$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Ostatecznym celem metabolizmu składników odżywczych jest wytworzenie trifosforanu adenozyny (ATP). W komórkach ssaków dzieje się to w mitochondriach, organellach o podwójnej błonie, które przekształcają energię zmagazynowaną w węglu w ATP. Produkcja ATP rozpoczyna się, gdy węgiel jest spalany przez mitochondria tworzące dwa nośniki elektronów, NADH i dinukleotyd flawinoadeninowy (FADH2)1. NADH i FADH2 są następnie utleniane przez wielopodjednostkowe kompleksy oddechowe I i II, odpowiednio, a uwolnione elektrony są przenoszone do końcowego akceptora elektronów tlenu cząsteczkowego (O2) w kompleksie IV1. Korzystny termodynamicznie transfer elektronów "w dół" do O2 na końcu łańcucha jest sprzężony z eksportem protonów do przestrzeni międzybłonowej przez kompleksy I, III i IV. W ten sposób powstaje transbłonowy gradient elektrochemiczny protonów (siła napędowa protonu), tymczasowa forma energii swobodnej Gibbsa, która jest wykorzystywana przez kompleks V, aby utworzyć ATP2. Reakcje przenoszenia elektronów w mitochondriach nie są idealnie sprzężone z produkcją ATP. W różnych punktach cyklu Krebsa i łańcucha oddechowego elektrony mogą przedwcześnie oddziaływać z O2, tworząc ROS3. Najbardziej istotnymi biologicznie ROS generowanymi przez mitochondria są O2●- i H2O2. Chociaż O2●- jest często uważany za proksymalny ROS utworzony przez mitochondria, obecnie jest oczywiste, że miejsca produkcji tworzą mieszaninę O2●- i H2O2, co jest związane z wolnymi rodnikami w flawinowych grupach protetycznych4,5. Przy wysokich poziomach ROS może być niebezpieczny, uszkadzając składniki biologiczne niezbędne do funkcjonowania komórki, powodując zaburzenia oksydacyjne6. Jednak w niewielkich ilościach mitochondrialne ROS spełniają ważne funkcje sygnalizacyjne. Na przykład uwalnianieH2O2z mitochondriów jest zaangażowane w kontrolowanie aktywacji limfocytów T, sygnalizacji stresu (np. Indukcji szlaków sygnałowych Nrf2), indukcji proliferacji i różnicowania komórek, sygnalizacji i uwalnianiu insuliny oraz zachowaniach żywieniowych7. Poczyniono znaczne postępy w zrozumieniu funkcji sygnalizacyjnej ROS. Jednak nadal pozostają ważne pytania dotyczące tego, które enzymy w mitochondriach służą jako najważniejsze źródła i jak kontrolowana jest produkcja.
Uwolnienie ROS przez miejsce produkcji zależy od kilku czynników: 1) stężenie miejsca oddawania elektronów, 2) stan redoks miejsca oddawania elektronów, 3) dostęp do tlenu, oraz 4) stężenie i rodzaj podłoża utleniającego3,8,9. W mitochondriach inne czynniki, takie jak stężenie NADH i siła potencjału błony, również wpływają na produkcję ROS8,10. Na przykład szybkość produkcji O2●-/H2O2 przez oczyszczony PDHC lub KGDHC wzrasta wraz ze wzrostem dostępności NADH5,11. W tym scenariuszu elektrony przepływają wstecz z NADH do centrum FAD w podjednostce E3 PDHC lub KGDHC, miejscu produkcji O2●-/H2O2 12. Podobnie, dostarczanie NAD+ ma odwrotny skutek, zmniejszając uwalnianie ROS z KGDHC12. Tak więc kontrolowanie wejścia lub wyjścia elektronów z miejsc produkcji ROS może zmienić ilość O2●-/H2O2 powstaje. Na przykład zablokowanie podjednostki E2 PDHC lub KGDHC za pomocą CPI-613, analogu kwasu liponowego, powoduje prawie 90% spadek produkcji O2●-/H2O213. Podobne wyniki można uzyskać za pomocą chemicznych katalizatorów S-glutationylionu, diamidu i disulfiramu, które prawie znoszą wytwarzanie O2●-/H2O2 przez PDHC lub KGDHC poprzez koniugację glutationu z podjednostką E214. Kompromisem w blokowaniu przepływu elektronów przez podjednostkę E2 PDHC i KGDHC jest zmniejszenie produkcji NADH, co zmniejsza tworzenie ROS przez łańcuch transportu elektronów (np. kompleks III). Może to również zmniejszyć produkcję ATP przez łańcuch transportu elektronów. Ogólnie rzecz biorąc, blokowanie wejścia elektronów do miejsc produkcji ROS może być bardzo skutecznym sposobem kontrolowania produkcji O2●-/H2O2.
