Niektóre cechy morfologiczne Drosophila są zróżnicowane wśród gatunków1,2,3,4,5. Do pytania o to, w jaki sposób powstaje różnorodność morfologiczna, możemy podejść poprzez porównanie mechanizmów powstawania tych morfologii. Przykładami takich morfologii są trichomy larw, grzebienie płciowe dorosłych, zewnętrzne narządy płciowe, pigmentacja brzucha i pigmentacja skrzydeł6,7,8,9,10,11,12,13,14,15. Aby zbadać różnice morfologiczne między dorosłymi osobnikami, ważna jest obserwacja i analiza stadiów poczwarki, ponieważ los cech dorosłych osobników jest determinowany w późnych stadiach larwalnych, a późniejsza morfogeneza przebiega w okresie poczwarki.
W badaniach biologii rozwojowej Drosophila melanogaster, "godziny APF" (godziny po uformowaniu się poczwarki) to powszechna metoda oznaczania stadium poczwarki16. System ten wykorzystuje bezwzględny czas po uformowaniu się poczwarki i jest bardzo wygodny w rutynowych eksperymentach. Jednak szybkość rozwoju może się różnić między poczwarkami i mogą mieć na nią wpływ niewielkie różnice genetyczne, epigenetyczne lub mikrośrodowiskowe, a zatem ten sam bezwzględny czas po utworzeniu poczwarki nie gwarantuje, że poczwarki są na tym samym etapie rozwoju. W wielu przypadkach stadia zdefiniowane przez cechy morfologiczne są preferowane do porównywania wielu osobników. W szczególności porównanie między gatunkami wymaga precyzyjnego stopniowania i porównania między odpowiadającymi im (homologicznymi) stadiami.
Bainbridge and Bownes17 rozpoznał 20 stadiów poczwarki (od P1 do P15(ii)) na podstawie cech morfologicznych poczwarek Drosophila melanogaster. Ta klasyfikacja jest najczęściej używanym systemem morfologicznej oceny stopnia rozwoju18. W poprzednim badaniu przeprowadziliśmy ocenę stopnia zaawansowania poczwarki Drosophila guttifera, aby stworzyć podstawę do badań nad pigmentacją skrzydeł19. D. guttifera ma wzór w kropki na skrzydłach i jest jednym z gatunków modelowych do tworzenia pigmentacji skrzydeł20. Chociaż odnieśliśmy się do kryteriów morfologicznych opisanych w badaniach Bainbridge'a i Bownesa17, bezpośrednio mierzyliśmy czas trwania etapu za pomocą obserwacji seryjnych19, zamiast używać oszacowania czasu trwania etapu Bainbridge'a i Bownesa na podstawie obserwowanej częstotliwości. W tym miejscu opisujemy metodę oceny stanu poczwarki i pomiaru czasu trwania stadiów poczwarki Drosophila zastosowaną w Fukutomi et al19.
Aby zbadać mechanizm rozwoju pigmentacji skrzydeł, musimy wiedzieć, kiedy w stadium poczwarkowym lub dorosłym występuje pigmentacja. Fukutomi i wsp. 19 ilościowe określenie gęstości optycznej (OD) pigmentacji w stadium poczwarki i dorosłego osobnika poprzez analizę obrazów skrzydeł. Uważa się, że pigmentacja skrzydeł Drosophila jest spowodowana nagromadzeniem czarnej melaniny21. Do kwantyfikacji OD użyto obrazów w skali szarości i oprogramowania ImageJ (https://imagej.nih.gov/ij/)22. Aby rozpoznać i określić ilościowo pigmentację specyficzną dla plamki (ΔOD), odejmujemy OD na zewnątrz plamki od OD wewnątrz plamki. Aby metoda ta była powtarzalna i obiektywna, miejsca pomiaru OD powinny być wyznaczane za pomocą żył skrzydłowych jako punktów orientacyjnych. W tym artykule szczegółowo opisujemy tę metodę ilościowego oznaczania pigmentacji skrzydeł u Drosophila guttifera.