UWAGA: Inkubacja fluorochromu i analiza konfokalna zajmą co najmniej 2-3 godziny dla próbki kontrolnej i poddanej działaniu substancji. Przetwarzanie danych nie jest uwzględniane w tym obliczaniu czasu. Wymagane materiały znajdują się w Tabeli Materiałów. Protokół ten można zastosować do plemników świeżych lub kriokonserwowanych. Solea senegalensis to gatunek ryby, który składa ikrę w zimnej wodzie, pracuje zawsze w niskich temperaturach (4-7 °C). Zobacz Rysunek 1, aby zapoznać się z ogólnym widokiem protokołu.
1. Prace przygotowawcze przed eksperymentem
- Przygotować 1 mM roztwór podstawowy do barwienia mitochondriów w DMSO klasy analitycznej.
- Przygotować 1 μg/ml roztworu podstawowego dichlorowodorku 4′,6-diamidyno-2-fenyloindolu (DAPI) w wodzie dejonizowanej.
- Przygotować roztwór Ringera o stężeniu 200 mOsm/kg (116 mM NaCl, 2,9 mM KCl, 1,8 mM CaCl2, 5 mM HEPES, pH 7,7)
- Przygotować 4 mM roztwór podstawowy dioctanu 2′,7′-dichlorodihydrofluoresceiny (DCFH-DA) w metanolu o czystości analitycznej.
UWAGA: Roztwory podstawowe należy przechowywać w porcjach w temperaturze -20 °C do czasu, gdy będą potrzebne.
- Ustawić mikrowirówkę na 4-7 °C.
2. Przygotowanie próbki przed inkubacją fluorochromu
UWAGA: Delikatne obchodzenie się z plemnikami jest pożądane podczas pipetowania i ponownego zawieszania.
- W przypadku pracy z komórkami kriokonserwowanymi przygotuj kąpiel wodną do rozmrożenia w temperaturze 40 °C dla plemników Solea senegalensis10. Zanurz próbki słomki w łaźni wodnej na 7 sekund.
- Za pomocą nożyczek do cięcia opróżnić próbkę do probówki do mikrofugi i odwirować w temperaturze 1000 x g, 4-7 °C przez 1 min.
- Usunąć osocze nasienne lub osocze nasienne za pomocą krioprotektantów z próbki kriokonserwowanej przez pipetowanie w celu odrzucenia wszelkich składników, które mogłyby zakłócać protokół barwienia.
- Zawiesić komórki w 50-100 μl roztworu Ringera o temperaturze 4 °C 200 mOsm/kg.
- Oznaczyć stężenie plemników za pomocą Neubauera lub podobnej komory liczącej pod mikroskopem stereoskopowym.
- Rozcieńczyć zawiesinę komórek do 1-2 x 106 komórek/ml w końcowej objętości 0,5 ml w roztworze Ringera o temperaturze 4 °C.
3. Inkubacja fluorochromu
UWAGA: Z fluorochromami należy obchodzić się w warunkach słabego oświetlenia, zwłaszcza gdy są w roztworze.
- Dodać 3,125 μl roztworu podstawowego DCFH-DA (końcowe stężenie w próbce: 25 μM) do rozcieńczenia próbki roboczej. Inkubować w temperaturze 4-7 °C przez 40 minut w ciemności10.
- Po 30 minutach dodać do próbki 0,5 μl roztworu podstawowego DAPI (stężenie końcowe w próbce: 2 μM) i 0,5 μl roztworu podstawowego barwienia mitochondriów (stężenie końcowe w próbce: 100 nM). Inkubuj oba fluorochromy przez 10 minut w ciemności.
4. Przygotowanie próbki do mikroskopii konfokalnej
- Po czasie inkubacji odwirować zawiesinę komórek w temperaturze 1000 x g, 4-7 °C przez 1 min.
- Ostrożnie wyrzucić supernatant przez pipetowanie.
- Dodać 10-20 μl roztworu Ringera o stężeniu 200 mOsm/kg.
- Umieścić 5 μl kropli skoncentrowanej zawiesiny komórek na szkiełku.
- Ostrożnie nałóż szkiełko nakrywkowe na preparat i uszczelnij go pastą. Po wyschnięciu pasty preparat jest gotowy do mikroskopii konfokalnej.