Mitochondria mogą zawierać do 12 potencjalnych O2●-/H2O2 sources6. Większość z tych miejsc to enzymy zawierające flawiny, które wytwarzają mieszaninę O2●- iH2O2. Zastosowanie różnych kombinacji substratów i inhibitorów pozwoliło na zidentyfikowanie, które kompleksy oddechowe i dehydrogenazy mitochondrialne służą jako miejsca tworzenia O2●-/H2O2 o dużej pojemności w różnych tkankach3. Wykazano, że PDHC i KGDHC służą jako miejsca emitujące O2●-/H2O2 o dużej pojemności w mitochondriach mięśni i wątroby13,15. Pozostają jednak pewne trudności w odniesieniu do badania potencjału tworzeniaO2●-/H2O2 poszczególnych miejsc w mitochondriach oraz wpływu różnych kombinacji substratów i inhibitorów na aktywność enzymów. Wynika to z obecności niepożądanych reakcji ubocznych (np. tworzenie O2●-/H2O2 przez miejsca inne niż enzym będący przedmiotem zainteresowania), zanieczyszczających endogenne składniki odżywcze (np. kwasy tłuszczowe) lub organelle (np. peroksysomy, które również tworzą O2●-/H2O2) oraz stosowanie inhibitorów, które nie są selektywne, i/lub stosowanie związków, które nie hamują w pełni wytwarzania ROS. Niektóre inhibitory mogą również zmieniać bioenergetykę mitochondriów i kierunek przepływu elektronów, a to zmienia uwalnianie ROS z innych miejsc produkcji i zakłóca wyniki. Bezwzględne szybkości uwalniania O2●-/H2O2 z poszczególnych miejsc w mitochondriach są również trudne do określenia ilościowego ze względu na wysokie stężenie enzymów eliminujących O2●- iH2O2 w macierzy i przestrzeni międzybłonowej. Dlatego eliminacja wszelkich konkurencyjnych reakcji, które mogą zakłócać pomiary uwalniania O2●-/H2O2 może być przydatna przy identyfikacji miejsc tworzenia O2● o dużej pojemności.
Tutaj prezentujemy prostą metodę, która pozwala na jednoczesne badanie produkcji O2●-/H2O2 i tworzenia NADH przez oczyszczone dehydrogenazy zależne od flawiny. Dzięki zastosowaniu oczyszczonych enzymów można wyeliminować niepożądane reakcje uboczne tworzące ROS i enzymy rozkładające ROS, co pozwala na dokładniejszy pomiar natywnych wskaźników produkcji O2●-/H2O2 dla poszczególnych flawoenzymów. Metodę tę można wykorzystać do bezpośredniego porównania zdolności do tworzeniaO2●-/H2O2 różnych oczyszczonych dehydrogenaz lub do badania przesiewowego potencjalnych specyficznych dla miejsca inhibitorów uwalniania O2●-/H2O2. Wreszcie, jednoczesny pomiar O2●-/H2O2 i produkcji NADH może pozwolić na ocenę w czasie rzeczywistym związku między aktywnością enzymu a zdolnością uwalniania ROS.