Jeden dzień po dysocjacji i wysiewaniu warstwa hPSC-CM będzie widoczna jako gęsta, biała błona pokrywająca środek komory MEA (Rysunek 3A). Po zdjęciu pierścienia (Rycina 3B), warstwa powinna pozostać na swoim miejscu, a oględziny pod mikroskopem świetlnym wykażą, że elektrody MEA są pokryte (kurczącą się) warstwą hPSC-CM (Rycina 3C). Ze względu na fizyczne i elektryczne sprzężenie komórek, do analizy zostanie użyta tylko jedna elektroda (elektroda złota).
Alternatywnie, podczas pracy ze strukturami 3D, takimi jak ciała embrionalne lub mikrotkanki, można je wysiewać w taki sposób, aby były one odizolowane fizycznie i elektrycznie. Inspekcja wizualna pod mikroskopem mogłaby potwierdzić brak fizycznego połączenia między klastrami, a niesynchronizowane fale R w MEA potwierdzają brak sprzężenia elektrycznego. W takim przypadku można analizować wiele niezależnych elektrod.
Typowe zapisy śladów FP przedstawiono na Rysunku 4. W szczególności, ślad dobrej jakości można zdefiniować poprzez obecność wyraźnego piku odpowiadającego napływowi Na+ i depolaryzacji błony (pik R/Q), wyraźnej fazy repolaryzacji odpowiadającej odpływowi K+ (pik T) oraz wysokiego stosunku sygnału do szumu (Rysunek 4A, lewa strona: zwrócić uwagę na skalę osi y oraz Rysunek 4B). Ślady złej jakości (Rysunek 4A, środek) mogą być wynikiem braku przywierania hPSC-CM do płytki MEA lub słabej aktywności elektrycznej hPSC-CM. Odczekanie 1–3 dni w celu lepszego przywierania może poprawić sygnał; jednak, jeśli nie jest widoczna poprawa sygnału, zaleca się wykluczenie tej MEA z eksperymentów. Zaszumione ślady (Rysunek 4A, prawa strona) można analizować po zastosowaniu filtracji.
Prawidłową analizę odstępu RR można potwierdzić poprzez wizualną inspekcję ekranu wyświetlającego detekcję szczytów (Rysunek 5A, 5B). W przedziale czasowym wyznaczonym przez kursory pionowe powinny znajdować się niebieskie oznaczenia odpowiadające każdemu szczytowi. W przypadku, gdy program nie zidentyfikuje jednego lub więcej szczytów, należy spróbować przesunąć kursor poziomy i ponownie uruchomić analizę lub dostosować ustawienia detekcji. Analogicznie, prawidłową analizę odstępu QT można potwierdzić poprzez wizualną inspekcję ekranu wyświetlającego detekcję FP (Rysunek 7). W przedziale czasowym wyznaczonym przez kursory pionowe powinny znajdować się niebieskie oznaczenia odpowiadające każdej detekcji FP. Jeśli program nie zidentyfikuje jednego lub więcej FP, należy spróbować ponownie zdefiniować szablon FP (Rysunek 6) lub dostosować ustawienia detekcji i ponownie uruchomić analizę.
Wyekstrahowane pojedyncze zapisy FP lub ich średnia (Rysunek 8) mogą być wykorzystane do wyznaczenia wartości odstępu QT przy zastosowaniu konkretnych ustawień, zgodnie z Rysunkiem 9. Zaleca się analizę zależności QT-RR, która jest istotna w przypadku linii hPSC zmutowanych oraz WT (Rysunek 10A), a także w celu oceny konieczności i/lub efektu korekcji odstępu QT (Rysunek 10B-10D). hPSC-CM niosące mutacje wywołujące LQTS wykazują wydłużone odstępy QT w porównaniu z kontrolą WT (Rysunek 1A). Leczenie hPSC-CM blokerem hERG skutkuje wydłużeniem odstępu QT (Rysunek 1B); przeciwnie, zastosowanie aktywatora hERG prowadzi do skrócenia odstępu QT (Rysunek 1C). Wreszcie, podawanie leków wpływających na częstotliwość skurczów hPSC-CM powinno być widoczne jako zmiana odstępu RR (Rysunek 1D, skrócenie odstępu RR).

