Ostatnie badania wykazały rolę zmian w pH podczas różnicowania komórkowego i dysplazji in vivo1,2. Badania te wykazały, że pH jest niezwykle spójne w komórkach tego samego typu na tym samym etapie różnicowania, ale zmienia się, gdy komórki przechodzą z jednego etapu do drugiego. W niektórych przypadkach blokowanie zmian w pH częściowo zaburza różnicowanie, co sugeruje, że zmiana pH nie jest tylko konsekwencją zmian w losie komórki, ale zamiast tego pomaga promować zmianę losu komórki, być może poprzez wpływ na wrażliwe na pH białka regulatorowe lub reakcje chemiczne wymagane do różnicowania. Przyszłe badania mogą przynieść więcej informacji na temat wielu różnych ról dynamiki pH in vivo. Jednak jednym z wyzwań związanych z badaniem pH podczas różnicowania in vivo jest uzyskanie dokładnych pomiarów pHi. W przeciwieństwie do innych cech różnicowania, takich jak zmiany w morfologii komórek i ekspresji genów, pH jest labilną właściwością chemiczną komórki, która nie jest zachowana w komórkach, które zostały utrwalone i przepuszczalne standardowymi metodami. Ponadto pH może nie być stabilne w komórkach, które są zestresowane lub umierają w wyniku eksperymentalnej manipulacji. Dlatego ważne jest, aby podczas pomiaru pH komórki były żywe i tak zdrowe, jak to tylko możliwe. Dostępnych jest kilka ważnych barwników, które dobrze sprawdzają się w pomiarze pH komórek w hodowli3, ale w wielu przypadkach nie nadają się do badań in vivo, ponieważ nie wnikają w tkankę wystarczająco głęboko lub równomiernie, aby zapewnić dokładne pomiary.
Aby obejść problem słabej penetracji barwnika, my i inni użyliśmy genetycznie kodowanej sondy, mCherry::p Hluorin4,5,6,7, który może być wyrażony w interesujących typach komórek i zobrazowany w żywej tkance. pHluorin to wariant GFP o wyższym pKa (~ 7,0 vs. ~ 4,0), który łatwiej się fałduje przy wyższym pH; więc całkowita Intensywność fluorescencji emitowanej z populacji cząsteczek pHluorin w komórce wzrasta wraz ze wzrostem pHi8. Co ważne, fluorescencja jest liniowa w normalnym cytozolowym zakresie wartości pHi. Natomiast fluorescencja mCherry (pKa ~ 4,5) jest niewrażliwa na zmiany pH w zakresie cytozolowym. Te dwa reportery są kowalencyjnie połączone ze sobą jako pojedyncze białko chimeryczne, kodowane przez pojedynczą otwartą ramkę odczytu, dzięki czemu są zawsze obecne w równych ilościach. Dlatego stosunek intensywności fluorescencji pHluorin do mCherry zapewnia pomiar pHi, który jest znormalizowany do stężenia sondy w każdej komórce. Współczynniki można następnie przekonwertować na oszacowania wartości pH za pomocą krzywej standardowej, która jest generowana przez uzyskanie stosunków pHluorin do mCherry z tkanek, które zostały zrównoważone do znanych wartości pH.
Tutaj opisujemy metody użycia mCherry::p Hluorin do pomiaru pH nabłonkowej linii FSC w jajniku Drosophila. Ta dobrze scharakteryzowana tkanka została wykorzystana do modelowania wielu różnych aspektów biologii nabłonka, takich jak samoodnawianie i różnicowanie komórek macierzystych9,10,11, kolektywna migracja komórek12, oraz rozwój i utrzymanie polaryzacji komórek13,14. Nabłonek mieszków włosowych jest wytwarzany przez dwa FSC, które znajdują się na przedniej krawędzi tkanki w strukturze zwanej germarium15,16. Komórki te dzielą się regularnie w wieku dorosłym, aby samoodnawiać się i wytwarzać potomstwo, zwane komórkami prepęcherzykowymi (pFC), które mogą ponownie wejść do niszy i stać się FSC lub różnicować się w jeden z trzech różnych typów komórek pęcherzykowych: komórki polarne, komórki łodygi lub komórki pęcherzykowe głównego ciała. Wykazaliśmy wcześniej, że w tkance typu dzikiego pH stale wzrasta we wczesnych stadiach różnicowania, od pH około 6,8 w FSC do 7,0 w pFC, do 7,3 w komórkach pęcherzykowych2. Zablokowanie tego wzrostu przez knockdown RNAi wszechobecnie eksprymowanego wymieniacza sód/proton, DNhe2, poważnie upośledza różnicowanie pFC, podczas gdy zwiększenie pHi przez nadekspresję DNhe2 powoduje łagodny fenotyp nadmiernego różnicowania. Wyniki te pokazują, że pH jest stabilnie utrzymywane we wczesnej linii FSC i że może być eksperymentalnie zwiększane lub zmniejszane in vivo. Opisane tutaj metody mogą być stosowane do pomiaru pH w tkance typu dzikiego lub różnych formach zmutowanych tkanek, w tym knockdown lub nadekspresji RNAi przy użyciu interesującego Gal4 i klonów mitotycznych.