Dokładne wykrywanie i analiza cząstek biologicznych, takich jak komórki, bakterie czy wirusy zawieszone w cieczy, jest bardzo interesujące dla wielu zastosowań1,2,3. Dobrze dopasowane pod względem rozmiaru, urządzenia mikroprzepływowe oferują unikalne zalety w tym celu, takie jak wysoka czułość, delikatna manipulacja próbką i dobrze kontrolowane mikrośrodowisko4,5,6,7. Ponadto urządzenia mikroprzepływowe mogą być zaprojektowane tak, aby wykorzystywały kombinację dynamiki płynów i pól siłowych do pasywnego frakcjonowania niejednorodnej populacji cząstek biologicznych w oparciu o różne właściwości8,9,10,11,12. W tych urządzeniach wynikowy rozkład cząstek może być używany jako odczyt, ale informacje przestrzenne są zwykle dostępne tylko za pomocą mikroskopii, co ogranicza praktyczną użyteczność urządzenia mikroprzepływowego poprzez powiązanie go z infrastrukturą laboratoryjną. W związku z tym zintegrowany czujnik, który może z łatwością raportować mapowanie czasoprzestrzenne cząstek, gdy są one manipulowane za pomocą urządzenia mikroprzepływowego, może potencjalnie umożliwić tanie, zintegrowane urządzenia typu lab-on-a-chip, które są szczególnie atrakcyjne do testowania próbek w mobilnych warunkach o ograniczonych zasobach.
Elektrody cienkowarstwowe były używane jako zintegrowane czujniki w urządzeniach mikroprzepływowych do różnych zastosowań13,14. Rezystancyjny czujnik impulsowy (RPS) jest szczególnie atrakcyjny do zintegrowanego wykrywania małych cząstek w kanałach mikroprzepływowych, ponieważ oferuje solidny, czuły i wysokowydajny mechanizm wykrywania bezpośrednio z pomiarów elektrycznych15. W RPS modulacja impedancji między parą elektrod zanurzonych w elektrolicie jest wykorzystywana jako środek do wykrywania cząstki. Kiedy cząstka przechodzi przez otwór, zwymiarowany zgodnie z porządkiem cząstki, liczba i amplituda impulsów przejściowych w prądzie elektrycznym są wykorzystywane odpowiednio do zliczania i wymiarowania cząstek. Co więcej, geometria czujnika może być zaprojektowana z rozdzielczością fotolitograficzną w celu kształtowania rezystancyjnych przebiegów impulsów w celu zwiększenia czułości16,17,18,19 lub do oszacowania pionowego położenia cząstek w kanałach mikroprzepływowych20.
Niedawno wprowadziliśmy skalowalną i prostą technologię multipleksowanego wykrywania impulsów rezystancyjnych o nazwie Microfluidic Coded Orthogonal Detection by Electrical Sensing (Microfluidic CODES)21. Microfluidic CODES opiera się na połączonej sieci rezystancyjnych czujników impulsowych, z których każdy składa się z szeregu elektrod poddanych mikroobróbce w celu modulacji przewodzenia w unikalny, wyróżniający się sposób, aby umożliwić multipleksowanie. Specjalnie zaprojektowaliśmy każdy czujnik tak, aby wytwarzał ortogonalne sygnały elektryczne podobne do kodów cyfrowych używanych w sieciach telekomunikacyjnych z podziałem kodu o wielokrotnym dostępie22 (CDMA), dzięki czemu indywidualny sygnał czujnika impulsów rezystancyjnych może być jednoznacznie odzyskany z pojedynczego przebiegu wyjściowego, nawet jeśli sygnały z różnych czujników zakłócają. W ten sposób nasza technologia kompresuje informacje przestrzenne 2D o cząstkach do sygnału elektrycznego 1D, umożliwiając monitorowanie cząstek w różnych miejscach na chipie mikroprzepływowym, przy jednoczesnym ograniczeniu złożoności zarówno na poziomie urządzenia, jak i systemu do minimum.
W tym artykule przedstawiamy szczegółowy protokół dla metod eksperymentalnych i obliczeniowych niezbędnych do wykorzystania technologii Microfluidic CODES, a także reprezentatywne wyniki jej użycia w analizie symulowanych próbek biologicznych. Wykorzystując wyniki z prototypowego urządzenia z czterema multipleksowanymi czujnikami jako przykład w celu wyjaśnienia techniki, przedstawiamy protokoły dotyczące (1) procesu mikrofabrykacji w celu stworzenia urządzeń mikroprzepływowych w technologii Microfluidic CODES, (2) opisu układu eksperymentalnego, w tym sprzętu elektronicznego, optycznego i fluidycznego, (3) algorytmu komputerowego do dekodowania sygnałów zakłócających z różnych czujników, oraz (4) wyniki wykrywania i analizy komórek nowotworowych w kanałach mikroprzepływowych. Wierzymy, że korzystając z opisanego tutaj szczegółowego protokołu, inni badacze mogą zastosować naszą technologię w swoich badaniach.