$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Określenie bezwzględnej ilości dowolnego białka, w tym białka CAPG w tkance myszy, wymaga standardowo zarówno specyficznego przeciwciała, jak i oczyszczonego białka. Przed przeprowadzeniem jakiejkolwiek analizy na dużą skalę należy również ustalić liniowy zakres analiz zarówno wzorca białka, jak i lizatów. Liniowy zakres przeciwciała jest w dużym stopniu zależny od przeciwciała jako takiego, a odpowiedni zakres rozcieńczenia określonego przeciwciała musi być zweryfikowany przez każdego indywidualnego użytkownika.
Najpierw określiliśmy specyficzność przeciwciała CAPG w tkankach nerki, śledziony i prostaty myszy, korzystając z analizy western blot z kontrolą negatywną (IgG free BSA) i kontrolą pozytywną (komercyjnie dostępne białko CAPG) (Rysunek 1A). Przeciwciało anty-CAPG było swoiste przeciwko lizatom ze śledziony myszy, serca, mięśni i prostaty (wykryto jedno prążko). Niespecyficzne prążki obserwowano w lizatach z nerek i wątroby. Jednak w lizacie nerkowym niespecyficzne prążki były znacznie słabsze niż swoiste prążki, co sugeruje, że przeciwciało nadaje się do analizy tkanki nerkowej. Następnie określono liniowy zakres wzorca białka i ilość lizatów do analiz za pomocą dwóch równoległych krzywych dawki. Komercyjnie dostępne białko CAPG było seryjnie rozcieńczane, jak wskazano w Tabeli 1 na podstawie naszych wcześniejszych doświadczeń, a lizaty tkankowe nerki, śledziony i prostaty myszy były również rozcieńczane w oparciu o ilość całkowitego białka w lizatach określoną przez zestaw do oznaczania białka całkowitego BCA. Dwa badania dawkowe przeprowadzono obok siebie i wykreślono razem w Rysunek 1B. Odpowiednią ilość lizatów mysich nerek, śledziony i prostaty dobrano na podstawie sygnałów QDB mierzonych przez czytnik mikropłytek w dowolnej jednostce. Oryginalny odczyt dla tego eksperymentu pokazano w tabeli 3.
W ostatnim kroku, seryjnie rozcieńczony wzorzec białka CAPG oraz lizaty z mysich nerek, śledziony i prostaty zostały załadowane na płytkę QDB. W tym przypadku zdecydowaliśmy się załadować 0,3 μg / próbkę dla lizatów z nerki i śledziony myszy oraz 1 μg / próbkę dla lizatów z analizy prostaty myszy , ponieważ na tych poziomach odczyt QDB był co najmniej 20-krotnie wyższy niż tło, podczas gdy mieścił się w liniowym zakresie analizy opartym na krzywej dawki zarówno lizatów, jak i wzorca białka. Płytka została poddana opisanemu protokołowi QDB, zanim płytka została oznaczona ilościowo bezpośrednio przez czytnik mikropłytek. Korzystając z seryjnie rozcieńczalnionego oczyszczonego białka CAPG, mogliśmy ustalić krzywą dawka-odpowiedź, równanie i R2 za pomocą prostej analizy regresji przy użyciu dostępnego oprogramowania (np. Microsoft Office Excel). Sygnały QDB z lizatów mysich nerek, śledziony i prostaty przeliczono na bezwzględną ilość białka CAPG w tych lizatach za pomocą ustalonego równania, a wyniki skorygowano o całkowitą ilość białka, w tym przypadku 0,3 μg dla lizatów z mysich śledzion, i 1 μg dla lizatów z mysiej prostaty, dla końcowego stężenia białka CAPG w tych tkankach jako pg/μg. Wyniki są pokazane w Rysunek 1C z oryginalnym odczytem pokazanym w Tabeli 4.

Rysunek 1. Reprezentatywny wynik analizy QDB w celu określenia bezwzględnych poziomów CAPG w trzech tkankach myszy (nerki, śledziona i prostata). ZA. Badanie swoistości króliczego przeciwciała anty-CAPG przy użyciu lizatów tkanek myszy przygotowanych ze śledziony, serca, mięśni, nerek, wątroby i prostaty przy użyciu analizy western blot z kontrolą ujemną (IgG wolne BSA) i kontrolą pozytywną (komercyjnie dostępne białko CAPG). B. określenie liniowego zakresu analiz QDB króliczego przeciwciała anty-CAPG z wykorzystaniem lizatów przygotowanych z prostaty, nerek, śledziony oraz z wykorzystaniem oczyszczonego rekombinowanego wzorca białka CAPG. Wyniki były średnią z trzech powtórzeń. C. Bezwzględne oznaczanie poziomów CAPG w lizatach przygotowanych z mysich nerek, śledziony i prostaty. Każdy pasek reprezentuje jedną tkankę z pojedynczej myszy. Wyniki były średnią trzykrotną. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Tabela 3: Wyniki badań dawkowania z czytnikiem mikropłytek z użyciem zarówno seryjnie rozcieńczonych, zbiorczych lizatów ze śledziony, nerek i prostaty myszy, jak i oczyszczonego rekombinowanego białka CAPG.

Tabela 4: Wynik analizy QDB z mikropłytki bezwzględnego poziomu CAPG w nerkach myszy (8), śledzionie (4) i prostacie (5) przy użyciu rekombinowanego białka CAPG jako standardu.