Jeden dzień po dysocjacji i wysianiu warstwa hPSC-CM będzie widoczna jako gęsty, biały film pokrywający środek komory MEA (Ryc. 3A). Po usunięciu pierścienia (Ryc. 3B), warstwa powinna pozostać na miejscu, a oględziny pod mikroskopem świetlnym wykażą elektrody MEA pokryte (kurczącą się) warstwą hPSC-CM (Ryc. 3C). Ze względu na fizyczne i elektryczne sprzężenie komórek, do analizy zostanie użyta tylko jedna elektroda (elektroda złota).
Alternatywnie, w przypadku pracy ze strukturami 3D, takimi jak ciała embrionalne lub mikrotkanki, można je wysiać w taki sposób, aby były od siebie fizycznie i elektrycznie odizolowane. Inspekcja wizualna pod mikroskopem może potwierdzić brak połączenia fizycznego między klastrami, a niesynchronizowane załamki R w zapisach MEA potwierdzają brak sprzężenia elektrycznego. W takim przypadku można analizować wiele niezależnych elektrod.
Typowe zapisy śladów FP przedstawiono na Rysunku 4. W szczególności wysoką jakość śladu można zdefiniować poprzez obecność wyraźnego piku odpowiadającego napływowi Na+ i depolaryzacji błony (pik R/Q), wyraźną fazę repolaryzacji odpowiadającą odpływowi K+ (pik T) oraz wysoki stosunek sygnału do szumu (Rysunek 4A, lewo: zwróć uwagę na skalę osi y oraz Rysunek 4B). Ślady słabej jakości (Rysunek 4A, środek) mogą być wynikiem braku przylegania hPSC-CM do płytki MEA lub słabej aktywności elektrycznej hPSC-CM. Odczekanie 1-3 dni w celu lepszego przylegania może poprawić sygnał; jednak jeśli nie zaobserwowano poprawy sygnału, zaleca się wykluczenie tej płytki MEA z eksperymentów. Zaśnieżone ślady (Rysunek 4A, prawo) można analizować po przefiltrowaniu.
Prawidłową analizę odstępu RR można potwierdzić poprzez wizualną inspekcję ekranu wyświetlającego detekcję szczytów (Rycina 5A, 5B). W przedziale czasowym wyznaczonym przez kursory pionowe powinny znajdować się niebieskie oznaczenia odpowiadające każdemu szczytowi. W przypadku, gdy program nie zidentyfikuje jednego lub większej liczby szczytów, należy spróbować przesunąć kursor poziomy i ponownie uruchomić analizę lub dostosować ustawienia detekcji. Podobnie, prawidłową analizę odstępu QT można potwierdzić poprzez wizualną inspekcję ekranu wyświetlającego detekcję FP (Rycina 7). W przedziale czasowym wyznaczonym przez kursory pionowe powinny znajdować się niebieskie oznaczenia odpowiadające każdej detekcji FP. W przypadku, gdy program nie zidentyfikuje jednego lub większej liczby FP, należy spróbować ponownie zdefiniować szablon FP (Rycina 6), dostosować ustawienia detekcji i ponownie uruchomić analizę.
Wyekstrahowane pojedyncze zapisy FP lub ich średnia (Rysunek 8) mogą być wykorzystane do uzyskania wartości odstępu QT przy określonych ustawieniach, jak pokazano na Rysunku 9. Zalecana i istotna jest analiza zależności QT-RR w liniach hPSC WT i chorych (Rysunek 10A), a także w celu oceny potrzeby i/lub efektu korekcji odstępu QT (Rysunek 10B-10D). hPSC-CMs posiadające mutacje powodujące LQTS wykazują wydłużone odstępy QT w porównaniu z kontrolą WT (Rysunek 11A). Leczenie hPSC-CMs blokerem kanałów hERG skutkuje wydłużeniem odstępu QT (Rysunek 11B); przeciwnie, zastosowanie aktywatora hERG prowadzi do skrócenia odstępu QT (Rysunek 11C). Wreszcie, podanie leków wpływających na częstotliwość skurczów hPSC-CMs powinno być widoczne jako zmiana odstępu RR (Rysunek 11D, skrócenie odstępu RR).

