Materia organiczna gleby (SOM) leży u podstaw wielu procesów i funkcji gleby. Spektroskopia w podczerwieni z transformacją Fouriera (FTIR) wykrywa aktywne w podczerwieni wiązania organiczne, które stanowią organiczny składnik gleby. Jednak stosunkowo niska zawartość materii organicznej w glebach (zwykle < 5% masy) oraz nakładanie się absorbancji mineralnych i organicznych grup funkcyjnych w obszarze średniej podczerwieni (MIR) (4 000-400 cm-1) powoduje znaczną interferencję ze strony dominujących absorbancji minerałów, utrudniając lub nawet uniemożliwiając interpretację widm dla charakterystyki SOM. Odejmowanie spektralne, czyli matematyczne traktowanie widm post hoc, może zmniejszyć interferencję minerałów i zwiększyć rozdzielczość obszarów widmowych odpowiadających organicznym grupom funkcyjnym poprzez matematyczne usunięcie absorbancji minerałów. Wymaga to wzbogaconego minerałami widma referencyjnego, które można empirycznie uzyskać dla danej próbki gleby poprzez usunięcie SOM. Widmo referencyjne wzbogacone w minerały odejmuje się od pierwotnego (niepoddanego obróbce) widma próbki gleby w celu uzyskania widma reprezentującego absorbancję SOM. Typowe metody usuwania SOM obejmują spalanie w wysokiej temperaturze ("spopielanie") i utlenianie chemiczne. Wybór metody usuwania SOM wiąże się z dwoma względami: (1) ilością usuniętego SOM oraz (2) artefaktami absorbancji w mineralnym spektrum odniesienia, a tym samym wynikowym widmem odejmowania. Te potencjalne problemy mogą i powinny być identyfikowane i kwantyfikowane w celu uniknięcia błędnych lub tendencyjnych interpretacji widm dla składu organicznych grup funkcyjnych SOM. Po usunięciu SOM otrzymana próbka wzbogacona w minerały jest wykorzystywana do zebrania mineralnego widma referencyjnego. Istnieje kilka strategii wykonywania odejmowania w zależności od celów eksperymentu i charakterystyki próby, w szczególności określania współczynnika odejmowania. Uzyskane widmo odejmowania wymaga starannej interpretacji w oparciu o wyżej wymienioną metodologię. W przypadku wielu próbek gleby i innych próbek środowiskowych zawierających znaczne składniki mineralne, odejmowanie ma duży potencjał w zakresie poprawy spektroskopowej charakterystyki składu materii organicznej FTIR.