$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Transport jonów i substancji rozpuszczonych przez błonę plazmatyczną jest niezbędny dla przetrwania komórek, a co za tym idzie, organizmów1. Selektywny transport jonów i substancji rozpuszczonych jest osiągany przez szereg wyspecjalizowanych białek kanałowych i transportowych. Mutacje w tych białkach często prowadzą do różnych stanów klinicznych, co sprawia, że białka kanałowe i transportowe stają się potencjalnymi celami leczenia farmakologicznego1. Niestety, zrozumienie mechanizmów leżących u podstaw funkcji i regulacji kanałów i transporterów jest często ograniczone przez dostępne podejścia do badania ich aktywności2,3,4.
Konkretnie, transportery można z grubsza podzielić na dwie duże grupy w zależności od tego, czy zmieniają potencjał transbłonowy komórki podczas transportu substancji rozpuszczonych: zmieniające się transportery jonów elektrogenicznych [np. kotransporter sodowo-fosforanowy 2a (NaPi2a), wymiennik sodowo-wapniowy (NCX), itp.] lub niezmieniające się transportery jonów elektroneutralnych [np. wymiennik sodowo-protonowy (NHE), kotransporter sodowo-chlorkowy, NaPi2c, itp.]. Aktywność obu klas transporterów została szeroko przebadana przy użyciu wychwytu izotopów promieniotwórczych i barwników fluorescencyjnych przenikających błonę2. Oba podejścia szacują aktywność transporterów poprzez pomiar zmian w stężeniu masowym określonych jonów cytoplazmatycznych i obie metody mają ograniczenia, takie jak umiarkowana czułość i rozdzielczość czasowa oraz niewystarczająca kontrola środowiska wewnątrzkomórkowego. Rzeczywiście, aktywność wielu transporterów zależy od stężenia cytoplazmatycznego przenoszonych jonów (np. NHE3, NCX), a oczekuje się, że zmiany tych stężeń jonów będą odgrywać znaczącą rolę w regulacji aktywności transportera2,3,5. Precyzyjny pomiar tych mechanizmów regulacyjnych jest ograniczony przy użyciu klasycznych metod.
Aby przezwyciężyć te ograniczenia, do badania aktywności transportera stosuje się metody zaciskania krosowego2,6. W szczególności samoreferencyjne elektrody jonoselektywne (ISE)7,8 w połączeniu z systemem zaciskania krosówek umożliwiły ostatnio pomiar aktywności transportera elektroneutralnego3,4,5. ISE opierają się na fakcie, że aktywność transportera tworzy gradient jonów w bliskiej odległości od błony komórkowej. ISE poruszający się w górę i od błony komórkowej w powtarzalny, oscylacyjny sposób rejestruje różnicę napięcia (μV). Różnice napięć można przekształcić w wartości strumienia jonów za pomocą metody kalibracji, która stosuje pierwszą zasadę dyfuzji Ficka2,9. Podczas gdy ISE są używane do wykrywania strumienia jonów wychodzących z komórek, metoda patch clamp zarówno w konfiguracjach całej komórki, jak i na lewą stronę jest stosowana do kontrolowania potencjału błonowego i wewnątrzkomórkowego składu jonów. Co więcej, zastosowanie techniki giant patch clamp pozwala na modyfikację wewnątrzkomórkowego składu nie tylko jonów, ale także lipidów i białek3,5.
Podsumowując, wszechstronność metody zaciskania krostek w porównaniu z innymi metodami do badania aktywności transportera sprawiła, że zaciskanie łat jest odpowiednie do przezwyciężenia typowych ograniczeń tych innych metod. Połączenie samoreferencyjnych ISE i technik patch clamp oferuje unikalną możliwość pomiaru aktywności transporterów elektroneutralnych w ściśle kontrolowanym środowisku eksperymentalnym oraz odkrycia nowych biofizycznych i molekularnych właściwości transportu błony komórkowej3,4,5. Podejście to zostało z powodzeniem wykorzystane do badania aktywności NHE. Rodzina białek NHE ssaków katalizuje elektroneutralną wymianę netto zewnątrzkomórkowego sodu (Na+) na wewnątrzkomórkowy proton (H+)10,11 wykorzystując wewnętrzny gradient Na+. U ssaków rodzina białek NHE obejmuje 11 pokrewnych białek (NHE1-9 i NHA1-2) oraz specyficzne dla plemników NHE10,12,13.
NHE (rodzina SLC9a) są powszechnie spotykane w większości organizmów żywych, od prostych prokariontów do wyższych eukariontów i są zaangażowane w różne funkcje życiowe komórek10,11, w tym kontrolowanie obrony komórek przed zasoleniem u prokariontów, utrzymywanie homeostazy kwasowo-zasadowej i objętości komórek oraz regulowanie wchłaniania soli i wody w różnych wyspecjalizowanych nabłonkach10,12,14,15. Kluczowe role biologiczne NHE i znaczenie ich funkcji zostały określone w kilku badaniach; jednak niewiele badań dotyczyło biofizycznych i molekularnych właściwości NHE ssaków ze względu na ograniczenia metodologiczne4. Niedawne zastosowanie samoreferencyjnych ISE podczas zaciskania łatek w całych komórkach ujawniło nowe mechanizmy molekularne izoform NHE regulowanych przez zmiany w wewnątrzkomórkowych stężeniach jonów, białek i fosfolipidów3,4.
W szczególności, protokół zawarty w tym manuskrypcie przedstawia metody i podejścia do badania aktywności i regulacji izoformy NHE 3 (NHE3), głównego gracza w absorpcji Na+, Cl-, HCO3- i płynu w błonie granicznej nabłonka nerek i jelit14,16. Przedstawiono nowe informacje na temat różnic we wrażliwości aktywności NHE3 na wewnątrzkomórkowe fosfoinozytydy (4,5-bisfosforan fosfatydyloinozytylu [PI(4,5)P2] i fosfatydyloinozytod 3,4,5-trifosforan [PI(3,4,5]P3]). Białka transportu komórkowego, takie jak kanały i transportery, są regulowane przez fosfoinozytydy17, a NHE3 bezpośrednio wiąże zarówno PI(4,5)P2, jak i PI(3,4,5)P318. Opierając się na aktualnej literaturze, fosfoinozytyd może być istotny dla fizjologicznej lub patofizjologicznej regulacji NHE35,18,19. Nasze odkrycia potwierdzają odrębne role PI(4,5)P2 i PI(3,4,5)P3 w regulacji aktywności NHE3. To rozróżnienie było możliwe dzięki zastosowaniu technik ISE w połączeniu z nagrywaniem z użyciem clampu krosowego całej komórki. Technika ta umożliwia również kontrolę zawartości komórkowej fosfoinozytolu poprzez wewnątrzkomórkową perfuzję różnych fosfoinozytydów podczas pomiaru aktywności NHE3.