Rysunek 1: Sterylizacja i powlekanie chipów MEA. (A) Schemat przedstawiający proces sterylizacji, obejmujący umieszczenie chipa MEA w autoklawowalnej szklanej szalce Petriego, owinięcie folią aluminiową, parowanie przez 6 min oraz naświetlanie UV przez 30 min. (B) Widok z góry (lewy panel) i z boku (środkowy panel) niestandardowego pierścienia z PTFE; pierścień ma średnicę zewnętrzną 1,2 cm, posiada 4 wypustki umożliwiające jego ustawienie w centrum chipa MEA, a średnica wewnętrzna wynosi 0,4 cm (prawy panel). (C) Schemat przedstawiający przygotowanie chipa MEA, obejmujący umieszczenie chipa w standardowej plastikowej szalce Petriego, dodanie 8 mL wody dejonizowanej na zewnątrz komory MEA, umieszczenie pierścienia z PTFE na środku komory oraz powleczenie macierzy elektrod fibronektyną. Po czasie inkubacji fibronektyna jest usuwana i zastępowana pożywką hodowlaną. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 2: Dysocjacja i wysiew hPSC-CMs. Schemat przedstawiający procesy enzymatycznej dysocjacji, wirowania, resuspensji i wysiewu hPSC-CMs w centrum komory MEA. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rysunek 3: Chipy MEA z warstwą hPSC-CM. (A) Widoki z góry chipu MEA zawierającego pierścień oraz warstwę hPSC-CM. (B) Widok z boku chipu MEA po usunięciu pierścienia. (C) Obraz hPSC-CM w jasnym polu, wysiane na macierzy mikroelektrod; powiększenie 4X. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 4: Rejestracja MEA kardiomiocytów pochodzących z ludzkich pluripotencjalnych komórek macierzystych (hPSC-CMs). (A) Reprezentatywne zapisy zarejestrowane za pomocą MEA przedstawiające zapis wysokiej jakości z wyraźnie widocznymi szczytami R/Q i T oraz wysokim stosunkiem sygnału do szumu (lewo), zapis niskiej jakości bez wyraźnie widocznych szczytów R/Q i T (środek) oraz zapis zaszumiony z wyraźnie widocznymi szczytami R/Q i T, ale niskim stosunkiem sygnału do szumu (prawo). (B) Reprezentatywne przykłady wysokiej jakości zapisów FP o różnych morfologiach, które mogą być rejestrowane podczas eksperymentów MEA z użyciem hPSC-CMs. Zacieniowany obszar reprezentuje odstęp QT zmierzony podczas analizy. Ponieważ FP w MEA przypomina pierwszą pochodną potencjału czynnościowego28, obliczono całkę z zapisu FP, przedstawioną jako czerwona linia przerywana, jako teoretyczną demonstrację wyboru fali T bliskiej pełnej repolaryzacji potencjału czynnościowego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 5: Obliczanie odstępu RR. (A) Przykład analizy odstępu RR z automatycznym wykrywaniem szczytów (góra) i ekstrakcją danych (dół) przy użyciu oprogramowania analitycznego (patrz Tabela materiałów). Kursory pionowe wyznaczają interesujący przedział czasowy, a kursor poziomy przecina wszystkie zdarzenia, które zostały wykryte i zidentyfikowane niebieskimi znacznikami. (B) Powiększona kolumna pokazuje wyekstrahowane dane użyte do obliczenia odstępu RR. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 6: Tworzenie szablonu FP. Przykład wyboru szablonu przy użyciu kursorów pionowych umieszczonych przed i po pojedynczym FP. Szablon ten jest wykorzystywany do automatycznej identyfikacji FP. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 7: Automatyczna identyfikacja szablonu FP. Przykład wyszukiwania szablonu w przedziale zdefiniowanym przez dwa pionowe kursory. Wszystkie wykryte zdarzenia są oznaczone niebieskimi znakami i automatycznie nałożone na siebie na wstawce. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 8: Ilościowe określenie parametrów FP. Analiza zapisanych zdarzeń, w której szczyt R został zidentyfikowany ręcznie za pomocą pierwszych dwóch kursorów, a szczyt T zidentyfikowano ręcznie za pomocą dwóch ostatnich kursorów. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 9: Okno analizy. Parametry używane w oknie statystyk do wykrywania szczytu R. W celu wykrycia szczytu T należy zmienić kursory i (jeśli to konieczne) polaryzację. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 10: Zależność QT-RR. (A) Przykład różnic w zależności między odstępami QT i RR u hPSC-CM typu WT (LQT1corr) oraz z zespołem wydłużonego odstępu QT typu 1 (LQT1R190Q). Zacieniowane obszary pokazują, że ta sama zmiana odstępu RR powoduje większą zmianę odstępu QT w linii z chorobą LQT1, co prawdopodobnie zwiększa podatność na arytmię. (B) Zależność między niepoprawionymi odstępami QT i RR zmierzonymi za pomocą MEA w CM z 7 różnych linii hPSC. Efekt korekty QT według wzorów Bazetta (C) lub Fridericii (D) jest przedstawiony i widoczny jako zmiana nachylenia zależności między odstępami QT-RR. Ryciny zaadaptowano z literatury30. Kliknij tutaj, aby wyświetlić rycinę w większym rozmiarze.

Rycina 11: Zmiany odstępów QT i RR wywołane chorobą lub lekiem. (A) Przykład wydłużenia odstępu QT w hPSC-CM pochodzących od pacjenta z mutacją zespołu wydłużonego QT (LQTS) w porównaniu z izogeniczną kontrolą WT. (B) Przykład wydłużenia odstępu QT w hPSC-CM po farmakologicznej blokadzie hERG. (C) Skrócenie odstępu QT po zastosowaniu rosnących dawek aktywatora hERG. Strzałka wskazuje kierunek skracania. (D) Przykład wywołanego lekiem skrócenia odstępu RR. Panel (C) został opracowany na podstawie referencji30. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.
| Pożywka LI-BPEL (low-insulin, BSA, polyvinylalcohol, essential lipids) |
| Komponent | Ilość na 100 ml |
| IMDM | 43 ml |
| F12 | 43 ml |
| 2-fosforan kwasu askorbinowego (5 mg/ml w wodzie destylowanej) | 1 mL |
| Suplement do hodowli komórkowych (bezpośredni zamiennik L-glutaminy) | 1 ml |
| Penicylina/Streptomycyna | 0,5 mL |
| Czerwony fenol | 1 mg |
| Bezbiałkowe Pożywka dla Hybridomów-II (PFHMII) | 5 ml |
| BSA (10% m/v w IMDM) | 2,5 ml |
| PVA (5% masy/obj. w wodzie destylowanej) | 2,5 mL |
| Chemicznie zdefiniowany koncentrat lipidowy (CDLC) | 1 mL |
| Insulina-Transferryna-Selen-Etanoloamina (ITS-X) 100X | 0,1 ml |
| $\alpha$-monotioglicerol (13 µL w 1 ml IMDM) | 0,3 ml |
| Połączyć odczynniki i przefiltrować za pomocą 0.22 µm przefiltrować przez filtr porowy i przechowywać pożywkę w 4 °C do 2 tygodni. |
Tabela 1: Skład pożywki Li-BPEL.