Rysunek 1: Sterylizacja i powlekanie chipów MEA. (A) Schemat przedstawiający proces sterylizacji, obejmujący umieszczenie chipa MEA w autoklawowalnej szklanej szalce Petriego, zawinięcie w folię aluminiową, sterylizację parową przez 6 min oraz naświetlanie promieniami UV przez 30 min. (B) Widok z góry (panel lewy) i z boku (panel środkowy) specjalnie wykonanego pierścienia z PTFE; pierścień posiada średnicę zewnętrzną 1,2 cm, w tym 4 wypustki umożliwiające jego pozycjonowanie w centrum chipa MEA, natomiast średnica wewnętrzna wynosi 0,4 cm (panel prawy). (C) Schemat przedstawiający przygotowanie chipa MEA, obejmujący umieszczenie chipa w standardycznej plastikowej szalce Petriego, dodanie 8 ml wody dejonizowanej poza komorą MEA, umieszczenie pierścienia PTFE na środku komory oraz pokrycie macierzy elektrod fibronektyną. Po czasie inkubacji fibronektyna zostaje usunięta i zastąpiona pożywką hodowlaną. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Dysocjacja i wysiewanie hPSC-CM. Schemat przedstawiający procesy dysocjacji enzymatycznej hPSC-CM, wirowania, resuspensji oraz wysiewania na środku komory MEA. Aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury, kliknij tutaj.

Rysunek 3: Chipy MEA z warstwą hPSC-CM. (A) Widoki z góry chipa MEA zawierającego pierścień oraz warstwę hPSC-CM. (B) widok z boku układu MEA po usunięciu pierścienia. (C) Obraz w jasnym polu warstwy hPSC-CMs wysianej na matrycy mikroelektrod; powiększenie 4X. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Rejestracja MEA dla hPSC-CM. (A) Reprezentatywne zapisy zarejestrowane za pomocą MEA, przedstawiające zapis dobrej jakości z wyraźnie widocznymi pikami R/Q i T oraz wysokim stosunkiem sygnału do szumu (po lewej), zapis złej jakości bez wyraźnie widocznych pików R/Q i T (w środku) oraz zapis zaszumiony z wyraźnie widocznymi pikami R/Q i T, lecz niskim stosunkiem sygnału do szumu (po prawej). (B) Reprezentatywne przykłady wysokiej jakości zapisów FP o różnej morfologii, które mogą zostać zarejestrowane podczas eksperymentów z użyciem MEA i hPSC-CM. Zacieniowany obszar przedstawia odstęp QT zmierzony podczas analizy. Ponieważ sygnał FP w MEA przypomina pierwszą pochodną potencjału czynnościowego28obliczyliśmy całkę z zapisu FP, przedstawioną jako czerwona przerywana linia, jako teoretyczną demonstrację wyboru fali T zbliżonego do całkowitej repolaryzacji potencjału czynnościowego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 5: Obliczanie odstępu RR. (APrzykład analizy odstępów RR z automatyczną detekcją szczytów (góra) i ekstrakcją danych (dół) przy użyciu oprogramowania analitycznego (patrz Tabela materiałów). Kursory pionowe wyznaczają interesujący przedział czasowy, a kursor poziomy przecina wszystkie zdarzenia, które zostały wykryte i zidentyfikowane niebieskimi znacznikami.B) Powiększona kolumna przedstawia wyekstrahowane dane wykorzystane do obliczenia odstępu RR. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.