5. Konfiguracja konfokalna przed eksperymentem
UWAGA: W zależności od mikroskopu, DCFH-DA może zostać "spalony". Najpierw ustal najlepsze warunki z próbką niewartościową.
- Włącz mikroskop, lasery, kamerę i komputer, na którym działa mikroskop.
- Ustaw lasery wzbudzenia biorąc pod uwagę maksima wzbudzenia i emisji każdego fluorochromu:
- W przypadku DAPI należy przyjąć maksimum wzbudzenia 358 nm i maksimum emisji 465 nm.
- W przypadku barwienia mitochondriów należy zastosować maksimum wzbudzenia 644 nm i maksimum emisji 662 nm.
- W przypadku DCFH-DA należy przyjąć maksimum wzbudzenia 504 nm i maksimum emisji 525 nm.
- Rozpocznij pracę z obiektywem 25X, aby skupić się na plemnikach. Wybierz kanał DAPI, aby ustawić ostrość, ponieważ ten fluorochrom zgłasza najwyższą intensywność. Po zogniskowaniu komórek użyj obiektywu 63X lub 100X w celu dokładnej oceny, ponieważ rozmiar plemników Solea senegalensis wynosi około 2 μm.
- Dla każdego kanału zoptymalizuj otworek, wzmocnienie i napięcie. W ten sam sposób dostosuj przesunięcie cyfrowe, aby zmniejszyć tło. Gdy wszystkie parametry zostaną zoptymalizowane pod kątem użytego fluorochromu, zapisz ustawienia. Do rutynowego eksperymentu na pojedynczym plemniku Solea senegalensis użyliśmy następujących parametrów (parametry te mogą się zmieniać w każdym eksperymencie): otworek 1 i napięcie wzmocnienia 750 V.
6. Akwizycja obrazów
- Wybierz żądane warunki jakości akwizycji obrazu. Zdefiniuj ustawienia akwizycji, takie jak głębia bitowa, format obrazu, grubość jasnego arkusza i wybierz jednostronne oświetlenie. Do rutynowego eksperymentu na pojedynczym plemniku Solea senegalensis użyliśmy następujących parametrów (parametry te mogą ulec zmianie w każdym eksperymencie): rozmiar klatki 1024 px; bitów na piksel 16; szybkość skanowania 2-4).
- Otwórz i wyśrodkuj obszar skanowania, aby rozpocząć i zrobić zdjęcie pola.
- Za pomocą narzędzia do przycinania wybierz obszar zainteresowania i naciśnij na żywo.
- Za pomocą narzędzia wskaźnika zasięgu dostosuj przesunięcie cyfrowe, aby zmniejszyć tło. Zrób to dla każdego kanału i zrób zdjęcie.
- Sprawdź jakość poszczególnych kanałów dla każdego fluorochromu i ich kombinacji.
7. Tworzenie filmu z obrazem 3D
- Ustawienia akwizycji Z-stack.
- Wybierz opcję Z-stack w oprogramowaniu.
- Zaznacz pojedynczą komórkę, grupę komórek lub obszar zainteresowania i ustaw na nim fokus
.
- Ogranicz stos Z za pomocą opcji "Pierwszy plasterek" i "Ostatni plasterek" i ustal krok z do interwału 0,2 μm za pomocą precyzyjnego ogniskowania. Wybierz kanał DAPI, aby ustawić ostrość, ponieważ ten fluorochrom może zgłaszać najwyższą intensywność i możesz łatwo wybrać całą głowę plemników. Wybierz optymalne parametry pozyskiwania dla każdego kanału i przeprowadź eksperyment.
- Uruchom eksperyment Z-stack. Podziel kanały i obserwuj lokalizację każdego sygnału w komórkach.
- Proces Z-stack.
- Renderowanie woluminu: Po zakończeniu eksperymentu wybierz opcje oprogramowania do przetwarzania stosu Z i wybierz opcję renderowania woluminu. Wybierz liczbę kroków i stopnie obrotu (360°). Zapisz plik z rozszerzeniem wideo.
- Anaglif stereo: Wybierz anaglif stereo w oknie procesu opcji. To narzędzie pozwala na stworzenie obrazu 3D wideo z podzielonymi kanałami.