Oznaczenie bezwzględnej ilości dowolnego białka, w tym białka CAPG w tkance mysiej, wymaga zastosowania zarówno specyficznego przeciwciała, jak i oczyszczonego białka jako standardu. Przed przeprowadzeniem jakiejkolwiek analizy na szeroką skalę należy również ustalić zakres liniowy analiz zarówno dla standardu białka, jak i dla lizatów. Zakres liniowy przeciwciała jest silnie uzależniony od samego przeciwciała, a odpowiedni zakres rozcieńczeń specyficznego przeciwciała musi zostać zweryfikowany przez każdego użytkownika indywidualnie.
W pierwszej kolejności określono swoistość przeciwciała przeciwko CAPG w tkankach nerki, śledziony i prostaty myszy, wykorzystując analizę western blot z kontrolą negatywną (BSA wolne od IgG) oraz kontrolą pozytywną (komercyjnie dostępnego białka CAPG) (Rycina 1A). Przeciwciało anty-CAPG wykazało swoistość wobec lizatów śledziony, serca, mięśni i prostaty myszy (wykryto jeden prążek). W lizatach nerki i wątroby zaobserwowano prążki nieswoiste. Jednak w lizacie nerki prążki nieswoiste były znacznie słabsze od prążka swoistego, co sugeruje, że przeciwciało nadaje się do analizy tkanki nerkowej. Następnie, za pomocą dwóch równoległych krzywych dawkowej, wyznaczono zakres liniowy standardu białka oraz ilość lizatów do analizy. Komercyjnie dostępne białko CAPG poddano rozcieńczeniom seryjnym zgodnie z Tabelą 1, opierając się na wcześniejszych doświadczeniach, a lizaty tkanek nerki, śledziony i prostaty myszy rozcieńczono w zależności od ilości całkowitego białka w lizatach, określonej za pomocą zestawu do oznaczania całkowitego białka BCA. Dwa badania dawkowe przeprowadzono równolegle i przedstawiono wspólnie na Rycini 1B. Odpowiednią ilość lizatów nerki, śledziony i prostaty myszy wybrano na podstawie sygnałów QDB zmierzonych czytnikiem mikropłytek w jednostkach arbitralnych. Oryginalne odczyty dla tego eksperymentu przedstawiono w Tabeli 3.
W ostatnim kroku seryjnie rozcieńczony standard białka CAPG oraz lizaty z nerki, śledziony i prostaty myszy zostały naniesione na płytkę QDB. W tym przypadku zdecydowaliśmy się na naniesienie 0,3 µg/próbkę dla lizatów z nerki i śledziony myszy oraz 1 µg/próbkę dla analizy lizatów z prostaty myszy, ponieważ przy tych poziomach odczyt QDB był co najmniej 20-krotnie wyższy od tła, pozostając jednocześnie w zakresie liniowym analizy opartej na krzywej dawka-odpowiedź dla obu lizatów oraz standardu białka. Płytka została poddana opisanemu protokołowi QDB, a następnie poddana bezpośredniej kwantyfikacji za pomocą czytnika mikropłytek. Wykorzystując seryjnie rozcieńczone oczyszczone białko CAPG, mogliśmy wyznaczyć krzywą dawka-odpowiedź, równanie oraz R2 za pomocą prostej analizy regresji z wykorzystaniem dostępnego oprogramowania (np. Microsoft Office Excel). Sygnały QDB z lizatów nerek, śledzion i prostat myszy przeliczono na bezwzględną ilość białka CAPG w tych lizatach, korzystając z wyznaczonego równania, a wyniki skorygowano o całkowitą ilość białka (w tym przypadku 0,3 µg dla lizatów ze śledzion i nerek myszy oraz 1 µg dla lizatów z prostaty myszy), aby uzyskać końcowe stężenie białka CAPG w tych tkankach wyrażone jako pg/µg. Wyniki przedstawiono na Rysunku 1C, a oryginalne odczyty podano w Tabeli 4.

Rycina 1. Reprezentatywny wynik analizy QDB w celu oznaczenia bezwzględnych poziomów CAPG w trzech tkankach myszy (nerce, śledzionie i prostacie). A. Badanie specyficzności przeciwciała króliczego anty-CAPG z wykorzystaniem lizatów tkanek mysich przygotowanych ze śledziony, serca, mięśnia, nerki, wątroby i prostaty za pomocą analizy western blot z kontrolą negatywną (BSA wolna od IgG) i kontrolą pozytywną (komercyjnie dostępnym białkiem CAPG). B. Wyznaczenie zakresu liniowego analiz QDB przeciwciała króliczego anty-CAPG z wykorzystaniem lizatów przygotowanych z prostaty, nerki, śledziony oraz oczyszczonego standardu rekombinowanego białka CAPG. Wyniki stanowią średnią z trzech powtórzeń. C. Bezwzględne oznaczenie poziomów CAPG w lizatach przygotowanych z nerek, śledzion i prostat myszy. Każdy słupek reprezentuje jedną tkankę od poszczególnej myszy. Wyniki stanowią średnią z trzech powtórzeń. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Tabela 3: Wyniki z czytnika mikropłytek z badań zależności dawka-odpowiedź z wykorzystaniem seryjnie rozcieńczonych, połączonych lizatów z śledzion, nerek i prostat myszy oraz oczyszczonego rekombinowanego białka CAPG.

Tabela 4: Wyniki z czytnika mikropłytek z analizy QDB bezwzględnego poziomu CAPG w nerkach myszy (8), śledzionach (4) i prostatach (5) z użyciem rekombinowanego białka CAPG jako standardu.