Rysunek 6: Tworzenie szablonu FP. Przykład wyboru szablonu przy użyciu kursorów pionowych umieszczonych przed i po pojedynczym FP. Szablon ten jest wykorzystywany do automatycznej identyfikacji FP. Proszę kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 7: Automatyczna identyfikacja matrycy FP. Przykład wyszukiwania wzorca w przedziale ograniczonym dwoma kursorami pionowymi. Wszystkie wykryte zdarzenia są oznaczone niebieskimi markerami i automatycznie nałożone na siebie na wstawce. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 8: Ilościowe określenie parametrów FP. Analiza zapisanych zdarzeń, w których szczyt R został zidentyfikowany ręcznie w obrębie dwóch pierwszych kursorów, a szczyt T został zidentyfikowany ręcznie w obrębie dwóch ostatnich kursorów. Aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny, kliknij tutaj.

Rysunek 9: Okno analizy. Parametry użyte w oknie Statystyki w celu wykrycia szczytu R. W celu wykrycia szczytu T należy zmienić kursory i (jeśli to konieczne) polaryzację. Aby wyświetlić tę figurę w powiększeniu, kliknij tutaj.

Rysunek 10: Zależność QT-RR. (A) Przykład różnic w zależności między odstępami QT i RR u osobników WT (LQT1korelacja) i zespół wydłużonego odstępu QT typu 1 (LQT1R190Q) hPSC-CMs. Zakreślone obszary wskazują, że ta sama zmiana w odstępie RR generuje większą zmianę w odstępie QT w linii chorobowej LQT1, co prawdopodobnie zwiększa podatność na arytmię. (B) Zależność między niekorygowanymi odstępami QT i RR zmierzonymi za pomocą MEA w kardiomiocytach (CMs) pochodzących z 7 różnych linii hPSC. Efekt korekty QT według wzoru Bazetta (C) lub Fridericii (D) formuła jest pokazana i widoczna jako zmiana nachylenia zależności między odstępem QT a RR. Rysunki zaadaptowano z literatury30. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 1: Zmiany odstępu QT i RR wywołane chorobą lub lekami. (APrzykład wydłużenia odstępu QT w kardiomiocytach pochodzących z ludzkich pluripotencjalnych komórek macierzystych (hPSC-CM) wyizolowanych od pacjenta z mutacją powodującą zespół wydłużonego QT (LQTS) w porównaniu z izogeniczną kontrolą typu dzikiego (WT).B) Przykład wydłużenia odstępu QT w hPSC-CM po farmakologicznym zablokowaniu kanałów hERG. (C) Skrócenie odstępu QT po zastosowaniu zwiększających się dawek aktywatora kanałów hERG. Strzałka wskazuje kierunek skrócenia. (D) Przykład wywołanego lekiem skrócenia odstępu RR. Panel (C) został opracowany na podstawie źródła30. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.
| Pożywka LI-BPEL (niska zawartość insuliny, BSA, alkohol poliwinylowy, lipidy niezbędne) |
| Komponent | Ilość na 10 ml |
| IMDM | 43 ml |
| F12 | 43 ml |
| 2-fosforan kwasu askorbinowego (5 mg/ml w wodzie destylowanej) | 1 ml |
| Suplement do hodowli komórkowych (bezpośredni zamiennik L-glutaminy) | 1 mL |
| Penicylina/Streptomycyna | 0,5 ml |
| Czerwony fenol | 1 mg |
| Bezbiałkowe pożywka dla hybridomów-II (PFHMII) | 5 ml |
| BSA (10% mas./obj. w IMDM) | 2,5 ml |
| PVA (5% wag./obj. w wodzie destylowanej) | 2,5 ml |
| Chemicznie zdefiniowany koncentrat lipidowy (CDLC) | 1 ml |
| Insulina-Transferryna-Selen-Etanoloamina (ITS-X) 10X | 0,1 ml |
| $\alpha$-monotioglicerol (13 µL w 1 ml IMDM) | 0,3 ml |
| Połączyć odczynniki, przefiltrować za pomocą 0.22 µm przefiltrować przez filtr porowy i przechowywać medium w temperaturze 4 °C przez maksymalnie 2 tygodnie. |
Tabela 1: Skład pożywki Li-BPEL.