Ogólnym celem tego protokołu jest synteza funkcjonalnych nanosensorów do przenośnego, opłacalnego i szybkiego wykrywania specyficznie ukierunkowanych bakterii chorobotwórczych poprzez połączenie relaksacji magnetycznej i emisji fluorescencji.
Method Article
Ogólnym celem tego protokołu jest synteza funkcjonalnych nanosensorów do przenośnego, opłacalnego i szybkiego wykrywania specyficznie ukierunkowanych bakterii chorobotwórczych poprzez połączenie relaksacji magnetycznej i emisji fluorescencji.
Enterokrwotoczna Escherichia coli O157:H7 została powiązana zarówno z chorobami przenoszonymi przez wodę, jak i przez żywność, i pozostaje zagrożeniem, pomimo stosowanych obecnie metod badania żywności i wody. Podczas gdy konwencjonalne metody wykrywania bakterii, takie jak reakcja łańcuchowa polimerazy (PCR) i testy immunoenzymatyczne (ELISA), mogą specyficznie wykrywać zanieczyszczenia chorobotwórcze, wymagają one intensywnego przygotowania próbki i długich okresów oczekiwania. Ponadto praktyki te wymagają wyrafinowanych przyrządów i ustawień laboratoryjnych i muszą być wykonywane przez przeszkolonych specjalistów. W niniejszym dokumencie zaproponowano protokół prostszej techniki diagnostycznej, która charakteryzuje się unikalnym połączeniem parametrów magnetycznych i fluorescencyjnych w platformie opartej na nanocząstkach. Proponowane wieloparametryczne nanoczujniki magnetofluorescencyjne (MFnS) mogą wykrywać zanieczyszczenie E. coli O157:H7 przy obecności zaledwie 1 jednostki tworzącej kolonie w roztworze w czasie krótszym niż 1 godzina. Ponadto zweryfikowano zdolność MFnS do zachowania wysokiej funkcjonalności w złożonych mediach, takich jak mleko i woda z jeziora. Zastosowano również dodatkowe testy swoistości, aby zademonstrować zdolność MFnS do wykrywania tylko określonych bakterii docelowych, nawet w obecności podobnych gatunków bakterii. Połączenie modalności magnetycznej i fluorescencyjnej pozwala na wykrywanie i kwantyfikację zanieczyszczenia patogenami w szerokim zakresie stężeń, wykazując wysoką skuteczność zarówno we wczesnym, jak i późnym etapie wykrywania zanieczyszczeń. Skuteczność, przystępność cenowa i przenośność MFnS sprawiają, że są one idealnym kandydatem do badań przesiewowych pod kątem zanieczyszczeń bakteryjnych w miejscu opieki nad pacjentem w szerokim zakresie zastosowań, od zbiorników wodnych po żywność pakowaną komercyjnie.
Uporczywe występowanie skażenia bakteryjnego zarówno w komercyjnie produkowanych źródłach żywności, jak i wody stworzyło zapotrzebowanie na coraz szybsze i bardziej specyficzne platformy diagnostyczne. 1,2 Niektóre z najczęstszych zanieczyszczeń bakteryjnych odpowiedzialnych za zanieczyszczenie żywności i wody pochodzą z rodzajów Salmonella, Staphylococcus, Listeria, Vibrio, Shigella, Bacillus i Escherichia. 3,4 Skażenie bakteryjne tymi patogenami często powoduje objawy takie jak gorączka,, zapalenie żołądka i jelit oraz biegunka. 4 Zanieczyszczenie źródeł wody często ma drastyczne i negatywne skutki dla społeczności bez dostępu do wystarczająco przefiltrowanej wody, a zanieczyszczenie żywności doprowadziło do dużej liczby chorób i prób wycofania produktu. 5,6
Aby zmniejszyć występowanie chorób spowodowanych skażeniem bakteryjnym, podjęto szereg wysiłków w celu opracowania metod, dzięki którym woda i żywność mogą być efektywnie skanowane przed sprzedażą lub spożyciem. 3 Techniki takie jak PCR,1,7,8,9,10 ELISA,11,12 amplifikacja izotermiczna za pośrednictwem pętli (LAMP),13,14 między innymi,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24 są ostatnio używane do wykrywania różnych patogenów. W porównaniu z tradycyjnymi metodami hodowli bakteryjnej, techniki te są znacznie bardziej skuteczne pod względem specyficzności i czasu. Jednak techniki te nadal zmagają się z wynikami fałszywie dodatnimi i ujemnymi, skomplikowanymi procedurami i kosztami. 1,3,25 Właśnie z tego powodu wieloparametryczne magnetofluorescencyjne nanoczujniki (MFnS) są proponowane jako alternatywna metoda wykrywania bakterii.
