórek (ryc. 2 i 3), a testy proliferacji komórek i żywotności korzystnie wpływają na normalizację danych. Jednak wykonanie tych testów leży w gestii każdego laboratorium z osobna.
Ograniczenia techniki
Głównym ograniczeniem tego protokołu jest to, że w badaniu użyliśmy tylko modelu hodowli komórkowej in vitro . Obecnie nie ma dostępnych modeli ex vivo ani modeli zwierzęcych, które mogłyby zajmować się funkcją mitochondriów komórek śródbłonka. Oczekuje się, że w przyszłych badaniach zostaną opracowane nowe modele do oceny funkcji bioenergetycznych in vivo i ex vivo .
Kolejnym ograniczeniem jest rozszerzenie ocen barier w ślad za działaniami bioenergetycznymi. Doświadczenia nie mogą być przeprowadzone, ponieważ, po pierwsze, po zakończeniu pomiarów bioenergetycznych, żywotność komórki jest zmniejszona w wyniku całkowitego przerwania łańcucha transportu elektronów; Po drugie, do wykrywania wartości bioenergetycznych wymagane są specjalne płytki i wkładki do hodowli komórkowych, które nie pasują do wkładek do oceny bariery. W związku z tym nie ma wielu testów funkcjonalnych, które można wykonać po teście bioenergetycznym. Oczekuje się jednak, że uda się opracować specjalne urządzenia do wykonywania testów funkcjonalnych przed testem bioenergetycznym.
Znaczenie techniki w odniesieniu do istniejących/alternatywnych metod
Poprzednie techniki oceny funkcji mitochondriów wymagały izolacji mitochondriów od komórek18. Ta nowa technika wykorzystująca bioanalizator pozwala na pomiar aktywności mitochondriów w nienaruszonych komórkach, co pozwala zachować więcej środowiska komórkowego niż ocena izolowanych mitochondriów.
Przyszłe zastosowania lub wskazówki po opanowaniu tej techniki
Protokół ten został zaprojektowany i opracowany dla linii komórkowej bEnd.3, ale jest również kompatybilny z pierwotnymi komórkami śródbłonka naczyń mózgowych (pCVE)7 lub innymi komórkami śródbłonka, co wykazaliśmy w naszej poprzedniej publikacji przy użyciu komórek pCVE7. W przypadku stosowania innych rodzajów śródbłonka może być wymagane pokrycie płytki hodowlanej i zastosowanie czynników wzrostu. Jednak test miareczkowania jest zalecany również dla innych typów komórek. Protokół ten oferuje ogólną metodę, którą należy przyjąć w ocenie bioenergetyki komórek CVE i może być dalej stosowany do badań mechanizmów lub odpowiedzi terapeutycznych w ten sposób.
Autorzy deklarują brak potencjalnych konfliktów interesów w odniesieniu do badań, autorstwa i/lub publikacji tego artykułu. Opłaty za otwarty dostęp do tego artykułu zostały zapewnione przez Agilent Technologies.
Ta praca została wsparta przez następujące granty: AHA 16SDG31170008 dla X.R. i NIH P20 GM109098, P01 AG027956, oraz U54 GM104942 dla J.W.S.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| bEnd.3 linia komórkowa | ATCC | CRL-2299 | 25 - 30 przejść |
| Zmodyfikowane podłoże orła Dulbecco (DMEM) | ATCC | 30-2002 | |
| Surowica bydlęca płodu | Atlanta Biologicals | S12450 | 10% stężenie końcowe |
| Penicylina / Steptomycyna | Hyklon | SV30010 | 1 razy; 100 pończochy |
| 0,25% trypsyna, 0,03% roztwór EDTA | Corning | 25-053-CI | |
| Pirogronian sodu | Corning | 25-000-CI | 1,0 i mikro; M stężenie końcowe |
| Glukoza | Sigma | CAS 50-99-7 | 25 mM stężenie końcowe |
| Oligomycyna | Sigma | O4876 | 1,0 &mikro; M stężenie końcowe |
| 4-(trifluorometoksy)fenylohydrazon karbonilocyjanku (FCCP) | Sigma | C2920 | 0,5 &mikro; M stężenie końcowe |
| Rotenon | Sigma | R8875 | 1.0 &mikro; M końcowe stężenie |
| Antymycyna A | Sigma | CAS 1397-94-0 | 1,0 &mikro; M stężenie końcowe |
| Stacja mycia płytek | Seahorse Bioscience Bioanalizator | ||
| strumienia zewnątrzkomórkowego | Seahorse Bioscience | XFe96 | |
| Płytka do hodowli komórek strumienia zewnątrzkomórkowego | Seahorse Bioscience | 102416-100 | |
| Wkład czujnika strumienia zewnątrzkomórkowego | Seahorse Bioscience | 102416-100 | |
| Roztwór kalibru strumienia zewnątrzkomórkowego | Seahorse Bioscience | 100840-000 | |
| Pożywka do oznaczania strumienia zewnątrzkomórkowego | Seahorse Bioscience | 102365-100 | PH buforowane przed badaniem |