$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Przewód pokarmowy (GI) ma wiele fałd i wypukłości, które stanowią największy interfejs oddzielający ciało wewnętrzne od środowiska zewnętrznego. Jelitowy układ odpornościowy odgrywa istotną rolę w utrzymaniu funkcji barierowej przewodu pokarmowego. Jest stale narażony na antygeny dietetyczne, bakterie komensalne i drobnoustroje chorobotwórcze. W związku z tym musi pozostać tolerancyjny na antygeny pokarmowe i bakterie komensalne, zachowując jednocześnie zdolność do szybkiego generowania skutecznej odpowiedzi immunologicznej na drobnoustroje enteropatogenne1. Jelitowy układ odpornościowy można anatomicznie podzielić na miejsca indukcyjne, w których naiwne limfocyty są aktywowane przez komórki prezentujące antygen przenoszące antygeny z błony śluzowej jelita, oraz miejsca efektorowe, w których aktywowane limfocyty wywierają określone funkcje efektorowe2. Miejsca indukcyjne obejmują zorganizowaną strukturę limfoidalną plastrów Peyera (PP), która bada światło jelita bezpośrednio poprzez działanie wyspecjalizowanych komórek M i regionalnych drenujących węzłów chłonnych krezkowych (MLN). Miejsca efektorowe składają się z blaszki właściwej (LP), która jest tkanką łączną poniżej błony podstawnej, oraz nabłonka jelitowego, pojedynczej warstwy komórkowej znajdującej się nad błoną podstawną, która zawiera limfocyty śródnabłonkowe (IEL). Limfocyty są głównymi graczami odporności adaptacyjnej, która pośredniczy w ochronie przed infekcjami i nowotworami, a także może przyczyniać się do immunopatologii w chorobach zapalnych. Badanie limfocytów w tych odrębnych anatomicznych przedziałach błony śluzowej jest ważne i bardzo istotne, aby lepiej zrozumieć ich funkcje indukcyjne i efektorowe.
Stosunkowo prosty i ujednolicony protokół izolacji limfocytów z tych przedziałów jest potrzebny, ponieważ liczba badaczy badających zdarzenia immunologiczne zachodzące w jelicie rośnie. Kilka grup badawczych opublikowało protokoły, które dzielą kilka podobnych procesów izolowania komórek odpornościowych z przedziałów jelita cienkiego myszy 3,4,5,6,7. Istnieje jednak między nimi kilka różnic technicznych w zależności od tego, na czym skupia się poszczególne protokoły. Na przykład, koncentrując się na izolowaniu komórek odpornościowych od LP, jeden z protokołów bada wpływ różnych trawień enzymatycznych na żywotność komórek, ekspresję markerów powierzchniowych komórek i skład izolowanych komórek odpornościowych5. Inny protokół podkreśla szybką i powtarzalną metodę izolacji limfocytów bez wirowania gęstości6. Wreszcie, istnieją również specjalne protokoły w celu izolowania fagocytów jednojądrzastych z różnych warstw tkanki jelita cienkiego7. W tym miejscu przedstawiono wysoce powtarzalny protokół, który umożliwia sekwencyjną izolację populacji limfocytów z przedziału MLN, PP, LP i IEL jelita cienkiego.
Skupiamy się na izolowaniu wysoce oczyszczonych populacji z przedziałów LP i IEL, które są w dużej mierze wolne od zanieczyszczeń z innych przedziałów jelitowych. Ten szeroko stosowany protokół zapewnia wysoką wydajność maksymalnie czystych i żywotnych limfocytów w akceptowalnych ograniczeniach czasowych4,8,9,10,11,12. Protokół ten zapewnia również izolację limfocytów z przedziału LP i IEL przy minimalnym zanieczyszczeniu międzyprzedziałowym, co daje możliwość badania limfocytów w tych odrębnych przedziałach. Wyizolowane limfocyty mogą być poddawane dalszym manipulacjom, takim jak analiza cytometrii przepływowej lub analiza funkcjonalna. Protokół ten został z powodzeniem zastosowany do izolacji limfocytów z jelita cienkiego i okrężnicy myszy podczas infekcji bakteryjnych, takich jak Listeria monocytogenes, Salmonella typhimurium i Yersinia pseudotuberculosis oraz stanów zapalnych, takich jak zapalenie jelita grubego wywołane przez chemikalia i patogeny. Protokół ten może być również stosowany do izolowania wrodzonych komórek odpornościowych, takich jak komórki dendrytyczne, makrofagi, neutrofile i monocyty z jelita cienkiego i okrężnicy myszy.