Ze względu na złożoność konfiguracji eksperymentalnych, eksperymenty z pompą i sondą z laserami na swobodnych elektronach wymagają wysokiego poziomu wiedzy i doświadczenia oraz wymagają bardzo starannego przygotowania i szczegółowych dyskusji z zespołami naukowymi, które obsługują laser na swobodnych elektronach, laser optyczny i stację końcową, zarówno przed, jak i w trakcie eksperymentu. Podczas wykonywania właściwego eksperymentu niezbędne jest precyzyjne określenie nakładania się przestrzennego i czasowego oraz ścisłe monitorowanie wszystkich systemów diagnostycznych i czasowych, zgodnie z opisem w niniejszym protokole.
Należy zauważyć, że większość opisanych tutaj metod ma zastosowanie tylko do określonego zakresu energii fotonów FEL, ponieważ opierają się one na efektach, które silnie zależą od energii fotonu. Na przykład stwierdzono, że określenie "zgrubnego" nakładania się czasowego za pomocą rozproszonego światła skierowanego na fotodiodę działa dobrze dla energii fotonów do ~250 eV. Przy wyższych energiach fotonów sygnał generowany przez impulsy FEL staje się tak mały, że trudno go wykryć. W tym przypadku okazało się, że otwarty kabel SMA, który można przyprowadzić bardzo blisko (mniej niż milimetr) do wiązki FEL, a nawet do niej, wytwarza bardziej niezawodny sygnał do wykonania procedury opisanej w kroku 3.1 protokołu. Podobnie, najlepszy cel do wyznaczenia "precyzyjnego" czasu, opisany w kroku 3.2), jest silnie zależny od energii fotonów. Dla impulsów FEL w obszarze XUV i miękkiego promieniowania rentgenowskiego powyżej energii fotonów 65,7 eV i ~57 eV (odpowiadających progom jonizacji 4d odpowiednio w ksenonach iCH3I), Xe iCH3I okazały się odpowiednimi celami dla procedury opisanej w kroku 3.2. Stwierdzono, że metoda wykorzystująca CH3I działa dla energii fotonów do 2 keV (powyżej której nie została jeszcze przetestowana), podczas gdy metoda wykorzystująca Xe została przetestowana do 250 eV. Dla energii fotonów poniżej 50 eV można zastosować proces zmiękczania wiązania w H2 19. Przy energiach fotonów powyżej 400 eV podobny proces w N2 jest również odpowiedni20. Alternatywne podejścia polegają na zmianie współczynnika odbicia próbki stałej 25,26,30 lub tworzeniu się pasm bocznych w widmie fotoelektronów 31,32.
W celu uzyskania najlepszej rozdzielczości czasowej konieczne jest sortowanie danych eksperymentalnych dla każdego ujęcia w analizie danych w celu skompensowania fluktuacji czasu przybycia między FEL a optycznymi impulsami lasera, jak opisano w kroku 5. Jednak jakość danych z sondy pompującej, a w szczególności osiągalna rozdzielczość czasowa, w dużym stopniu zależy od wydajności FEL podczas eksperymentu oraz od czasu trwania impulsów lasera optycznego i impulsów FEL, które mogą być dostarczone w tym czasie. Dla przykładowych danych pokazanych tutaj, czas trwania impulsów UV oszacowano na 150 fs (FWHM), a czas trwania impulsu FEL oszacowano na 120 fs (FWHM). Chociaż całkowity jitter czasu przybycia wynoszący około 90 fs (rms) przed korekcją jittera mógł zostać zredukowany do około 27 fs (rms) przy użyciu procedury opisanej tutaj12, wynikająca z tego poprawa całkowitej rozdzielczości czasowej eksperymentu była raczej niewielka ze względu na stosunkowo długi czas trwania impulsów FEL i lasera optycznego. Oba te czynniki można jednak znacznie zmniejszyć, w takim przypadku wpływ schematu korekcji jittera będzie bardziej znaczący. Na przykład w FLASH instalowany jest obecnie nowy laser optyczny, który będzie miał czas trwania impulsu (w bliskiej podczerwieni) poniżej 15 fs, a także testowane są nowe tryby pracy FEL, które mogą wytwarzać impulsy FEL o czasie trwania impulsu wynoszącym kilka femtosekund lub nawet mniej. Osiągnięcia te umożliwią wkrótce eksperymenty z pompą i sondą łączącą FEL i optyczne impulsy laserowe o ogólnej rozdzielczości czasowej wynoszącej zaledwie kilkadziesiąt femtosekund.
Podczas gdy zwiększona dostępność krótkich i intensywnych impulsów XUV i rentgenowskich wytwarzanych przez FEL zrodziła szereg eksperymentów z pompą i sondą NIR/UV - XUV, takich jak ten opisany tutaj, podobne eksperymenty pompa-sonda mogą być również przeprowadzane ze źródłami generacji wysokich harmonicznych (HHG) 33,34,35. Głównym ograniczeniem eksperymentów opartych na FEL jest zazwyczaj osiągalna rozdzielczość czasowa, która jest zasadniczo ograniczona przez synchronizację między FEL a laserem optycznym lub przez precyzję, z jaką można zmierzyć względny czas między impulsami pompy i sondy. Nie jest tak w przypadku eksperymentu z pompą i sondą opartego na HHG, w którym impulsy XUV i NIR są wewnętrznie zsynchronizowane z precyzją podcyklu i które w związku z tym mogą mieć znacznie wyższą rozdzielczość czasową. Z drugiej strony, główną zaletą eksperymentów opartych na FEL jest o kilka rzędów wielkości wyższa fluencja fotonów, co umożliwia eksperymenty, np. na rozcieńczonych tarczach, które nie są możliwe do wykonania przy obecnych źródłach HHG, zwłaszcza przy wyższych energiach fotonów w reżimie miękkiego promieniowania rentgenowskiego. W dającej się przewidzieć przyszłości eksperymenty z pompą i sondą z użyciem FEL i HHG pozostaną zatem komplementarne, z pewnym nakładaniem się na siebie w regionie XUV, gdzie oba te elementy mogą być wykorzystane do podobnych badań. Niektóre kroki do wykonania tych eksperymentów są również podobne, a niektóre z opisanych tutaj metod można zatem również zastosować do eksperymentów z pompą i sondą opartą na HHG.