Te nanosensory unikalnie łączą ze sobą modalności relaksacji magnetycznej i fluorescencji, co pozwala na stworzenie platformy podwójnej detekcji, która jest zarówno szybka, jak i dokładna. Wykorzystując E. coli O157:H7 jako zanieczyszczenie próbki, wykazano zdolność MFnS do wykrycia zaledwie 1 jtk w ciągu kilku minut. Przeciwciała specyficzne dla patogenu są stosowane w celu zwiększenia swoistości, a połączenie modalności magnetycznej i fluorescencyjnej pozwala na wykrywanie i ilościowe określanie zanieczyszczeń bakteryjnych zarówno w zakresie niskiego, jak i wysokiego zanieczyszczenia. 16 W przypadku skażenia bakteryjnego, nanosensory będą roić się wokół bakterii ze względu na zdolność przeciwciał specyficznych dla patogenu do celowania. Wiązanie między magnetycznymi nanoczujnikami a bakteriami ogranicza interakcję między magnetycznym rdzeniem żelaza a otaczającymi go protonami wody. Powoduje to wydłużenie czasu relaksacji T2, rejestrowanego przez relaksometr magnetyczny. Wraz ze wzrostem stężenia bakterii w roztworze nanoczujniki rozpraszają się wraz ze wzrostem liczby bakterii, co skutkuje niższymi wartościami T2. I odwrotnie, emisja fluorescencji będzie rosła proporcjonalnie do stężenia bakterii, ze względu na zwiększoną liczbę nanoczujników bezpośrednio związanych z patogenem. Wirowanie próbek i izolacja osadu bakteryjnego pozwoli zachować tylko nanocząstki bezpośrednio przyczepione do bakterii, usuwając wszelkie swobodnie unoszące się nanoczujniki i bezpośrednio korelując emisję fluorescencji z liczbą bakterii obecnych w roztworze. Schematyczne przedstawienie tego mechanizmu przedstawiono na rysunku 1.
Ta platforma MFnS została zaprojektowana z myślą o badaniach przesiewowych w miejscu opieki nad pacjentem, co skutkuje tanimi i przenośnymi cechami. MFnS są stabilne w temperaturze pokojowej i są wymagane tylko w bardzo niskich stężeniach do dokładnego wykrywania zanieczyszczeń bakteryjnych. Ponadto po syntezie korzystanie z MFnS jest proste i nie wymaga korzystania z przeszkolonych specjalistów w tej dziedzinie. Wreszcie, ta platforma diagnostyczna pozwala na wysoce konfigurowalne targetowanie, zapewniając środki, za pomocą których ta jedna platforma może być używana do wykrywania wszelkiego rodzaju patogenów w wielu różnych ustawieniach.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
1.Synteza i funkcjonalizacja wieloparametrycznych magnetofluorescencyjnych nanosensorów (MFnS).
2. Hodowla bakterii i przygotowanie roztworu podstawowego
3. Szybkie wykrywanie E. coli O157:H7 za pomocą MFnS
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Mechanizm działania MFnS jest reprezentowany w Rysunek 1. Grupowanie MFnS wokół powierzchni zanieczyszczeń bakteryjnych zakłóca interakcje między rdzeniami magnetycznymi MFnS a otaczającymi jądrami wodoru. W wyniku tego grupowania wzrastają wartości relaksacji magnetycznej. Wraz ze wzrostem stężenia zanieczyszczeń bakteryjnych zmniejsza się grupowanie, a zmiana wartości T2 maleje. Dlatego kluczowe znaczenie ma dodanie metody fluorescencyjnej. Wraz ze wzrostem stężenia bakterii wzrasta siła s...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Protokół ten został zaprojektowany tak, aby w pełni funkcjonalny MFnS był tak prosty, jak to tylko możliwe. Istnieje jednak wiele kluczowych punktów, w których zmiana protokołu może być przydatna, w zależności od końcowego celu użytkownika. Na przykład zastosowanie różnych przeciwciał pozwoliłoby na celowanie w wiele innych patogenów. Ponadto protokół ten nie ogranicza się do stosowania przeciwciał jako cząsteczek docelowych. Każda cząsteczka, która ma specyficzne powinowactwo wiązania do...
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Wykazane zastosowanie tej nanotechnologii nie zostało jeszcze zatwierdzone przez FDA.
Ta praca jest wspierana przez K-INBRE P20GM103418, Kansas Soybean Commission (KSC/PSU 1663), ACS PRF 56629-UNI7 i PSU polymer chemistry startup fund, wszystkie do SS. Dziękujemy kamerzyście uniwersyteckiemu, panu Jacobowi Anselmiemu, za jego wyjątkową pracę nad filmem. Dziękujemy również Panu Rogerowi Heckertowi i Pani Kathie Heckert za ich hojne wsparcie dla badań.
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| Czterowodny chlorek żelaza | Fisher Scientific | I90-500 | |
| Sześciowodny chlorek żelaza | Fisher Scientific | I88-500 | |
| Wodorotlenek amonu | Fisher Scientific | A669S-500 | |
| Kwas solny | Fisher Scientific | A144S-500 | |
| Kwas poliakrylowy | Sigma-Aldrich | 323667-100G | |
| EDC | Thermofisher Scientific | 22980 | |
| NHS | Fisher Scientific AC157270250 | ||
| Przeciwciało anty-E. coli O111 | sera care | 5310-0352 | |
| Przeciwciało anty-E. coli O157:H7 [P3C6] | Abcam | ab75244 | |
| DiI Stain | Fisher Scientific | D282 | |
| Bulion odżywczy | Difco | 233000 | |
| Liofilizowany granulat E. coli O157:H7 ATCC | 700728 | ||
| Magnetyczny relaksomteter | Bruker | mq20 | |
| Zetasizer | Malvern | NANO-ZS90 | |
| Tecan | Infinite M200 PRO | ||
| Wirówka QuadroMACS | 130-090-976 | ||
| Wirówka serii Eppendorf | 5804 | ||
| (accuSpin Micro 17) | Fisher Scientific | 13-100-676 | |
| Inkubator z wytrząsaniem modelu podłogowego | SHEL LAB | SSI5 | |
| Waga analityczna | Metler Toledo | ME104E | |
| Cyfrowy mieszalnik wirowy | Fisher Scientific | 02-215-370 | |
| Otwarta huśtaczka | Fisher Scientific | 02-217-765 |
Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission